248 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_82287 on replicon NC_009042
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009042  PICST_82287  cAMP-dependent protein kinase regulatory subunit (PKA regulatory subunit)  100 
 
 
441 aa  907    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.770378 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04987  cAMP-dependent protein kinase regulatory subunit (PKA regulatory subunit) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:O59922]  47.37 
 
 
412 aa  275  9e-73  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.599779  normal  0.51731 
 
 
-
 
NC_006670  CNA05510  cAMP-dependent protein kinase inhibitor, putative  35 
 
 
482 aa  246  4.9999999999999997e-64  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_3120  predicted protein  37.99 
 
 
241 aa  161  2e-38  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_5235  predicted protein  34.6 
 
 
263 aa  143  6e-33  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.540131  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_11563  predicted protein  35.06 
 
 
238 aa  127  3e-28  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.684972  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_12211  predicted protein  34.8 
 
 
528 aa  120  4.9999999999999996e-26  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_10848  predicted protein  31.33 
 
 
261 aa  119  1.9999999999999998e-25  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_12655  predicted protein  26.17 
 
 
260 aa  109  8.000000000000001e-23  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_27248  predicted protein  30.77 
 
 
680 aa  99.4  1e-19  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.2735 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_29662  predicted protein  30.77 
 
 
680 aa  99.4  1e-19  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.226582  normal  0.0425728 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0343  cyclic nucleotide-binding protein  27.4 
 
 
811 aa  77.8  0.0000000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0783507  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3368  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.39 
 
 
503 aa  72.8  0.00000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00879958  normal  0.135189 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3152  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25.1 
 
 
487 aa  72  0.00000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.833452  normal  0.47191 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0301  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  27.19 
 
 
858 aa  68.6  0.0000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3689  cyclic nucleotide-binding protein  30.17 
 
 
454 aa  64.7  0.000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.120597  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0420  cyclic nucleotide-binding protein  29.35 
 
 
255 aa  62.8  0.00000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.554509  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2230  hypothetical protein  25.28 
 
 
356 aa  62  0.00000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00323716 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2270  cyclic nucleotide-binding protein  30.94 
 
 
477 aa  62.4  0.00000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00166052 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2946  cyclic nucleotide-binding protein  25.27 
 
 
369 aa  61.2  0.00000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.360561  normal  0.390891 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2894  cyclic nucleotide-binding protein  32.05 
 
 
482 aa  61.6  0.00000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00660929  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2199  cyclic nucleotide-binding protein  30.7 
 
 
357 aa  60.8  0.00000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0664  cyclic nucleotide-binding  33.64 
 
 
449 aa  60.1  0.00000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0101822  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0590  cyclic nucleotide-binding protein  26.09 
 
 
801 aa  60.5  0.00000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.120802  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3166  cyclic nucleotide-binding protein  28.71 
 
 
482 aa  60.1  0.00000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00363184  normal 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_4561  predicted protein  29.75 
 
 
121 aa  59.7  0.00000009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0295097 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4351  cyclic nucleotide-binding protein  34.69 
 
 
948 aa  58.9  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3804  MscS Mechanosensitive ion channel  29.63 
 
 
495 aa  58.9  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2593  cyclic nucleotide-binding protein  24.89 
 
 
707 aa  58.9  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000223415 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2616  cyclic nucleotide-binding protein  38.64 
 
 
219 aa  58.2  0.0000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1108  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.87 
 
 
1075 aa  58.2  0.0000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000733786  normal  0.267995 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09760  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  33.33 
 
 
226 aa  57.4  0.0000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2303  MscS Mechanosensitive ion channel  34.02 
 
 
512 aa  57  0.0000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.697138  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4944  cyclic nucleotide-binding protein  27.93 
 
 
454 aa  57  0.0000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0658137  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5417  cyclic nucleotide-binding protein  35.96 
 
 
419 aa  57  0.0000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0881735  normal  0.0681678 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3370  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  36.36 
 
 
425 aa  56.6  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2732  cyclic nucleotide-binding protein  36.36 
 
 
425 aa  56.6  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1061  Crp family transcriptional regulator  36.05 
 
 
214 aa  55.8  0.000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0336611  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1284  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.93 
 
 
224 aa  55.8  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.304913  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3038  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  31.63 
 
 
225 aa  55.5  0.000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3722  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  23.57 
 
 
760 aa  55.5  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.44099  normal  0.232019 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0840  cyclic nucleotide-binding protein  29.03 
 
 
350 aa  55.1  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.126759 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1814  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  36.36 
 
 
225 aa  55.8  0.000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3539  cyclic nucleotide-binding protein  31.86 
 
 
857 aa  55.5  0.000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0290793  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0929  bacteriocin-processing peptidase  31.91 
 
 
1040 aa  54.7  0.000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.247839  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4460  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.79 
 
 
171 aa  54.7  0.000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2519  cyclic nucleotide-regulated small mechanosensitive ion channel  28.04 
 
 
492 aa  54.7  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.806579  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2775  Crp/FNR family transcriptional regulator  30.17 
 
 
232 aa  54.7  0.000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.9012  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3345  cyclic nucleotide-binding protein  32.65 
 
 
417 aa  54.7  0.000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.254717  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1513  cyclic nucleotide-binding protein  27.41 
 
 
308 aa  54.3  0.000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00604424  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0098  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  34.88 
 
 
211 aa  54.3  0.000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  4.4392599999999995e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1119  catabolite gene activator (cAMP receptor protein) (cAMP-regulatory protein)  27.93 
 
 
222 aa  54.3  0.000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.106899 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5091  MscS Mechanosensitive ion channel  25.87 
 
 
637 aa  54.3  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00148956  normal  0.0183068 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2905  cyclic nucleotide-binding protein  26.67 
 
 
157 aa  53.9  0.000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0600936 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36130  cAMP-binding protein  29.82 
 
 
224 aa  53.9  0.000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.758224 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5808  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  33.33 
 
 
231 aa  53.9  0.000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.254135  normal  0.0101482 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3626  cyclic nucleotide-regulated small mechanosensitive ion channel  30.25 
 
 
489 aa  53.9  0.000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0841  cyclic nucleotide-binding protein  27.37 
 
 
160 aa  53.9  0.000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.108052 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6450  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  36.05 
 
 
253 aa  53.9  0.000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3831  cyclic nucleotide-binding protein  29.81 
 
 
435 aa  53.9  0.000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0387698 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2725  cyclic nucleotide binding/GGDEF domain-containing protein  30 
 
 
322 aa  53.1  0.000009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.792666  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26230  cAMP-binding protein  29.81 
 
 
225 aa  53.1  0.000009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.466611  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04510  cyclic nucleotide-binding domain protein (AFU_orthologue; AFUA_2G03170)  32.26 
 
 
923 aa  52.8  0.00001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0755  Crp/FNR family transcriptional regulator  28.04 
 
 
222 aa  53.1  0.00001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.2571 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5052  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.57 
 
 
228 aa  52.8  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.267336 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1598  hypothetical protein  32.14 
 
 
407 aa  52.4  0.00001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.303519  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1494  cyclic nucleotide-binding protein  38.16 
 
 
119 aa  52.8  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00548568  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0253  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.82 
 
 
224 aa  53.1  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4020  cyclic nucleotide-binding  31.96 
 
 
367 aa  52  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.109231  normal  0.727114 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1178  cyclic nucleotide-regulated small mechanosensitive ion channel  29.36 
 
 
505 aa  52.4  0.00002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.811879  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1954  putative Crp/Fnr family transcriptional regulator  27.78 
 
 
141 aa  52  0.00002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009047  PICST_63653  Leucine rich repeat protein, contains F-box  21.93 
 
 
868 aa  52.4  0.00002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.422768  normal  0.952681 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4167  cyclic nucleotide-binding protein  27.73 
 
 
570 aa  52  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3942  cAMP-dependent protein kinase regulatory subunit  34.09 
 
 
154 aa  51.2  0.00003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.644852  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0765  MscS Mechanosensitive ion channel  28.43 
 
 
484 aa  51.2  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2775  cyclic nucleotide-regulated small mechanosensitive ion channel  28.3 
 
 
493 aa  51.6  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.85719 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0475  bacteriocin-processing peptidase  28.26 
 
 
1018 aa  51.6  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.977404  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2710  cyclic nucleotide-binding protein  35.23 
 
 
388 aa  51.2  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3395  Crp/FNR family transcriptional regulator  32.63 
 
 
225 aa  51.2  0.00003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5013  cyclic nucleotide-binding protein  28.16 
 
 
147 aa  51.6  0.00003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.32822  normal  0.191008 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0736  MscS Mechanosensitive ion channel  28.43 
 
 
484 aa  51.2  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4286  Crp/FNR family transcriptional regulator  29.21 
 
 
241 aa  50.8  0.00004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2419  cyclic nucleotide-binding protein  28.69 
 
 
563 aa  51.2  0.00004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.871595  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3212  CRP/FNR family transcriptional regulator  27.03 
 
 
229 aa  51.2  0.00004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0543887  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18280  cAMP-binding protein  33.33 
 
 
225 aa  50.8  0.00005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.186071  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3176  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  32.63 
 
 
225 aa  50.8  0.00005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.231761 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1062  Crp/FNR family transcriptional regulator  30.16 
 
 
236 aa  50.8  0.00005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13268  transmembrane transport protein  30.1 
 
 
1048 aa  50.8  0.00005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.321047 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0998  cyclic nucleotide-binding protein  25.74 
 
 
265 aa  50.8  0.00005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00000000222196  unclonable  1.0277600000000001e-18 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1298  cyclic nucleotide binding domain-containing protein  32.41 
 
 
177 aa  50.4  0.00007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000825589  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5607  cAMP-dependent protein kinase regulatory subunit  31.07 
 
 
154 aa  50.4  0.00007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3692  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  30 
 
 
146 aa  50.1  0.00007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4730  cyclic nucleotide-binding protein  28.57 
 
 
286 aa  50.1  0.00007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.813554  normal  0.722063 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1944  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.45 
 
 
227 aa  50.1  0.00007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1250  Crp/FNR family transcriptional regulator  29.37 
 
 
236 aa  50.1  0.00009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.403908  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0299  Crp/FNR family transcriptional regulator  25.98 
 
 
247 aa  49.3  0.0001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3904  cyclic nucleotide-binding:Sulfate transporter/antisigma-factor antagonist STAS:xanthine/uracil/vitamin C permease:sulphate transporter  28.24 
 
 
736 aa  49.3  0.0001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2911  cyclic nucleotide-binding protein  28.38 
 
 
1124 aa  49.3  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.965385  normal  0.0176228 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0154  serine/threonine-protein kinase  27.68 
 
 
447 aa  49.3  0.0001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1167  cyclic nucleotide-binding protein  32.47 
 
 
127 aa  49.3  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>