More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BRA0281 on replicon NC_004311
Organism: Brucella suis 1330



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004311  BRA0281  transcriptional regulator NnrR  100 
 
 		 232 aa  470  1e-132  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0257  transcriptional regulator NnrR  98.71 
 
 		 232 aa  462  1e-129  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3114  CRP/FNR family transcriptional regulator  78.35 
 
 		 232 aa  374  1e-103  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0262  Crp/FNR family transcriptional regulator  60.26 
 
 		 231 aa  288  5.0000000000000004e-77  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0238  Crp/FNR family transcriptional regulator  60.26 
 
 		 231 aa  288  5.0000000000000004e-77  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4381  CRP/FNR family transcriptional regulator  55.46 
 
 		 231 aa  276  2e-73  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6276  CRP/FNR family transcriptional regulator  59.73 
 
 		 231 aa  276  3e-73  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.298402  normal  0.17195 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1523  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  48.03 
 
 		 231 aa  222  3e-57  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4277  Crp/FNR family transcriptional regulator  46.46 
 
 		 234 aa  218  5e-56  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4621  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  46.26 
 
 		 236 aa  218  8.999999999999998e-56  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1444  Crp/Fnr family transcriptional regulator  46.26 
 
 		 236 aa  217  1e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.920255  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1465  Crp/FNR family transcriptional regulator  46.26 
 
 		 236 aa  212  2.9999999999999995e-54  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.342125  normal  0.439299 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3945  Crp/FNR family transcriptional regulator  45.83 
 
 		 240 aa  211  5.999999999999999e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  decreased coverage  0.0000374248  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2246  Crp/FNR family transcriptional regulator  44.89 
 
 		 233 aa  209  3e-53  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6822  Crp/FNR family transcriptional regulator  45.37 
 
 		 239 aa  209  4e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0327  Crp/FNR family transcriptional regulator  40.45 
 
 		 233 aa  187  1e-46  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.539351  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1972  CRP/FNR family transcriptional regulator  40.45 
 
 		 233 aa  187  1e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0968  CRP/FNR family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 233 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1010  CRP/FNR family transcriptional regulator  39.19 
 
 		 257 aa  168  5e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2417  cyclic nucleotide-binding protein  35.91 
 
 		 250 aa  164  1.0000000000000001e-39  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.034588  normal  0.0382931 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2812  Crp/FNR family transcriptional regulator  35.91 
 
 		 243 aa  164  1.0000000000000001e-39  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2941  Crp/FNR family transcriptional regulator  36.8 
 
 		 235 aa  160  1e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1070  Crp/FNR family transcriptional regulator  36.41 
 
 		 235 aa  153  2e-36  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.105875  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3150  Crp/FNR family transcriptional regulator  33.18 
 
 		 252 aa  138  7e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3066  cyclic nucleotide-binding  31.65 
 
 		 240 aa  137  2e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0837  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  33.03 
 
 		 234 aa  136  2e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1660  Crp/FNR family transcriptional regulator  33.83 
 
 		 261 aa  127  2.0000000000000002e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.74426  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5204  CRP/FNR family transcriptional regulator  30.63 
 
 		 261 aa  125  5e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.26828 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1803  Crp/FNR family transcriptional regulator  29.6 
 
 		 249 aa  124  1e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0808632  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0824  Crp/FNR family transcriptional regulator  30.45 
 
 		 225 aa  123  3e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0928817  normal  0.0486748 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0698  CRP/FNR family transcriptional regulator  27.06 
 
 		 227 aa  122  4e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2386  CRP/FNR family transcriptional regulator  23.42 
 
 		 225 aa  122  7e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8112  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30.37 
 
 		 229 aa  121  8e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2020  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  35.29 
 
 		 239 aa  121  9.999999999999999e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0424227  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09760  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.99 
 
 		 226 aa  120  1.9999999999999998e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18160  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.91 
 
 		 219 aa  113  2.0000000000000002e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000607267  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0719  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  32.71 
 
 		 257 aa  113  2.0000000000000002e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000204419 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1633  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.03 
 
 		 226 aa  112  3e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.391452  normal  0.0281193 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3897  Crp/FNR family transcriptional regulator  26.51 
 
 		 227 aa  112  3e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.280734  normal  0.887061 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2039  CRP/FNR family transcriptional regulator  28.37 
 
 		 226 aa  112  5e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2668  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.1 
 
 		 225 aa  109  3e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0967754  hitchhiker  0.000000348595 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24470  cAMP-binding protein  32.46 
 
 		 261 aa  107  1e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0754  Crp/FNR family transcriptional regulator  23.08 
 
 		 236 aa  105  5e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.0000212493  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3395  Crp/FNR family transcriptional regulator  24.32 
 
 		 225 aa  104  9e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2492  response regulator receiver  26.54 
 
 		 352 aa  103  2e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.570528  normal  0.0101485 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1814  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  24.2 
 
 		 225 aa  103  2e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18280  cAMP-binding protein  25.23 
 
 		 225 aa  103  2e-21  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.186071  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0394  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.5 
 
 		 237 aa  103  3e-21  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0595  CRP/FNR family transcriptional regulator  25.12 
 
 		 228 aa  103  3e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.130469  unclonable  0.00000708114 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0778  Crp/FNR family transcriptional regulator  23.08 
 
 		 236 aa  103  3e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000312841  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3176  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  23.87 
 
 		 225 aa  102  4e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.231761 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3038  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25.45 
 
 		 225 aa  102  6e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0781  Crp/FNR family transcriptional regulator  20.36 
 
 		 236 aa  100  1e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0113537  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3468  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.51 
 
 		 227 aa  100  2e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3406  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.89 
 
 		 227 aa  100  2e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.757412  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0757  Crp/FNR family transcriptional regulator  20.36 
 
 		 236 aa  100  3e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0100726  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1279  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28 
 
 		 227 aa  100  3e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0123359  normal  0.583782 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0644  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28 
 
 		 243 aa  99.4  4e-20  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000386152  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0362  Crp/FNR family transcriptional regulator  25.34 
 
 		 234 aa  99.4  5e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.74387  normal  0.571703 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3421  Crp/FNR family transcriptional regulator  27.93 
 
 		 241 aa  98.6  8e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25400  cAMP-binding protein  24.11 
 
 		 225 aa  98.6  8e-20  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2034  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  23.53 
 
 		 243 aa  98.6  8e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.663242  normal  0.0439569 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4850  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  22.54 
 
 		 228 aa  97.8  1e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2803  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.82 
 
 		 229 aa  98.2  1e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2102  Crp/FNR family transcriptional regulator  29.13 
 
 		 226 aa  97.4  2e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000889631  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5808  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30.7 
 
 		 231 aa  97.1  2e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.254135  normal  0.0101482 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0339  cyclic nucleotide-binding  24.09 
 
 		 225 aa  97.4  2e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3095  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25.58 
 
 		 220 aa  96.3  4e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000148221 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2118  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  24.77 
 
 		 227 aa  95.5  6e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.545546  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1062  Crp/FNR family transcriptional regulator  24.66 
 
 		 236 aa  95.5  6e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0993  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.01 
 
 		 229 aa  95.5  6e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.98476 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0092  Crp/FNR family transcriptional regulator  27.93 
 
 		 230 aa  95.5  7e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000552774  hitchhiker  0.0000198015 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1167  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  24.06 
 
 		 239 aa  95.1  8e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000625437  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05940  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  22.97 
 
 		 231 aa  95.1  9e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.558941  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1250  Crp/FNR family transcriptional regulator  24.2 
 
 		 236 aa  94.4  1e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.403908  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5745  transcriptional regulator  22.52 
 
 		 243 aa  93.6  2e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.810963  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0700  CRP/FNR family transcriptional regulator  28.26 
 
 		 228 aa  94  2e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.259996 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2039  CRP/FNR family transcriptional regulator  28.72 
 
 		 242 aa  93.6  3e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.191538  hitchhiker  0.00387918 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2644  Crp/FNR family transcriptional regulator  26.48 
 
 		 248 aa  93.2  3e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.446339  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0435  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  24.55 
 
 		 226 aa  92.8  4e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.376669 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04890  cAMP-binding protein  25 
 
 		 226 aa  92.8  4e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.84759 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26230  cAMP-binding protein  22.77 
 
 		 225 aa  92.8  4e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.466611  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0851  CRP/FNR family transcriptional regulator  28.51 
 
 		 229 aa  92.8  4e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0183246  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0517  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  23.36 
 
 		 224 aa  91.3  1e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0204  Crp/Fnr family transcriptional regulator  22.54 
 
 		 226 aa  91.7  1e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0718939  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0117  cyclic nucleotide-binding: regulatory protein, Crp  22.79 
 
 		 228 aa  90.1  2e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0783  CRP/FNR family transcriptional regulator  27.88 
 
 		 217 aa  90.5  2e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20120  cAMP-binding protein  27.48 
 
 		 223 aa  90.5  2e-17  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00290987  normal  0.0142715 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5205  Crp/FNR family transcriptional regulator  23.81 
 
 		 224 aa  89.7  3e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.703662  hitchhiker  0.000819508 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4818  Crp/FNR family transcriptional regulator  23.81 
 
 		 224 aa  89.7  3e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4904  Crp/FNR family transcriptional regulator  23.81 
 
 		 224 aa  89.7  3e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.385516 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5435  CRP/FNR family transcriptional regulator  23.81 
 
 		 224 aa  89.4  4e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.397858 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1284  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  23.42 
 
 		 224 aa  89.4  5e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.304913  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1678  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  21.26 
 
 		 234 aa  89  6e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0857  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.27 
 
 		 229 aa  89  6e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5315  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  21.36 
 
 		 228 aa  88.6  8e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.527594 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0981  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.27 
 
 		 246 aa  88.6  8e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0154476 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0678  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25.52 
 
 		 236 aa  88.6  8e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0236133  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0424  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25 
 
 		 242 aa  88.2  9e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.24952 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2027  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25.93 
 
 		 226 aa  88.6  9e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>