More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_0718 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007948  Bpro_0718  cyclic nucleotide-binding  100 
 
 
747 aa  1492    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00567448  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3904  cyclic nucleotide-binding:Sulfate transporter/antisigma-factor antagonist STAS:xanthine/uracil/vitamin C permease:sulphate transporter  24.8 
 
 
736 aa  139  2e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0571  sulphate anion transporter  25.56 
 
 
563 aa  116  2.0000000000000002e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0913  sulfate transporter  25.34 
 
 
568 aa  114  5e-24  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0056  cyclic nucleotide-binding  24.01 
 
 
739 aa  111  4.0000000000000004e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1585  sulfate transporter  26.87 
 
 
563 aa  110  1e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1648  sulfate transporter  25.32 
 
 
568 aa  108  3e-22  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.423895  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0667  sulphate anion transporter  24.84 
 
 
570 aa  106  2e-21  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0679788 
 
 
-
 
NC_006368  lpp3069  hypothetical protein  24.1 
 
 
721 aa  101  5e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2103  sulfate transporter  22.91 
 
 
568 aa  99  3e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2926  hypothetical protein  23.99 
 
 
721 aa  98.6  4e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0900  sulfate transporter  22.67 
 
 
556 aa  96.7  1e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.312059 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2701  sulfate transporter  24.49 
 
 
568 aa  96.3  2e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.293526 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1575  sulfate transporter  26.17 
 
 
570 aa  95.9  2e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1111  cyclic nucleotide-binding  22.49 
 
 
729 aa  96.3  2e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.804267  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2616  SulP family sulfate permease  24.11 
 
 
551 aa  94.7  5e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.352608 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2581  sulphate transporter  22.43 
 
 
563 aa  94  1e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000213177  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4088  sulphate transporter  24.89 
 
 
558 aa  93.6  1e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.242606  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5012  sulfate transporter  24.91 
 
 
579 aa  92.8  2e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.29259 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1175  sulphate transporter  23.35 
 
 
730 aa  92.4  3e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0317024  normal  0.332491 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2454  sulfate transporter  22.81 
 
 
606 aa  92  3e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.792452  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1983  sulphate transporter  23.81 
 
 
509 aa  91.7  4e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0343473 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1731  SulP family sulfate permease  22.86 
 
 
551 aa  91.7  4e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.281721  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0030  sulfate transporter  22.98 
 
 
734 aa  90.9  8e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.127752  normal  0.27039 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2257  sulphate transporter  23.73 
 
 
572 aa  90.9  9e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.00522526  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1474  sulphate transporter  24.06 
 
 
560 aa  90.1  1e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.525598  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1459  SulP family sulfate permease  22.22 
 
 
551 aa  90.1  1e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.032999  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0223  sulphate transporter  23.83 
 
 
553 aa  89.4  2e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5404  sulphate transporter  23.43 
 
 
577 aa  89.4  2e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.428288  normal  0.878672 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1734  sulphate transporter  22.9 
 
 
581 aa  89.7  2e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.181286  normal  0.0512367 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5025  cyclic nucleotide-binding  26.91 
 
 
749 aa  89  3e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0554599  normal  0.33022 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0366  putative sulfate transporter  23.23 
 
 
727 aa  89  3e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.972082  normal  0.273026 
 
 
-
 
NC_002950  PG0022  sulfate permease family protein  22.24 
 
 
558 aa  88.6  4e-16  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1643  sulphate transporter  22.84 
 
 
583 aa  88.6  4e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0164  Sulfate transporter/antisigma-factor antagonist  25.8 
 
 
575 aa  87.8  6e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1136  sulfate transporter  23.01 
 
 
572 aa  87.4  8e-16  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1358  Ion transport protein  39.29 
 
 
419 aa  86.3  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0441  sulfate transporter  23.15 
 
 
587 aa  85.5  0.000000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0288663  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3387  sulphate transporter  25.21 
 
 
564 aa  85.9  0.000000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.084852  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4038  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  39.29 
 
 
409 aa  84.7  0.000000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2065  sulfate transporter/antisigma-factor antagonist STAS  22.9 
 
 
579 aa  84.3  0.000000000000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0195664  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0363  sulfate transporter  21.81 
 
 
552 aa  84.3  0.000000000000008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0736  sulphate anion transporter  20.76 
 
 
545 aa  83.6  0.00000000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0245  sulfate transporter family protein  23.04 
 
 
605 aa  82.8  0.00000000000002  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.651817  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4804  sulphate transporter  23.13 
 
 
583 aa  83.2  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3570  putative glutaminase  30.47 
 
 
620 aa  83.2  0.00000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.615084 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4712  cyclic nucleotide-binding protein  38.39 
 
 
412 aa  82.4  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.566577  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2117  sulphate transporter  24.59 
 
 
703 aa  82  0.00000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.271394  normal  0.0391706 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0718  sulfate transporter  24.11 
 
 
570 aa  81.6  0.00000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2506  sulfate permease  22.68 
 
 
581 aa  81.6  0.00000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.037188  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4465  sulfate transporter  24.09 
 
 
573 aa  81.3  0.00000000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0772  cyclic nucleotide-binding protein  31.08 
 
 
164 aa  80.5  0.0000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0960  sulphate transporter  27.9 
 
 
556 aa  80.1  0.0000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2465  sulphate transporter  23.8 
 
 
546 aa  80.1  0.0000000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.320203  decreased coverage  0.00514746 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0405  sulphate transporter  21.44 
 
 
560 aa  80.5  0.0000000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2233  sulphate transporter  25.89 
 
 
545 aa  79.7  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.566684  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02290  sulfate permease-like transporter, MFS superfamily  25.76 
 
 
585 aa  79.3  0.0000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3641  sulfate permease  25.4 
 
 
708 aa  79.7  0.0000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1553  sulphate anion transporter  21 
 
 
553 aa  79  0.0000000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000000364529  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0752  sulfate transporter  24.25 
 
 
570 aa  79  0.0000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.614638  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2312  sulfate transporter family protein  27.02 
 
 
590 aa  78.6  0.0000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0741  sulphate transporter  24.11 
 
 
586 aa  78.6  0.0000000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0653  sulphate transporter  23.48 
 
 
708 aa  78.6  0.0000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.266407  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0897  sulfate transporter  23.68 
 
 
690 aa  77.8  0.0000000000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.675666  normal  0.770489 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1167  sulphate transporter  23.7 
 
 
496 aa  78.2  0.0000000000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.422162  normal  0.0121281 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0497  putative sulfate transporter YchM  23.94 
 
 
565 aa  77  0.000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1668  sulphate transporter  23.75 
 
 
550 aa  77  0.000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.299108 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1378  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  38.39 
 
 
408 aa  77  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0840  sulfate transporter  23.63 
 
 
559 aa  76.3  0.000000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2574  sulfate transporter  25.62 
 
 
591 aa  75.9  0.000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.527803  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0893  Crp/FNR family transcriptional regulator  29.94 
 
 
226 aa  75.9  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1005  cyclic nucleotide-binding  30.46 
 
 
226 aa  75.5  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.184599  normal  0.14907 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2563  sulfate transporter  23.64 
 
 
495 aa  75.5  0.000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.542829  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1831  putative sulfate transporter  22.59 
 
 
560 aa  75.1  0.000000000004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.505905  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1078  sulfate transporter  21.69 
 
 
552 aa  75.1  0.000000000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.408762  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2017  sulfate transporter  23.89 
 
 
730 aa  75.1  0.000000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5693  sulphate transporter  24.79 
 
 
548 aa  75.5  0.000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.108223 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2612  sulphate transporter  24.37 
 
 
555 aa  74.7  0.000000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1342  cyclic nucleotide-binding  24.14 
 
 
731 aa  74.7  0.000000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0631571 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0580  SulP family sulfate transporter  25.96 
 
 
632 aa  74.3  0.000000000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2671  sulfate transporter  25.08 
 
 
736 aa  74.3  0.000000000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.183061  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3032  Crp family transcriptional regulator  30.46 
 
 
224 aa  73.9  0.000000000009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0461942  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5025  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  32.45 
 
 
1056 aa  73.6  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00524189  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0690  sulphate anion transporter  22.5 
 
 
583 aa  73.6  0.00000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1160  sulfate transporter  23.42 
 
 
554 aa  73.9  0.00000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.175133  normal  0.549813 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3404  sulfate permease family protein  21.05 
 
 
587 aa  73.6  0.00000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1549  sulfate transporter  21.16 
 
 
552 aa  73.9  0.00000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.0674996 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1550  cyclic nucleotide-binding protein  26.64 
 
 
613 aa  73.6  0.00000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0559  Crp/FNR family transcriptional regulator  29.49 
 
 
225 aa  73.2  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.338488  normal  0.42035 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0835  hypothetical protein  22.42 
 
 
567 aa  73.2  0.00000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1037  putative sulfate transporter YchM  22.4 
 
 
587 aa  72.8  0.00000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1104  putative sulfate transporter YchM  22.4 
 
 
587 aa  72.8  0.00000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3253  putative sulfate transporter YchM  22.4 
 
 
587 aa  72.8  0.00000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00237703 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2348  sulfate transporter  25.41 
 
 
572 aa  72.8  0.00000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.21714 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2208  sulphate transporter  24.13 
 
 
512 aa  72.8  0.00000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11722  transmembrane protein  24.7 
 
 
486 aa  72.4  0.00000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.15236 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2609  sulphate anion transporter  24.37 
 
 
603 aa  72.4  0.00000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.107186  normal  0.766743 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2336  sulfate transporter  24.67 
 
 
703 aa  72.4  0.00000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0246739  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0825  sulphate transporter  26.04 
 
 
531 aa  72.4  0.00000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.270295  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1814  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  31.85 
 
 
225 aa  72.4  0.00000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>