More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_5811 on replicon NC_010625
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010625  Bphy_5811  Crp/FNR family transcriptional regulator  100 
 
 		 266 aa  544  1e-154  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.118405 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1138  Crp/FNR family transcriptional regulator  79.35 
 
 		 260 aa  410  1e-114  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1636  Crp/FNR family transcriptional regulator  70.4 
 
 		 259 aa  379  1e-104  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0129  Crp/FNR family transcriptional regulator  70 
 
 		 259 aa  375  1e-103  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.300797  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1554  Crp/FNR family transcriptional regulator  70 
 
 		 259 aa  375  1e-103  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.796955  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1665  Crp/FNR family transcriptional regulator  70.36 
 
 		 259 aa  368  1e-101  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00239618  normal  0.130389 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0460  Crp/FNR family transcriptional regulator  71.55 
 
 		 260 aa  368  1e-101  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1244  Crp/FNR family transcriptional regulator  70.92 
 
 		 261 aa  369  1e-101  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5999  Crp/FNR family transcriptional regulator  69.35 
 
 		 259 aa  370  1e-101  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.582695  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0164  Crp/FNR family transcriptional regulator  71.07 
 
 		 260 aa  367  1e-100  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1016  Crp/FNR family transcriptional regulator  71.07 
 
 		 260 aa  367  1e-100  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1334  Crp/FNR family transcriptional regulator  71.07 
 
 		 242 aa  365  1e-100  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2747  Crp/Fnr family transcriptional regulator  71.07 
 
 		 260 aa  367  1e-100  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.225266  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4265  Crp/FNR family transcriptional regulator  71.78 
 
 		 259 aa  367  1e-100  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.367581  normal  0.892156 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4355  Crp/FNR family transcriptional regulator  68.97 
 
 		 259 aa  367  1e-100  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0811079  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2604  Crp/Fnr family transcriptional regulator  71.07 
 
 		 260 aa  367  1e-100  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4012  Crp/FNR family transcriptional regulator  68.97 
 
 		 259 aa  367  1e-100  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0190  Crp/FNR family transcriptional regulator  71.07 
 
 		 242 aa  365  1e-100  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4238  Crp/FNR family transcriptional regulator  68.08 
 
 		 257 aa  363  1e-99  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0460631  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3764  Crp/FNR family transcriptional regulator  71.13 
 
 		 259 aa  360  1e-98  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0549839 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5904  Crp/FNR family transcriptional regulator  65.41 
 
 		 257 aa  358  4e-98  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.379633  normal  0.222249 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3812  Crp/FNR family transcriptional regulator  69.83 
 
 		 257 aa  358  4e-98  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.279241  normal  0.577974 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4280  Crp/FNR family transcriptional regulator  69.42 
 
 		 257 aa  358  7e-98  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0900166 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6195  Crp/FNR family transcriptional regulator  69.01 
 
 		 257 aa  357  9.999999999999999e-98  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.107166  normal  0.295507 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6315  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  61.83 
 
 		 403 aa  333  2e-90  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0606  Crp/FNR family transcriptional regulator  53.21 
 
 		 267 aa  286  2e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.149995 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1047  cyclic nucleotide-binding: regulatory protein, Crp  57.02 
 
 		 247 aa  279  3e-74  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4433  Crp/FNR family transcriptional regulator  57.34 
 
 		 224 aa  279  4e-74  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1147  cyclic nucleotide-binding: regulatory protein, Crp  54.51 
 
 		 261 aa  277  1e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1217  cyclic nucleotide-binding: regulatory protein, Crp  54.51 
 
 		 261 aa  277  1e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3138  Crp/FNR family transcriptional regulator  56.09 
 
 		 248 aa  275  5e-73  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0037  Crp/FNR family transcriptional regulator  55.22 
 
 		 251 aa  274  1.0000000000000001e-72  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5297  Crp/FNR family transcriptional regulator  56.09 
 
 		 248 aa  274  1.0000000000000001e-72  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0035  Crp/FNR family transcriptional regulator  55.22 
 
 		 251 aa  274  1.0000000000000001e-72  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0051  cAMP-binding proteins - catabolite gene activator and regulatory subunit of cAMP-dependent protein kinases  55.22 
 
 		 251 aa  274  1.0000000000000001e-72  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5737  Crp/FNR family transcriptional regulator  55.95 
 
 		 248 aa  273  2.0000000000000002e-72  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.188641 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1540  Crp/FNR family transcriptional regulator  55.22 
 
 		 630 aa  273  2.0000000000000002e-72  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.18142  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5122  Crp/FNR family transcriptional regulator  55.95 
 
 		 248 aa  273  2.0000000000000002e-72  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3149  Crp/FNR family transcriptional regulator  54.58 
 
 		 249 aa  273  2.0000000000000002e-72  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4486  Crp/FNR family transcriptional regulator  55.95 
 
 		 248 aa  272  3e-72  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0031  Crp/FNR family transcriptional regulator  54.78 
 
 		 251 aa  272  3e-72  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0037  Crp/FNR family transcriptional regulator  54.78 
 
 		 251 aa  272  3e-72  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.284481  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1184  Crp/FNR family transcriptional regulator  54.78 
 
 		 251 aa  272  3e-72  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1464  Crp/FNR family transcriptional regulator  54.78 
 
 		 251 aa  272  3e-72  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.855917  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5008  Crp/FNR family transcriptional regulator  54.43 
 
 		 249 aa  271  9e-72  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4272  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  56.88 
 
 		 218 aa  270  2e-71  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.71016  normal  0.563993 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0190  transcription regulator protein  52.77 
 
 		 266 aa  269  2.9999999999999997e-71  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.180711 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2772  Crp/FNR family transcriptional regulator  56.05 
 
 		 245 aa  269  2.9999999999999997e-71  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00275745 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4561  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  50.59 
 
 		 263 aa  269  4e-71  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.291712 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4428  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  50.59 
 
 		 263 aa  269  4e-71  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1530  Crp/FNR family transcriptional regulator  54.71 
 
 		 239 aa  265  7e-70  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4521  Crp/Fnr family transcriptional regulator  54.22 
 
 		 257 aa  264  1e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0161618  normal  0.0108643 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1091  CRP/FNR family transcriptional regulator  54.26 
 
 		 247 aa  263  3e-69  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.140321  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1007  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  54.26 
 
 		 242 aa  263  3e-69  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1163  CRP/FNR family transcriptional regulator  54.26 
 
 		 251 aa  259  2e-68  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1288  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  55.56 
 
 		 246 aa  260  2e-68  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2471  transcription factor Fnr  54.09 
 
 		 269 aa  259  4e-68  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.366844  normal  0.0435693 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2782  Crp/FNR family transcriptional regulator  52.47 
 
 		 262 aa  256  3e-67  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0680307  normal  0.414614 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3775  CRP/FNR family transcriptional regulator  53.64 
 
 		 265 aa  251  7e-66  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4294  Crp/FNR family transcriptional regulator  46.79 
 
 		 272 aa  248  5e-65  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2510  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  54.67 
 
 		 274 aa  247  1e-64  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.6173 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1170  Crp/FNR family transcriptional regulator  48.76 
 
 		 274 aa  246  3e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1207  Crp/FNR family transcriptional regulator  52.02 
 
 		 264 aa  244  8e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.494469  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3345  Crp/FNR family transcriptional regulator  48.72 
 
 		 247 aa  240  1e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.797997  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0792  CRP/FNR family transcriptional regulator  48.41 
 
 		 262 aa  240  2e-62  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.328451  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1937  Crp/FNR family transcriptional regulator  51.64 
 
 		 223 aa  233  3e-60  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.155753  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2037  Crp/FNR family transcriptional regulator  45.09 
 
 		 232 aa  222  4.9999999999999996e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.441781 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2233  CRP/FNR family transcriptional regulator  45.05 
 
 		 253 aa  221  9.999999999999999e-57  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0375344  normal  0.791743 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0460  CRP/FNR family transcriptional regulator  45.5 
 
 		 256 aa  219  1.9999999999999999e-56  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2034  cyclic nucleotide-binding: regulatory protein, Crp  43.3 
 
 		 232 aa  218  7.999999999999999e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1666  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  48.17 
 
 		 250 aa  218  8.999999999999998e-56  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0506299  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1283  putative fumarate and nitrate reduction regulatory transcription regulator protein  42.73 
 
 		 242 aa  216  2e-55  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0516193  normal  0.32826 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1356  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  43.95 
 
 		 256 aa  217  2e-55  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.0588975 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1111  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  41.85 
 
 		 242 aa  214  9.999999999999999e-55  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.700786  normal  0.531022 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1204  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  42.04 
 
 		 242 aa  214  9.999999999999999e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0212  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  43.8 
 
 		 254 aa  211  1e-53  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1811  Crp/FNR family transcriptional regulator  43.38 
 
 		 244 aa  210  2e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2615  CRP/FNR family transcriptional regulator  42.79 
 
 		 244 aa  210  2e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00240538  normal  0.855877 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1987  fumarate/nitrate reduction transcriptional regulator  41.63 
 
 		 239 aa  208  8e-53  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3425  cyclic nucleotide-binding: regulatory protein, Crp  42.79 
 
 		 244 aa  206  4e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0533041 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19910  Fnr-like negative transcriptional regulator of CydAB  43.12 
 
 		 244 aa  206  4e-52  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4265  transcriptional regulator Anr  41.7 
 
 		 244 aa  205  5e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.880812  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1991  transcriptional activator Anr  43.78 
 
 		 244 aa  206  5e-52  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.695719  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1603  CRP/FNR family transcriptional regulator  41.7 
 
 		 244 aa  205  5e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.138297 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3830  Crp/FNR family transcriptional regulator  41.7 
 
 		 244 aa  204  8e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.525453 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2417  fumarate/nitrate reduction transcriptional regulator  40.61 
 
 		 249 aa  203  2e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0646393  decreased coverage  0.000000159166 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1843  fumarate/nitrate reduction transcriptional regulator  41.7 
 
 		 250 aa  203  2e-51  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0177159  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2018  fumarate/nitrate reduction transcriptional regulator  41.52 
 
 		 252 aa  203  2e-51  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.831368  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1799  fumarate/nitrate reduction transcriptional regulator  41.36 
 
 		 250 aa  203  3e-51  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.417815  normal  0.180258 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0319  Crp/FNR family transcriptional regulator  43.5 
 
 		 262 aa  202  4e-51  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3583  Crp/FNR family transcriptional regulator  42.4 
 
 		 244 aa  202  6e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2311  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  39.67 
 
 		 250 aa  201  9e-51  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.144598  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2291  fumarate/nitrate reduction transcriptional regulator  39.67 
 
 		 250 aa  201  9e-51  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1450  fumarate/nitrate reduction transcriptional regulator  39.67 
 
 		 250 aa  201  9e-51  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1575  fumarate/nitrate reduction transcriptional regulator  39.67 
 
 		 250 aa  201  9e-51  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1788  fumarate/nitrate reduction transcriptional regulator  39.67 
 
 		 250 aa  201  9e-51  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.765276  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1546  fumarate/nitrate reduction transcriptional regulator  39.67 
 
 		 250 aa  201  9e-51  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1783  fumarate/nitrate reduction transcriptional regulator  40 
 
 		 250 aa  201  9.999999999999999e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.251439 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1845  fumarate/nitrate reduction transcriptional regulator  40 
 
 		 250 aa  201  9.999999999999999e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.918423  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1981  fumarate/nitrate reduction transcriptional regulator  39.67 
 
 		 250 aa  201  9.999999999999999e-51  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.320226 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>