More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_0946 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_0946  Crp/FNR family transcriptional regulator  100 
 
 		 253 aa  503  1e-141  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.336903  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5030  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  72.5 
 
 		 238 aa  335  5.999999999999999e-91  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3926  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  72.5 
 
 		 238 aa  335  5.999999999999999e-91  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0422  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  57.45 
 
 		 246 aa  273  2.0000000000000002e-72  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1302  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  55.51 
 
 		 254 aa  263  1e-69  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0109091  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6132  Crp/FNR family transcriptional regulator  57.26 
 
 		 245 aa  257  1e-67  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0884478  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1357  cyclic nucleotide-binding  56.03 
 
 		 250 aa  257  1e-67  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.395788 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1557  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  54.47 
 
 		 250 aa  256  2e-67  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00717235  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1377  Crp/FNR family transcriptional regulator  56.17 
 
 		 239 aa  256  3e-67  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1357  Crp/Fnr family transcriptional regulator  58.22 
 
 		 239 aa  256  3e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4039  Crp/FNR family transcriptional regulator  55.79 
 
 		 239 aa  254  1.0000000000000001e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.70749  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4713  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  54.08 
 
 		 239 aa  246  2e-64  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.557049  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5746  Crp/FNR family transcriptional regulator  53.52 
 
 		 237 aa  235  6e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.765257  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1984  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  46.22 
 
 		 250 aa  180  2e-44  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.312779  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1631  CRP/FNR family transcriptional regulator  44.93 
 
 		 310 aa  179  4e-44  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2634  CRP/FNR family transcriptional regulator  42.15 
 
 		 249 aa  169  3e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0654  Crp/FNR family transcriptional regulator  42.15 
 
 		 248 aa  166  2e-40  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.48838  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0647  nitrogen fixation regulation protein fixk  42.15 
 
 		 251 aa  166  5e-40  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.774151  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3322  Crp/FNR family transcriptional regulator  39.64 
 
 		 262 aa  161  1e-38  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0702622  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0660  transcriptional regulator  37.45 
 
 		 249 aa  155  8e-37  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1752  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  40 
 
 		 250 aa  154  1e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.103124 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3858  Crp/FNR family transcriptional regulator  39.09 
 
 		 248 aa  147  1.0000000000000001e-34  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2026  transcriptional activator Crp family  36.61 
 
 		 241 aa  147  2.0000000000000003e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0532  CRP/FNR family transcriptional regulator  38.67 
 
 		 248 aa  144  1e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.283437 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0698  Crp-Fnr regulatory protein (FnrL)  38.22 
 
 		 248 aa  144  2e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2353  CRP/FNR family transcriptional regulator  38.22 
 
 		 248 aa  144  2e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.689366  normal  0.139893 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1678  Crp/FNR family transcriptional regulator  38.35 
 
 		 230 aa  139  4.999999999999999e-32  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.330352  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1742  CRP/FNR family transcriptional regulator  38.36 
 
 		 242 aa  137  1e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.275504  normal  0.265558 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1746  CRP/FNR family transcriptional regulator  41.12 
 
 		 236 aa  136  4e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.753218  normal  0.546792 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6927  Crp/FNR family transcriptional regulator  42.57 
 
 		 227 aa  135  4e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.422372 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2581  Crp/FNR family transcriptional regulator  42.7 
 
 		 222 aa  135  6.0000000000000005e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5386  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  42.35 
 
 		 230 aa  135  6.0000000000000005e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.662421  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1036  transcriptional regulator FixK  40.84 
 
 		 231 aa  135  8e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1951  transcriptional regulator FixK  39.79 
 
 		 231 aa  132  5e-30  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2039  CRP/FNR family transcriptional regulator  41.08 
 
 		 242 aa  130  1.0000000000000001e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.191538  hitchhiker  0.00387918 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2547  Crp/FNR family transcriptional regulator  36.16 
 
 		 246 aa  130  1.0000000000000001e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.389339  normal  0.365128 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2581  Crp/FNR family transcriptional regulator  36.05 
 
 		 231 aa  130  2.0000000000000002e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.658135  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0870  transcriptional regulator FixK  41.81 
 
 		 227 aa  130  2.0000000000000002e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3277  Crp/FNR family transcriptional regulator  43.32 
 
 		 226 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2118  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  35.05 
 
 		 240 aa  129  3e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00291012 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6164  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  44.68 
 
 		 247 aa  129  6e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.257657  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1361  transcriptional regulator FixK  39.18 
 
 		 229 aa  129  6e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0646149  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3505  regulatory protein Crp  40.21 
 
 		 229 aa  127  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.021842  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3812  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  40.21 
 
 		 229 aa  127  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2699  Crp/FNR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 232 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.276502  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2360  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  35.51 
 
 		 240 aa  126  3e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.948966  hitchhiker  0.00636029 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1850  CRP/FNR family transcriptional regulator  40.1 
 
 		 211 aa  126  3e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4729  transcriptional regulator FixK  38.86 
 
 		 230 aa  126  4.0000000000000003e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2786  transcriptional regulator FixK  39 
 
 		 229 aa  126  4.0000000000000003e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0460697  normal  0.11454 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1945  Crp/FNR family transcriptional regulator  36.89 
 
 		 242 aa  125  5e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1340  transcriptional regulator FixK  38.66 
 
 		 229 aa  125  5e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.324269  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0408  Crp/FNR family transcriptional regulator  46.98 
 
 		 230 aa  125  7e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6270  transcriptional regulator FixK  39.79 
 
 		 211 aa  125  9e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.967473  normal  0.128199 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0629  transcriptional regulator FixK  42.29 
 
 		 215 aa  124  1e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.595222  normal  0.236212 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0460  CRP/FNR family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 256 aa  124  2e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6107  Crp/FNR family transcriptional regulator  41.01 
 
 		 227 aa  123  2e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0266042 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4375  Crp/FNR family transcriptional regulator  40.94 
 
 		 268 aa  123  3e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0576  CRP/FNR family transcriptional regulator  40 
 
 		 235 aa  122  6e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.670039  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1356  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  31.72 
 
 		 256 aa  122  6e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.0588975 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4055  transcriptional regulator FixK  39.55 
 
 		 229 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3889  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  42.05 
 
 		 229 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.128439 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1258  Crp/FNR family transcriptional regulator  33.98 
 
 		 241 aa  120  3e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2279  Crp/FNR family transcriptional regulator  34.58 
 
 		 258 aa  120  3e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2975  Crp/FNR family transcriptional regulator  40.53 
 
 		 220 aa  118  9.999999999999999e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.169439  normal  0.307783 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1273  cAMP-binding protein  37.65 
 
 		 243 aa  118  9.999999999999999e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2457  Crp/FNR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 204 aa  115  5e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.325923  normal  0.600278 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3266  cyclic nucleotide-binding  38.95 
 
 		 220 aa  115  6e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00116153 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2233  CRP/FNR family transcriptional regulator  27.83 
 
 		 253 aa  114  1.0000000000000001e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0375344  normal  0.791743 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2201  transcriptional regulator  33.33 
 
 		 262 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.586423 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1987  fumarate/nitrate reduction transcriptional regulator  30.13 
 
 		 239 aa  114  2.0000000000000002e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4871  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  40 
 
 		 228 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1823  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  40.54 
 
 		 234 aa  113  3e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0333657 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2034  cyclic nucleotide-binding: regulatory protein, Crp  34.56 
 
 		 232 aa  112  5e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2061  Crp family transcriptional regulator  33.02 
 
 		 241 aa  112  5e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  hitchhiker  0.00300081  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4521  Crp/Fnr family transcriptional regulator  30.08 
 
 		 257 aa  112  5e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0161618  normal  0.0108643 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1091  CRP/FNR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 247 aa  112  6e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.140321  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1464  transcriptional activator Anr  30.47 
 
 		 244 aa  112  7.000000000000001e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1007  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  33.33 
 
 		 242 aa  112  8.000000000000001e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5989  transcriptional regulator CRP family  33.33 
 
 		 257 aa  111  9e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2782  Crp/FNR family transcriptional regulator  32.3 
 
 		 262 aa  111  1.0000000000000001e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0680307  normal  0.414614 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5184  transcriptional regulator FixK  40.7 
 
 		 211 aa  111  1.0000000000000001e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.639909 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2037  Crp/FNR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 232 aa  110  2.0000000000000002e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.441781 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3865  Crp/FNR family transcriptional regulator  35.18 
 
 		 252 aa  110  2.0000000000000002e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.925805  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3775  CRP/FNR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 265 aa  110  2.0000000000000002e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2222  fumarate/nitrate reduction transcriptional regulator  30.26 
 
 		 250 aa  110  3e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0665535  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1000  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.69 
 
 		 250 aa  110  3e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.523077  normal  0.289991 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1666  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  32.89 
 
 		 250 aa  109  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0506299  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1283  putative fumarate and nitrate reduction regulatory transcription regulator protein  33.64 
 
 		 242 aa  109  5e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0516193  normal  0.32826 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1692  Crp/FNR family transcriptional regulator  34.07 
 
 		 244 aa  109  5e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.816346  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3788  transcriptional regulator Anr  30.53 
 
 		 244 aa  108  6e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.620164  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2772  Crp/FNR family transcriptional regulator  31.88 
 
 		 245 aa  108  6e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00275745 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44490  transcriptional regulator Anr  30.53 
 
 		 244 aa  108  6e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.793348 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0460  Crp/FNR family transcriptional regulator  32.27 
 
 		 260 aa  108  8.000000000000001e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0878  fumarate/nitrate reduction transcriptional regulator  29.52 
 
 		 257 aa  108  8.000000000000001e-23  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0364978  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2115  fumarate/nitrate reduction transcriptional regulator  30.84 
 
 		 250 aa  108  9.000000000000001e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.508722  normal  0.0650668 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2014  fumarate/nitrate reduction transcriptional regulator  30.84 
 
 		 250 aa  108  9.000000000000001e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000000422436 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2615  CRP/FNR family transcriptional regulator  30.53 
 
 		 244 aa  107  1e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00240538  normal  0.855877 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1016  Crp/FNR family transcriptional regulator  32.73 
 
 		 260 aa  108  1e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2747  Crp/Fnr family transcriptional regulator  32.73 
 
 		 260 aa  108  1e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.225266  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1334  Crp/FNR family transcriptional regulator  32.73 
 
 		 242 aa  108  1e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>