More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_4564 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_4564  Crp/FNR family transcriptional regulator  100 
 
 		 257 aa  521  1e-147  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00106309 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4497  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  82.52 
 
 		 255 aa  406  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0140276  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3758  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  54.88 
 
 		 247 aa  282  4.0000000000000003e-75  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6209  Crp/FNR family transcriptional regulator  52.85 
 
 		 247 aa  278  7e-74  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0102902  normal  0.673418 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7477  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  53.72 
 
 		 246 aa  275  6e-73  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.403111  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2763  cyclic nucleotide-binding  54.32 
 
 		 244 aa  271  9e-72  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.746131  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2990  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  54.32 
 
 		 244 aa  271  1e-71  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2886  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  55.46 
 
 		 244 aa  269  4e-71  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.473656  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7493  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  52.07 
 
 		 246 aa  266  2.9999999999999995e-70  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4270  CRP/FNR family transcriptional regulator  54.67 
 
 		 225 aa  258  5.0000000000000005e-68  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0893417 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6403  Crp/FNR family transcriptional regulator  51.24 
 
 		 246 aa  257  1e-67  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1439  Crp/FNR family transcriptional regulator  52.34 
 
 		 243 aa  233  3e-60  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000118444 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2367  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  46.41 
 
 		 255 aa  215  5e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0615204  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1359  Crp/FNR family transcriptional regulator  46.19 
 
 		 236 aa  210  2e-53  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.342582  normal  0.0135439 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3167  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  47.22 
 
 		 307 aa  207  1e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0073  cyclic nucleotide-binding  45.49 
 
 		 255 aa  200  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0060  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  46.32 
 
 		 384 aa  200  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4036  Crp/FNR family transcriptional regulator  45.85 
 
 		 315 aa  196  3e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3385  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  45.02 
 
 		 384 aa  194  9e-49  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0783  cyclic nucleotide-binding  44.02 
 
 		 376 aa  192  6e-48  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0359827  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0133  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  43.82 
 
 		 268 aa  191  7e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.564261  normal  0.0379159 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3862  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  45.22 
 
 		 249 aa  188  5.999999999999999e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.582037  normal  0.123136 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3389  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  40.52 
 
 		 248 aa  185  6e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3480  cyclic nucleotide-binding  44.78 
 
 		 249 aa  184  9e-46  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3788  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  44.78 
 
 		 249 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.371562 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2950  Crp/FNR family transcriptional regulator  41.63 
 
 		 250 aa  181  1e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.908761  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2433  Crp/FNR family transcriptional regulator  42.13 
 
 		 247 aa  180  2e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.168738  normal  0.817452 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1991  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  40.85 
 
 		 249 aa  177  2e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.250977  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5361  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  42.17 
 
 		 299 aa  176  5e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1986  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  41.03 
 
 		 259 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4876  cyclic nucleotide-binding  41.74 
 
 		 317 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.155933  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2301  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  41.63 
 
 		 259 aa  173  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.161686 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2024  cyclic nucleotide-binding  41.63 
 
 		 259 aa  173  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.996332 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5417  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  43.35 
 
 		 298 aa  172  3.9999999999999995e-42  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.36754  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2447  cyclic nucleotide-binding protein  41.53 
 
 		 255 aa  171  1e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4786  cyclic nucleotide-binding protein  38.56 
 
 		 243 aa  161  1e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1441  Crp/FNR family transcriptional regulator  39.9 
 
 		 259 aa  161  1e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00010652 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2944  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  40.28 
 
 		 246 aa  160  1e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0738845  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3832  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  37.61 
 
 		 245 aa  160  2e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2686  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  38.94 
 
 		 239 aa  158  7e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.038663  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1485  cyclic nucleotide-binding protein  37.29 
 
 		 244 aa  155  9e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6130  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  37.77 
 
 		 244 aa  154  2e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6249  Crp/FNR family transcriptional regulator  40.68 
 
 		 281 aa  153  2e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.999867 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0772  cyclic nucleotide-binding  37.93 
 
 		 254 aa  152  5.9999999999999996e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1835  cyclic nucleotide-binding protein  39.83 
 
 		 281 aa  149  3e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011893  Mnod_8765  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  36.91 
 
 		 244 aa  149  5e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.474033  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1427  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  36.36 
 
 		 267 aa  144  9e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1230  Crp/FNR family transcriptional regulator  38.86 
 
 		 263 aa  143  2e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.583862  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2609  Crp/FNR family transcriptional regulator  37.75 
 
 		 293 aa  138  7e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.325512  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0859  CRP/FNR family transcriptional regulator  37.75 
 
 		 234 aa  137  2e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0477074 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0953  CRP/FNR family transcriptional regulator  37.07 
 
 		 254 aa  134  9.999999999999999e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4068  Crp/FNR family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 247 aa  133  3e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.936766  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3486  putative signal transduction histidine kinase  35.37 
 
 		 243 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.173486 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3616  Crp/FNR family transcriptional regulator  34.06 
 
 		 243 aa  129  4.0000000000000003e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3741  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  37.21 
 
 		 242 aa  129  5.0000000000000004e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0604  cyclic nucleotide-binding protein  35.17 
 
 		 246 aa  129  5.0000000000000004e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1953  Crp/FNR family transcriptional regulator  34.71 
 
 		 246 aa  129  6e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1734  Crp/FNR family transcriptional regulator  33.19 
 
 		 241 aa  129  6e-29  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.79675  hitchhiker  0.000773544 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2400  CRP/FNR family transcriptional regulator  35.52 
 
 		 250 aa  127  2.0000000000000002e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0375093 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1184  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  35.19 
 
 		 243 aa  127  3e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3805  cyclic nucleotide-binding  34.43 
 
 		 263 aa  126  3e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1000  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  37.56 
 
 		 250 aa  125  5e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.523077  normal  0.289991 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2201  transcriptional regulator  34.22 
 
 		 262 aa  124  2e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.586423 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1153  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  36.59 
 
 		 250 aa  123  3e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5989  transcriptional regulator CRP family  36.63 
 
 		 257 aa  121  9.999999999999999e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6056  Crp/FNR family transcriptional regulator  31.6 
 
 		 241 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0532  cyclic nucleotide-binding protein  33.03 
 
 		 276 aa  117  1.9999999999999998e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.053126  normal  0.207643 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4040  Crp/FNR family transcriptional regulator  35.42 
 
 		 256 aa  116  3.9999999999999997e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.858211 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1787  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  34.31 
 
 		 263 aa  115  6e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0997  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  34.88 
 
 		 230 aa  115  8.999999999999998e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3844  cyclic nucleotide-binding protein  33.48 
 
 		 242 aa  114  1.0000000000000001e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0414  Crp/FNR family transcriptional regulator  33.51 
 
 		 252 aa  111  1.0000000000000001e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.766284  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0357  Crp/FNR family transcriptional regulator  33.51 
 
 		 252 aa  111  1.0000000000000001e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5597  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  32.59 
 
 		 246 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0675352  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2391  CRP/FNR family transcriptional regulator  31.8 
 
 		 274 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0955  CRP/FNR family transcriptional regulator  32.13 
 
 		 226 aa  109  5e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.869769  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3499  CRP/FNR family transcriptional regulator  32.93 
 
 		 286 aa  107  2e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.519814  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0490  CRP/FNR family transcriptional regulator  35.41 
 
 		 256 aa  107  2e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3568  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  33.51 
 
 		 242 aa  107  2e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1862  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30.13 
 
 		 250 aa  106  3e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0720375  normal  0.182435 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3367  CRP/FNR family transcriptional regulator  33.51 
 
 		 252 aa  105  6e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.184948  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2934  cyclic nucleotide-binding protein  32.96 
 
 		 249 aa  100  3e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1275  Crp/Fnr family transcriptional regulator  32.4 
 
 		 249 aa  98.6  8e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2705  cyclic nucleotide-binding protein  31.84 
 
 		 249 aa  98.6  9e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2575  Crp/FNR family transcriptional regulator  33.76 
 
 		 240 aa  98.6  9e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2108  CRP/FNR family transcriptional regulator  32.46 
 
 		 243 aa  98.2  1e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.819689  normal  0.0771917 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5658  cyclic nucleotide-binding protein  30.42 
 
 		 245 aa  96.3  4e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0189  Crp/FNR family transcriptional regulator  30.95 
 
 		 235 aa  96.7  4e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.338052  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0196  Crp/FNR family transcriptional regulator  30.95 
 
 		 253 aa  94.7  1e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0367027  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1854  CRP/FNR family transcriptional regulator  28.51 
 
 		 250 aa  94  2e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.191124  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0983  Crp/FNR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 245 aa  90.5  2e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3865  Crp/FNR family transcriptional regulator  32.66 
 
 		 252 aa  91.3  2e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.925805  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0394  cyclic nucleotide-binding protein  30.73 
 
 		 236 aa  89.4  5e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0638348  normal  0.718832 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0447  transcriptional regulator  32.81 
 
 		 262 aa  88.2  1e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  decreased coverage  0.00494896  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2360  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30.61 
 
 		 240 aa  87.4  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.948966  hitchhiker  0.00636029 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0266  CRP/FNR family transcriptional regulator  29.27 
 
 		 253 aa  87  2e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1678  Crp/FNR family transcriptional regulator  28.63 
 
 		 230 aa  86.3  5e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.330352  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0660  transcriptional regulator  30.77 
 
 		 249 aa  84  0.000000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2118  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.59 
 
 		 240 aa  82.8  0.000000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00291012 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4822  cyclic nucleotide-binding protein  30.52 
 
 		 243 aa  80.5  0.00000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.379105  normal  0.123433 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>