More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_4497 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_4497  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  100 
 
 		 255 aa  518  1e-146  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0140276  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4564  Crp/FNR family transcriptional regulator  82.52 
 
 		 257 aa  408  1e-113  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00106309 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3758  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  57.32 
 
 		 247 aa  304  7e-82  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6209  Crp/FNR family transcriptional regulator  55.87 
 
 		 247 aa  295  4e-79  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0102902  normal  0.673418 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7477  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  55.83 
 
 		 246 aa  281  9e-75  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.403111  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2763  cyclic nucleotide-binding  52.85 
 
 		 244 aa  275  4e-73  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.746131  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2990  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  52.85 
 
 		 244 aa  275  4e-73  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7493  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  54.13 
 
 		 246 aa  275  6e-73  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2886  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  52.65 
 
 		 244 aa  274  9e-73  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.473656  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6403  Crp/FNR family transcriptional regulator  54.13 
 
 		 246 aa  270  2e-71  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4270  CRP/FNR family transcriptional regulator  54.91 
 
 		 225 aa  261  8.999999999999999e-69  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0893417 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1439  Crp/FNR family transcriptional regulator  50.21 
 
 		 243 aa  228  9e-59  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000118444 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3167  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  49.56 
 
 		 307 aa  221  9.999999999999999e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2367  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  45.57 
 
 		 255 aa  216  2e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0615204  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4036  Crp/FNR family transcriptional regulator  47.28 
 
 		 315 aa  212  3.9999999999999995e-54  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1359  Crp/FNR family transcriptional regulator  45.26 
 
 		 236 aa  204  8e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.342582  normal  0.0135439 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0073  cyclic nucleotide-binding  44.21 
 
 		 255 aa  198  6e-50  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3862  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  44.21 
 
 		 249 aa  198  6e-50  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.582037  normal  0.123136 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0060  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  44.16 
 
 		 384 aa  196  3e-49  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0133  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  44.78 
 
 		 268 aa  195  6e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.564261  normal  0.0379159 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5361  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  44.07 
 
 		 299 aa  193  3e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3385  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  43.29 
 
 		 384 aa  191  8e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5417  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  43.46 
 
 		 298 aa  190  2e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.36754  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4876  cyclic nucleotide-binding  43.64 
 
 		 317 aa  189  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.155933  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0783  cyclic nucleotide-binding  42.74 
 
 		 376 aa  189  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0359827  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3788  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  42.15 
 
 		 249 aa  188  5.999999999999999e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.371562 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3389  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  40 
 
 		 248 aa  188  8e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3480  cyclic nucleotide-binding  42.15 
 
 		 249 aa  187  1e-46  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1991  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  41.28 
 
 		 249 aa  182  4.0000000000000006e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.250977  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2433  Crp/FNR family transcriptional regulator  41.99 
 
 		 247 aa  182  5.0000000000000004e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.168738  normal  0.817452 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1986  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  39.74 
 
 		 259 aa  179  4.999999999999999e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2024  cyclic nucleotide-binding  39.83 
 
 		 259 aa  176  3e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.996332 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2301  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  39.83 
 
 		 259 aa  176  3e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.161686 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2950  Crp/FNR family transcriptional regulator  38.63 
 
 		 250 aa  176  4e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.908761  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1441  Crp/FNR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 259 aa  167  1e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00010652 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2447  cyclic nucleotide-binding protein  38.98 
 
 		 255 aa  167  1e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2944  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  37.25 
 
 		 246 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0738845  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6249  Crp/FNR family transcriptional regulator  41.1 
 
 		 281 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.999867 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0772  cyclic nucleotide-binding  39.26 
 
 		 254 aa  162  4.0000000000000004e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6130  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  37.55 
 
 		 244 aa  160  2e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2686  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  39.38 
 
 		 239 aa  160  2e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.038663  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4786  cyclic nucleotide-binding protein  38.2 
 
 		 243 aa  159  3e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3832  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  35.04 
 
 		 245 aa  157  1e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1835  cyclic nucleotide-binding protein  39.41 
 
 		 281 aa  157  2e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011893  Mnod_8765  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  36.68 
 
 		 244 aa  155  5.0000000000000005e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.474033  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1230  Crp/FNR family transcriptional regulator  40.61 
 
 		 263 aa  154  1e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.583862  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1427  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  37.66 
 
 		 267 aa  151  1e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0859  CRP/FNR family transcriptional regulator  35.93 
 
 		 234 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0477074 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1485  cyclic nucleotide-binding protein  35.06 
 
 		 244 aa  146  3e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4068  Crp/FNR family transcriptional regulator  35.5 
 
 		 247 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.936766  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2609  Crp/FNR family transcriptional regulator  37.38 
 
 		 293 aa  139  6e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.325512  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3616  Crp/FNR family transcriptional regulator  34.93 
 
 		 243 aa  137  2e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1184  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  35.34 
 
 		 243 aa  136  3.0000000000000003e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3486  putative signal transduction histidine kinase  34.6 
 
 		 243 aa  135  6.0000000000000005e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.173486 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1000  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  39.02 
 
 		 250 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.523077  normal  0.289991 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0604  cyclic nucleotide-binding protein  33.62 
 
 		 246 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0953  CRP/FNR family transcriptional regulator  33.47 
 
 		 254 aa  129  4.0000000000000003e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1953  Crp/FNR family transcriptional regulator  33.19 
 
 		 246 aa  129  5.0000000000000004e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3805  cyclic nucleotide-binding  31.9 
 
 		 263 aa  129  5.0000000000000004e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1153  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  38.05 
 
 		 250 aa  127  1.0000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3741  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  35.81 
 
 		 242 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1787  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  37.25 
 
 		 263 aa  125  5e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1734  Crp/FNR family transcriptional regulator  33.2 
 
 		 241 aa  125  5e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.79675  hitchhiker  0.000773544 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6056  Crp/FNR family transcriptional regulator  31.17 
 
 		 241 aa  124  1e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2400  CRP/FNR family transcriptional regulator  35.36 
 
 		 250 aa  124  1e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0375093 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5989  transcriptional regulator CRP family  37.13 
 
 		 257 aa  124  2e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2201  transcriptional regulator  34.47 
 
 		 262 aa  119  7e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.586423 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4040  Crp/FNR family transcriptional regulator  31.72 
 
 		 256 aa  117  1.9999999999999998e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.858211 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0532  cyclic nucleotide-binding protein  31.67 
 
 		 276 aa  117  1.9999999999999998e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.053126  normal  0.207643 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0997  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  34.63 
 
 		 230 aa  115  7.999999999999999e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3844  cyclic nucleotide-binding protein  31.6 
 
 		 242 aa  114  2.0000000000000002e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2391  CRP/FNR family transcriptional regulator  30.38 
 
 		 274 aa  112  5e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3499  CRP/FNR family transcriptional regulator  32.28 
 
 		 286 aa  109  5e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.519814  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5658  cyclic nucleotide-binding protein  32.6 
 
 		 245 aa  108  1e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5597  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  32.37 
 
 		 246 aa  107  2e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0675352  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0196  Crp/FNR family transcriptional regulator  32.92 
 
 		 253 aa  106  4e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0367027  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3568  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  34.62 
 
 		 242 aa  106  4e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0189  Crp/FNR family transcriptional regulator  32.62 
 
 		 235 aa  106  4e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.338052  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0955  CRP/FNR family transcriptional regulator  30.69 
 
 		 226 aa  102  5e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.869769  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3367  CRP/FNR family transcriptional regulator  30.37 
 
 		 252 aa  102  8e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.184948  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0414  Crp/FNR family transcriptional regulator  32.12 
 
 		 252 aa  101  1e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.766284  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0357  Crp/FNR family transcriptional regulator  32.12 
 
 		 252 aa  101  1e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2575  Crp/FNR family transcriptional regulator  34.17 
 
 		 240 aa  100  2e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0490  CRP/FNR family transcriptional regulator  36.42 
 
 		 256 aa  99.8  4e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0266  CRP/FNR family transcriptional regulator  31.15 
 
 		 253 aa  98.6  8e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2108  CRP/FNR family transcriptional regulator  28.15 
 
 		 243 aa  98.6  9e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.819689  normal  0.0771917 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3865  Crp/FNR family transcriptional regulator  35.79 
 
 		 252 aa  96.3  5e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.925805  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1854  CRP/FNR family transcriptional regulator  27.83 
 
 		 250 aa  95.9  5e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.191124  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1862  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.51 
 
 		 250 aa  94.4  1e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0720375  normal  0.182435 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2934  cyclic nucleotide-binding protein  31.84 
 
 		 249 aa  94.4  2e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1275  Crp/Fnr family transcriptional regulator  31.84 
 
 		 249 aa  93.6  3e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2705  cyclic nucleotide-binding protein  31.28 
 
 		 249 aa  92.4  6e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2360  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30.05 
 
 		 240 aa  89.7  4e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.948966  hitchhiker  0.00636029 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0698  Crp-Fnr regulatory protein (FnrL)  30.59 
 
 		 248 aa  87.8  1e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2353  CRP/FNR family transcriptional regulator  30.59 
 
 		 248 aa  87.8  1e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.689366  normal  0.139893 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1678  Crp/FNR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 230 aa  87.4  2e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.330352  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0447  transcriptional regulator  31.36 
 
 		 262 aa  87.8  2e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  decreased coverage  0.00494896  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0660  transcriptional regulator  32.37 
 
 		 249 aa  87  3e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0532  CRP/FNR family transcriptional regulator  30.74 
 
 		 248 aa  87  3e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.283437 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0983  Crp/FNR family transcriptional regulator  28.37 
 
 		 245 aa  85.1  9e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>