More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_3904 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007298  Daro_3904  cyclic nucleotide-binding:Sulfate transporter/antisigma-factor antagonist STAS:xanthine/uracil/vitamin C permease:sulphate transporter  100 
 
 
736 aa  1471    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02853  low affinity sulfate transporter  32.3 
 
 
545 aa  209  1e-52  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0985  putative sulfate transporter  30.36 
 
 
549 aa  201  3.9999999999999996e-50  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1867  sulphate transporter  30.25 
 
 
557 aa  196  1e-48  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0504  putative sulfate transporter  30.54 
 
 
558 aa  196  1e-48  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.602665  normal  0.0793834 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02911  putative sulfate transporter  32.04 
 
 
555 aa  195  2e-48  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1831  putative sulfate transporter  30.55 
 
 
560 aa  194  3e-48  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.505905  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0104  Sulfate transporter/antisigma-factor antagonist STAS  30.47 
 
 
565 aa  192  2e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07961  putative sulfate transporter  30.34 
 
 
573 aa  192  2e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1575  sulfate transporter  30.7 
 
 
570 aa  191  4e-47  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02441  putative sulfate transporter  29.36 
 
 
551 aa  190  7e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0624614  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02331  putative sulfate transporter  29.26 
 
 
550 aa  190  9e-47  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.868992  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1581  putative sulfate transporter  32.04 
 
 
555 aa  190  9e-47  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0245  sulfate transporter family protein  29.89 
 
 
605 aa  189  2e-46  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.651817  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02351  putative sulfate transporter  29.46 
 
 
550 aa  189  2e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.779533  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0216  putative sulfate transporter  29.19 
 
 
550 aa  189  2e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0891  putative sulfate transporter  30.1 
 
 
565 aa  188  3e-46  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02341  putative sulfate transporter  31.77 
 
 
577 aa  186  1.0000000000000001e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1057  sulphate transporter  30.68 
 
 
574 aa  185  2.0000000000000003e-45  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0213258  normal  0.0387274 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03456  hypothetical protein  27.54 
 
 
562 aa  185  3e-45  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0736  sulphate anion transporter  26.59 
 
 
545 aa  184  4.0000000000000006e-45  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002556  sulfate permease family protein  27.54 
 
 
556 aa  184  7e-45  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.790014  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0363  sulfate transporter  27.27 
 
 
552 aa  183  9.000000000000001e-45  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2050  sulphate transporter  27.87 
 
 
571 aa  183  1e-44  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.135317 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0119  sulfate permease family protein  27.91 
 
 
548 aa  182  2e-44  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0615  sulphate transporter  33.75 
 
 
540 aa  181  2.9999999999999997e-44  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1754  sulfate permease family protein  27.89 
 
 
536 aa  180  7e-44  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0323665  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0913  sulfate transporter  28.79 
 
 
568 aa  179  2e-43  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4725  sulphate transporter  29.87 
 
 
561 aa  179  2e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5025  cyclic nucleotide-binding  27.25 
 
 
749 aa  178  3e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0554599  normal  0.33022 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1731  SulP family sulfate permease  27.61 
 
 
551 aa  178  4e-43  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.281721  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0754  sulfate transporter/antisigma-factor antagonist STAS  29.84 
 
 
573 aa  177  7e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02105  permease protein of sulfate transporter  31.73 
 
 
550 aa  177  9e-43  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.862998  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1459  SulP family sulfate permease  27.24 
 
 
551 aa  175  1.9999999999999998e-42  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.032999  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2701  sulfate transporter  27.35 
 
 
568 aa  174  3.9999999999999995e-42  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.293526 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1474  sulphate transporter  26.66 
 
 
560 aa  173  7.999999999999999e-42  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.525598  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1136  sulfate transporter  27.17 
 
 
572 aa  173  1e-41  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1648  sulfate transporter  27.13 
 
 
568 aa  173  1e-41  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.423895  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0441  sulfate transporter  25.49 
 
 
587 aa  172  2e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0288663  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1549  sulfate transporter  26.62 
 
 
552 aa  172  2e-41  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.0674996 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2189  sulphate transporter  28.19 
 
 
550 aa  171  4e-41  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1078  sulfate transporter  27.39 
 
 
552 aa  171  5e-41  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.408762  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2103  sulfate transporter  26.21 
 
 
568 aa  171  6e-41  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0840  sulfate transporter  26.96 
 
 
559 aa  169  1e-40  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0930  sulfate transporter  30.78 
 
 
489 aa  168  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4401  sulfate transporter  30.78 
 
 
489 aa  165  3e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.840656  hitchhiker  0.00000000131237 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2506  sulfate permease  30.05 
 
 
581 aa  165  3e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.037188  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2454  sulfate transporter  27.26 
 
 
606 aa  165  3e-39  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.792452  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0667  sulphate anion transporter  26.74 
 
 
570 aa  164  6e-39  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0679788 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2581  sulphate transporter  23.95 
 
 
563 aa  163  8.000000000000001e-39  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000213177  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0900  sulfate transporter  26.86 
 
 
556 aa  164  8.000000000000001e-39  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.312059 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0864  hypothetical protein  26.16 
 
 
567 aa  162  2e-38  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0781  sulphate transporter  30.02 
 
 
489 aa  162  3e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.292925  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0056  cyclic nucleotide-binding  23.72 
 
 
739 aa  162  3e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0835  hypothetical protein  26.52 
 
 
567 aa  161  4e-38  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0022  sulfate permease family protein  27.76 
 
 
558 aa  159  1e-37  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1058  sulphate transporter  33.02 
 
 
550 aa  159  1e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.161168  normal  0.396315 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0405  sulphate transporter  25.18 
 
 
560 aa  159  2e-37  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3404  sulfate permease family protein  25.28 
 
 
587 aa  158  3e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1686  sulfate transporter  25.6 
 
 
552 aa  158  4e-37  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1334  putative sulfate transporter YchM  26.04 
 
 
574 aa  157  6e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.817877  normal  0.258167 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2305  sulphate transporter  29.16 
 
 
549 aa  157  6e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0968  sulfate permease family protein  29.65 
 
 
498 aa  156  2e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1553  sulphate anion transporter  27.94 
 
 
553 aa  155  2e-36  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000000364529  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2017  sulfate transporter  29.23 
 
 
730 aa  156  2e-36  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1058  sulfate permease family protein  30.59 
 
 
492 aa  154  5.9999999999999996e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000677797  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0781  sulfate transporter  28.82 
 
 
492 aa  153  8.999999999999999e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0718  cyclic nucleotide-binding  24.8 
 
 
747 aa  153  8.999999999999999e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00567448  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3980  sulfate permease family protein  28.36 
 
 
567 aa  152  2e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0780  sulfate transporter  29.51 
 
 
492 aa  152  2e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0967  sulfate permease family protein  29.46 
 
 
492 aa  151  3e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0834  sulfate permease family protein  29.46 
 
 
492 aa  151  4e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4288  sulphate transporter  27.09 
 
 
554 aa  151  4e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0878  sulfate permease family protein  29.46 
 
 
492 aa  151  4e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5404  sulphate transporter  27.87 
 
 
577 aa  150  7e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.428288  normal  0.878672 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0030  sulfate transporter  24.17 
 
 
734 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.127752  normal  0.27039 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0571  sulphate anion transporter  26.68 
 
 
563 aa  149  2.0000000000000003e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1734  sulphate transporter  27.47 
 
 
581 aa  149  2.0000000000000003e-34  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.181286  normal  0.0512367 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3320  putative sulfate transporter YchM  25.95 
 
 
573 aa  148  3e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0232868  hitchhiker  0.00197509 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1111  cyclic nucleotide-binding  23.58 
 
 
729 aa  146  1e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.804267  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4401  sulphate transporter  28.65 
 
 
549 aa  144  5e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4315  sulphate transporter  28.65 
 
 
549 aa  144  5e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2257  sulphate transporter  27.51 
 
 
572 aa  144  5e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.00522526  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4452  sulphate transporter  27.46 
 
 
495 aa  144  6e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.000256302  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1426  putative sulfate transporter YchM  26.14 
 
 
579 aa  144  6e-33  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.144333  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2612  sulphate transporter  28.6 
 
 
555 aa  144  7e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3363  Sulfate transporter/antisigma-factor antagonist STAS:sulphate transporter  27.58 
 
 
481 aa  143  9e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.301476  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp3069  hypothetical protein  23.39 
 
 
721 aa  143  9.999999999999999e-33  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2616  SulP family sulfate permease  28.1 
 
 
551 aa  143  9.999999999999999e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.352608 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0223  sulphate transporter  26.35 
 
 
553 aa  143  9.999999999999999e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0005  sulphate transporter  27.34 
 
 
511 aa  142  1.9999999999999998e-32  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1995  sulphate transporter  24.19 
 
 
573 aa  142  1.9999999999999998e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3029  sulphate transporter  26.95 
 
 
549 aa  142  1.9999999999999998e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1119  sulphate transporter  29.04 
 
 
546 aa  142  3e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.977726 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0978  sulphate transporter  21.83 
 
 
580 aa  142  3e-32  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000059535  normal  0.199384 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2081  sulphate transporter  26.46 
 
 
729 aa  141  3.9999999999999997e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3593  sulfate permease family protein  27.61 
 
 
481 aa  140  7e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5693  sulphate transporter  28.7 
 
 
548 aa  140  7e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.108223 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1042  putative sulfate transporter YchM  24.68 
 
 
585 aa  140  7.999999999999999e-32  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1643  sulphate transporter  25.67 
 
 
583 aa  140  8.999999999999999e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>