More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A1217 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007347  Reut_A1147  cyclic nucleotide-binding: regulatory protein, Crp  100 
 
 
261 aa  539  9.999999999999999e-153  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1217  cyclic nucleotide-binding: regulatory protein, Crp  100 
 
 
261 aa  539  9.999999999999999e-153  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4521  Crp/Fnr family transcriptional regulator  62.16 
 
 
257 aa  292  4e-78  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0161618  normal  0.0108643 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6315  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  56.67 
 
 
403 aa  287  1e-76  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0190  transcription regulator protein  58.59 
 
 
266 aa  285  5.999999999999999e-76  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.180711 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5811  Crp/FNR family transcriptional regulator  53.97 
 
 
266 aa  284  1.0000000000000001e-75  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.118405 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0460  Crp/FNR family transcriptional regulator  57.08 
 
 
260 aa  281  7.000000000000001e-75  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4428  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  58.93 
 
 
263 aa  281  9e-75  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4561  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  58.93 
 
 
263 aa  281  9e-75  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.291712 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4238  Crp/FNR family transcriptional regulator  53.91 
 
 
257 aa  278  6e-74  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0460631  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3764  Crp/FNR family transcriptional regulator  55.32 
 
 
259 aa  278  9e-74  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0549839 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0164  Crp/FNR family transcriptional regulator  57.08 
 
 
260 aa  277  1e-73  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1016  Crp/FNR family transcriptional regulator  57.08 
 
 
260 aa  277  1e-73  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2604  Crp/Fnr family transcriptional regulator  57.08 
 
 
260 aa  277  1e-73  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2747  Crp/Fnr family transcriptional regulator  57.08 
 
 
260 aa  277  1e-73  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.225266  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4280  Crp/FNR family transcriptional regulator  55.32 
 
 
257 aa  276  3e-73  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0900166 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1334  Crp/FNR family transcriptional regulator  57.94 
 
 
242 aa  275  4e-73  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0190  Crp/FNR family transcriptional regulator  57.94 
 
 
242 aa  275  4e-73  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0606  Crp/FNR family transcriptional regulator  54.55 
 
 
267 aa  275  5e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.149995 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3812  Crp/FNR family transcriptional regulator  54.89 
 
 
257 aa  275  7e-73  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.279241  normal  0.577974 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4265  Crp/FNR family transcriptional regulator  53.56 
 
 
259 aa  275  7e-73  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.367581  normal  0.892156 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1665  Crp/FNR family transcriptional regulator  55.9 
 
 
259 aa  273  2.0000000000000002e-72  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00239618  normal  0.130389 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0129  Crp/FNR family transcriptional regulator  54.36 
 
 
259 aa  272  4.0000000000000004e-72  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.300797  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1554  Crp/FNR family transcriptional regulator  54.36 
 
 
259 aa  272  4.0000000000000004e-72  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.796955  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1636  Crp/FNR family transcriptional regulator  54.36 
 
 
259 aa  272  4.0000000000000004e-72  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6195  Crp/FNR family transcriptional regulator  56.33 
 
 
257 aa  272  5.000000000000001e-72  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.107166  normal  0.295507 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1138  Crp/FNR family transcriptional regulator  55.9 
 
 
260 aa  271  7e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3138  Crp/FNR family transcriptional regulator  56.83 
 
 
248 aa  271  1e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5999  Crp/FNR family transcriptional regulator  54.04 
 
 
259 aa  271  1e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.582695  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4012  Crp/FNR family transcriptional regulator  55.02 
 
 
259 aa  270  2e-71  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4355  Crp/FNR family transcriptional regulator  55.02 
 
 
259 aa  270  2e-71  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0811079  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4486  Crp/FNR family transcriptional regulator  56.39 
 
 
248 aa  269  2.9999999999999997e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1244  Crp/FNR family transcriptional regulator  57.47 
 
 
261 aa  267  1e-70  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5297  Crp/FNR family transcriptional regulator  56.39 
 
 
248 aa  267  1e-70  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5737  Crp/FNR family transcriptional regulator  55.95 
 
 
248 aa  266  2e-70  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.188641 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1540  Crp/FNR family transcriptional regulator  54.55 
 
 
630 aa  266  2e-70  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.18142  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4272  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  56.74 
 
 
218 aa  266  2e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.71016  normal  0.563993 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5122  Crp/FNR family transcriptional regulator  55.95 
 
 
248 aa  266  2e-70  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0031  Crp/FNR family transcriptional regulator  54.55 
 
 
251 aa  266  2.9999999999999995e-70  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3149  Crp/FNR family transcriptional regulator  55.51 
 
 
249 aa  266  2.9999999999999995e-70  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1464  Crp/FNR family transcriptional regulator  54.55 
 
 
251 aa  266  2.9999999999999995e-70  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.855917  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0037  Crp/FNR family transcriptional regulator  54.55 
 
 
251 aa  266  2.9999999999999995e-70  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.284481  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0037  Crp/FNR family transcriptional regulator  54.55 
 
 
251 aa  266  2.9999999999999995e-70  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1184  Crp/FNR family transcriptional regulator  54.55 
 
 
251 aa  266  2.9999999999999995e-70  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0051  cAMP-binding proteins - catabolite gene activator and regulatory subunit of cAMP-dependent protein kinases  54.55 
 
 
251 aa  266  2.9999999999999995e-70  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5008  Crp/FNR family transcriptional regulator  55.51 
 
 
249 aa  265  4e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5904  Crp/FNR family transcriptional regulator  55.02 
 
 
257 aa  265  4e-70  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.379633  normal  0.222249 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0035  Crp/FNR family transcriptional regulator  54.11 
 
 
251 aa  264  1e-69  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4433  Crp/FNR family transcriptional regulator  56.74 
 
 
224 aa  263  1e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1288  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  55 
 
 
246 aa  249  3e-65  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2772  Crp/FNR family transcriptional regulator  51.32 
 
 
245 aa  246  4e-64  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00275745 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1047  cyclic nucleotide-binding: regulatory protein, Crp  51.44 
 
 
247 aa  245  4e-64  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1007  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  50.45 
 
 
242 aa  243  3e-63  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1091  CRP/FNR family transcriptional regulator  50.45 
 
 
247 aa  242  3.9999999999999997e-63  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.140321  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2782  Crp/FNR family transcriptional regulator  50 
 
 
262 aa  238  5.999999999999999e-62  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0680307  normal  0.414614 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1530  Crp/FNR family transcriptional regulator  50 
 
 
239 aa  237  1e-61  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3775  CRP/FNR family transcriptional regulator  50.45 
 
 
265 aa  236  4e-61  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2471  transcription factor Fnr  53.64 
 
 
269 aa  233  2.0000000000000002e-60  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.366844  normal  0.0435693 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1163  CRP/FNR family transcriptional regulator  50.45 
 
 
251 aa  233  2.0000000000000002e-60  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1666  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  49.15 
 
 
250 aa  232  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0506299  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1207  Crp/FNR family transcriptional regulator  48.96 
 
 
264 aa  228  5e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.494469  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2510  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  51.36 
 
 
274 aa  228  7e-59  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.6173 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1937  Crp/FNR family transcriptional regulator  49.52 
 
 
223 aa  219  3e-56  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.155753  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3345  Crp/FNR family transcriptional regulator  47.27 
 
 
247 aa  219  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.797997  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0460  CRP/FNR family transcriptional regulator  46.43 
 
 
256 aa  218  7e-56  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1170  Crp/FNR family transcriptional regulator  45.49 
 
 
274 aa  217  2e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4294  Crp/FNR family transcriptional regulator  49.09 
 
 
272 aa  215  5.9999999999999996e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3034  Crp/FNR family transcriptional regulator  44.69 
 
 
269 aa  214  9e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.369454  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0792  CRP/FNR family transcriptional regulator  46.85 
 
 
262 aa  214  9.999999999999999e-55  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.328451  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1204  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  44.59 
 
 
242 aa  213  2.9999999999999995e-54  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1111  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  44.59 
 
 
242 aa  213  2.9999999999999995e-54  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.700786  normal  0.531022 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1283  putative fumarate and nitrate reduction regulatory transcription regulator protein  44.59 
 
 
242 aa  211  9e-54  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0516193  normal  0.32826 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2037  Crp/FNR family transcriptional regulator  43.89 
 
 
232 aa  211  1e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.441781 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3287  Crp/FNR family transcriptional regulator  45.7 
 
 
265 aa  210  2e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2471  CRP/FNR family transcriptional regulator  45.7 
 
 
273 aa  209  3e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.185946  normal  0.661743 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1356  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  44.64 
 
 
256 aa  208  9e-53  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.0588975 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2034  cyclic nucleotide-binding: regulatory protein, Crp  42.99 
 
 
232 aa  207  2e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2233  CRP/FNR family transcriptional regulator  42.92 
 
 
253 aa  202  5e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0375344  normal  0.791743 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44490  transcriptional regulator Anr  42.27 
 
 
244 aa  196  3e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.793348 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3788  transcriptional regulator Anr  42.27 
 
 
244 aa  196  3e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.620164  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1864  fumarate/nitrate reduction transcriptional regulator  42.53 
 
 
250 aa  196  3e-49  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.856056  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2105  fumarate/nitrate reduction transcriptional regulator  43.64 
 
 
248 aa  196  4.0000000000000005e-49  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0944449  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1951  fumarate/nitrate reduction transcriptional regulator  40.81 
 
 
250 aa  195  5.000000000000001e-49  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.80493  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0319  Crp/FNR family transcriptional regulator  42.99 
 
 
262 aa  195  5.000000000000001e-49  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2115  fumarate/nitrate reduction transcriptional regulator  40.81 
 
 
250 aa  195  6e-49  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.508722  normal  0.0650668 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2014  fumarate/nitrate reduction transcriptional regulator  40.81 
 
 
250 aa  195  6e-49  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000000422436 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4265  transcriptional regulator Anr  42.34 
 
 
244 aa  195  7e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.880812  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1603  CRP/FNR family transcriptional regulator  42.34 
 
 
244 aa  195  7e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.138297 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2398  fumarate/nitrate reduction transcriptional regulator  43.18 
 
 
248 aa  195  8.000000000000001e-49  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3830  Crp/FNR family transcriptional regulator  42.34 
 
 
244 aa  194  8.000000000000001e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.525453 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1853  fumarate/nitrate reduction transcriptional regulator  42.99 
 
 
250 aa  194  1e-48  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.755428 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2222  fumarate/nitrate reduction transcriptional regulator  40.81 
 
 
250 aa  194  2e-48  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00000942023  normal  0.178468 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2212  fumarate/nitrate reduction transcriptional regulator  40.81 
 
 
250 aa  194  2e-48  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00299596  normal  0.266977 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2209  fumarate/nitrate reduction transcriptional regulator  40.81 
 
 
250 aa  194  2e-48  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00613295  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2162  fumarate/nitrate reduction transcriptional regulator  40.81 
 
 
250 aa  194  2e-48  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.914647  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3583  Crp/FNR family transcriptional regulator  42.66 
 
 
244 aa  193  2e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1961  fumarate/nitrate reduction transcriptional regulator  40.36 
 
 
250 aa  193  2e-48  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00754009 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4495  fumarate/nitrate reduction transcriptional regulator  40.81 
 
 
250 aa  194  2e-48  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2081  fumarate/nitrate reduction transcriptional regulator  42.73 
 
 
250 aa  192  3e-48  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0488524  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1464  transcriptional activator Anr  41.96 
 
 
244 aa  192  4e-48  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>