More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_1441 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_1441  Crp/FNR family transcriptional regulator  100 
 
 		 259 aa  516  1.0000000000000001e-145  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00010652 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3862  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  46.41 
 
 		 249 aa  205  5e-52  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.582037  normal  0.123136 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2024  cyclic nucleotide-binding  43.97 
 
 		 259 aa  203  3e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.996332 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2301  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  43.97 
 
 		 259 aa  203  3e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.161686 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0783  cyclic nucleotide-binding  46.98 
 
 		 376 aa  202  4e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0359827  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0073  cyclic nucleotide-binding  46.98 
 
 		 255 aa  202  6e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0060  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  45.69 
 
 		 384 aa  201  9.999999999999999e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0133  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  44.3 
 
 		 268 aa  199  5e-50  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.564261  normal  0.0379159 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3385  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  44.83 
 
 		 384 aa  198  7.999999999999999e-50  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1986  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  41.77 
 
 		 259 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6209  Crp/FNR family transcriptional regulator  42.5 
 
 		 247 aa  194  2e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0102902  normal  0.673418 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3480  cyclic nucleotide-binding  48.5 
 
 		 249 aa  193  3e-48  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3788  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  48.5 
 
 		 249 aa  192  3e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.371562 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7493  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  39.92 
 
 		 246 aa  186  5e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1485  cyclic nucleotide-binding protein  41.99 
 
 		 244 aa  186  5e-46  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7477  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  40.33 
 
 		 246 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.403111  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0772  cyclic nucleotide-binding  45.02 
 
 		 254 aa  179  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3758  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  39.58 
 
 		 247 aa  179  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2886  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  38.7 
 
 		 244 aa  178  8e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.473656  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6130  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  47.85 
 
 		 244 aa  176  3e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6403  Crp/FNR family transcriptional regulator  39.74 
 
 		 246 aa  173  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2763  cyclic nucleotide-binding  38.7 
 
 		 244 aa  172  3.9999999999999995e-42  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.746131  normal  1 
 
 
-
 
NC_011893  Mnod_8765  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  46.77 
 
 		 244 aa  172  3.9999999999999995e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.474033  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2990  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  38.7 
 
 		 244 aa  172  3.9999999999999995e-42  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2944  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  42.42 
 
 		 246 aa  171  1e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0738845  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1991  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  40.6 
 
 		 249 aa  169  3e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.250977  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3389  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  39.13 
 
 		 248 aa  169  3e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4270  CRP/FNR family transcriptional regulator  39.59 
 
 		 225 aa  167  1e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0893417 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2686  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  40.91 
 
 		 239 aa  166  4e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.038663  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4497  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  39.32 
 
 		 255 aa  165  5.9999999999999996e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0140276  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2367  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  39.5 
 
 		 255 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0615204  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4786  cyclic nucleotide-binding protein  41.63 
 
 		 243 aa  163  3e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1359  Crp/FNR family transcriptional regulator  39.91 
 
 		 236 aa  160  1e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.342582  normal  0.0135439 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2950  Crp/FNR family transcriptional regulator  36.75 
 
 		 250 aa  161  1e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.908761  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4564  Crp/FNR family transcriptional regulator  40.1 
 
 		 257 aa  159  3e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00106309 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5361  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  38.26 
 
 		 299 aa  157  1e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3832  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  36.05 
 
 		 245 aa  157  2e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2433  Crp/FNR family transcriptional regulator  40.5 
 
 		 247 aa  157  2e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.168738  normal  0.817452 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5417  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  39.22 
 
 		 298 aa  156  4e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.36754  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4876  cyclic nucleotide-binding  37.83 
 
 		 317 aa  155  5.0000000000000005e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.155933  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0859  CRP/FNR family transcriptional regulator  36.96 
 
 		 234 aa  153  2e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0477074 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1835  cyclic nucleotide-binding protein  43.59 
 
 		 281 aa  150  2e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6249  Crp/FNR family transcriptional regulator  38.37 
 
 		 281 aa  146  3e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.999867 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1230  Crp/FNR family transcriptional regulator  41.48 
 
 		 263 aa  143  3e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.583862  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3486  putative signal transduction histidine kinase  37.45 
 
 		 243 aa  143  3e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.173486 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3616  Crp/FNR family transcriptional regulator  36.6 
 
 		 243 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1439  Crp/FNR family transcriptional regulator  34.05 
 
 		 243 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000118444 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4036  Crp/FNR family transcriptional regulator  36.12 
 
 		 315 aa  139  6e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2609  Crp/FNR family transcriptional regulator  36.44 
 
 		 293 aa  138  7.999999999999999e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.325512  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2447  cyclic nucleotide-binding protein  37.39 
 
 		 255 aa  137  2e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3167  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  35.64 
 
 		 307 aa  136  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3499  CRP/FNR family transcriptional regulator  38.03 
 
 		 286 aa  135  9e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.519814  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0953  CRP/FNR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 254 aa  134  9.999999999999999e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3741  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  35.53 
 
 		 242 aa  130  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5597  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  36.96 
 
 		 246 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0675352  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1953  Crp/FNR family transcriptional regulator  32.47 
 
 		 246 aa  124  1e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0604  cyclic nucleotide-binding protein  32.47 
 
 		 246 aa  124  2e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4068  Crp/FNR family transcriptional regulator  30.4 
 
 		 247 aa  122  6e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.936766  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2108  CRP/FNR family transcriptional regulator  33.48 
 
 		 243 aa  122  8e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.819689  normal  0.0771917 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3805  cyclic nucleotide-binding  29.49 
 
 		 263 aa  119  3.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1427  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  32.82 
 
 		 267 aa  116  5e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1184  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.39 
 
 		 243 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2391  CRP/FNR family transcriptional regulator  30.32 
 
 		 274 aa  112  6e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1787  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  31.53 
 
 		 263 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0955  CRP/FNR family transcriptional regulator  34.07 
 
 		 226 aa  110  3e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.869769  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6056  Crp/FNR family transcriptional regulator  28.63 
 
 		 241 aa  109  5e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1000  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  32 
 
 		 250 aa  105  7e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.523077  normal  0.289991 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3844  cyclic nucleotide-binding protein  33.49 
 
 		 242 aa  103  3e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2400  CRP/FNR family transcriptional regulator  30.69 
 
 		 250 aa  103  4e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0375093 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5989  transcriptional regulator CRP family  31.66 
 
 		 257 aa  101  1e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1734  Crp/FNR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 241 aa  101  1e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.79675  hitchhiker  0.000773544 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1153  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  31 
 
 		 250 aa  101  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0532  cyclic nucleotide-binding protein  31.61 
 
 		 276 aa  98.6  8e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.053126  normal  0.207643 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2201  transcriptional regulator  30.04 
 
 		 262 aa  98.6  9e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.586423 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0490  CRP/FNR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 256 aa  98.2  1e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3865  Crp/FNR family transcriptional regulator  30.15 
 
 		 252 aa  98.2  1e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.925805  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1854  CRP/FNR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 250 aa  98.2  1e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.191124  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3367  CRP/FNR family transcriptional regulator  28.26 
 
 		 252 aa  95.5  8e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.184948  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0983  Crp/FNR family transcriptional regulator  29.46 
 
 		 245 aa  95.5  8e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1862  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30.41 
 
 		 250 aa  95.5  9e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0720375  normal  0.182435 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2575  Crp/FNR family transcriptional regulator  30.65 
 
 		 240 aa  94.7  1e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4822  cyclic nucleotide-binding protein  28.51 
 
 		 243 aa  92.4  6e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.379105  normal  0.123433 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4040  Crp/FNR family transcriptional regulator  30.05 
 
 		 256 aa  92.4  7e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.858211 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0997  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  32.2 
 
 		 230 aa  91.3  1e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0189  Crp/FNR family transcriptional regulator  26.58 
 
 		 235 aa  89  8e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.338052  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0196  Crp/FNR family transcriptional regulator  26.58 
 
 		 253 aa  88.6  1e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0367027  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0266  CRP/FNR family transcriptional regulator  30.09 
 
 		 253 aa  86.3  5e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0414  Crp/FNR family transcriptional regulator  28.27 
 
 		 252 aa  85.5  7e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.766284  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0357  Crp/FNR family transcriptional regulator  28.27 
 
 		 252 aa  85.5  7e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3568  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  26.36 
 
 		 242 aa  84  0.000000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2705  cyclic nucleotide-binding protein  29.69 
 
 		 249 aa  84.3  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1275  Crp/Fnr family transcriptional regulator  27.64 
 
 		 249 aa  81.6  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2934  cyclic nucleotide-binding protein  27.14 
 
 		 249 aa  80.1  0.00000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0447  transcriptional regulator  30.29 
 
 		 262 aa  79.3  0.00000000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  decreased coverage  0.00494896  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5658  cyclic nucleotide-binding protein  28.43 
 
 		 245 aa  78.2  0.0000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0447  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.22 
 
 		 233 aa  76.6  0.0000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000251756 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0270  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.22 
 
 		 233 aa  76.6  0.0000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.479827  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4729  transcriptional regulator FixK  28.95 
 
 		 230 aa  71.2  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1377  Crp/FNR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 239 aa  70.5  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1951  transcriptional regulator FixK  29.73 
 
 		 231 aa  70.5  0.00000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>