More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_4036 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_4036  Crp/FNR family transcriptional regulator  100 
 
 		 315 aa  632  1e-180  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3167  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  80.99 
 
 		 307 aa  410  1e-113  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2886  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  46.46 
 
 		 244 aa  221  9e-57  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.473656  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2763  cyclic nucleotide-binding  47.35 
 
 		 244 aa  218  1e-55  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.746131  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2990  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  47.35 
 
 		 244 aa  218  1e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3758  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  45.02 
 
 		 247 aa  204  2e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6209  Crp/FNR family transcriptional regulator  45.85 
 
 		 247 aa  203  3e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0102902  normal  0.673418 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4270  CRP/FNR family transcriptional regulator  48.78 
 
 		 225 aa  202  8e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0893417 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4497  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  50.75 
 
 		 255 aa  200  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0140276  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4564  Crp/FNR family transcriptional regulator  48.24 
 
 		 257 aa  190  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00106309 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6403  Crp/FNR family transcriptional regulator  44.21 
 
 		 246 aa  185  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7477  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  41.7 
 
 		 246 aa  182  7e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.403111  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7493  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  41.63 
 
 		 246 aa  179  7e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0133  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  41.06 
 
 		 268 aa  172  6.999999999999999e-42  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.564261  normal  0.0379159 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1359  Crp/FNR family transcriptional regulator  42.79 
 
 		 236 aa  170  2e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.342582  normal  0.0135439 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2367  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  40.28 
 
 		 255 aa  166  4e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0615204  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0060  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  40.09 
 
 		 384 aa  165  8e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0783  cyclic nucleotide-binding  39.22 
 
 		 376 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0359827  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3385  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  39.66 
 
 		 384 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3389  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  39.48 
 
 		 248 aa  162  7e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0073  cyclic nucleotide-binding  39.22 
 
 		 255 aa  162  9e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1439  Crp/FNR family transcriptional regulator  38.79 
 
 		 243 aa  159  6e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000118444 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2024  cyclic nucleotide-binding  37.71 
 
 		 259 aa  158  1e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.996332 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2301  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  37.71 
 
 		 259 aa  158  1e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.161686 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1986  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  38.91 
 
 		 259 aa  156  4e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3862  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  37.55 
 
 		 249 aa  154  2e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.582037  normal  0.123136 
 
 
-
 
NC_011893  Mnod_8765  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  36.7 
 
 		 244 aa  153  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.474033  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6130  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  36.7 
 
 		 244 aa  152  5.9999999999999996e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5417  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  35.95 
 
 		 298 aa  152  8e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.36754  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4786  cyclic nucleotide-binding protein  38.33 
 
 		 243 aa  150  2e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2433  Crp/FNR family transcriptional regulator  37.77 
 
 		 247 aa  150  3e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.168738  normal  0.817452 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5361  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  35.66 
 
 		 299 aa  145  6e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6249  Crp/FNR family transcriptional regulator  37.6 
 
 		 281 aa  145  9e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.999867 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4876  cyclic nucleotide-binding  35.66 
 
 		 317 aa  144  1e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.155933  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3832  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  37.12 
 
 		 245 aa  142  8e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1835  cyclic nucleotide-binding protein  41.09 
 
 		 281 aa  140  3e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2447  cyclic nucleotide-binding protein  36.86 
 
 		 255 aa  139  4.999999999999999e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1441  Crp/FNR family transcriptional regulator  36.12 
 
 		 259 aa  139  7.999999999999999e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00010652 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2944  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  36.8 
 
 		 246 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0738845  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3788  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  37.44 
 
 		 249 aa  135  9.999999999999999e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.371562 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3480  cyclic nucleotide-binding  37.44 
 
 		 249 aa  135  9.999999999999999e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1485  cyclic nucleotide-binding protein  37.56 
 
 		 244 aa  135  9.999999999999999e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0772  cyclic nucleotide-binding  32.79 
 
 		 254 aa  134  3e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2950  Crp/FNR family transcriptional regulator  33.62 
 
 		 250 aa  133  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.908761  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0953  CRP/FNR family transcriptional regulator  33.89 
 
 		 254 aa  130  2.0000000000000002e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1991  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  33.33 
 
 		 249 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.250977  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2686  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  34.06 
 
 		 239 aa  128  1.0000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.038663  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1230  Crp/FNR family transcriptional regulator  36.12 
 
 		 263 aa  127  3e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.583862  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3741  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  34.65 
 
 		 242 aa  125  7e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5989  transcriptional regulator CRP family  36.98 
 
 		 257 aa  120  3.9999999999999996e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2609  Crp/FNR family transcriptional regulator  36.41 
 
 		 293 aa  119  9e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.325512  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0859  CRP/FNR family transcriptional regulator  35.18 
 
 		 234 aa  117  3.9999999999999997e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0477074 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1427  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30.3 
 
 		 267 aa  116  6e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3499  CRP/FNR family transcriptional regulator  32.24 
 
 		 286 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.519814  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0266  CRP/FNR family transcriptional regulator  31.86 
 
 		 253 aa  110  3e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2391  CRP/FNR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 274 aa  109  8.000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1000  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  34.03 
 
 		 250 aa  108  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.523077  normal  0.289991 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0189  Crp/FNR family transcriptional regulator  33.17 
 
 		 235 aa  107  2e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.338052  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0955  CRP/FNR family transcriptional regulator  33.78 
 
 		 226 aa  107  3e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.869769  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0196  Crp/FNR family transcriptional regulator  35.75 
 
 		 253 aa  106  5e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0367027  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4068  Crp/FNR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 247 aa  105  1e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.936766  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1153  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  32.98 
 
 		 250 aa  105  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2201  transcriptional regulator  37.24 
 
 		 262 aa  103  5e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.586423 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1184  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.61 
 
 		 243 aa  101  2e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3805  cyclic nucleotide-binding  29.31 
 
 		 263 aa  100  2e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1787  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  33.33 
 
 		 263 aa  100  3e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5597  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  31.94 
 
 		 246 aa  100  3e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0675352  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1734  Crp/FNR family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 241 aa  99.8  6e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.79675  hitchhiker  0.000773544 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3844  cyclic nucleotide-binding protein  33.33 
 
 		 242 aa  98.6  1e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0414  Crp/FNR family transcriptional regulator  32.46 
 
 		 252 aa  98.2  2e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.766284  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0357  Crp/FNR family transcriptional regulator  32.46 
 
 		 252 aa  98.2  2e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6056  Crp/FNR family transcriptional regulator  30.39 
 
 		 241 aa  98.2  2e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3486  putative signal transduction histidine kinase  31.11 
 
 		 243 aa  98.2  2e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.173486 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1854  CRP/FNR family transcriptional regulator  32.68 
 
 		 250 aa  97.4  2e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.191124  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3616  Crp/FNR family transcriptional regulator  32.82 
 
 		 243 aa  97.1  3e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0604  cyclic nucleotide-binding protein  29.07 
 
 		 246 aa  97.1  3e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4040  Crp/FNR family transcriptional regulator  34.92 
 
 		 256 aa  96.7  5e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.858211 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2400  CRP/FNR family transcriptional regulator  33.68 
 
 		 250 aa  96.3  6e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0375093 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1953  Crp/FNR family transcriptional regulator  30.24 
 
 		 246 aa  96.3  6e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0983  Crp/FNR family transcriptional regulator  30.18 
 
 		 245 aa  96.3  6e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2575  Crp/FNR family transcriptional regulator  34.3 
 
 		 240 aa  95.9  8e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3865  Crp/FNR family transcriptional regulator  34.92 
 
 		 252 aa  94.4  2e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.925805  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0532  cyclic nucleotide-binding protein  33.7 
 
 		 276 aa  94.7  2e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.053126  normal  0.207643 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3367  CRP/FNR family transcriptional regulator  33.17 
 
 		 252 aa  93.6  4e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.184948  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1862  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  31.2 
 
 		 250 aa  91.7  1e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0720375  normal  0.182435 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0997  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  31.61 
 
 		 230 aa  89.7  6e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4822  cyclic nucleotide-binding protein  29.59 
 
 		 243 aa  89.4  7e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.379105  normal  0.123433 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2705  cyclic nucleotide-binding protein  31.77 
 
 		 249 aa  87.8  2e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0490  CRP/FNR family transcriptional regulator  32.07 
 
 		 256 aa  84.7  0.000000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3858  Crp/FNR family transcriptional regulator  30.35 
 
 		 248 aa  84.3  0.000000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2108  CRP/FNR family transcriptional regulator  28.34 
 
 		 243 aa  83.2  0.000000000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.819689  normal  0.0771917 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0447  transcriptional regulator  31.38 
 
 		 262 aa  82.8  0.000000000000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  decreased coverage  0.00494896  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0698  Crp-Fnr regulatory protein (FnrL)  29.15 
 
 		 248 aa  80.5  0.00000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2353  CRP/FNR family transcriptional regulator  29.15 
 
 		 248 aa  80.5  0.00000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.689366  normal  0.139893 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2547  Crp/FNR family transcriptional regulator  29.29 
 
 		 246 aa  80.1  0.00000000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.389339  normal  0.365128 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1275  Crp/Fnr family transcriptional regulator  31.98 
 
 		 249 aa  79  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0532  CRP/FNR family transcriptional regulator  29.56 
 
 		 248 aa  77.8  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.283437 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2934  cyclic nucleotide-binding protein  30.3 
 
 		 249 aa  77.8  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2634  CRP/FNR family transcriptional regulator  30.65 
 
 		 249 aa  77.8  0.0000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3322  Crp/FNR family transcriptional regulator  30.57 
 
 		 262 aa  75.1  0.000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0702622  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>