78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aazo_0140 on replicon NC_014248
Organism: 'Nostoc azollae' 0708



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014248  Aazo_0140  putative Crp/Fnr family transcriptional regulator  100 
 
 		 239 aa  495  1e-139  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0938698  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1750  Crp/FNR family transcriptional regulator  98.74 
 
 		 239 aa  488  1e-137  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.499959  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3616  CRP/FNR family transcriptional regulator  69.71 
 
 		 256 aa  364  1e-100  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0729234 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0115  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  60 
 
 		 225 aa  279  2e-74  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.2299 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2356  Crp/FNR family transcriptional regulator  28.17 
 
 		 208 aa  73.9  0.000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1146  CRP/FNR family transcriptional regulator  35.21 
 
 		 211 aa  71.2  0.00000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.242619  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2491  Crp/FNR family transcriptional regulator  26.63 
 
 		 393 aa  69.3  0.00000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.116073 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0372  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.65 
 
 		 225 aa  62.4  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3970  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.07 
 
 		 199 aa  62  0.000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1291  CRP/FNR family transcriptional regulator  27.98 
 
 		 305 aa  60.8  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.06322  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2484  putative Crp/Fnr family transcriptional regulator  27.64 
 
 		 389 aa  59.7  0.00000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.399715  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2058  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.09 
 
 		 225 aa  58.2  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2082  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.09 
 
 		 225 aa  58.2  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0207  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  31.34 
 
 		 218 aa  57.8  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.163925 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0353  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.27 
 
 		 200 aa  56.2  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0346  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.27 
 
 		 200 aa  56.2  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0127  Crp/FNR family transcriptional regulator  41.56 
 
 		 222 aa  55.8  0.0000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.867755  normal  0.325855 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0755  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  38.96 
 
 		 223 aa  54.7  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.125698 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3283  Crp/FNR family transcriptional regulator  24.87 
 
 		 223 aa  55.1  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1065  Crp/Fnr family transcriptional regulator  37.66 
 
 		 223 aa  55.1  0.000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.547512  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24561  CRP family global nitrogen regulatory protein  38.16 
 
 		 222 aa  53.9  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3366  Crp/FNR family transcriptional regulator  23.85 
 
 		 208 aa  54.3  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.698764  normal  0.804601 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2075  Crp/FNR family transcriptional regulator  40.79 
 
 		 210 aa  53.1  0.000004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2023  Crp/FNR family transcriptional regulator  38.96 
 
 		 221 aa  52.8  0.000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0496812 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1376  CRP/FNR family transcriptional regulator  34.12 
 
 		 228 aa  51.2  0.00001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.271211  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0269  Crp/FNR family transcriptional regulator  26.42 
 
 		 238 aa  51.2  0.00001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2510  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.25 
 
 		 274 aa  51.2  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.6173 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02791  CRP family global nitrogen regulatory protein  32.53 
 
 		 244 aa  50.8  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.696842  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0248  Crp/FNR family transcriptional regulator  38.16 
 
 		 244 aa  50.1  0.00003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02691  CRP family global nitrogen regulatory protein  35.53 
 
 		 244 aa  49.3  0.00005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02681  CRP family global nitrogen regulatory protein  35.53 
 
 		 244 aa  49.3  0.00005  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.548193  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0437  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family with PAS/PAC sensor  24.07 
 
 		 405 aa  49.3  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1612  Crp/FNR family transcriptional regulator  35.53 
 
 		 243 aa  49.3  0.00006  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03241  CRP family global nitrogen regulatory protein  35.53 
 
 		 243 aa  49.3  0.00006  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3725  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  34.18 
 
 		 237 aa  48.5  0.00008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0054318  normal  0.342144 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2113  CRP/FNR family transcriptional regulator  25.86 
 
 		 313 aa  48.1  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000556838  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1987  fumarate/nitrate reduction transcriptional regulator  25.32 
 
 		 239 aa  47.8  0.0001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0303  cyclic nucleotide-binding domain protein  26.6 
 
 		 236 aa  47.8  0.0002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.232206 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1586  cAMP family transcriptional regulator  38.54 
 
 		 182 aa  47  0.0003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.406741  hitchhiker  0.00767311 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1684  CRP/FNR family transcriptional regulator  29.93 
 
 		 206 aa  46.6  0.0003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.24693  normal  0.330754 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2010  Crp family regulatory protein  41.77 
 
 		 212 aa  46.2  0.0004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2222  fumarate/nitrate reduction transcriptional regulator  23.7 
 
 		 250 aa  45.1  0.0009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00000942023  normal  0.178468 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4495  fumarate/nitrate reduction transcriptional regulator  23.7 
 
 		 250 aa  45.1  0.0009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2209  fumarate/nitrate reduction transcriptional regulator  23.7 
 
 		 250 aa  45.1  0.0009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00613295  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2212  fumarate/nitrate reduction transcriptional regulator  23.7 
 
 		 250 aa  45.1  0.0009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00299596  normal  0.266977 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2162  fumarate/nitrate reduction transcriptional regulator  23.7 
 
 		 250 aa  45.1  0.0009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.914647  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2356  fumarate/nitrate reduction transcriptional regulator  22.54 
 
 		 254 aa  45.1  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09541  Crp family regulatory protein  50 
 
 		 197 aa  44.7  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.230149  hitchhiker  0.000196756 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0814  CRP/FNR family transcriptional regulator  62.86 
 
 		 195 aa  45.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0872325  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2014  fumarate/nitrate reduction transcriptional regulator  23.7 
 
 		 250 aa  44.7  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000000422436 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2115  fumarate/nitrate reduction transcriptional regulator  23.7 
 
 		 250 aa  44.7  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.508722  normal  0.0650668 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08701  Crp family regulatory proteins  62.86 
 
 		 195 aa  44.7  0.001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07751  Crp family regulatory proteins  62.86 
 
 		 195 aa  45.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_11071  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family protein  21.03 
 
 		 233 aa  45.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08671  Crp family regulatory proteins  62.86 
 
 		 195 aa  45.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0277995  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1993  fumarate/nitrate reduction transcriptional regulator  23.56 
 
 		 249 aa  44.3  0.002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.238952  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1998  CRP/FNR family transcriptional regulator  40 
 
 		 207 aa  43.9  0.002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  hitchhiker  0.00839318  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2219  fumarate/nitrate reduction transcriptional regulator  23.3 
 
 		 249 aa  43.9  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0214  cAMP family transcriptional regulator  47.17 
 
 		 198 aa  43.5  0.003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1944  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  35.29 
 
 		 227 aa  43.5  0.003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0990  putative Crp/Fnr family transcriptional regulator  27.03 
 
 		 195 aa  43.5  0.003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.596823  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02063  transcriptional regulator of aerobic, anaerobic respiration, osmotic balance (CAMP-binding family) protein  24.85 
 
 		 222 aa  43.9  0.003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00714534  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08461  Crp family regulatory proteins  61.76 
 
 		 198 aa  43.1  0.004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.836651  hitchhiker  0.00426427 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1951  fumarate/nitrate reduction transcriptional regulator  23.12 
 
 		 250 aa  43.1  0.004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.80493  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1799  fumarate/nitrate reduction transcriptional regulator  22.54 
 
 		 250 aa  43.1  0.004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.417815  normal  0.180258 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17661  regulatory proteins, Crp family protein  41.54 
 
 		 260 aa  43.1  0.004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.941841 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8112  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  24.1 
 
 		 229 aa  43.1  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2026  transcriptional activator Crp family  24.77 
 
 		 241 aa  43.1  0.004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0463  Crp/FNR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 197 aa  43.1  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.778777  normal  0.174596 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1961  fumarate/nitrate reduction transcriptional regulator  23.12 
 
 		 250 aa  43.1  0.004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00754009 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0783  cyclic nucleotide-binding  31.4 
 
 		 376 aa  42.7  0.005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0359827  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17701  regulatory proteins, Crp family protein  61.76 
 
 		 198 aa  42.7  0.005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.639467 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2018  fumarate/nitrate reduction transcriptional regulator  24.22 
 
 		 252 aa  42.7  0.005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.831368  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0299  Crp/FNR family transcriptional regulator  22.65 
 
 		 247 aa  42.4  0.006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2222  fumarate/nitrate reduction transcriptional regulator  23.12 
 
 		 250 aa  42.4  0.007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0665535  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1498  Crp/FNR family transcriptional regulator  23.71 
 
 		 239 aa  42  0.008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.163113  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05940  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  33.33 
 
 		 231 aa  42  0.009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.558941  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1843  fumarate/nitrate reduction transcriptional regulator  23.3 
 
 		 250 aa  41.6  0.01  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0177159  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>