More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_1332 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008148  Rxyl_1332  Crp/FNR family transcriptional regulator  100 
 
 
238 aa  461  1e-129  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.407818  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2076  Crp/FNR family transcriptional regulator  49.78 
 
 
234 aa  189  4e-47  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.398696  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2081  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  33.33 
 
 
229 aa  126  3e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.264181  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0299  Crp/FNR family transcriptional regulator  36.23 
 
 
247 aa  120  1.9999999999999998e-26  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1633  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.05 
 
 
226 aa  119  3.9999999999999996e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.391452  normal  0.0281193 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0698  CRP/FNR family transcriptional regulator  31.53 
 
 
227 aa  119  6e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0860  Crp/FNR family transcriptional regulator  36.95 
 
 
234 aa  118  7.999999999999999e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.693979  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1262  CRP/FNR family transcriptional regulator  33.64 
 
 
222 aa  115  6e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.247212  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4102  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  35.12 
 
 
251 aa  114  8.999999999999998e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.363021  normal  0.0126572 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2386  CRP/FNR family transcriptional regulator  27.15 
 
 
225 aa  114  1.0000000000000001e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0349  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  37.13 
 
 
222 aa  113  3e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000192919 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0517  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  33.49 
 
 
224 aa  113  3e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1641  cyclic nucleotide-binding  33.63 
 
 
267 aa  113  3e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0117  cyclic nucleotide-binding: regulatory protein, Crp  34.51 
 
 
228 aa  112  4.0000000000000004e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4850  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  34.39 
 
 
228 aa  112  4.0000000000000004e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3158  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.77 
 
 
223 aa  112  5e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04890  cAMP-binding protein  37.63 
 
 
226 aa  110  1.0000000000000001e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.84759 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1995  transcriptional regulator  36.28 
 
 
224 aa  110  1.0000000000000001e-23  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26230  cAMP-binding protein  36.27 
 
 
225 aa  110  2.0000000000000002e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.466611  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2039  CRP/FNR family transcriptional regulator  33.98 
 
 
226 aa  110  3e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0204  Crp/Fnr family transcriptional regulator  34.95 
 
 
226 aa  108  7.000000000000001e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0718939  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3095  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  36.68 
 
 
220 aa  108  9.000000000000001e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000148221 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18280  cAMP-binding protein  33.33 
 
 
225 aa  107  1e-22  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.186071  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3038  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  35.47 
 
 
225 aa  107  1e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0468  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  35.29 
 
 
226 aa  107  2e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.974187 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2034  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  32.07 
 
 
243 aa  107  2e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.663242  normal  0.0439569 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0291  Crp/FNR family transcriptional regulator  36.65 
 
 
227 aa  107  2e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.277011  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1944  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  32.98 
 
 
227 aa  106  4e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1955  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  31.05 
 
 
229 aa  105  6e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5315  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  32.69 
 
 
228 aa  105  9e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.527594 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0424  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  35.83 
 
 
242 aa  104  1e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.24952 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1275  Crp/FNR family transcriptional regulator  39.36 
 
 
230 aa  104  1e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.651323 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1482  CRP/FNR family transcriptional regulator  30.1 
 
 
235 aa  104  1e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000000238682  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3176  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  34.38 
 
 
225 aa  103  2e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.231761 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0608  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  35.42 
 
 
225 aa  102  4e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.847542  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2058  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  31.02 
 
 
225 aa  102  4e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3395  Crp/FNR family transcriptional regulator  34.38 
 
 
225 aa  102  4e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2082  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  31.02 
 
 
225 aa  102  4e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0339  cyclic nucleotide-binding  32.56 
 
 
225 aa  102  5e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0435  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  36.08 
 
 
226 aa  102  6e-21  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.376669 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18160  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30.41 
 
 
219 aa  102  6e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000607267  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1814  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.7 
 
 
225 aa  102  7e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2833  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  40.62 
 
 
213 aa  101  8e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0320601  normal  0.661336 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2775  Crp/FNR family transcriptional regulator  28.84 
 
 
232 aa  101  8e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.9012  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5808  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  31.53 
 
 
231 aa  101  9e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.254135  normal  0.0101482 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0824  Crp/FNR family transcriptional regulator  30.29 
 
 
225 aa  101  1e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0928817  normal  0.0486748 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0778  Crp/FNR family transcriptional regulator  27.85 
 
 
236 aa  101  1e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000312841  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1853  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30.41 
 
 
240 aa  100  2e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0127  Crp/FNR family transcriptional regulator  31.25 
 
 
222 aa  100  2e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.867755  normal  0.325855 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0372  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30.26 
 
 
225 aa  100  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0244  CRP/FNR family transcriptional regulator  36.65 
 
 
228 aa  99.8  3e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0431251 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0755  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30.21 
 
 
223 aa  99.8  3e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.125698 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1234  Crp/FNR family transcriptional regulator  36.36 
 
 
232 aa  99.8  3e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1592  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.71 
 
 
228 aa  99.8  4e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2023  Crp/FNR family transcriptional regulator  30.48 
 
 
221 aa  98.6  8e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0496812 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0106  Crp/FNR family transcriptional regulator  30.53 
 
 
254 aa  98.2  1e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0754  Crp/FNR family transcriptional regulator  27.4 
 
 
236 aa  97.8  1e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.0000212493  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3283  Crp/FNR family transcriptional regulator  30.11 
 
 
223 aa  97.4  2e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1294  cyclic nucleotide-binding: regulatory protein, Crp  34.5 
 
 
220 aa  96.7  3e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.957461  normal  0.413121 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2075  Crp/FNR family transcriptional regulator  31.63 
 
 
210 aa  96.3  4e-19  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22000  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  31.87 
 
 
235 aa  96.3  4e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.457493  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8981  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  35.23 
 
 
222 aa  96.3  4e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3725  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.18 
 
 
237 aa  95.9  5e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0054318  normal  0.342144 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09760  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.46 
 
 
226 aa  95.9  5e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0781  Crp/FNR family transcriptional regulator  27.32 
 
 
236 aa  95.9  5e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0113537  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1644  Crp/FNR family transcriptional regulator  34.2 
 
 
223 aa  95.1  7e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0559  Crp/FNR family transcriptional regulator  32.69 
 
 
225 aa  95.1  9e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.338488  normal  0.42035 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0269  Crp/FNR family transcriptional regulator  30.61 
 
 
238 aa  95.1  9e-19  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0757  Crp/FNR family transcriptional regulator  27.32 
 
 
236 aa  94.7  1e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0100726  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25400  cAMP-binding protein  32.95 
 
 
225 aa  94.7  1e-18  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1066  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.25 
 
 
225 aa  94.7  1e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2750  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  32.43 
 
 
222 aa  94.4  2e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000000354449  normal  0.602467 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0979  cAMP-binding protein  27.19 
 
 
239 aa  94  2e-18  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0893  Crp/FNR family transcriptional regulator  31.73 
 
 
226 aa  94  2e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05940  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.12 
 
 
231 aa  93.6  2e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.558941  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20120  cAMP-binding protein  35.38 
 
 
223 aa  93.6  2e-18  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00290987  normal  0.0142715 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1376  CRP/FNR family transcriptional regulator  28.75 
 
 
228 aa  94  2e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.271211  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1065  Crp/Fnr family transcriptional regulator  29.53 
 
 
223 aa  93.6  2e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.547512  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1659  cyclic nucleotide-binding  34.38 
 
 
223 aa  93.2  3e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.834954  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3348  cyclic nucleotide-binding  37.63 
 
 
254 aa  93.2  3e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.181039  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0303  cyclic nucleotide-binding domain protein  26.61 
 
 
236 aa  92.8  4e-18  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.232206 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0602  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  32.65 
 
 
225 aa  92.8  4e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.628877 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0884  Crp/Fnr family transcriptional regulator  36.98 
 
 
214 aa  92.4  5e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.163926  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1167  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.04 
 
 
239 aa  91.7  1e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000625437  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3932  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  31.13 
 
 
224 aa  90.1  2e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.571672  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3032  Crp family transcriptional regulator  32.56 
 
 
224 aa  90.9  2e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0461942  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1061  Crp family transcriptional regulator  31.25 
 
 
214 aa  90.5  2e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0336611  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4187  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  34.85 
 
 
254 aa  90.9  2e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.338954  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1005  cyclic nucleotide-binding  31.16 
 
 
226 aa  90.5  2e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.184599  normal  0.14907 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3176  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  24.35 
 
 
230 aa  90.5  2e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0993  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30.77 
 
 
229 aa  89.7  3e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.98476 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2279  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  24.35 
 
 
230 aa  89.7  3e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.216294  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1975  Crp/FNR family transcriptional regulator  24.35 
 
 
230 aa  89.7  3e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2928  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.02 
 
 
232 aa  89.7  3e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.39759 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3673  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  36.56 
 
 
254 aa  90.1  3e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.43296  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1984  Crp/FNR family transcriptional regulator  24.35 
 
 
230 aa  89.7  4e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.513682  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2132  Crp/FNR family transcriptional regulator  24.35 
 
 
226 aa  89.4  4e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1958  Crp/FNR family transcriptional regulator  24.35 
 
 
230 aa  89.4  5e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0304498  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1936  Crp/FNR family transcriptional regulator  24.35 
 
 
230 aa  89.4  5e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.308171  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2165  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  24.35 
 
 
230 aa  89.4  5e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>