More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_1937 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_1937  Crp/FNR family transcriptional regulator  100 
 
 		 223 aa  451  1.0000000000000001e-126  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.155753  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1530  Crp/FNR family transcriptional regulator  84.4 
 
 		 239 aa  380  1e-105  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2782  Crp/FNR family transcriptional regulator  81.57 
 
 		 262 aa  377  1e-104  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0680307  normal  0.414614 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1007  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  83.18 
 
 		 242 aa  380  1e-104  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1091  CRP/FNR family transcriptional regulator  83.18 
 
 		 247 aa  380  1e-104  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.140321  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1163  CRP/FNR family transcriptional regulator  81.36 
 
 		 251 aa  372  1e-102  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3775  CRP/FNR family transcriptional regulator  82.33 
 
 		 265 aa  369  1e-101  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1207  Crp/FNR family transcriptional regulator  72.48 
 
 		 264 aa  322  2e-87  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.494469  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2772  Crp/FNR family transcriptional regulator  67.87 
 
 		 245 aa  316  1e-85  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00275745 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1047  cyclic nucleotide-binding: regulatory protein, Crp  66.06 
 
 		 247 aa  309  2e-83  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2471  transcription factor Fnr  68.37 
 
 		 269 aa  299  2e-80  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.366844  normal  0.0435693 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1288  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  60.91 
 
 		 246 aa  283  2.0000000000000002e-75  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1170  Crp/FNR family transcriptional regulator  53.52 
 
 		 274 aa  243  9.999999999999999e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6315  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  52.86 
 
 		 403 aa  241  7e-63  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3345  Crp/FNR family transcriptional regulator  52.8 
 
 		 247 aa  240  1e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.797997  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0460  Crp/FNR family transcriptional regulator  51.64 
 
 		 260 aa  238  5.999999999999999e-62  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5904  Crp/FNR family transcriptional regulator  51.17 
 
 		 257 aa  237  9e-62  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.379633  normal  0.222249 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1138  Crp/FNR family transcriptional regulator  52.58 
 
 		 260 aa  236  2e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3812  Crp/FNR family transcriptional regulator  50.7 
 
 		 257 aa  234  6e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.279241  normal  0.577974 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4280  Crp/FNR family transcriptional regulator  50.7 
 
 		 257 aa  234  7e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0900166 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2037  Crp/FNR family transcriptional regulator  51.63 
 
 		 232 aa  234  8e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.441781 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5811  Crp/FNR family transcriptional regulator  51.64 
 
 		 266 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.118405 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1204  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  49.77 
 
 		 242 aa  231  5e-60  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4265  Crp/FNR family transcriptional regulator  52.11 
 
 		 259 aa  231  7.000000000000001e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.367581  normal  0.892156 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1111  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  49.77 
 
 		 242 aa  231  7.000000000000001e-60  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.700786  normal  0.531022 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0164  Crp/FNR family transcriptional regulator  51.17 
 
 		 260 aa  231  8.000000000000001e-60  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1016  Crp/FNR family transcriptional regulator  51.17 
 
 		 260 aa  231  8.000000000000001e-60  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2747  Crp/Fnr family transcriptional regulator  51.17 
 
 		 260 aa  231  8.000000000000001e-60  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.225266  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2604  Crp/Fnr family transcriptional regulator  51.17 
 
 		 260 aa  231  8.000000000000001e-60  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0190  Crp/FNR family transcriptional regulator  51.17 
 
 		 242 aa  230  1e-59  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1334  Crp/FNR family transcriptional regulator  51.17 
 
 		 242 aa  230  1e-59  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1283  putative fumarate and nitrate reduction regulatory transcription regulator protein  49.77 
 
 		 242 aa  229  2e-59  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0516193  normal  0.32826 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6195  Crp/FNR family transcriptional regulator  49.3 
 
 		 257 aa  229  2e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.107166  normal  0.295507 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0190  transcription regulator protein  53.73 
 
 		 266 aa  228  7e-59  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.180711 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2034  cyclic nucleotide-binding: regulatory protein, Crp  49.77 
 
 		 232 aa  227  9e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4272  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  46.95 
 
 		 218 aa  227  9e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.71016  normal  0.563993 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0606  Crp/FNR family transcriptional regulator  46.48 
 
 		 267 aa  227  1e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.149995 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4486  Crp/FNR family transcriptional regulator  50.7 
 
 		 248 aa  226  2e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0129  Crp/FNR family transcriptional regulator  48.83 
 
 		 259 aa  226  3e-58  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.300797  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3138  Crp/FNR family transcriptional regulator  50.7 
 
 		 248 aa  226  3e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4433  Crp/FNR family transcriptional regulator  46.95 
 
 		 224 aa  225  3e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1636  Crp/FNR family transcriptional regulator  48.83 
 
 		 259 aa  226  3e-58  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4294  Crp/FNR family transcriptional regulator  50.48 
 
 		 272 aa  226  3e-58  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1554  Crp/FNR family transcriptional regulator  48.83 
 
 		 259 aa  226  3e-58  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.796955  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1665  Crp/FNR family transcriptional regulator  49.77 
 
 		 259 aa  224  6e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00239618  normal  0.130389 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1244  Crp/FNR family transcriptional regulator  48.36 
 
 		 261 aa  224  1e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4238  Crp/FNR family transcriptional regulator  50.23 
 
 		 257 aa  223  1e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0460631  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4428  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  52.74 
 
 		 263 aa  223  1e-57  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4561  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  52.74 
 
 		 263 aa  223  1e-57  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.291712 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5737  Crp/FNR family transcriptional regulator  50.23 
 
 		 248 aa  223  2e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.188641 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5122  Crp/FNR family transcriptional regulator  50.23 
 
 		 248 aa  223  2e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3764  Crp/FNR family transcriptional regulator  50.23 
 
 		 259 aa  222  3e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0549839 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4355  Crp/FNR family transcriptional regulator  49.3 
 
 		 259 aa  221  6e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0811079  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4012  Crp/FNR family transcriptional regulator  49.3 
 
 		 259 aa  221  6e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5999  Crp/FNR family transcriptional regulator  49.3 
 
 		 259 aa  221  6e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.582695  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3149  Crp/FNR family transcriptional regulator  49.77 
 
 		 249 aa  220  9.999999999999999e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0460  CRP/FNR family transcriptional regulator  47.03 
 
 		 256 aa  220  9.999999999999999e-57  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5297  Crp/FNR family transcriptional regulator  49.77 
 
 		 248 aa  219  1.9999999999999999e-56  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5008  Crp/FNR family transcriptional regulator  49.77 
 
 		 249 aa  219  1.9999999999999999e-56  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1356  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  47.03 
 
 		 256 aa  219  3e-56  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.0588975 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1666  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  47.25 
 
 		 250 aa  218  5e-56  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0506299  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0792  CRP/FNR family transcriptional regulator  50 
 
 		 262 aa  218  5e-56  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.328451  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1540  Crp/FNR family transcriptional regulator  49.05 
 
 		 630 aa  215  4e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.18142  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0031  Crp/FNR family transcriptional regulator  49.05 
 
 		 251 aa  214  5.9999999999999996e-55  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0051  cAMP-binding proteins - catabolite gene activator and regulatory subunit of cAMP-dependent protein kinases  49.05 
 
 		 251 aa  214  5.9999999999999996e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1464  Crp/FNR family transcriptional regulator  49.05 
 
 		 251 aa  214  5.9999999999999996e-55  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.855917  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0037  Crp/FNR family transcriptional regulator  49.05 
 
 		 251 aa  214  5.9999999999999996e-55  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.284481  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0037  Crp/FNR family transcriptional regulator  49.05 
 
 		 251 aa  214  5.9999999999999996e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1184  Crp/FNR family transcriptional regulator  49.05 
 
 		 251 aa  214  5.9999999999999996e-55  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1147  cyclic nucleotide-binding: regulatory protein, Crp  50 
 
 		 261 aa  214  7e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1217  cyclic nucleotide-binding: regulatory protein, Crp  50 
 
 		 261 aa  214  7e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0035  Crp/FNR family transcriptional regulator  49.05 
 
 		 251 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4521  Crp/Fnr family transcriptional regulator  48.33 
 
 		 257 aa  208  6e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0161618  normal  0.0108643 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0212  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  43.93 
 
 		 254 aa  197  1.0000000000000001e-49  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2510  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  49.22 
 
 		 274 aa  196  2.0000000000000003e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.6173 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1692  Crp/FNR family transcriptional regulator  44.55 
 
 		 244 aa  196  3e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.816346  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3287  Crp/FNR family transcriptional regulator  43.81 
 
 		 265 aa  195  5.000000000000001e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2471  CRP/FNR family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 273 aa  192  3e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.185946  normal  0.661743 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3788  transcriptional regulator Anr  43.48 
 
 		 244 aa  188  4e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.620164  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44490  transcriptional regulator Anr  43.48 
 
 		 244 aa  188  4e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.793348 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1811  Crp/FNR family transcriptional regulator  43.48 
 
 		 244 aa  187  9e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4265  transcriptional regulator Anr  43.48 
 
 		 244 aa  187  1e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.880812  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1944  fumarate/nitrate reduction transcriptional regulator  42.01 
 
 		 250 aa  187  1e-46  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.755264  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2293  fumarate/nitrate reduction transcriptional regulator  42.01 
 
 		 250 aa  187  1e-46  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1833  fumarate/nitrate reduction transcriptional regulator  42.01 
 
 		 250 aa  187  1e-46  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3830  Crp/FNR family transcriptional regulator  43.48 
 
 		 244 aa  187  1e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.525453 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1603  CRP/FNR family transcriptional regulator  43.48 
 
 		 244 aa  187  1e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.138297 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1993  fumarate/nitrate reduction transcriptional regulator  41.36 
 
 		 249 aa  187  1e-46  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.238952  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3583  Crp/FNR family transcriptional regulator  43.48 
 
 		 244 aa  187  1e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2018  fumarate/nitrate reduction transcriptional regulator  41.43 
 
 		 252 aa  186  3e-46  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.831368  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2212  fumarate/nitrate reduction transcriptional regulator  41.23 
 
 		 250 aa  185  5e-46  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00299596  normal  0.266977 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2162  fumarate/nitrate reduction transcriptional regulator  41.23 
 
 		 250 aa  185  5e-46  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.914647  n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4495  fumarate/nitrate reduction transcriptional regulator  41.23 
 
 		 250 aa  185  5e-46  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2222  fumarate/nitrate reduction transcriptional regulator  41.23 
 
 		 250 aa  185  5e-46  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00000942023  normal  0.178468 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2209  fumarate/nitrate reduction transcriptional regulator  41.23 
 
 		 250 aa  185  5e-46  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00613295  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19910  Fnr-like negative transcriptional regulator of CydAB  43 
 
 		 244 aa  185  5e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1864  fumarate/nitrate reduction transcriptional regulator  42.06 
 
 		 250 aa  184  7e-46  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.856056  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0787  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  39.62 
 
 		 243 aa  184  7e-46  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2615  CRP/FNR family transcriptional regulator  43 
 
 		 244 aa  184  8e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00240538  normal  0.855877 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1991  transcriptional activator Anr  43.9 
 
 		 244 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.695719  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>