More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A2201 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008825  Mpe_A2201  transcriptional regulator  100 
 
 		 262 aa  529  1e-149  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.586423 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0532  cyclic nucleotide-binding protein  62.18 
 
 		 276 aa  316  2e-85  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.053126  normal  0.207643 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0997  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  61.74 
 
 		 230 aa  291  9e-78  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4040  Crp/FNR family transcriptional regulator  56.2 
 
 		 256 aa  285  5e-76  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.858211 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1734  Crp/FNR family transcriptional regulator  47.21 
 
 		 241 aa  237  1e-61  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.79675  hitchhiker  0.000773544 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1000  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  48.02 
 
 		 250 aa  218  7e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.523077  normal  0.289991 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2400  CRP/FNR family transcriptional regulator  50.73 
 
 		 250 aa  216  2.9999999999999998e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0375093 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3844  cyclic nucleotide-binding protein  45.8 
 
 		 242 aa  214  8e-55  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1153  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  47.14 
 
 		 250 aa  214  8e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5989  transcriptional regulator CRP family  44.17 
 
 		 257 aa  208  8e-53  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2934  cyclic nucleotide-binding protein  47.28 
 
 		 249 aa  204  2e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1275  Crp/Fnr family transcriptional regulator  46.86 
 
 		 249 aa  202  4e-51  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2705  cyclic nucleotide-binding protein  46.03 
 
 		 249 aa  199  3.9999999999999996e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1787  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  44.54 
 
 		 263 aa  196  4.0000000000000005e-49  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3568  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  41.42 
 
 		 242 aa  191  9e-48  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0490  CRP/FNR family transcriptional regulator  43.61 
 
 		 256 aa  165  5e-40  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3486  putative signal transduction histidine kinase  36.49 
 
 		 243 aa  132  3.9999999999999996e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.173486 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0604  cyclic nucleotide-binding protein  33.48 
 
 		 246 aa  132  5e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1953  Crp/FNR family transcriptional regulator  33.48 
 
 		 246 aa  132  5e-30  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3616  Crp/FNR family transcriptional regulator  34.68 
 
 		 243 aa  128  9.000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1862  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30.53 
 
 		 250 aa  122  4e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0720375  normal  0.182435 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6209  Crp/FNR family transcriptional regulator  33.49 
 
 		 247 aa  122  8e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0102902  normal  0.673418 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4564  Crp/FNR family transcriptional regulator  36.51 
 
 		 257 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00106309 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5361  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  33.03 
 
 		 299 aa  115  6.9999999999999995e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4497  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30.6 
 
 		 255 aa  115  6.9999999999999995e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0140276  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3167  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  38.46 
 
 		 307 aa  115  7.999999999999999e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4876  cyclic nucleotide-binding  33.03 
 
 		 317 aa  115  7.999999999999999e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.155933  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3758  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  35.45 
 
 		 247 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1986  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  32.39 
 
 		 259 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2886  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  32 
 
 		 244 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.473656  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0196  Crp/FNR family transcriptional regulator  32.31 
 
 		 253 aa  113  3e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0367027  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7477  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  33.67 
 
 		 246 aa  113  3e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.403111  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1854  CRP/FNR family transcriptional regulator  29.02 
 
 		 250 aa  113  3e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.191124  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3865  Crp/FNR family transcriptional regulator  31.19 
 
 		 252 aa  112  8.000000000000001e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.925805  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2024  cyclic nucleotide-binding  32.39 
 
 		 259 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.996332 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5417  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30.33 
 
 		 298 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.36754  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0189  Crp/FNR family transcriptional regulator  31.44 
 
 		 235 aa  111  1.0000000000000001e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.338052  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2301  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  32.39 
 
 		 259 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.161686 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0422  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  32.47 
 
 		 246 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2763  cyclic nucleotide-binding  30.41 
 
 		 244 aa  109  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.746131  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2990  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30.41 
 
 		 244 aa  109  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0060  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30.63 
 
 		 384 aa  109  5e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3862  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  31.88 
 
 		 249 aa  107  2e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.582037  normal  0.123136 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3480  cyclic nucleotide-binding  32.14 
 
 		 249 aa  107  2e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3788  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  32.14 
 
 		 249 aa  107  2e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.371562 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7493  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  31.63 
 
 		 246 aa  106  5e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0266  CRP/FNR family transcriptional regulator  31.88 
 
 		 253 aa  105  5e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0073  cyclic nucleotide-binding  30.4 
 
 		 255 aa  105  6e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0946  Crp/FNR family transcriptional regulator  32 
 
 		 253 aa  105  7e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.336903  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3385  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.73 
 
 		 384 aa  105  8e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0133  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  31.03 
 
 		 268 aa  105  1e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.564261  normal  0.0379159 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0983  Crp/FNR family transcriptional regulator  29.13 
 
 		 245 aa  104  1e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0783  cyclic nucleotide-binding  30.52 
 
 		 376 aa  104  1e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0359827  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2207  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  31.42 
 
 		 260 aa  103  2e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.363509  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0772  cyclic nucleotide-binding  30.8 
 
 		 254 aa  103  2e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1631  CRP/FNR family transcriptional regulator  30.81 
 
 		 310 aa  103  3e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4036  Crp/FNR family transcriptional regulator  37.24 
 
 		 315 aa  103  4e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1945  Crp/FNR family transcriptional regulator  31.53 
 
 		 242 aa  102  5e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4270  CRP/FNR family transcriptional regulator  33.14 
 
 		 225 aa  102  6e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0893417 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2944  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  31.19 
 
 		 246 aa  102  7e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0738845  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3322  Crp/FNR family transcriptional regulator  31.8 
 
 		 262 aa  102  8e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0702622  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1230  Crp/FNR family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 263 aa  102  9e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.583862  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3389  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  31.5 
 
 		 248 aa  101  1e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1991  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30.88 
 
 		 249 aa  101  1e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.250977  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2433  Crp/FNR family transcriptional regulator  32.31 
 
 		 247 aa  101  1e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.168738  normal  0.817452 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5746  Crp/FNR family transcriptional regulator  28.51 
 
 		 237 aa  101  1e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.765257  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6403  Crp/FNR family transcriptional regulator  32 
 
 		 246 aa  100  2e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5030  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30.3 
 
 		 238 aa  100  2e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3926  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30.3 
 
 		 238 aa  100  2e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6132  Crp/FNR family transcriptional regulator  31.6 
 
 		 245 aa  100  3e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0884478  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2686  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  31.19 
 
 		 239 aa  100  3e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.038663  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6249  Crp/FNR family transcriptional regulator  34.03 
 
 		 281 aa  100  3e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.999867 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1439  Crp/FNR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 243 aa  99.8  4e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000118444 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1441  Crp/FNR family transcriptional regulator  30.04 
 
 		 259 aa  98.6  9e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00010652 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1359  Crp/FNR family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 236 aa  98.2  1e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.342582  normal  0.0135439 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3367  CRP/FNR family transcriptional regulator  30.7 
 
 		 252 aa  97.8  1e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.184948  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2367  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  31.53 
 
 		 255 aa  94.7  1e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0615204  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0859  CRP/FNR family transcriptional regulator  32.12 
 
 		 234 aa  94.7  1e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0477074 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0447  transcriptional regulator  34.43 
 
 		 262 aa  95.1  1e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  decreased coverage  0.00494896  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1302  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  31.88 
 
 		 254 aa  95.1  1e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0109091  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0414  Crp/FNR family transcriptional regulator  31.02 
 
 		 252 aa  94  2e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.766284  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0357  Crp/FNR family transcriptional regulator  31.02 
 
 		 252 aa  94  2e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1485  cyclic nucleotide-binding protein  29.15 
 
 		 244 aa  93.6  3e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1357  cyclic nucleotide-binding  30.7 
 
 		 250 aa  93.6  3e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.395788 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1377  Crp/FNR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 239 aa  92.8  4e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4039  Crp/FNR family transcriptional regulator  30.09 
 
 		 239 aa  92.8  5e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.70749  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1258  Crp/FNR family transcriptional regulator  29.11 
 
 		 241 aa  92.8  5e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0532  CRP/FNR family transcriptional regulator  27.35 
 
 		 248 aa  92.4  6e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.283437 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1357  Crp/Fnr family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 239 aa  92.4  6e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1557  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30.26 
 
 		 250 aa  92.4  6e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00717235  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0654  Crp/FNR family transcriptional regulator  29.54 
 
 		 248 aa  92.4  7e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.48838  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0698  Crp-Fnr regulatory protein (FnrL)  28.37 
 
 		 248 aa  92.4  7e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2353  CRP/FNR family transcriptional regulator  28.37 
 
 		 248 aa  92.4  7e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.689366  normal  0.139893 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2772  Crp/FNR family transcriptional regulator  28.63 
 
 		 245 aa  92  9e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00275745 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4713  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.02 
 
 		 239 aa  91.3  2e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.557049  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0647  nitrogen fixation regulation protein fixk  29.54 
 
 		 251 aa  90.1  3e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.774151  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0917  CRP/FNR family transcriptional regulator  28.09 
 
 		 254 aa  89.7  4e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2575  Crp/FNR family transcriptional regulator  31.47 
 
 		 240 aa  89.7  4e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2581  Crp/FNR family transcriptional regulator  32.95 
 
 		 222 aa  89.4  5e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6927  Crp/FNR family transcriptional regulator  31.63 
 
 		 227 aa  89  7e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.422372 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>