More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_1312 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007575  Suden_1312  CRP/FNR family transcriptional regulator  100 
 
 
209 aa  410  1e-114  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  decreased coverage  0.000433355  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0349  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  40.51 
 
 
219 aa  158  7e-38  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000181532  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0691  cyclic nucleotide-binding protein  40.51 
 
 
212 aa  149  2e-35  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0436  transcription regulator  40 
 
 
214 aa  144  8.000000000000001e-34  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0316636  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1550  protein YieJ  38.83 
 
 
212 aa  144  1e-33  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0798  transcription regulator  36.36 
 
 
213 aa  142  4e-33  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000892201  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0465  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  36.73 
 
 
223 aa  128  5.0000000000000004e-29  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000196856  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1382  transcription regulator  36.25 
 
 
213 aa  109  2.0000000000000002e-23  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1473  putative transcriptional regulator  36.02 
 
 
198 aa  105  4e-22  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0168255  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0491  putative transcriptional regulator  35.48 
 
 
201 aa  102  5e-21  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0132873  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0516  putative transcriptional regulator  36.02 
 
 
198 aa  101  7e-21  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.635671  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0689  conserved hypothetical protein, putative transcriptional regulator  35.2 
 
 
200 aa  100  2e-20  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2600  Crp/FNR family transcriptional regulator  28.85 
 
 
229 aa  97.1  2e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0103419  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0339  cyclic nucleotide-binding  24.64 
 
 
225 aa  96.7  2e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1279  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.94 
 
 
227 aa  96.3  3e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0123359  normal  0.583782 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2644  Crp/FNR family transcriptional regulator  28.5 
 
 
248 aa  95.5  5e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.446339  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05940  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30 
 
 
231 aa  94.7  9e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.558941  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3176  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.05 
 
 
225 aa  94.4  1e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.231761 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0204  Crp/Fnr family transcriptional regulator  26.73 
 
 
226 aa  93.2  3e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0718939  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3395  Crp/FNR family transcriptional regulator  26.57 
 
 
225 aa  92.4  4e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0700  CRP/FNR family transcriptional regulator  25.63 
 
 
228 aa  92  6e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.259996 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4850  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  23.67 
 
 
228 aa  91.3  9e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0117  cyclic nucleotide-binding: regulatory protein, Crp  24.64 
 
 
228 aa  90.9  1e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0993  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25.13 
 
 
229 aa  90.9  1e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.98476 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3445  Crp/FNR family transcriptional regulator  27.78 
 
 
228 aa  90.5  1e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.90711  unclonable  0.00000836213 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1286  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.17 
 
 
227 aa  89.7  3e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2593  Crp/FNR family transcriptional regulator  25.62 
 
 
254 aa  89.4  3e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.431237  normal  0.296758 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2803  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.54 
 
 
229 aa  89.4  4e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4660  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.27 
 
 
225 aa  89  5e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3583  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.27 
 
 
225 aa  89  5e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2118  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.32 
 
 
227 aa  88.2  7e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.545546  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1167  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.92 
 
 
239 aa  87.8  1e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000625437  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18280  cAMP-binding protein  26.09 
 
 
225 aa  87.4  1e-16  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.186071  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5315  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  23.67 
 
 
228 aa  86.7  3e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.527594 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1785  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.5 
 
 
225 aa  86.3  3e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0232074  normal  0.813169 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3421  Crp/FNR family transcriptional regulator  28.22 
 
 
241 aa  85.9  4e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2109  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.5 
 
 
225 aa  85.9  4e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.170093  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2574  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  23.94 
 
 
236 aa  85.9  4e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0710  cyclic nucleotide-binding protein  31.41 
 
 
221 aa  85.5  5e-16  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000071434  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09760  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.57 
 
 
226 aa  85.5  6e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0468  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  23.96 
 
 
226 aa  85.5  6e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.974187 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0092  Crp/FNR family transcriptional regulator  27.54 
 
 
230 aa  85.1  7e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000552774  hitchhiker  0.0000198015 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0851  CRP/FNR family transcriptional regulator  28.99 
 
 
229 aa  84  0.000000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0183246  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0517  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25.58 
 
 
224 aa  83.6  0.000000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3187  Crp/FNR family transcriptional regulator  24.88 
 
 
231 aa  83.2  0.000000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0154809 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0139  cAMP-regulatory protein  26.78 
 
 
214 aa  83.6  0.000000000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0698  CRP/FNR family transcriptional regulator  27.27 
 
 
227 aa  84  0.000000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0824  Crp/FNR family transcriptional regulator  23.67 
 
 
225 aa  82.4  0.000000000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0928817  normal  0.0486748 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1763  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  23.38 
 
 
223 aa  82.4  0.000000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.796832  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18160  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25.96 
 
 
219 aa  82.8  0.000000000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000607267  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3406  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.72 
 
 
227 aa  82  0.000000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.757412  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3468  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.72 
 
 
227 aa  82  0.000000000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0258  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.24 
 
 
222 aa  81.6  0.000000000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3038  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  24.75 
 
 
225 aa  81.3  0.000000000000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2102  Crp/FNR family transcriptional regulator  28.71 
 
 
226 aa  81.3  0.000000000000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000889631  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1995  transcriptional regulator  21.74 
 
 
224 aa  81.3  0.000000000000009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1814  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  24.15 
 
 
225 aa  80.9  0.00000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1296  CRP/FNR family transcriptional regulator  30.3 
 
 
218 aa  80.5  0.00000000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00112875  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0755  cAMP-regulatory protein  25 
 
 
211 aa  80.9  0.00000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.276204 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2034  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25.96 
 
 
243 aa  80.5  0.00000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.663242  normal  0.0439569 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1633  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.79 
 
 
226 aa  80.1  0.00000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.391452  normal  0.0281193 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3784  cAMP-regulatory protein  25.14 
 
 
210 aa  79.7  0.00000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0916512  hitchhiker  0.00483948 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0293  cAMP-regulatory protein  24.59 
 
 
210 aa  79.7  0.00000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.160804  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2386  CRP/FNR family transcriptional regulator  27.4 
 
 
225 aa  79.3  0.00000000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2039  CRP/FNR family transcriptional regulator  25 
 
 
226 aa  79  0.00000000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0369  cAMP-regulatory protein  24.59 
 
 
210 aa  79.3  0.00000000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02297  transcription regulator protein  24.24 
 
 
225 aa  79  0.00000000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.419231 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3663  cAMP-regulatory protein  24.59 
 
 
210 aa  79  0.00000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.185514  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3771  cAMP-regulatory protein  24.59 
 
 
210 aa  79  0.00000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.275024  normal  0.523362 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3834  cAMP-regulatory protein  24.59 
 
 
210 aa  79  0.00000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.429858  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3737  cAMP-regulatory protein  24.59 
 
 
210 aa  79  0.00000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0176942 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00075  cAMP-regulatory protein  25.14 
 
 
210 aa  79  0.00000000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3663  cAMP-regulatory protein  24.59 
 
 
210 aa  79  0.00000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03208  DNA-binding transcriptional dual regulator  24.59 
 
 
210 aa  78.6  0.00000000000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0221065  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0355  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  24.59 
 
 
210 aa  78.6  0.00000000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000236327  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3639  cAMP-regulatory protein  24.59 
 
 
210 aa  78.6  0.00000000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000269957 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3554  cAMP-regulatory protein  24.59 
 
 
210 aa  78.6  0.00000000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03160  hypothetical protein  24.59 
 
 
210 aa  78.6  0.00000000000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0202429  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4667  cAMP-regulatory protein  24.59 
 
 
210 aa  78.6  0.00000000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00224827  normal  0.233908 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3733  cAMP-regulatory protein  24.59 
 
 
210 aa  78.6  0.00000000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0355  cAMP-regulatory protein  24.59 
 
 
210 aa  78.6  0.00000000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0526852  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0324  Crp/FNR family transcriptional regulator  21.61 
 
 
226 aa  78.6  0.00000000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.105795  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1010  CRP/FNR family transcriptional regulator  23.04 
 
 
257 aa  78.6  0.00000000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3191  transcriptional regulator Dnr  23.23 
 
 
227 aa  78.2  0.00000000000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0388  cAMP-regulatory protein  25.79 
 
 
212 aa  78.6  0.00000000000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0189183  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002279  cyclic AMP receptor protein  25.14 
 
 
210 aa  78.2  0.00000000000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3827  cAMP-regulatory protein  24.59 
 
 
210 aa  77.8  0.0000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1066  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  22.58 
 
 
225 aa  77.4  0.0000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2562  cyclic AMP receptor protein  25.76 
 
 
222 aa  77.8  0.0000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.553837  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1512  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  29.23 
 
 
221 aa  77.4  0.0000000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00000347396  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8903  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  23.67 
 
 
224 aa  77.4  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25400  cAMP-binding protein  23.76 
 
 
225 aa  77.8  0.0000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3853  cAMP-regulatory protein  24.59 
 
 
210 aa  77.4  0.0000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0248  cAMP-regulatory protein  24.59 
 
 
210 aa  77  0.0000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4032  cAMP-regulatory protein  24.59 
 
 
210 aa  77  0.0000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.203601  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3702  cAMP-regulatory protein  24.59 
 
 
210 aa  77  0.0000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1643  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  24.15 
 
 
227 aa  76.6  0.0000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2376  CRP/FNR family transcriptional regulator  25.57 
 
 
226 aa  76.6  0.0000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.253524 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04890  cAMP-binding protein  23.76 
 
 
226 aa  77.4  0.0000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.84759 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4580  cAMP-regulatory protein  24.59 
 
 
210 aa  76.6  0.0000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0550419  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>