More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_0698 on replicon NC_007493
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007493  RSP_0698  Crp-Fnr regulatory protein (FnrL)  100 
 
 		 248 aa  506  9.999999999999999e-143  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2353  CRP/FNR family transcriptional regulator  100 
 
 		 248 aa  506  9.999999999999999e-143  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.689366  normal  0.139893 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0532  CRP/FNR family transcriptional regulator  95.97 
 
 		 248 aa  491  9.999999999999999e-139  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.283437 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2547  Crp/FNR family transcriptional regulator  75.2 
 
 		 246 aa  392  1e-108  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.389339  normal  0.365128 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0660  transcriptional regulator  72.53 
 
 		 249 aa  367  1e-101  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3858  Crp/FNR family transcriptional regulator  69.66 
 
 		 248 aa  352  4e-96  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1850  CRP/FNR family transcriptional regulator  71.63 
 
 		 211 aa  312  2.9999999999999996e-84  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2581  Crp/FNR family transcriptional regulator  44.3 
 
 		 231 aa  194  1e-48  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.658135  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1678  Crp/FNR family transcriptional regulator  42.73 
 
 		 230 aa  194  1e-48  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.330352  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2026  transcriptional activator Crp family  42.44 
 
 		 241 aa  189  2.9999999999999997e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1945  Crp/FNR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 242 aa  179  4.999999999999999e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2118  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  41.89 
 
 		 240 aa  178  5.999999999999999e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00291012 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2360  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  42.22 
 
 		 240 aa  176  4e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.948966  hitchhiker  0.00636029 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1742  CRP/FNR family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 242 aa  169  4e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.275504  normal  0.265558 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2061  Crp family transcriptional regulator  38.3 
 
 		 241 aa  167  1e-40  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  hitchhiker  0.00300081  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1258  Crp/FNR family transcriptional regulator  37 
 
 		 241 aa  160  2e-38  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5746  Crp/FNR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 237 aa  144  2e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.765257  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0946  Crp/FNR family transcriptional regulator  38.22 
 
 		 253 aa  138  1e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.336903  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5030  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  38.65 
 
 		 238 aa  137  2e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3926  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  38.65 
 
 		 238 aa  137  2e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1377  Crp/FNR family transcriptional regulator  35.4 
 
 		 239 aa  134  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1357  Crp/Fnr family transcriptional regulator  35.4 
 
 		 239 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2279  Crp/FNR family transcriptional regulator  33.18 
 
 		 258 aa  132  3.9999999999999996e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0422  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  35.96 
 
 		 246 aa  132  5e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1302  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  39.71 
 
 		 254 aa  130  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0109091  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2572  crpK, Fnr-type transcriptional regulator  35.08 
 
 		 263 aa  131  1.0000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1230  CRP/FNR family transcriptional regulator  35.08 
 
 		 263 aa  131  1.0000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1357  cyclic nucleotide-binding  38.6 
 
 		 250 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.395788 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2634  CRP/FNR family transcriptional regulator  34.05 
 
 		 249 aa  130  2.0000000000000002e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0654  Crp/FNR family transcriptional regulator  34.91 
 
 		 248 aa  130  3e-29  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.48838  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1557  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  38.6 
 
 		 250 aa  129  3e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00717235  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1951  CRP/FNR family transcriptional regulator  33.5 
 
 		 263 aa  129  6e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0647  nitrogen fixation regulation protein fixk  33.33 
 
 		 251 aa  129  6e-29  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.774151  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4039  Crp/FNR family transcriptional regulator  33.62 
 
 		 239 aa  127  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.70749  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1631  CRP/FNR family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 310 aa  125  7e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4713  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  32.58 
 
 		 239 aa  122  7e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.557049  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6132  Crp/FNR family transcriptional regulator  34.07 
 
 		 245 aa  119  4.9999999999999996e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0884478  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1984  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  33.33 
 
 		 250 aa  115  7.999999999999999e-25  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.312779  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3322  Crp/FNR family transcriptional regulator  31.67 
 
 		 262 aa  112  6e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0702622  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1752  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  34.62 
 
 		 250 aa  111  9e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.103124 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1464  transcriptional activator Anr  31.36 
 
 		 244 aa  109  4.0000000000000004e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5386  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  34.81 
 
 		 230 aa  108  8.000000000000001e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.662421  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2775  Crp/FNR family transcriptional regulator  24.68 
 
 		 232 aa  106  4e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.9012  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2581  Crp/FNR family transcriptional regulator  31.55 
 
 		 222 aa  105  7e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2039  CRP/FNR family transcriptional regulator  32.45 
 
 		 242 aa  103  3e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.191538  hitchhiker  0.00387918 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6164  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  32.87 
 
 		 247 aa  102  6e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.257657  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3505  regulatory protein Crp  33.33 
 
 		 229 aa  102  7e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.021842  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3812  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  33.33 
 
 		 229 aa  102  7e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0629  transcriptional regulator FixK  33.33 
 
 		 215 aa  102  7e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.595222  normal  0.236212 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1361  transcriptional regulator FixK  33.7 
 
 		 229 aa  102  8e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0646149  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0408  Crp/FNR family transcriptional regulator  35.5 
 
 		 230 aa  100  2e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3277  Crp/FNR family transcriptional regulator  31.16 
 
 		 226 aa  100  3e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4055  transcriptional regulator FixK  32.98 
 
 		 229 aa  99.4  4e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2975  Crp/FNR family transcriptional regulator  31.68 
 
 		 220 aa  99  6e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.169439  normal  0.307783 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1340  transcriptional regulator FixK  33.15 
 
 		 229 aa  99  6e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.324269  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4729  transcriptional regulator FixK  31.77 
 
 		 230 aa  99  6e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3889  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  35.29 
 
 		 229 aa  98.2  1e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.128439 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2786  transcriptional regulator FixK  32.29 
 
 		 229 aa  98.2  1e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0460697  normal  0.11454 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3788  transcriptional regulator Anr  30.38 
 
 		 244 aa  97.1  2e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.620164  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0870  transcriptional regulator FixK  31.55 
 
 		 227 aa  97.1  2e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4521  Crp/Fnr family transcriptional regulator  30.41 
 
 		 257 aa  97.4  2e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0161618  normal  0.0108643 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44490  transcriptional regulator Anr  30.38 
 
 		 244 aa  97.1  2e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.793348 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1036  transcriptional regulator FixK  31.28 
 
 		 231 aa  96.3  4e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2699  Crp/FNR family transcriptional regulator  28.06 
 
 		 232 aa  96.3  4e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.276502  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1993  fumarate/nitrate reduction transcriptional regulator  26.64 
 
 		 249 aa  95.9  5e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.238952  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4871  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  31.94 
 
 		 228 aa  95.9  5e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2222  fumarate/nitrate reduction transcriptional regulator  25.75 
 
 		 250 aa  95.9  6e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0665535  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6927  Crp/FNR family transcriptional regulator  35.06 
 
 		 227 aa  95.5  8e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.422372 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3610  hypothetical protein  30.33 
 
 		 231 aa  95.1  9e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4265  transcriptional regulator Anr  30.32 
 
 		 244 aa  94.7  1e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.880812  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3425  cyclic nucleotide-binding: regulatory protein, Crp  29.86 
 
 		 244 aa  94.7  1e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0533041 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1603  CRP/FNR family transcriptional regulator  30.32 
 
 		 244 aa  94.7  1e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.138297 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6270  transcriptional regulator FixK  33.84 
 
 		 211 aa  95.1  1e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.967473  normal  0.128199 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3830  Crp/FNR family transcriptional regulator  30.32 
 
 		 244 aa  94.7  1e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.525453 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1853  fumarate/nitrate reduction transcriptional regulator  28.7 
 
 		 250 aa  94.4  1e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.755428 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6107  Crp/FNR family transcriptional regulator  33.7 
 
 		 227 aa  94.4  1e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0266042 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3583  Crp/FNR family transcriptional regulator  30.32 
 
 		 244 aa  94.7  1e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1356  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.27 
 
 		 256 aa  94.7  1e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.0588975 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1864  fumarate/nitrate reduction transcriptional regulator  27.59 
 
 		 250 aa  94  2e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.856056  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1991  transcriptional activator Anr  28.96 
 
 		 244 aa  94  2e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.695719  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1147  cyclic nucleotide-binding: regulatory protein, Crp  26.87 
 
 		 261 aa  94  2e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1217  cyclic nucleotide-binding: regulatory protein, Crp  26.87 
 
 		 261 aa  94  2e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1811  Crp/FNR family transcriptional regulator  30.18 
 
 		 244 aa  94  2e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2233  CRP/FNR family transcriptional regulator  26.56 
 
 		 253 aa  93.6  2e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0375344  normal  0.791743 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2311  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.59 
 
 		 250 aa  93.2  3e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.144598  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1788  fumarate/nitrate reduction transcriptional regulator  27.59 
 
 		 250 aa  93.2  3e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.765276  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0576  CRP/FNR family transcriptional regulator  31.31 
 
 		 235 aa  93.2  3e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.670039  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1951  transcriptional regulator FixK  32.31 
 
 		 231 aa  93.6  3e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2105  fumarate/nitrate reduction transcriptional regulator  28.02 
 
 		 248 aa  93.6  3e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0944449  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0778  Crp/FNR family transcriptional regulator  25.22 
 
 		 236 aa  93.2  3e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000312841  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1575  fumarate/nitrate reduction transcriptional regulator  27.59 
 
 		 250 aa  93.2  3e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0754  Crp/FNR family transcriptional regulator  24.34 
 
 		 236 aa  93.6  3e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.0000212493  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0757  Crp/FNR family transcriptional regulator  26.2 
 
 		 236 aa  93.6  3e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0100726  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1981  fumarate/nitrate reduction transcriptional regulator  27.59 
 
 		 250 aa  93.6  3e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.320226 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1450  fumarate/nitrate reduction transcriptional regulator  27.59 
 
 		 250 aa  93.2  3e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1546  fumarate/nitrate reduction transcriptional regulator  27.59 
 
 		 250 aa  93.2  3e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2398  fumarate/nitrate reduction transcriptional regulator  28.02 
 
 		 248 aa  93.6  3e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2291  fumarate/nitrate reduction transcriptional regulator  27.59 
 
 		 250 aa  93.2  3e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1491  fumarate/nitrate reduction transcriptional regulator  28.24 
 
 		 250 aa  92.8  4e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0202312  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1783  fumarate/nitrate reduction transcriptional regulator  28.24 
 
 		 250 aa  92.8  4e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.251439 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>