More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_6209 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_6209  Crp/FNR family transcriptional regulator  100 
 
 		 247 aa  502  1e-141  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0102902  normal  0.673418 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3758  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  80.49 
 
 		 247 aa  412  1e-114  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6403  Crp/FNR family transcriptional regulator  61.98 
 
 		 246 aa  308  5e-83  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2886  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  58.37 
 
 		 244 aa  308  5.9999999999999995e-83  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.473656  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7493  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  58.85 
 
 		 246 aa  300  1e-80  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7477  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  58.26 
 
 		 246 aa  299  2e-80  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.403111  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4270  CRP/FNR family transcriptional regulator  60.27 
 
 		 225 aa  298  5e-80  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0893417 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2990  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  58.05 
 
 		 244 aa  296  2e-79  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2763  cyclic nucleotide-binding  58.05 
 
 		 244 aa  296  3e-79  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.746131  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4497  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  55.87 
 
 		 255 aa  286  2e-76  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0140276  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4564  Crp/FNR family transcriptional regulator  52.85 
 
 		 257 aa  270  2e-71  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00106309 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1439  Crp/FNR family transcriptional regulator  48.09 
 
 		 243 aa  230  2e-59  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000118444 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0060  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  50.22 
 
 		 384 aa  227  1e-58  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0133  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  49.15 
 
 		 268 aa  226  3e-58  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.564261  normal  0.0379159 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3385  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  50.22 
 
 		 384 aa  225  5.0000000000000005e-58  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0073  cyclic nucleotide-binding  49.35 
 
 		 255 aa  224  1e-57  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1359  Crp/FNR family transcriptional regulator  45.96 
 
 		 236 aa  219  3.9999999999999997e-56  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.342582  normal  0.0135439 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0783  cyclic nucleotide-binding  47.62 
 
 		 376 aa  214  9.999999999999999e-55  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0359827  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3167  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  47.6 
 
 		 307 aa  213  2.9999999999999995e-54  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3862  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  47.39 
 
 		 249 aa  210  2e-53  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.582037  normal  0.123136 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2433  Crp/FNR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 247 aa  210  2e-53  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.168738  normal  0.817452 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3389  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  42.67 
 
 		 248 aa  207  1e-52  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4036  Crp/FNR family transcriptional regulator  45.85 
 
 		 315 aa  203  2e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1991  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  45.92 
 
 		 249 aa  201  9.999999999999999e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.250977  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2367  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  42.92 
 
 		 255 aa  199  1.9999999999999998e-50  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0615204  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3480  cyclic nucleotide-binding  45.3 
 
 		 249 aa  195  5.000000000000001e-49  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3788  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  45.3 
 
 		 249 aa  195  6e-49  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.371562 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2301  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  43.29 
 
 		 259 aa  194  1e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.161686 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2024  cyclic nucleotide-binding  43.29 
 
 		 259 aa  194  1e-48  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.996332 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1441  Crp/FNR family transcriptional regulator  42.5 
 
 		 259 aa  194  2e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00010652 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1986  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  42.86 
 
 		 259 aa  192  3e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5361  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  45.45 
 
 		 299 aa  191  9e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4876  cyclic nucleotide-binding  45.02 
 
 		 317 aa  188  5.999999999999999e-47  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.155933  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0772  cyclic nucleotide-binding  44.59 
 
 		 254 aa  188  7e-47  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2950  Crp/FNR family transcriptional regulator  41.2 
 
 		 250 aa  187  1e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.908761  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3832  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  40.26 
 
 		 245 aa  186  4e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2447  cyclic nucleotide-binding protein  43.29 
 
 		 255 aa  184  9e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5417  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  43.67 
 
 		 298 aa  183  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.36754  normal  1 
 
 
-
 
NC_011893  Mnod_8765  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  40.6 
 
 		 244 aa  180  2e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.474033  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1485  cyclic nucleotide-binding protein  38.79 
 
 		 244 aa  179  2.9999999999999997e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2944  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  41.63 
 
 		 246 aa  179  4e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0738845  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6130  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  40.17 
 
 		 244 aa  179  4.999999999999999e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2686  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  41.55 
 
 		 239 aa  177  1e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.038663  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0953  CRP/FNR family transcriptional regulator  39.22 
 
 		 254 aa  172  5.999999999999999e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0859  CRP/FNR family transcriptional regulator  39.66 
 
 		 234 aa  170  2e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0477074 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4786  cyclic nucleotide-binding protein  38.53 
 
 		 243 aa  167  1e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1184  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  41.56 
 
 		 243 aa  166  2e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6249  Crp/FNR family transcriptional regulator  41.13 
 
 		 281 aa  165  5e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.999867 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1230  Crp/FNR family transcriptional regulator  41.92 
 
 		 263 aa  163  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.583862  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1835  cyclic nucleotide-binding protein  40.26 
 
 		 281 aa  159  4e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3805  cyclic nucleotide-binding  37.23 
 
 		 263 aa  157  1e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1427  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  36.96 
 
 		 267 aa  156  3e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4068  Crp/FNR family transcriptional regulator  37.23 
 
 		 247 aa  156  4e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.936766  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2609  Crp/FNR family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 293 aa  154  1e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.325512  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3616  Crp/FNR family transcriptional regulator  39.83 
 
 		 243 aa  152  5.9999999999999996e-36  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6056  Crp/FNR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 241 aa  150  2e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2391  CRP/FNR family transcriptional regulator  37.34 
 
 		 274 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3486  putative signal transduction histidine kinase  37.66 
 
 		 243 aa  144  1e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.173486 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3741  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  40.57 
 
 		 242 aa  141  8e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1953  Crp/FNR family transcriptional regulator  39.3 
 
 		 246 aa  141  9.999999999999999e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0604  cyclic nucleotide-binding protein  39.3 
 
 		 246 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0955  CRP/FNR family transcriptional regulator  35.43 
 
 		 226 aa  135  5e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.869769  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1734  Crp/FNR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 241 aa  130  1.0000000000000001e-29  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.79675  hitchhiker  0.000773544 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5989  transcriptional regulator CRP family  38.54 
 
 		 257 aa  130  2.0000000000000002e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3499  CRP/FNR family transcriptional regulator  36.03 
 
 		 286 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.519814  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1000  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  36.63 
 
 		 250 aa  129  5.0000000000000004e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.523077  normal  0.289991 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1787  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  35.87 
 
 		 263 aa  129  6e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2400  CRP/FNR family transcriptional regulator  34.39 
 
 		 250 aa  128  8.000000000000001e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0375093 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3844  cyclic nucleotide-binding protein  33.78 
 
 		 242 aa  125  4.0000000000000003e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1153  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  35.64 
 
 		 250 aa  125  8.000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2108  CRP/FNR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 243 aa  124  2e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.819689  normal  0.0771917 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2201  transcriptional regulator  33.49 
 
 		 262 aa  122  7e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.586423 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0532  cyclic nucleotide-binding protein  33.03 
 
 		 276 aa  121  9.999999999999999e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.053126  normal  0.207643 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5597  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  33.7 
 
 		 246 aa  118  7.999999999999999e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0675352  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3568  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  30.94 
 
 		 242 aa  116  3.9999999999999997e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0997  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  34.7 
 
 		 230 aa  114  1.0000000000000001e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0490  CRP/FNR family transcriptional regulator  39.79 
 
 		 256 aa  113  3e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2934  cyclic nucleotide-binding protein  34.07 
 
 		 249 aa  113  3e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1275  Crp/Fnr family transcriptional regulator  34.07 
 
 		 249 aa  112  4.0000000000000004e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2705  cyclic nucleotide-binding protein  35.94 
 
 		 249 aa  112  7.000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0196  Crp/FNR family transcriptional regulator  31.68 
 
 		 253 aa  111  1.0000000000000001e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0367027  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0189  Crp/FNR family transcriptional regulator  31.68 
 
 		 235 aa  111  1.0000000000000001e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.338052  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0266  CRP/FNR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 253 aa  110  3e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1862  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.93 
 
 		 250 aa  108  1e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0720375  normal  0.182435 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4040  Crp/FNR family transcriptional regulator  34.43 
 
 		 256 aa  107  3e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.858211 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0414  Crp/FNR family transcriptional regulator  29.22 
 
 		 252 aa  102  4e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.766284  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3367  CRP/FNR family transcriptional regulator  31.55 
 
 		 252 aa  102  4e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.184948  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0357  Crp/FNR family transcriptional regulator  29.22 
 
 		 252 aa  102  4e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2575  Crp/FNR family transcriptional regulator  34.31 
 
 		 240 aa  102  4e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4822  cyclic nucleotide-binding protein  32.3 
 
 		 243 aa  102  5e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.379105  normal  0.123433 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1854  CRP/FNR family transcriptional regulator  27.23 
 
 		 250 aa  102  6e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.191124  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0983  Crp/FNR family transcriptional regulator  28.38 
 
 		 245 aa  101  1e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3865  Crp/FNR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 252 aa  100  3e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.925805  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5658  cyclic nucleotide-binding protein  30.67 
 
 		 245 aa  99  7e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0447  transcriptional regulator  34.52 
 
 		 262 aa  93.2  4e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  decreased coverage  0.00494896  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0660  transcriptional regulator  29.6 
 
 		 249 aa  79  0.00000000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0394  cyclic nucleotide-binding protein  27.91 
 
 		 236 aa  75.5  0.0000000000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0638348  normal  0.718832 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3322  Crp/FNR family transcriptional regulator  29.23 
 
 		 262 aa  74.3  0.000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0702622  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2634  CRP/FNR family transcriptional regulator  28.02 
 
 		 249 aa  73.9  0.000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5030  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.02 
 
 		 238 aa  73.6  0.000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>