More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_1230 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_1230  Crp/FNR family transcriptional regulator  100 
 
 		 263 aa  529  1e-149  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.583862  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6249  Crp/FNR family transcriptional regulator  71.21 
 
 		 281 aa  362  4e-99  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.999867 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5417  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  50.83 
 
 		 298 aa  216  2e-55  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.36754  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4876  cyclic nucleotide-binding  52.19 
 
 		 317 aa  216  2.9999999999999998e-55  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.155933  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5361  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  52.19 
 
 		 299 aa  216  4e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0073  cyclic nucleotide-binding  52.26 
 
 		 255 aa  213  2.9999999999999995e-54  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0783  cyclic nucleotide-binding  51.75 
 
 		 376 aa  206  3e-52  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0359827  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3385  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  50 
 
 		 384 aa  200  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0060  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  50.44 
 
 		 384 aa  197  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0133  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  45.61 
 
 		 268 aa  177  1e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.564261  normal  0.0379159 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3862  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  45.85 
 
 		 249 aa  176  3e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.582037  normal  0.123136 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0772  cyclic nucleotide-binding  43.86 
 
 		 254 aa  169  5e-41  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3788  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  42.86 
 
 		 249 aa  167  2e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.371562 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3480  cyclic nucleotide-binding  42.86 
 
 		 249 aa  167  2e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6209  Crp/FNR family transcriptional regulator  41.92 
 
 		 247 aa  163  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0102902  normal  0.673418 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2886  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  38.6 
 
 		 244 aa  160  2e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.473656  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1835  cyclic nucleotide-binding protein  42.54 
 
 		 281 aa  159  4e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7477  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  39.3 
 
 		 246 aa  156  4e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.403111  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2763  cyclic nucleotide-binding  37.72 
 
 		 244 aa  155  9e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.746131  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2990  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  37.72 
 
 		 244 aa  155  9e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3758  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  39.74 
 
 		 247 aa  154  1e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6130  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  37.89 
 
 		 244 aa  154  2e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1439  Crp/FNR family transcriptional regulator  39.91 
 
 		 243 aa  152  4e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000118444 
 
 
-
 
NC_011893  Mnod_8765  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  37.89 
 
 		 244 aa  152  5e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.474033  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7493  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  38.43 
 
 		 246 aa  151  8.999999999999999e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6403  Crp/FNR family transcriptional regulator  42.17 
 
 		 246 aa  150  2e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4497  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  40.17 
 
 		 255 aa  149  5e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0140276  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3389  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  36.59 
 
 		 248 aa  145  5e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1991  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  40 
 
 		 249 aa  145  9e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.250977  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4270  CRP/FNR family transcriptional regulator  39.41 
 
 		 225 aa  144  2e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0893417 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2301  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  40.45 
 
 		 259 aa  143  3e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.161686 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2024  cyclic nucleotide-binding  40.45 
 
 		 259 aa  143  3e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.996332 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1441  Crp/FNR family transcriptional regulator  41.48 
 
 		 259 aa  143  3e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00010652 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2433  Crp/FNR family transcriptional regulator  37.12 
 
 		 247 aa  141  9.999999999999999e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.168738  normal  0.817452 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1359  Crp/FNR family transcriptional regulator  40.61 
 
 		 236 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.342582  normal  0.0135439 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3167  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  36.89 
 
 		 307 aa  140  3e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4564  Crp/FNR family transcriptional regulator  40 
 
 		 257 aa  140  3e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00106309 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1986  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  38.64 
 
 		 259 aa  137  2e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2367  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  40.17 
 
 		 255 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0615204  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2950  Crp/FNR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 250 aa  136  4e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.908761  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1427  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  35.32 
 
 		 267 aa  127  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4036  Crp/FNR family transcriptional regulator  36.12 
 
 		 315 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2944  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  36.55 
 
 		 246 aa  124  2e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0738845  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0859  CRP/FNR family transcriptional regulator  38.07 
 
 		 234 aa  121  9.999999999999999e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0477074 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2686  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  35.65 
 
 		 239 aa  121  9.999999999999999e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.038663  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4786  cyclic nucleotide-binding protein  34.65 
 
 		 243 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1485  cyclic nucleotide-binding protein  34.52 
 
 		 244 aa  120  3e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3832  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  35.09 
 
 		 245 aa  119  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0604  cyclic nucleotide-binding protein  36.36 
 
 		 246 aa  119  3.9999999999999996e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2447  cyclic nucleotide-binding protein  36.48 
 
 		 255 aa  118  7.999999999999999e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1953  Crp/FNR family transcriptional regulator  35.93 
 
 		 246 aa  118  9e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3616  Crp/FNR family transcriptional regulator  35.47 
 
 		 243 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3741  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  35.32 
 
 		 242 aa  113  3e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3486  putative signal transduction histidine kinase  35.9 
 
 		 243 aa  112  6e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.173486 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0532  cyclic nucleotide-binding protein  30.67 
 
 		 276 aa  110  3e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.053126  normal  0.207643 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2609  Crp/FNR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 293 aa  109  5e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.325512  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0955  CRP/FNR family transcriptional regulator  34.4 
 
 		 226 aa  108  1e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.869769  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0953  CRP/FNR family transcriptional regulator  36.87 
 
 		 254 aa  107  3e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3499  CRP/FNR family transcriptional regulator  34.27 
 
 		 286 aa  104  2e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.519814  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0997  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30.32 
 
 		 230 aa  103  3e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5597  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  34.95 
 
 		 246 aa  102  5e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0675352  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2108  CRP/FNR family transcriptional regulator  36.23 
 
 		 243 aa  102  5e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.819689  normal  0.0771917 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2391  CRP/FNR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 274 aa  102  6e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4040  Crp/FNR family transcriptional regulator  28.33 
 
 		 256 aa  102  6e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.858211 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2201  transcriptional regulator  31.4 
 
 		 262 aa  102  9e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.586423 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4068  Crp/FNR family transcriptional regulator  30.13 
 
 		 247 aa  99  7e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.936766  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3805  cyclic nucleotide-binding  30.13 
 
 		 263 aa  97.4  2e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1184  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30.13 
 
 		 243 aa  97.8  2e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3844  cyclic nucleotide-binding protein  31.34 
 
 		 242 aa  96.3  4e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1275  Crp/Fnr family transcriptional regulator  31.31 
 
 		 249 aa  96.3  5e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6056  Crp/FNR family transcriptional regulator  28.89 
 
 		 241 aa  95.5  7e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2934  cyclic nucleotide-binding protein  30.92 
 
 		 249 aa  94.7  1e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1000  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30.37 
 
 		 250 aa  93.6  3e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.523077  normal  0.289991 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2705  cyclic nucleotide-binding protein  30.54 
 
 		 249 aa  92.8  5e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1787  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  28.77 
 
 		 263 aa  92.4  6e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1153  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.91 
 
 		 250 aa  91.7  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0266  CRP/FNR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 253 aa  90.5  2e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2575  Crp/FNR family transcriptional regulator  34.02 
 
 		 240 aa  90.5  3e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1734  Crp/FNR family transcriptional regulator  30.73 
 
 		 241 aa  89.4  5e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.79675  hitchhiker  0.000773544 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0189  Crp/FNR family transcriptional regulator  30.26 
 
 		 235 aa  89.4  5e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.338052  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2400  CRP/FNR family transcriptional regulator  32.57 
 
 		 250 aa  88.6  9e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0375093 
 
 
-
 
NC_004310  BR0196  Crp/FNR family transcriptional regulator  30.26 
 
 		 253 aa  87.8  2e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0367027  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0490  CRP/FNR family transcriptional regulator  35.22 
 
 		 256 aa  87.8  2e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5989  transcriptional regulator CRP family  32.81 
 
 		 257 aa  87.4  2e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3367  CRP/FNR family transcriptional regulator  29.65 
 
 		 252 aa  84.3  0.000000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.184948  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0414  Crp/FNR family transcriptional regulator  26.58 
 
 		 252 aa  82  0.000000000000008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.766284  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0357  Crp/FNR family transcriptional regulator  26.58 
 
 		 252 aa  82  0.000000000000008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0660  transcriptional regulator  30.28 
 
 		 249 aa  81.3  0.00000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0447  transcriptional regulator  28.96 
 
 		 262 aa  78.6  0.0000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  decreased coverage  0.00494896  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3865  Crp/FNR family transcriptional regulator  31.29 
 
 		 252 aa  77.8  0.0000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.925805  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4822  cyclic nucleotide-binding protein  27.52 
 
 		 243 aa  77  0.0000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.379105  normal  0.123433 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0983  Crp/FNR family transcriptional regulator  26.98 
 
 		 245 aa  75.5  0.0000000000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0532  CRP/FNR family transcriptional regulator  32.97 
 
 		 248 aa  75.5  0.0000000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.283437 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0698  Crp-Fnr regulatory protein (FnrL)  31.66 
 
 		 248 aa  74.7  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2353  CRP/FNR family transcriptional regulator  31.66 
 
 		 248 aa  74.7  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.689366  normal  0.139893 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1854  CRP/FNR family transcriptional regulator  25.86 
 
 		 250 aa  73.6  0.000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.191124  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3927  Crp/FNR family transcriptional regulator  30.26 
 
 		 242 aa  73.2  0.000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.729399  hitchhiker  0.00211875 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0749  Crp/FNR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 242 aa  72  0.000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.887641  normal  0.079497 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0394  cyclic nucleotide-binding protein  26.67 
 
 		 236 aa  71.6  0.00000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0638348  normal  0.718832 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2699  Crp/FNR family transcriptional regulator  28.39 
 
 		 232 aa  70.5  0.00000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.276502  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>