More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_2563 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008740  Maqu_2102  sulphate transporter  76.01 
 
 		 495 aa  752    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1995  sulphate transporter  80.65 
 
 		 496 aa  795    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3234  sulfate permease family protein  71.63 
 
 		 495 aa  699    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1853  sulphate transporter  79.44 
 
 		 496 aa  818    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.770429  hitchhiker  0.00215909 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3086  Sulfate transporter/antisigma-factor antagonist STAS:sulphate transporter  72.29 
 
 		 495 aa  709    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5067  sulfate permease  66.26 
 
 		 496 aa  682    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2041  SulP family sulfate permease  67.96 
 
 		 499 aa  677    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4197  antisigma-factor antagonist, STAS  64.11 
 
 		 496 aa  651    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.291756  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0183  putative sulfate transporter  89.09 
 
 		 495 aa  913    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0945  sulfate transporter  73.33 
 
 		 495 aa  762    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0235468  normal  0.511838 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2669  putative sulfate transporter  69.96 
 
 		 495 aa  718    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1049  sulphate transporter  76.52 
 
 		 500 aa  756    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.272014  hitchhiker  0.000191113 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0431  sulphate transporter  69.59 
 
 		 494 aa  707    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0215713  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0175  sulphate transporter  67.14 
 
 		 500 aa  677    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.672348  normal  0.30485 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2764  sulphate transporter  75.6 
 
 		 499 aa  781    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2344  sulphate transporter  67.76 
 
 		 499 aa  676    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4472  sulfate transporter  71.77 
 
 		 492 aa  734    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0760011  normal  0.0111943 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4600  sulfate transporter  71.77 
 
 		 492 aa  734    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000140835  normal  0.0151662 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02670  hypothetical protein  65.73 
 
 		 496 aa  691    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1226  sulphate transporter  79.03 
 
 		 496 aa  784    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0780  sulphate transporter  68.56 
 
 		 494 aa  684    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5170  sulphate transporter  76.11 
 
 		 495 aa  767    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0186  sulphate transporter  80.65 
 
 		 496 aa  795    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1911  sulphate transporter  69.48 
 
 		 497 aa  681    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.42059  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2563  sulfate transporter  100 
 
 		 495 aa  992    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.542829  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2719  sulphate transporter  69.28 
 
 		 497 aa  670    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.400715 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0790  sulphate transporter  80.24 
 
 		 496 aa  772    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0851  sulphate transporter  66.8 
 
 		 502 aa  671    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.819336  normal  0.625423 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31380  putative sulfate transporter  71.57 
 
 		 495 aa  724    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.114535  hitchhiker  0.000000000000146923 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1167  sulphate transporter  78.43 
 
 		 496 aa  812    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.422162  normal  0.0121281 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3036  sulphate transporter  64.44 
 
 		 496 aa  642    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3344  sulphate transporter  64.65 
 
 		 496 aa  656    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.411492 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3460  UspA domain-containing protein  63.31 
 
 		 496 aa  634  1e-180  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.833239  normal  0.103375 
 
 
-
 
NC_009008  RSP_4257  antisigma-factor antagonist STAS  63.29 
 
 		 496 aa  625  1e-178  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.470624  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4143  sulphate transporter  63.08 
 
 		 496 aa  624  1e-177  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.508442  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4067  sulphate transporter  63.92 
 
 		 502 aa  620  1e-176  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.124032  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2784  sulphate transporter  61.62 
 
 		 494 aa  607  9.999999999999999e-173  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.88404  normal  0.423283 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0226  sulphate transporter  63.24 
 
 		 484 aa  592  1e-168  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.660997  normal  0.925755 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5890  sulfate permease  60.78 
 
 		 493 aa  578  1e-164  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.401805  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4611  sulphate transporter  60.54 
 
 		 493 aa  569  1e-161  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2773  sulphate transporter  58.3 
 
 		 499 aa  570  1e-161  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0549  sulphate transporter  56.4 
 
 		 483 aa  566  1e-160  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0374  sulphate transporter  59.55 
 
 		 498 aa  563  1.0000000000000001e-159  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0019  sulphate transporter  59.54 
 
 		 514 aa  560  1e-158  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.32634 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4649  sulfate permease family protein  55.37 
 
 		 483 aa  557  1e-157  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000779975  unclonable  1.77501e-25 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3936  sulphate transporter  59.58 
 
 		 501 aa  556  1e-157  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.529754  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2200  sulfate permease  56.88 
 
 		 487 aa  552  1e-156  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0689  sulfate permease family protein  54.75 
 
 		 483 aa  554  1e-156  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0381157  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3643  sulphate transporter  59.79 
 
 		 501 aa  555  1e-156  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3926  sulphate transporter  58.44 
 
 		 492 aa  549  1e-155  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0884886  normal  0.213644 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3083  sulphate transporter  59.96 
 
 		 498 aa  544  1e-153  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0982983  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1264  sulphate transporter  57.59 
 
 		 492 aa  543  1e-153  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.036153 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0721  sulfate permease family protein  54.55 
 
 		 483 aa  537  1e-151  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0782  sulfate permease family protein  54.55 
 
 		 483 aa  535  1e-151  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0621  sulfate permease family protein  54.34 
 
 		 483 aa  535  1e-150  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.822382  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0565  sulfate transporter  54.13 
 
 		 483 aa  533  1e-150  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0564  sulfate transporter  54.13 
 
 		 483 aa  534  1e-150  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0031948  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0567  sulphate transporter  53.93 
 
 		 492 aa  532  1e-150  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0653  sulfate permease family protein  54.34 
 
 		 483 aa  535  1e-150  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2639  sulphate transporter  57.8 
 
 		 502 aa  534  1e-150  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0710  sulfate permease family protein  54.13 
 
 		 483 aa  534  1e-150  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.152209 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2483  sulphate transporter  55.21 
 
 		 488 aa  520  1e-146  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3392  sulphate transporter  55.65 
 
 		 487 aa  516  1.0000000000000001e-145  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.106782 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2191  sulphate transporter  55.42 
 
 		 488 aa  504  1e-141  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.0000878585  normal  0.36183 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0427  sulphate transporter  51.03 
 
 		 493 aa  485  1e-136  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0815  sulphate transporter  52.61 
 
 		 484 aa  481  1e-134  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.839761  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0078  sulphate transporter  51.71 
 
 		 506 aa  479  1e-134  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.566328  normal  1 
 
 
-
 
NC_006663  SEA0024  sulfate permease family protein  51.67 
 
 		 483 aa  477  1e-133  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1631  sulphate transporter  51.15 
 
 		 499 aa  471  1e-132  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.196541  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1646  sulphate transporter  52.1 
 
 		 527 aa  472  1e-132  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0415983  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04150  sulfate permease  51.33 
 
 		 495 aa  466  9.999999999999999e-131  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.712324  n/a   
 
 
-
 
NC_014159  Tpau_4306  sulphate transporter  55.11 
 
 		 502 aa  466  9.999999999999999e-131  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0228312  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3487  sulphate transporter  53.75 
 
 		 496 aa  462  1e-129  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0913  sulphate transporter  52.79 
 
 		 496 aa  462  1e-129  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.846691  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0896  sulphate transporter  52.79 
 
 		 496 aa  462  1e-129  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0902  sulphate transporter  52.79 
 
 		 496 aa  462  1e-129  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0446823 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4351  sulphate transporter  50.51 
 
 		 496 aa  458  9.999999999999999e-129  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1159  sulphate transporter  53.65 
 
 		 500 aa  460  9.999999999999999e-129  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.778389  normal  0.502681 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0104  sulphate transporter  52.02 
 
 		 500 aa  455  1e-127  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3975  sulphate transporter  53 
 
 		 526 aa  454  1.0000000000000001e-126  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0845  putative sulfate transporter  46.98 
 
 		 523 aa  449  1e-125  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_12181  putative sulfate transporter  47.4 
 
 		 526 aa  447  1.0000000000000001e-124  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.97846 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21570  sulfate permease-like transporter, MFS superfamily  50.21 
 
 		 505 aa  445  1.0000000000000001e-124  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0555  sulphate transporter  51.04 
 
 		 497 aa  444  1e-123  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.849318 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05020  sulfate permease-like transporter, MFS superfamily  51.76 
 
 		 520 aa  443  1e-123  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3144  sulphate transporter  50.63 
 
 		 501 aa  440  9.999999999999999e-123  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1810  putative sulfate transporter  46.67 
 
 		 520 aa  439  9.999999999999999e-123  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0735  sulphate transporter  51.49 
 
 		 554 aa  434  1e-120  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.725862  hitchhiker  0.00858649 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35810  sulfate permease-like transporter, MFS superfamily  52.69 
 
 		 531 aa  429  1e-119  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_14611  putative sulfate transporter  45.11 
 
 		 514 aa  419  1e-116  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.324968  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0631  putative sulfate transporter  45.32 
 
 		 527 aa  420  1e-116  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_07001  putative sulfate transporter  45.14 
 
 		 521 aa  419  1e-116  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0644  putative sulfate transporter  45.53 
 
 		 521 aa  417  9.999999999999999e-116  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06711  putative sulfate transporter  44.42 
 
 		 521 aa  412  1e-114  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0471  sulphate transporter  52.36 
 
 		 542 aa  409  1e-113  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07551  putative sulfate transporter  44.38 
 
 		 525 aa  407  1.0000000000000001e-112  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.0159934 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07101  putative sulfate transporter  44.21 
 
 		 524 aa  405  1e-111  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1080  sulphate transporter  45.09 
 
 		 540 aa  394  1e-108  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.610745  normal  0.0982504 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0142  sulphate transporter  48.43 
 
 		 507 aa  389  1e-107  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2208  sulphate transporter  42.92 
 
 		 512 aa  375  1e-103  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>