More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCV52592_0436 on replicon NC_009715
Organism: Campylobacter curvus 525.92



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009715  CCV52592_0436  transcription regulator  100 
 
 
214 aa  430  1e-120  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0316636  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1550  protein YieJ  74.06 
 
 
212 aa  333  1e-90  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0798  transcription regulator  54.5 
 
 
213 aa  242  3e-63  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000892201  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0691  cyclic nucleotide-binding protein  45.63 
 
 
212 aa  190  1e-47  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0349  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  39.34 
 
 
219 aa  174  9e-43  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000181532  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1382  transcription regulator  44.23 
 
 
213 aa  169  3e-41  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0465  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  41.35 
 
 
223 aa  169  4e-41  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000196856  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1312  CRP/FNR family transcriptional regulator  40 
 
 
209 aa  144  9e-34  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  decreased coverage  0.000433355  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0689  conserved hypothetical protein, putative transcriptional regulator  38.18 
 
 
200 aa  113  3e-24  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1473  putative transcriptional regulator  34.38 
 
 
198 aa  112  4.0000000000000004e-24  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0168255  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0491  putative transcriptional regulator  34.83 
 
 
201 aa  109  4.0000000000000004e-23  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0132873  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0516  putative transcriptional regulator  33.85 
 
 
198 aa  108  6e-23  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.635671  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1296  CRP/FNR family transcriptional regulator  32.82 
 
 
218 aa  107  1e-22  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00112875  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2600  Crp/FNR family transcriptional regulator  31.98 
 
 
229 aa  103  3e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0103419  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0698  CRP/FNR family transcriptional regulator  31.94 
 
 
227 aa  101  8e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2118  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.59 
 
 
227 aa  99  5e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.545546  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0710  cyclic nucleotide-binding protein  31.31 
 
 
221 aa  99  5e-20  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000071434  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2574  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.91 
 
 
236 aa  98.6  6e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3468  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.51 
 
 
227 aa  97.8  1e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3187  Crp/FNR family transcriptional regulator  29.15 
 
 
231 aa  97.1  2e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0154809 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3406  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.18 
 
 
227 aa  97.1  2e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.757412  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3445  Crp/FNR family transcriptional regulator  30 
 
 
228 aa  97.1  2e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.90711  unclonable  0.00000836213 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2386  CRP/FNR family transcriptional regulator  28.64 
 
 
225 aa  95.9  4e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1512  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  29.56 
 
 
221 aa  94.4  1e-18  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00000347396  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1633  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.52 
 
 
226 aa  93.6  2e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.391452  normal  0.0281193 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5315  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.07 
 
 
228 aa  93.6  2e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.527594 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0993  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  22.75 
 
 
229 aa  94  2e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.98476 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0824  Crp/FNR family transcriptional regulator  27.18 
 
 
225 aa  93.2  3e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0928817  normal  0.0486748 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2644  Crp/FNR family transcriptional regulator  25.96 
 
 
248 aa  92.4  4e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.446339  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1279  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.01 
 
 
227 aa  92.4  4e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0123359  normal  0.583782 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18160  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.42 
 
 
219 aa  92  6e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000607267  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3421  Crp/FNR family transcriptional regulator  30.19 
 
 
241 aa  91.3  1e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2803  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.7 
 
 
229 aa  88.2  9e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3176  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25 
 
 
225 aa  87.4  2e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.231761 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0117  cyclic nucleotide-binding: regulatory protein, Crp  24.64 
 
 
228 aa  86.7  2e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0092  Crp/FNR family transcriptional regulator  29.11 
 
 
230 aa  87  2e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000552774  hitchhiker  0.0000198015 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3395  Crp/FNR family transcriptional regulator  24.53 
 
 
225 aa  85.5  5e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3071  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.18 
 
 
224 aa  85.1  7e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00222127  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0700  CRP/FNR family transcriptional regulator  21.33 
 
 
228 aa  85.1  7e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.259996 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09760  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.77 
 
 
226 aa  84.7  9e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2034  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.54 
 
 
243 aa  84.7  9e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.663242  normal  0.0439569 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1803  Crp/FNR family transcriptional regulator  24.02 
 
 
249 aa  84.7  9e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0808632  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1555  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.54 
 
 
230 aa  84.3  0.000000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0079  Crp/FNR family transcriptional regulator  30 
 
 
225 aa  84.7  0.000000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.849443  normal  0.162256 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2102  Crp/FNR family transcriptional regulator  26.7 
 
 
226 aa  84.3  0.000000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000889631  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1995  transcriptional regulator  23.29 
 
 
224 aa  83.6  0.000000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0851  CRP/FNR family transcriptional regulator  28.05 
 
 
229 aa  83.2  0.000000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0183246  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2562  cyclic AMP receptor protein  28.64 
 
 
222 aa  82.4  0.000000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.553837  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4850  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  23.11 
 
 
228 aa  82.4  0.000000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0608  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.67 
 
 
225 aa  82.4  0.000000000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.847542  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0362  Crp/FNR family transcriptional regulator  30.77 
 
 
234 aa  82.4  0.000000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.74387  normal  0.571703 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0339  cyclic nucleotide-binding  23.33 
 
 
225 aa  81.6  0.000000000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0857  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.73 
 
 
229 aa  80.9  0.00000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1643  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.11 
 
 
227 aa  81.3  0.00000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0981  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.73 
 
 
246 aa  80.9  0.00000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.0154476 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0204  Crp/Fnr family transcriptional regulator  22.75 
 
 
226 aa  80.5  0.00000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0718939  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1658  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.59 
 
 
222 aa  79.7  0.00000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.365354  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1356  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.59 
 
 
222 aa  79.7  0.00000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1119  catabolite gene activator (cAMP receptor protein) (cAMP-regulatory protein)  19.81 
 
 
222 aa  79  0.00000000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.106899 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1814  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25 
 
 
225 aa  78.6  0.00000000000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2039  CRP/FNR family transcriptional regulator  25.24 
 
 
226 aa  77.8  0.0000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0755  Crp/FNR family transcriptional regulator  19.23 
 
 
222 aa  77  0.0000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.2571 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5062  cyclic nucleotide-binding  26.73 
 
 
254 aa  77  0.0000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.319018  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1284  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  20.28 
 
 
224 aa  76.6  0.0000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.304913  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20120  cAMP-binding protein  25 
 
 
223 aa  77  0.0000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00290987  normal  0.0142715 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0468  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  23.33 
 
 
226 aa  77  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.974187 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1286  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.08 
 
 
227 aa  76.6  0.0000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2593  Crp/FNR family transcriptional regulator  22.5 
 
 
254 aa  75.9  0.0000000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.431237  normal  0.296758 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05940  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  24.14 
 
 
231 aa  75.9  0.0000000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.558941  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1491  Crp/FNR family transcriptional regulator  24.75 
 
 
224 aa  75.5  0.0000000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000413534  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1678  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.37 
 
 
234 aa  75.9  0.0000000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0424  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  22.37 
 
 
242 aa  75.5  0.0000000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.24952 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2706  Crp/FNR family transcriptional regulator  24.64 
 
 
228 aa  74.7  0.0000000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.154877  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3095  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  23.36 
 
 
220 aa  74.3  0.000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000148221 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3427  Crp/FNR family transcriptional regulator  23.65 
 
 
223 aa  73.9  0.000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0598833  hitchhiker  0.00496827 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4617  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  22.45 
 
 
243 aa  73.6  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.652735  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2775  Crp/FNR family transcriptional regulator  23.29 
 
 
232 aa  73.6  0.000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.9012  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0780  Crp/FNR family transcriptional regulator  28.14 
 
 
231 aa  73.9  0.000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.390237  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25400  cAMP-binding protein  21.53 
 
 
225 aa  73.6  0.000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4483  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  22.45 
 
 
243 aa  73.6  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.183908 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0292  CRP/FNR family transcriptional regulator  25.24 
 
 
224 aa  72.8  0.000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.210312  normal  0.0189188 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1062  Crp/FNR family transcriptional regulator  25.11 
 
 
236 aa  72.8  0.000000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2444  Crp/FNR family transcriptional regulator  23.22 
 
 
238 aa  73.2  0.000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000577484  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1250  Crp/FNR family transcriptional regulator  25.11 
 
 
236 aa  72.4  0.000000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.403908  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2020  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  24.19 
 
 
239 aa  72.8  0.000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0424227  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1167  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  23.11 
 
 
239 aa  72.4  0.000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000625437  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2323  CRP/FNR family transcriptional regulator  25.26 
 
 
233 aa  72.4  0.000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00053006  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1660  Crp/FNR family transcriptional regulator  22.12 
 
 
261 aa  72.4  0.000000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.74426  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1294  cyclic nucleotide-binding: regulatory protein, Crp  22.82 
 
 
220 aa  72  0.000000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.957461  normal  0.413121 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3138  Crp/FNR family transcriptional regulator  30.91 
 
 
248 aa  72  0.000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18280  cAMP-binding protein  22.64 
 
 
225 aa  72  0.000000000007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.186071  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1691  CRP/FNR family transcriptional regulator  20.37 
 
 
232 aa  72  0.000000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00272653  normal  0.637065 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0388  cAMP-regulatory protein  29.57 
 
 
212 aa  71.6  0.000000000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0189183  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3800  Crp/FNR family transcriptional regulator  17.7 
 
 
225 aa  70.9  0.00000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0407  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  24.17 
 
 
243 aa  70.9  0.00000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5745  transcriptional regulator  22.17 
 
 
243 aa  71.2  0.00000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.810963  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0719  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  19.18 
 
 
257 aa  71.2  0.00000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000204419 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5122  Crp/FNR family transcriptional regulator  30.45 
 
 
248 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0757  Crp/FNR family transcriptional regulator  25.46 
 
 
236 aa  70.5  0.00000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0100726  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0258  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.05 
 
 
222 aa  70.5  0.00000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>