96 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_2113 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009972  Haur_2113  CRP/FNR family transcriptional regulator  100 
 
 		 313 aa  637    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000556838  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1291  CRP/FNR family transcriptional regulator  43.51 
 
 		 305 aa  220  1.9999999999999999e-56  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.06322  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0990  putative Crp/Fnr family transcriptional regulator  29.94 
 
 		 195 aa  79.3  0.00000000000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.596823  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0207  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30 
 
 		 218 aa  68.9  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.163925 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0463  Crp/FNR family transcriptional regulator  27.16 
 
 		 197 aa  67.4  0.0000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.778777  normal  0.174596 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0755  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  23.22 
 
 		 223 aa  66.2  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.125698 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2023  Crp/FNR family transcriptional regulator  23.81 
 
 		 221 aa  65.9  0.0000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0496812 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0127  Crp/FNR family transcriptional regulator  26.63 
 
 		 222 aa  63.9  0.000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.867755  normal  0.325855 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1146  CRP/FNR family transcriptional regulator  26.71 
 
 		 211 aa  61.2  0.00000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.242619  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0372  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.37 
 
 		 225 aa  60.8  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1065  Crp/Fnr family transcriptional regulator  27.11 
 
 		 223 aa  60.8  0.00000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.547512  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2058  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25.82 
 
 		 225 aa  59.7  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2082  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25.82 
 
 		 225 aa  59.7  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2356  Crp/FNR family transcriptional regulator  28.19 
 
 		 208 aa  60.1  0.00000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02691  CRP family global nitrogen regulatory protein  27.44 
 
 		 244 aa  59.7  0.00000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3283  Crp/FNR family transcriptional regulator  27.54 
 
 		 223 aa  59.7  0.00000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02681  CRP family global nitrogen regulatory protein  27.44 
 
 		 244 aa  59.3  0.00000008  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.548193  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0115  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.17 
 
 		 225 aa  58.5  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.2299 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0248  Crp/FNR family transcriptional regulator  26.83 
 
 		 244 aa  58.5  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2174  CRP/FNR family transcriptional regulator  30.82 
 
 		 209 aa  58.2  0.0000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.576133 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0435  regulatory protein, Crp  28.48 
 
 		 210 aa  57.4  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0427117  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_11461  CRP/FNR family transcriptional regulator  27.97 
 
 		 210 aa  57.4  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00962041 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2448  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25.54 
 
 		 238 aa  56.6  0.0000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02791  CRP family global nitrogen regulatory protein  26.83 
 
 		 244 aa  56.6  0.0000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.696842  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24561  CRP family global nitrogen regulatory protein  26.58 
 
 		 222 aa  56.2  0.0000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0269  Crp/FNR family transcriptional regulator  25.58 
 
 		 238 aa  54.7  0.000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1612  Crp/FNR family transcriptional regulator  25.77 
 
 		 243 aa  54.7  0.000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03241  CRP family global nitrogen regulatory protein  25.77 
 
 		 243 aa  54.7  0.000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2444  Crp/FNR family transcriptional regulator  20.83 
 
 		 238 aa  54.7  0.000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000577484  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2075  Crp/FNR family transcriptional regulator  25.95 
 
 		 210 aa  53.9  0.000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1802  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25.84 
 
 		 238 aa  53.9  0.000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0106  Crp/FNR family transcriptional regulator  24.73 
 
 		 254 aa  53.9  0.000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_11071  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family protein  24.04 
 
 		 233 aa  53.5  0.000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0860  Crp/FNR family transcriptional regulator  25.75 
 
 		 234 aa  53.9  0.000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.693979  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1814  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  22.87 
 
 		 225 aa  52.8  0.000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3366  Crp/FNR family transcriptional regulator  25 
 
 		 208 aa  52.4  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.698764  normal  0.804601 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4881  putative cyclic-AMP receptor-like protein  26.34 
 
 		 281 aa  52.4  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.353478  normal  0.139273 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2491  Crp/FNR family transcriptional regulator  25.15 
 
 		 393 aa  51.2  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.116073 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1234  Crp/FNR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 232 aa  51.2  0.00002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2591  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  24.86 
 
 		 221 aa  51.6  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.44001  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2775  Crp/FNR family transcriptional regulator  21.61 
 
 		 232 aa  50.8  0.00003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.9012  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0353  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.04 
 
 		 200 aa  50.4  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0346  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.04 
 
 		 200 aa  50.4  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1992  Crp/FNR family transcriptional regulator  23.19 
 
 		 226 aa  50.4  0.00004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.103472  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0437  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family with PAS/PAC sensor  23.87 
 
 		 405 aa  50.1  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0324  Crp/FNR family transcriptional regulator  25.93 
 
 		 226 aa  49.3  0.00007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.105795  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3616  CRP/FNR family transcriptional regulator  28.03 
 
 		 256 aa  49.7  0.00007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0729234 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0750  Crp/FNR family transcriptional regulator  25.73 
 
 		 238 aa  49.3  0.00008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3395  Crp/FNR family transcriptional regulator  26.11 
 
 		 225 aa  49.3  0.00008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1633  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  24.74 
 
 		 226 aa  48.5  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.391452  normal  0.0281193 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1853  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  18.13 
 
 		 240 aa  48.9  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3176  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.9 
 
 		 225 aa  48.9  0.0001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.231761 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26230  cAMP-binding protein  24.02 
 
 		 225 aa  48.5  0.0001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.466611  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0629  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  44.9 
 
 		 230 aa  48.1  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.0000285446  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0140  putative Crp/Fnr family transcriptional regulator  25.86 
 
 		 239 aa  48.1  0.0002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0938698  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1684  CRP/FNR family transcriptional regulator  27.39 
 
 		 206 aa  48.5  0.0002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.24693  normal  0.330754 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1750  Crp/FNR family transcriptional regulator  25.86 
 
 		 239 aa  47.8  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.499959  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2484  putative Crp/Fnr family transcriptional regulator  30.12 
 
 		 389 aa  48.1  0.0002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.399715  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1697  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25.95 
 
 		 259 aa  47.4  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.314621  hitchhiker  0.0000199045 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0517  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25.88 
 
 		 224 aa  47.4  0.0004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1763  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  24.71 
 
 		 223 aa  47  0.0004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.796832  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1574  CRP/FNR family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 191 aa  47  0.0004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.255141  normal  0.0532067 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0424  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  24.75 
 
 		 242 aa  46.6  0.0005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.24952 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4199  cyclic nucleotide-binding protein  27.23 
 
 		 260 aa  46.2  0.0006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0253  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  24.44 
 
 		 224 aa  46.2  0.0007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1995  transcriptional regulator  25.84 
 
 		 224 aa  46.2  0.0008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5315  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25.29 
 
 		 228 aa  45.8  0.0008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.527594 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1663  CRP/FNR family transcriptional regulator  23.03 
 
 		 179 aa  46.2  0.0008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.231367  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25400  cAMP-binding protein  25 
 
 		 225 aa  45.8  0.0009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2869  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  23.66 
 
 		 211 aa  45.8  0.0009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.00060408  normal  0.537416 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1523  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.45 
 
 		 231 aa  45.1  0.001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08701  Crp family regulatory proteins  26.51 
 
 		 195 aa  45.4  0.001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1659  cyclic nucleotide-binding  26.4 
 
 		 223 aa  45.4  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.834954  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02711  global nitrogen regulatory protein  33.33 
 
 		 244 aa  45.4  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1644  Crp/FNR family transcriptional regulator  25.84 
 
 		 223 aa  44.7  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1262  CRP/FNR family transcriptional regulator  24.12 
 
 		 222 aa  44.3  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.247212  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3658  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.89 
 
 		 249 aa  44.7  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.336394 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08671  Crp family regulatory proteins  26.51 
 
 		 195 aa  44.7  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0277995  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2928  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  22.17 
 
 		 232 aa  44.3  0.003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.39759 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18280  cAMP-binding protein  26.42 
 
 		 225 aa  44.3  0.003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.186071  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0496  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  34.38 
 
 		 129 aa  44.3  0.003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3970  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  23.17 
 
 		 199 aa  44.3  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1482  CRP/FNR family transcriptional regulator  25.28 
 
 		 235 aa  44.3  0.003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000000238682  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07751  Crp family regulatory proteins  25.3 
 
 		 195 aa  43.5  0.004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0719  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.95 
 
 		 257 aa  43.9  0.004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000204419 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1827  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  23.96 
 
 		 229 aa  43.9  0.004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4850  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  24.86 
 
 		 228 aa  43.9  0.004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0214  cAMP family transcriptional regulator  30.12 
 
 		 198 aa  43.5  0.005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0698  CRP/FNR family transcriptional regulator  21.31 
 
 		 227 aa  43.5  0.005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6822  Crp/FNR family transcriptional regulator  24.32 
 
 		 239 aa  43.5  0.005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0824  Crp/FNR family transcriptional regulator  37.21 
 
 		 225 aa  43.1  0.006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0928817  normal  0.0486748 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0814  CRP/FNR family transcriptional regulator  32.76 
 
 		 195 aa  43.1  0.006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0872325  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3725  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25.58 
 
 		 237 aa  43.1  0.007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0054318  normal  0.342144 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05940  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  19.32 
 
 		 231 aa  42.7  0.008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.558941  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2081  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  22.62 
 
 		 229 aa  42.4  0.009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.264181  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0339  cyclic nucleotide-binding  24.86 
 
 		 225 aa  42.4  0.009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>