More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HS_1426 on replicon NC_008309
Organism: Haemophilus somnus 129PT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008309  HS_1426  putative sulfate transporter YchM  100 
 
 
579 aa  1161    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.144333  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1995  putative sulfate transporter YchM  58.95 
 
 
562 aa  605  9.999999999999999e-173  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00599656 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2174  putative sulfate transporter YchM  58.56 
 
 
565 aa  603  1.0000000000000001e-171  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.813593  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2061  putative sulfate transporter YchM  58.56 
 
 
565 aa  603  1.0000000000000001e-171  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.160318  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2454  putative sulfate transporter YchM  58.38 
 
 
565 aa  599  1e-170  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2575  putative sulfate transporter YchM  58.21 
 
 
567 aa  592  1e-168  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.228059  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1914  putative sulfate transporter YchM  58.59 
 
 
561 aa  585  1e-166  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.200297  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01181  predicted transporter  58.8 
 
 
559 aa  583  1.0000000000000001e-165  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.968457  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2441  sulfate transporter  58.83 
 
 
550 aa  583  1.0000000000000001e-165  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.445001  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1936  putative sulfate transporter YchM  58.62 
 
 
559 aa  582  1.0000000000000001e-165  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000016191  normal  0.11461 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1311  putative sulfate transporter YchM  58.83 
 
 
550 aa  583  1.0000000000000001e-165  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000228855  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2420  putative sulfate transporter YchM  58.83 
 
 
550 aa  583  1.0000000000000001e-165  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.643639  hitchhiker  0.00551985 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1540  putative sulfate transporter YchM  58.59 
 
 
561 aa  584  1.0000000000000001e-165  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0985805  normal  0.161381 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01191  hypothetical protein  58.8 
 
 
559 aa  583  1.0000000000000001e-165  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.818983  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1353  putative sulfate transporter YchM  58.83 
 
 
550 aa  583  1.0000000000000001e-165  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000101083  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2268  putative sulfate transporter YchM  58.03 
 
 
572 aa  582  1.0000000000000001e-165  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1978  putative sulfate transporter YchM  58.41 
 
 
561 aa  584  1.0000000000000001e-165  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0846232  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2342  putative sulfate transporter YchM  58.56 
 
 
560 aa  583  1.0000000000000001e-165  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1920  putative sulfate transporter YchM  58.41 
 
 
561 aa  582  1.0000000000000001e-165  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0235525  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1687  putative sulfate transporter YchM  58.8 
 
 
559 aa  583  1.0000000000000001e-165  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000554758  normal  0.520634 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1356  putative sulfate transporter YchM  58.59 
 
 
561 aa  584  1.0000000000000001e-165  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0275368  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1792  sulfate transporter  56.76 
 
 
571 aa  577  1.0000000000000001e-163  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.793346  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3253  putative sulfate transporter YchM  55.16 
 
 
587 aa  565  1e-160  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00237703 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1037  putative sulfate transporter YchM  55.16 
 
 
587 aa  565  1e-160  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1138  putative sulfate transporter YchM  55.16 
 
 
587 aa  565  1e-160  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1104  putative sulfate transporter YchM  55.16 
 
 
587 aa  565  1e-160  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1370  putative sulfate transporter YchM  58.44 
 
 
559 aa  561  1.0000000000000001e-159  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000347462  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3320  putative sulfate transporter YchM  53.14 
 
 
573 aa  560  1e-158  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0232868  hitchhiker  0.00197509 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1042  putative sulfate transporter YchM  54.41 
 
 
585 aa  557  1e-157  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1334  putative sulfate transporter YchM  52.33 
 
 
574 aa  552  1e-156  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.817877  normal  0.258167 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3553  putative sulfate transporter YchM  53.66 
 
 
588 aa  550  1e-155  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2974  putative sulfate transporter YchM  54.41 
 
 
590 aa  546  1e-154  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.117668  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3056  putative sulfate transporter YchM  54.41 
 
 
590 aa  545  1e-154  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.524026  normal  0.540816 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3154  putative sulfate transporter YchM  54.68 
 
 
590 aa  546  1e-154  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.32723  normal  0.884447 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1756  sulfate transporter  57.22 
 
 
572 aa  540  9.999999999999999e-153  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3674  putative sulfate transporter YchM  52.06 
 
 
575 aa  521  1e-146  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3470  putative sulfate transporter YchM  51.81 
 
 
578 aa  516  1.0000000000000001e-145  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0965  putative sulfate transporter YchM  47.83 
 
 
573 aa  478  1e-133  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.175193  normal  0.1395 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1067  putative sulfate transporter YchM  51 
 
 
572 aa  477  1e-133  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.773654 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0497  putative sulfate transporter YchM  47.94 
 
 
565 aa  445  1e-123  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0608  putative sulfate transporter YchM  46.54 
 
 
594 aa  408  1.0000000000000001e-112  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.288861  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2103  sulfate transporter  37.43 
 
 
568 aa  374  1e-102  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0948  putative sulfate transporter YchM  49.9 
 
 
579 aa  373  1e-102  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.327323 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0667  sulphate anion transporter  37.04 
 
 
570 aa  356  6.999999999999999e-97  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0679788 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2454  sulfate transporter  36.92 
 
 
606 aa  355  1e-96  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.792452  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0913  sulfate transporter  37.48 
 
 
568 aa  353  5e-96  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1474  sulphate transporter  38.9 
 
 
560 aa  346  8e-94  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.525598  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1553  sulphate anion transporter  37.77 
 
 
553 aa  344  2e-93  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000000364529  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2616  SulP family sulfate permease  39.22 
 
 
551 aa  342  1e-92  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.352608 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1136  sulfate transporter  41.03 
 
 
572 aa  340  4e-92  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0363  sulfate transporter  36.35 
 
 
552 aa  338  9.999999999999999e-92  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1648  sulfate transporter  35.94 
 
 
568 aa  338  1.9999999999999998e-91  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.423895  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1575  sulfate transporter  38.08 
 
 
570 aa  334  3e-90  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0223  sulphate transporter  36.15 
 
 
553 aa  333  5e-90  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0441  sulfate transporter  39.92 
 
 
587 aa  333  7.000000000000001e-90  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0288663  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1459  SulP family sulfate permease  38.64 
 
 
551 aa  332  1e-89  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.032999  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0900  sulfate transporter  36.35 
 
 
556 aa  331  2e-89  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.312059 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1731  SulP family sulfate permease  38.05 
 
 
551 aa  330  4e-89  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.281721  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2701  sulfate transporter  37.1 
 
 
568 aa  330  6e-89  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.293526 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1585  sulfate transporter  36.47 
 
 
563 aa  329  1.0000000000000001e-88  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1549  sulfate transporter  36.17 
 
 
552 aa  327  3e-88  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.0674996 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0864  hypothetical protein  39.28 
 
 
567 aa  327  3e-88  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0062  sulfate permease family protein  40.53 
 
 
553 aa  327  4.0000000000000003e-88  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000218031  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0835  hypothetical protein  37.74 
 
 
567 aa  327  5e-88  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0405  sulphate transporter  39.74 
 
 
560 aa  326  7e-88  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2506  sulfate permease  36.36 
 
 
581 aa  326  8.000000000000001e-88  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.037188  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1354  sulphate transporter  37.54 
 
 
541 aa  323  4e-87  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.0620345 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1992  sulphate transporter  39.36 
 
 
559 aa  322  9.999999999999999e-87  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.998362 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0736  sulphate anion transporter  37.06 
 
 
545 aa  320  5e-86  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1078  sulfate transporter  36.72 
 
 
552 aa  320  7e-86  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.408762  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2581  sulphate transporter  34.14 
 
 
563 aa  319  7e-86  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000213177  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0840  sulfate transporter  38.37 
 
 
559 aa  319  1e-85  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0022  sulfate permease family protein  35.36 
 
 
558 aa  316  8e-85  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0571  sulphate anion transporter  36.19 
 
 
563 aa  316  8e-85  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0164  Sulfate transporter/antisigma-factor antagonist  37.37 
 
 
575 aa  315  9.999999999999999e-85  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4982  Sulfate transporter/antisigma-factor antagonist STAS:xanthine/uracil/vitamin C permease:sulphate transporter  35.1 
 
 
552 aa  315  1.9999999999999998e-84  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2612  sulphate transporter  40.43 
 
 
555 aa  315  1.9999999999999998e-84  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2065  sulfate transporter/antisigma-factor antagonist STAS  38.91 
 
 
579 aa  314  2.9999999999999996e-84  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0195664  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4804  sulphate transporter  38.4 
 
 
583 aa  313  3.9999999999999997e-84  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2257  sulphate transporter  35.14 
 
 
572 aa  312  1e-83  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.00522526  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1734  sulphate transporter  37.87 
 
 
581 aa  305  2.0000000000000002e-81  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.181286  normal  0.0512367 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1643  sulphate transporter  36.01 
 
 
583 aa  304  3.0000000000000004e-81  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3387  sulphate transporter  40.89 
 
 
564 aa  303  5.000000000000001e-81  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.084852  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4088  sulphate transporter  34.7 
 
 
558 aa  301  2e-80  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.242606  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3404  sulfate permease family protein  39.66 
 
 
587 aa  301  2e-80  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1808  sulfate transporter  38.27 
 
 
587 aa  301  3e-80  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2189  sulphate transporter  37.61 
 
 
550 aa  300  4e-80  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5404  sulphate transporter  37.77 
 
 
577 aa  298  2e-79  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.428288  normal  0.878672 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3882  sulphate transporter  41.57 
 
 
573 aa  296  7e-79  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0900185 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1160  sulfate transporter  35.47 
 
 
554 aa  294  3e-78  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.175133  normal  0.549813 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1556  sulphate transporter  38.12 
 
 
568 aa  292  1e-77  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.902777  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0640  sulphate transporter  38.36 
 
 
581 aa  291  2e-77  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.029925  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1686  sulfate transporter  34.89 
 
 
552 aa  289  9e-77  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24970  Sulphate transporter-SulP-type  38.45 
 
 
553 aa  286  8e-76  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2233  sulphate transporter  38.67 
 
 
545 aa  285  2.0000000000000002e-75  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.566684  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0741  sulphate transporter  34.02 
 
 
586 aa  283  4.0000000000000003e-75  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5173  sulphate transporter  40.81 
 
 
426 aa  281  2e-74  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00867302  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0580  SulP family sulfate transporter  38.28 
 
 
632 aa  281  2e-74  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1668  sulphate transporter  35.49 
 
 
550 aa  279  1e-73  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.299108 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0616  sulphate transporter  36.65 
 
 
580 aa  278  2e-73  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.012784 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>