238 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_1550 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_1550  cyclic nucleotide-binding protein  100 
 
 
613 aa  1243    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3570  putative glutaminase  56.28 
 
 
620 aa  641    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.615084 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1640  cyclic nucleotide-binding protein  42.31 
 
 
624 aa  456  1e-127  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.346806 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0296  cyclic nucleotide-binding protein  40.1 
 
 
624 aa  402  9.999999999999999e-111  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.339618 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3926  cyclic nucleotide-binding protein  38.81 
 
 
608 aa  362  1e-98  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0555  anti-sigma-factor antagonist  40.3 
 
 
601 aa  358  1.9999999999999998e-97  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2331  glutaminase  46.55 
 
 
425 aa  334  2e-90  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.370553  normal  0.322979 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1945  Glutaminase  46.36 
 
 
483 aa  320  7e-86  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.59569  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0446  Glutaminase  52.6 
 
 
412 aa  317  3e-85  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0966  glutaminase  49.5 
 
 
334 aa  317  6e-85  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2670  Glutaminase  47.83 
 
 
343 aa  315  1.9999999999999998e-84  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.987694 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3446  Glutaminase  47.52 
 
 
343 aa  314  3.9999999999999997e-84  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1969  Glutaminase  50.51 
 
 
318 aa  312  1e-83  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.677797 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1163  glutaminase  59.38 
 
 
331 aa  311  2.9999999999999997e-83  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.245083  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1319  Glutaminase  50 
 
 
331 aa  309  1.0000000000000001e-82  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2799  Glutaminase  44.81 
 
 
343 aa  281  2e-74  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.095609 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0080  Glutaminase  47.56 
 
 
422 aa  279  1e-73  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.742612  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37730  L-glutaminase  48.49 
 
 
338 aa  273  8.000000000000001e-72  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.89769  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0795  Glutaminase  48.44 
 
 
306 aa  270  5.9999999999999995e-71  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3622  glutaminase  38.93 
 
 
418 aa  270  8e-71  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22150  L-glutaminase  47.56 
 
 
456 aa  267  5e-70  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00310  glutaminase  35.19 
 
 
645 aa  264  4e-69  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2251  glutaminase  44.6 
 
 
305 aa  253  1e-65  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1963  glutaminase  44.6 
 
 
305 aa  253  1e-65  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3760  glutaminase  43.17 
 
 
332 aa  249  1e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4729  glutaminase  41.99 
 
 
311 aa  247  4.9999999999999997e-64  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1503  Glutaminase  41.69 
 
 
330 aa  241  4e-62  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2130  glutaminase  40.32 
 
 
335 aa  238  3e-61  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0295591 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2254  glutaminase  40.32 
 
 
335 aa  238  3e-61  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2143  glutaminase  40.32 
 
 
335 aa  238  3e-61  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2917  glutaminase  41.32 
 
 
434 aa  231  4e-59  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25660  L-glutaminase  43.25 
 
 
333 aa  229  1e-58  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0571  glutaminase  40.79 
 
 
307 aa  227  5.0000000000000005e-58  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06680  glutaminase  44.1 
 
 
347 aa  227  5.0000000000000005e-58  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1407  glutaminase  42.24 
 
 
331 aa  227  6e-58  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.883492 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0557  glutaminase  40.46 
 
 
307 aa  226  1e-57  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0038  glutaminase  37.82 
 
 
313 aa  221  3e-56  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.744531 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2044  glutaminase  41.32 
 
 
307 aa  218  2.9999999999999998e-55  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0528  glutaminase  39.27 
 
 
310 aa  216  9.999999999999999e-55  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0524  glutaminase  39.6 
 
 
310 aa  215  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3131  glutaminase  38.94 
 
 
310 aa  215  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0971481  hitchhiker  0.0000872807 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0564  glutaminase  38.94 
 
 
310 aa  215  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0578  glutaminase  39.4 
 
 
310 aa  214  2.9999999999999995e-54  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0751  glutaminase  41.43 
 
 
304 aa  214  4.9999999999999996e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.010977 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0420  glutaminase  38.94 
 
 
310 aa  213  5.999999999999999e-54  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00436  predicted glutaminase  39.27 
 
 
310 aa  213  7e-54  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3125  Glutaminase  39.27 
 
 
310 aa  213  7e-54  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.28972  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0340  glutaminase  41.64 
 
 
317 aa  213  7e-54  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00441  hypothetical protein  39.27 
 
 
310 aa  213  7e-54  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4940  glutaminase  41.07 
 
 
304 aa  213  1e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  unclonable  0.000018103 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5348  glutaminase  41.07 
 
 
304 aa  213  1e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.336875  normal  0.201751 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1254  L-glutaminase  38.87 
 
 
306 aa  212  1e-53  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.576026  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3428  glutaminase  40.71 
 
 
304 aa  210  5e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3164  glutaminase  36.82 
 
 
326 aa  209  1e-52  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.566002 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2907  glutaminase  36.82 
 
 
326 aa  209  2e-52  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0924561  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1513  glutaminase  43.4 
 
 
315 aa  208  2e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.696873  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2932  glutaminase  36.15 
 
 
326 aa  207  5e-52  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.070844  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2857  glutaminase  36.15 
 
 
326 aa  207  5e-52  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.872371  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3155  glutaminase  36.15 
 
 
326 aa  207  5e-52  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3676  glutaminase  39.93 
 
 
304 aa  207  6e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.471921 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3171  glutaminase  36.15 
 
 
326 aa  206  7e-52  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.268114  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4887  glutaminase  40.28 
 
 
304 aa  207  7e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000632239 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002449  glutaminase  39.87 
 
 
306 aa  206  9e-52  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0507  glutaminase  37.25 
 
 
306 aa  206  9e-52  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3142  glutaminase  35.81 
 
 
326 aa  206  1e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4370  glutaminase  39.93 
 
 
333 aa  206  1e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00679253  normal  0.0112972 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1946  glutaminase  43.94 
 
 
309 aa  206  1e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.790671  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2097  glutaminase  35.81 
 
 
326 aa  206  1e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.851377  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4692  glutaminase  44.03 
 
 
311 aa  205  2e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1383  glutaminase  43.37 
 
 
311 aa  205  2e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3529  glutaminase  41.67 
 
 
309 aa  204  3e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0048  glutaminase  37.92 
 
 
310 aa  204  3e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1403  glutaminase  43.37 
 
 
311 aa  204  4e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.208624  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4504  glutaminase  44.03 
 
 
309 aa  203  7e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.34383  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0553  glutaminase  37.99 
 
 
309 aa  202  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00275922  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0555  glutaminase  37.99 
 
 
309 aa  202  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00000637393  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0471  glutaminase  37.99 
 
 
309 aa  202  9.999999999999999e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.233073  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0410  glutaminase  37.99 
 
 
309 aa  202  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.11216  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0480  glutaminase  37.99 
 
 
309 aa  202  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4418  Glutaminase  41.43 
 
 
308 aa  202  9.999999999999999e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0499  glutaminase  37.99 
 
 
309 aa  202  9.999999999999999e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0044437  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0536  glutaminase  39.2 
 
 
306 aa  202  1.9999999999999998e-50  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0688524  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0814  glutaminase  39.86 
 
 
304 aa  202  1.9999999999999998e-50  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.650659  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0029  glutaminase  39.86 
 
 
304 aa  202  1.9999999999999998e-50  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.359819  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0934  glutaminase  39.86 
 
 
304 aa  202  1.9999999999999998e-50  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1594  glutaminase  39.86 
 
 
304 aa  202  1.9999999999999998e-50  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4820  glutaminase  37.99 
 
 
309 aa  202  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.404932  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0502  glutaminase  37.99 
 
 
309 aa  202  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00198512  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03588  glutaminase  39.06 
 
 
306 aa  201  3e-50  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3365  glutaminase  39.13 
 
 
304 aa  201  3.9999999999999996e-50  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0414  glutaminase  37.63 
 
 
309 aa  201  3.9999999999999996e-50  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000025535  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1127  glutaminase  38.41 
 
 
304 aa  201  3.9999999999999996e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2961  glutaminase  39.02 
 
 
308 aa  201  3.9999999999999996e-50  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0416  glutaminase  37.28 
 
 
309 aa  201  5e-50  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00235106  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0426  glutaminase  36 
 
 
309 aa  200  6e-50  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000693628  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3193  glutaminase  38.05 
 
 
304 aa  200  7e-50  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.256164  normal  0.605856 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4570  glutaminase  42.36 
 
 
309 aa  199  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0449204  decreased coverage  0.00110113 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0842  glutaminase  39.93 
 
 
304 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3050  glutaminase  38.05 
 
 
304 aa  199  2.0000000000000003e-49  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000590255  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2796  glutaminase  41.92 
 
 
318 aa  198  2.0000000000000003e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.394459 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>