More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_7493 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_7493  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  100 
 
 		 246 aa  508  1e-143  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7477  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  92.28 
 
 		 246 aa  476  1e-133  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.403111  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6403  Crp/FNR family transcriptional regulator  63.01 
 
 		 246 aa  338  2.9999999999999998e-92  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3758  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  61.98 
 
 		 247 aa  312  1.9999999999999998e-84  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6209  Crp/FNR family transcriptional regulator  58.85 
 
 		 247 aa  300  1e-80  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0102902  normal  0.673418 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4270  CRP/FNR family transcriptional regulator  57.59 
 
 		 225 aa  281  8.000000000000001e-75  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0893417 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2763  cyclic nucleotide-binding  53.11 
 
 		 244 aa  274  1.0000000000000001e-72  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.746131  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2990  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  53.11 
 
 		 244 aa  273  1.0000000000000001e-72  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2886  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  53.31 
 
 		 244 aa  272  4.0000000000000004e-72  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.473656  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4497  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  54.13 
 
 		 255 aa  268  5e-71  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0140276  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4564  Crp/FNR family transcriptional regulator  52.07 
 
 		 257 aa  260  1e-68  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00106309 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1439  Crp/FNR family transcriptional regulator  49.38 
 
 		 243 aa  225  4e-58  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000118444 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1359  Crp/FNR family transcriptional regulator  46.35 
 
 		 236 aa  216  2.9999999999999998e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.342582  normal  0.0135439 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0073  cyclic nucleotide-binding  44.64 
 
 		 255 aa  212  4.9999999999999996e-54  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2367  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  44.92 
 
 		 255 aa  208  6e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0615204  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3385  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  44.12 
 
 		 384 aa  207  1e-52  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0783  cyclic nucleotide-binding  43.7 
 
 		 376 aa  206  2e-52  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0359827  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1986  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  43.78 
 
 		 259 aa  204  1e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0060  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  42.86 
 
 		 384 aa  202  3e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2024  cyclic nucleotide-binding  42.8 
 
 		 259 aa  201  7e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.996332 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2301  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  42.8 
 
 		 259 aa  201  7e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.161686 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2433  Crp/FNR family transcriptional regulator  42.02 
 
 		 247 aa  197  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.168738  normal  0.817452 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3167  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  44.21 
 
 		 307 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0133  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  42.24 
 
 		 268 aa  194  8.000000000000001e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.564261  normal  0.0379159 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3862  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  43.97 
 
 		 249 aa  193  3e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.582037  normal  0.123136 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1441  Crp/FNR family transcriptional regulator  39.92 
 
 		 259 aa  186  4e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00010652 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3389  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  37.29 
 
 		 248 aa  179  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4036  Crp/FNR family transcriptional regulator  41.63 
 
 		 315 aa  179  4e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2447  cyclic nucleotide-binding protein  41.03 
 
 		 255 aa  178  5.999999999999999e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3480  cyclic nucleotide-binding  42.02 
 
 		 249 aa  178  8e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3788  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  42.02 
 
 		 249 aa  177  1e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.371562 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2944  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  39.29 
 
 		 246 aa  175  6e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0738845  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1991  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  40.85 
 
 		 249 aa  174  9e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.250977  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2950  Crp/FNR family transcriptional regulator  38.72 
 
 		 250 aa  174  9.999999999999999e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.908761  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0772  cyclic nucleotide-binding  40.52 
 
 		 254 aa  174  9.999999999999999e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2686  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  39.73 
 
 		 239 aa  172  3.9999999999999995e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.038663  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5417  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  38.36 
 
 		 298 aa  168  7e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.36754  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5361  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  38.36 
 
 		 299 aa  167  1e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3832  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  37.18 
 
 		 245 aa  166  2e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1485  cyclic nucleotide-binding protein  41.09 
 
 		 244 aa  167  2e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4876  cyclic nucleotide-binding  38.36 
 
 		 317 aa  167  2e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.155933  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6130  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  39.39 
 
 		 244 aa  165  6.9999999999999995e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4786  cyclic nucleotide-binding protein  37.12 
 
 		 243 aa  162  4.0000000000000004e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1835  cyclic nucleotide-binding protein  41.48 
 
 		 281 aa  161  8.000000000000001e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011893  Mnod_8765  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  38.1 
 
 		 244 aa  158  6e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.474033  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3616  Crp/FNR family transcriptional regulator  37.55 
 
 		 243 aa  154  1e-36  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0953  CRP/FNR family transcriptional regulator  37.55 
 
 		 254 aa  154  1e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0604  cyclic nucleotide-binding protein  36.64 
 
 		 246 aa  153  2e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1953  Crp/FNR family transcriptional regulator  36.21 
 
 		 246 aa  152  5e-36  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1230  Crp/FNR family transcriptional regulator  38.43 
 
 		 263 aa  151  8e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.583862  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3486  putative signal transduction histidine kinase  36.71 
 
 		 243 aa  151  1e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.173486 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0859  CRP/FNR family transcriptional regulator  36.49 
 
 		 234 aa  147  1.0000000000000001e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0477074 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6249  Crp/FNR family transcriptional regulator  34.93 
 
 		 281 aa  144  9e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.999867 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3741  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  37.75 
 
 		 242 aa  143  2e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1427  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  37.66 
 
 		 267 aa  143  2e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3805  cyclic nucleotide-binding  34.58 
 
 		 263 aa  142  4e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6056  Crp/FNR family transcriptional regulator  33.77 
 
 		 241 aa  142  6e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2391  CRP/FNR family transcriptional regulator  32.91 
 
 		 274 aa  138  6e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1184  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  36.8 
 
 		 243 aa  138  7.999999999999999e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4068  Crp/FNR family transcriptional regulator  34.63 
 
 		 247 aa  137  1e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.936766  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0955  CRP/FNR family transcriptional regulator  34.07 
 
 		 226 aa  134  9.999999999999999e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.869769  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2609  Crp/FNR family transcriptional regulator  34.85 
 
 		 293 aa  131  9e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.325512  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5597  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  34.62 
 
 		 246 aa  122  6e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0675352  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3499  CRP/FNR family transcriptional regulator  31.85 
 
 		 286 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.519814  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2400  CRP/FNR family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 250 aa  117  1.9999999999999998e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0375093 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2108  CRP/FNR family transcriptional regulator  31.49 
 
 		 243 aa  117  1.9999999999999998e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.819689  normal  0.0771917 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0532  cyclic nucleotide-binding protein  32.29 
 
 		 276 aa  117  1.9999999999999998e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.053126  normal  0.207643 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0997  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  35.14 
 
 		 230 aa  113  3e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0490  CRP/FNR family transcriptional regulator  40.24 
 
 		 256 aa  112  5e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1787  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  31.25 
 
 		 263 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1000  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  31.82 
 
 		 250 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.523077  normal  0.289991 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2934  cyclic nucleotide-binding protein  31.46 
 
 		 249 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1275  Crp/Fnr family transcriptional regulator  31.46 
 
 		 249 aa  109  4.0000000000000004e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0414  Crp/FNR family transcriptional regulator  29.22 
 
 		 252 aa  109  5e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.766284  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0357  Crp/FNR family transcriptional regulator  29.22 
 
 		 252 aa  109  5e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5989  transcriptional regulator CRP family  33.68 
 
 		 257 aa  109  5e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3367  CRP/FNR family transcriptional regulator  30.58 
 
 		 252 aa  109  5e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.184948  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1862  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30.43 
 
 		 250 aa  108  6e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0720375  normal  0.182435 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3844  cyclic nucleotide-binding protein  31.19 
 
 		 242 aa  108  7.000000000000001e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1854  CRP/FNR family transcriptional regulator  28.22 
 
 		 250 aa  108  9.000000000000001e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.191124  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1734  Crp/FNR family transcriptional regulator  27.93 
 
 		 241 aa  108  1e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.79675  hitchhiker  0.000773544 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2705  cyclic nucleotide-binding protein  34.07 
 
 		 249 aa  107  2e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1153  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30.91 
 
 		 250 aa  107  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4040  Crp/FNR family transcriptional regulator  29.65 
 
 		 256 aa  107  2e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.858211 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2201  transcriptional regulator  31.63 
 
 		 262 aa  106  4e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.586423 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0983  Crp/FNR family transcriptional regulator  28.76 
 
 		 245 aa  103  2e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3568  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  28.64 
 
 		 242 aa  101  1e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2575  Crp/FNR family transcriptional regulator  31.22 
 
 		 240 aa  99.8  4e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0447  transcriptional regulator  32.69 
 
 		 262 aa  93.6  3e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  decreased coverage  0.00494896  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3865  Crp/FNR family transcriptional regulator  34.83 
 
 		 252 aa  92.8  5e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.925805  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0189  Crp/FNR family transcriptional regulator  29.81 
 
 		 235 aa  92  7e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.338052  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0266  CRP/FNR family transcriptional regulator  29.47 
 
 		 253 aa  91.7  1e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0196  Crp/FNR family transcriptional regulator  29.81 
 
 		 253 aa  90.9  2e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0367027  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5658  cyclic nucleotide-binding protein  27.19 
 
 		 245 aa  89.4  5e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3858  Crp/FNR family transcriptional regulator  29.85 
 
 		 248 aa  87  3e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4822  cyclic nucleotide-binding protein  30.77 
 
 		 243 aa  85.5  6e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.379105  normal  0.123433 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0660  transcriptional regulator  30.96 
 
 		 249 aa  83.6  0.000000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09760  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.11 
 
 		 226 aa  82  0.000000000000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0698  Crp-Fnr regulatory protein (FnrL)  27.23 
 
 		 248 aa  79.3  0.00000000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2353  CRP/FNR family transcriptional regulator  27.23 
 
 		 248 aa  79.3  0.00000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.689366  normal  0.139893 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>