More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B0606 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007952  Bxe_B0606  Crp/FNR family transcriptional regulator  100 
 
 		 267 aa  539  9.999999999999999e-153  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.149995 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4272  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  95.41 
 
 		 218 aa  423  1e-117  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.71016  normal  0.563993 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4433  Crp/FNR family transcriptional regulator  83.03 
 
 		 224 aa  377  1e-103  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3138  Crp/FNR family transcriptional regulator  64.79 
 
 		 248 aa  350  2e-95  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4486  Crp/FNR family transcriptional regulator  65.17 
 
 		 248 aa  348  5e-95  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3149  Crp/FNR family transcriptional regulator  70.64 
 
 		 249 aa  347  2e-94  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5737  Crp/FNR family transcriptional regulator  64.04 
 
 		 248 aa  345  3e-94  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.188641 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5122  Crp/FNR family transcriptional regulator  64.04 
 
 		 248 aa  345  3e-94  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5008  Crp/FNR family transcriptional regulator  70.21 
 
 		 249 aa  345  5e-94  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5297  Crp/FNR family transcriptional regulator  64.79 
 
 		 248 aa  343  2e-93  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0037  Crp/FNR family transcriptional regulator  69.23 
 
 		 251 aa  340  1e-92  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0051  cAMP-binding proteins - catabolite gene activator and regulatory subunit of cAMP-dependent protein kinases  69.23 
 
 		 251 aa  340  1e-92  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1540  Crp/FNR family transcriptional regulator  69.23 
 
 		 630 aa  339  2e-92  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.18142  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0031  Crp/FNR family transcriptional regulator  68.8 
 
 		 251 aa  338  4e-92  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1184  Crp/FNR family transcriptional regulator  68.8 
 
 		 251 aa  338  4e-92  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0037  Crp/FNR family transcriptional regulator  68.8 
 
 		 251 aa  338  4e-92  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.284481  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1464  Crp/FNR family transcriptional regulator  68.8 
 
 		 251 aa  338  4e-92  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.855917  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0035  Crp/FNR family transcriptional regulator  68.8 
 
 		 251 aa  338  5e-92  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6315  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  57.74 
 
 		 403 aa  303  2.0000000000000002e-81  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3812  Crp/FNR family transcriptional regulator  53.91 
 
 		 257 aa  301  6.000000000000001e-81  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.279241  normal  0.577974 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4280  Crp/FNR family transcriptional regulator  53.52 
 
 		 257 aa  300  1e-80  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0900166 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6195  Crp/FNR family transcriptional regulator  52.34 
 
 		 257 aa  295  5e-79  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.107166  normal  0.295507 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1636  Crp/FNR family transcriptional regulator  57.38 
 
 		 259 aa  295  6e-79  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0129  Crp/FNR family transcriptional regulator  58.4 
 
 		 259 aa  294  1e-78  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.300797  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1554  Crp/FNR family transcriptional regulator  58.4 
 
 		 259 aa  294  1e-78  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.796955  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0460  Crp/FNR family transcriptional regulator  53.52 
 
 		 260 aa  292  3e-78  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5904  Crp/FNR family transcriptional regulator  51.95 
 
 		 257 aa  290  1e-77  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.379633  normal  0.222249 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1138  Crp/FNR family transcriptional regulator  53.33 
 
 		 260 aa  288  7e-77  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1244  Crp/FNR family transcriptional regulator  57.89 
 
 		 261 aa  286  2e-76  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5811  Crp/FNR family transcriptional regulator  53.21 
 
 		 266 aa  286  2e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.118405 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0164  Crp/FNR family transcriptional regulator  57.08 
 
 		 260 aa  285  4e-76  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2747  Crp/Fnr family transcriptional regulator  57.08 
 
 		 260 aa  285  4e-76  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.225266  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1016  Crp/FNR family transcriptional regulator  57.08 
 
 		 260 aa  285  4e-76  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2604  Crp/Fnr family transcriptional regulator  57.08 
 
 		 260 aa  285  4e-76  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4012  Crp/FNR family transcriptional regulator  53.91 
 
 		 259 aa  285  5e-76  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4355  Crp/FNR family transcriptional regulator  53.91 
 
 		 259 aa  285  5e-76  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0811079  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0190  Crp/FNR family transcriptional regulator  57.08 
 
 		 242 aa  285  5.999999999999999e-76  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1334  Crp/FNR family transcriptional regulator  57.08 
 
 		 242 aa  285  5.999999999999999e-76  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4238  Crp/FNR family transcriptional regulator  52.92 
 
 		 257 aa  285  7e-76  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0460631  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3764  Crp/FNR family transcriptional regulator  56.64 
 
 		 259 aa  284  1.0000000000000001e-75  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0549839 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5999  Crp/FNR family transcriptional regulator  54.89 
 
 		 259 aa  284  1.0000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.582695  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1665  Crp/FNR family transcriptional regulator  51.95 
 
 		 259 aa  283  2.0000000000000002e-75  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00239618  normal  0.130389 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4265  Crp/FNR family transcriptional regulator  55.75 
 
 		 259 aa  277  1e-73  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.367581  normal  0.892156 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1147  cyclic nucleotide-binding: regulatory protein, Crp  54.71 
 
 		 261 aa  266  2e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1217  cyclic nucleotide-binding: regulatory protein, Crp  54.71 
 
 		 261 aa  266  2e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1047  cyclic nucleotide-binding: regulatory protein, Crp  53.39 
 
 		 247 aa  259  3e-68  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2772  Crp/FNR family transcriptional regulator  51.69 
 
 		 245 aa  258  9e-68  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00275745 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4521  Crp/Fnr family transcriptional regulator  52.7 
 
 		 257 aa  255  5e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0161618  normal  0.0108643 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1288  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  52.91 
 
 		 246 aa  253  2.0000000000000002e-66  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3775  CRP/FNR family transcriptional regulator  45.63 
 
 		 265 aa  248  8e-65  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4428  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  49.12 
 
 		 263 aa  241  9e-63  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4561  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  49.12 
 
 		 263 aa  241  9e-63  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.291712 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2782  Crp/FNR family transcriptional regulator  46.67 
 
 		 262 aa  241  1e-62  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0680307  normal  0.414614 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1530  Crp/FNR family transcriptional regulator  46.64 
 
 		 239 aa  240  2e-62  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1007  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  46.64 
 
 		 242 aa  240  2e-62  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1091  CRP/FNR family transcriptional regulator  46.64 
 
 		 247 aa  240  2e-62  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.140321  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1163  CRP/FNR family transcriptional regulator  47.98 
 
 		 251 aa  239  5e-62  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0190  transcription regulator protein  48.67 
 
 		 266 aa  238  1e-61  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.180711 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2471  transcription factor Fnr  52.91 
 
 		 269 aa  237  2e-61  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.366844  normal  0.0435693 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4294  Crp/FNR family transcriptional regulator  47.52 
 
 		 272 aa  228  7e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2037  Crp/FNR family transcriptional regulator  47.79 
 
 		 232 aa  228  8e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.441781 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1170  Crp/FNR family transcriptional regulator  45.17 
 
 		 274 aa  227  1e-58  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1937  Crp/FNR family transcriptional regulator  46.48 
 
 		 223 aa  227  2e-58  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.155753  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1204  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  45.45 
 
 		 242 aa  227  2e-58  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1111  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  45.45 
 
 		 242 aa  226  3e-58  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.700786  normal  0.531022 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3345  Crp/FNR family transcriptional regulator  47.98 
 
 		 247 aa  225  5.0000000000000005e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.797997  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1207  Crp/FNR family transcriptional regulator  47.53 
 
 		 264 aa  225  7e-58  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.494469  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2034  cyclic nucleotide-binding: regulatory protein, Crp  46.46 
 
 		 232 aa  224  2e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0792  CRP/FNR family transcriptional regulator  48.42 
 
 		 262 aa  222  4.9999999999999996e-57  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.328451  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1283  putative fumarate and nitrate reduction regulatory transcription regulator protein  43.72 
 
 		 242 aa  220  1.9999999999999999e-56  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0516193  normal  0.32826 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1356  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  42.74 
 
 		 256 aa  219  3e-56  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.0588975 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0460  CRP/FNR family transcriptional regulator  42.74 
 
 		 256 aa  219  3e-56  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2510  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  45.81 
 
 		 274 aa  213  1.9999999999999998e-54  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.6173 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0212  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  45.29 
 
 		 254 aa  211  1e-53  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1666  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  43.81 
 
 		 250 aa  208  6e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0506299  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2233  CRP/FNR family transcriptional regulator  39.48 
 
 		 253 aa  202  4e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0375344  normal  0.791743 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1464  transcriptional activator Anr  40 
 
 		 244 aa  198  6e-50  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1951  fumarate/nitrate reduction transcriptional regulator  40.17 
 
 		 250 aa  198  9e-50  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.80493  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2018  fumarate/nitrate reduction transcriptional regulator  40.81 
 
 		 252 aa  197  1.0000000000000001e-49  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.831368  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1799  fumarate/nitrate reduction transcriptional regulator  39.47 
 
 		 250 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.417815  normal  0.180258 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2219  fumarate/nitrate reduction transcriptional regulator  40.62 
 
 		 249 aa  196  4.0000000000000005e-49  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1843  fumarate/nitrate reduction transcriptional regulator  38.72 
 
 		 250 aa  196  4.0000000000000005e-49  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0177159  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2222  fumarate/nitrate reduction transcriptional regulator  39.38 
 
 		 250 aa  195  8.000000000000001e-49  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0665535  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1993  fumarate/nitrate reduction transcriptional regulator  39.38 
 
 		 249 aa  194  9e-49  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.238952  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0931  fumarate/nitrate reduction transcriptional regulator  39.01 
 
 		 249 aa  193  2e-48  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.896198 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1987  fumarate/nitrate reduction transcriptional regulator  40.27 
 
 		 239 aa  193  3e-48  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2356  fumarate/nitrate reduction transcriptional regulator  39.66 
 
 		 254 aa  193  3e-48  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1864  fumarate/nitrate reduction transcriptional regulator  39.38 
 
 		 250 aa  192  3e-48  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.856056  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02295  fumarate/nitrate reduction transcriptional regulator  39.38 
 
 		 248 aa  193  3e-48  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2293  fumarate/nitrate reduction transcriptional regulator  39.82 
 
 		 250 aa  192  4e-48  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2222  fumarate/nitrate reduction transcriptional regulator  38.98 
 
 		 250 aa  192  5e-48  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00000942023  normal  0.178468 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1944  fumarate/nitrate reduction transcriptional regulator  39.82 
 
 		 250 aa  192  5e-48  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.755264  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2162  fumarate/nitrate reduction transcriptional regulator  38.98 
 
 		 250 aa  192  5e-48  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.914647  n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4495  fumarate/nitrate reduction transcriptional regulator  38.98 
 
 		 250 aa  192  5e-48  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1833  fumarate/nitrate reduction transcriptional regulator  39.82 
 
 		 250 aa  192  5e-48  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2209  fumarate/nitrate reduction transcriptional regulator  38.98 
 
 		 250 aa  192  5e-48  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00613295  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2212  fumarate/nitrate reduction transcriptional regulator  38.98 
 
 		 250 aa  192  5e-48  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00299596  normal  0.266977 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2115  fumarate/nitrate reduction transcriptional regulator  39.29 
 
 		 250 aa  192  7e-48  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.508722  normal  0.0650668 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2014  fumarate/nitrate reduction transcriptional regulator  39.29 
 
 		 250 aa  192  7e-48  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000000422436 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2120  Crp/FNR family transcriptional regulator  41.26 
 
 		 245 aa  191  8e-48  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>