293 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_3570 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_1550  cyclic nucleotide-binding protein  56.28 
 
 		 613 aa  641    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3570  putative glutaminase  100 
 
 		 620 aa  1259    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.615084 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1640  cyclic nucleotide-binding protein  40.61 
 
 		 624 aa  435  1e-121  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.346806 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0296  cyclic nucleotide-binding protein  39.87 
 
 		 624 aa  409  1.0000000000000001e-112  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.339618 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3926  cyclic nucleotide-binding protein  41.51 
 
 		 608 aa  385  1e-105  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0555  anti-sigma-factor antagonist  40.18 
 
 		 601 aa  362  1e-98  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0446  Glutaminase  54.86 
 
 		 412 aa  320  3.9999999999999996e-86  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1945  Glutaminase  48.72 
 
 		 483 aa  319  1e-85  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.59569  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2670  Glutaminase  49.68 
 
 		 343 aa  314  2.9999999999999996e-84  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.987694 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3446  Glutaminase  49.68 
 
 		 343 aa  314  3.9999999999999997e-84  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2331  glutaminase  45.43 
 
 		 425 aa  311  2e-83  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.370553  normal  0.322979 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0966  glutaminase  51.32 
 
 		 334 aa  306  9.000000000000001e-82  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1969  Glutaminase  50 
 
 		 318 aa  305  2.0000000000000002e-81  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.677797 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1319  Glutaminase  48.24 
 
 		 331 aa  299  9e-80  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1163  glutaminase  55.33 
 
 		 331 aa  295  2e-78  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.245083  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2799  Glutaminase  45.54 
 
 		 343 aa  285  2.0000000000000002e-75  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.095609 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0080  Glutaminase  46.23 
 
 		 422 aa  273  6e-72  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.742612  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3622  glutaminase  38.26 
 
 		 418 aa  271  2e-71  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00310  glutaminase  36.99 
 
 		 645 aa  271  2e-71  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22150  L-glutaminase  47.21 
 
 		 456 aa  266  1e-69  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0795  Glutaminase  46.9 
 
 		 306 aa  254  2.0000000000000002e-66  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37730  L-glutaminase  46.23 
 
 		 338 aa  250  6e-65  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.89769  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3760  glutaminase  44.26 
 
 		 332 aa  249  1e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1503  Glutaminase  40.73 
 
 		 330 aa  239  1e-61  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2917  glutaminase  42.41 
 
 		 434 aa  233  1e-59  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4729  glutaminase  40.91 
 
 		 311 aa  228  2e-58  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2251  glutaminase  41.81 
 
 		 305 aa  226  1e-57  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1963  glutaminase  41.81 
 
 		 305 aa  226  1e-57  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1407  glutaminase  41.21 
 
 		 331 aa  222  9.999999999999999e-57  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.883492 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06680  glutaminase  43.97 
 
 		 347 aa  221  3.9999999999999997e-56  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2130  glutaminase  39.33 
 
 		 335 aa  214  3.9999999999999995e-54  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0295591 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2254  glutaminase  39.33 
 
 		 335 aa  214  3.9999999999999995e-54  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2143  glutaminase  39.33 
 
 		 335 aa  214  3.9999999999999995e-54  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25660  L-glutaminase  41.61 
 
 		 333 aa  211  2e-53  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2044  glutaminase  40.97 
 
 		 307 aa  210  5e-53  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4504  glutaminase  44.82 
 
 		 309 aa  209  1e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.34383  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1541  glutaminase  43.54 
 
 		 309 aa  208  3e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.345343  normal  0.210861 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1946  glutaminase  40.97 
 
 		 309 aa  207  7e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.790671  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1383  glutaminase  43.34 
 
 		 311 aa  204  3e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2155  glutaminase  40.13 
 
 		 309 aa  203  6e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.948088 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0814  glutaminase  40.47 
 
 		 304 aa  203  9e-51  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.650659  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0029  glutaminase  40.47 
 
 		 304 aa  203  9e-51  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.359819  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0934  glutaminase  40.47 
 
 		 304 aa  203  9e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1594  glutaminase  40.47 
 
 		 304 aa  203  9e-51  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3676  glutaminase  40.13 
 
 		 304 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.471921 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0340  glutaminase  41.79 
 
 		 317 aa  202  1.9999999999999998e-50  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2189  glutaminase  41.49 
 
 		 304 aa  202  1.9999999999999998e-50  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0842  glutaminase  41.49 
 
 		 304 aa  202  1.9999999999999998e-50  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0048  glutaminase  36.93 
 
 		 310 aa  202  1.9999999999999998e-50  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4692  glutaminase  42.32 
 
 		 311 aa  201  3e-50  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1403  glutaminase  43.77 
 
 		 311 aa  201  3e-50  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.208624  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1254  L-glutaminase  36.68 
 
 		 306 aa  201  3.9999999999999996e-50  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.576026  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4570  glutaminase  43.34 
 
 		 309 aa  201  3.9999999999999996e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0449204  decreased coverage  0.00110113 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3529  glutaminase  40.45 
 
 		 309 aa  200  6e-50  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1788  glutaminase  38.99 
 
 		 346 aa  200  7e-50  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2961  glutaminase  40.07 
 
 		 308 aa  200  7.999999999999999e-50  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2796  glutaminase  39.81 
 
 		 318 aa  198  2.0000000000000003e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.394459 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0524  glutaminase  37.95 
 
 		 310 aa  199  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0557  glutaminase  37.93 
 
 		 307 aa  198  2.0000000000000003e-49  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4887  glutaminase  39.74 
 
 		 304 aa  199  2.0000000000000003e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000632239 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0578  glutaminase  37.62 
 
 		 310 aa  197  4.0000000000000005e-49  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0420  glutaminase  37.29 
 
 		 310 aa  197  5.000000000000001e-49  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0564  glutaminase  37.29 
 
 		 310 aa  197  5.000000000000001e-49  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0571  glutaminase  37.59 
 
 		 307 aa  197  5.000000000000001e-49  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0528  glutaminase  37.29 
 
 		 310 aa  197  5.000000000000001e-49  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3131  glutaminase  37.29 
 
 		 310 aa  197  5.000000000000001e-49  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0971481  hitchhiker  0.0000872807 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4370  glutaminase  39.4 
 
 		 333 aa  197  5.000000000000001e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00679253  normal  0.0112972 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00436  predicted glutaminase  37.62 
 
 		 310 aa  197  6e-49  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3125  Glutaminase  37.62 
 
 		 310 aa  197  6e-49  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.28972  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00441  hypothetical protein  37.62 
 
 		 310 aa  197  6e-49  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0751  glutaminase  39.46 
 
 		 304 aa  196  1e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.010977 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5348  glutaminase  39.39 
 
 		 304 aa  196  1e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.336875  normal  0.201751 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4940  glutaminase  39.39 
 
 		 304 aa  196  1e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000018103 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2907  glutaminase  36.36 
 
 		 326 aa  195  2e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0924561  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1928  glutaminase  39.66 
 
 		 308 aa  195  2e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1513  glutaminase  42.16 
 
 		 315 aa  196  2e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.696873  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3164  glutaminase  36.36 
 
 		 326 aa  195  2e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.566002 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2331  glutaminase  40.63 
 
 		 309 aa  195  2e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.240514 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2932  glutaminase  36.03 
 
 		 326 aa  194  3e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.070844  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2857  glutaminase  36.03 
 
 		 326 aa  194  3e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.872371  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3155  glutaminase  36.03 
 
 		 326 aa  194  3e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1143  glutaminase  39.6 
 
 		 304 aa  194  4e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.118169 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3171  glutaminase  36.03 
 
 		 326 aa  194  4e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.268114  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1330  glutaminase  41.45 
 
 		 306 aa  194  4e-48  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.957887  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3428  glutaminase  39.06 
 
 		 304 aa  194  5e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3142  glutaminase  35.69 
 
 		 326 aa  193  6e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2097  glutaminase  35.69 
 
 		 326 aa  193  6e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.851377  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5773  glutaminase  39.6 
 
 		 304 aa  193  8e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.919857  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0299  L-glutaminase  40.43 
 
 		 308 aa  193  9e-48  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0584671  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2867  glutaminase  39.86 
 
 		 307 aa  192  1e-47  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.705763 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0416  glutaminase  35.54 
 
 		 309 aa  192  2e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00235106  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0426  glutaminase  36.04 
 
 		 309 aa  191  2.9999999999999997e-47  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000693628  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2652  glutaminase  39.37 
 
 		 309 aa  191  5e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1127  glutaminase  38.38 
 
 		 304 aa  190  7e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2375  glutaminase  40.6 
 
 		 309 aa  190  8e-47  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.188361  normal  0.312198 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3795  glutaminase  38.81 
 
 		 303 aa  189  9e-47  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0198584  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0038  glutaminase  35.07 
 
 		 313 aa  189  1e-46  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.744531 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0555  glutaminase  36.04 
 
 		 309 aa  189  1e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00000637393  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0499  glutaminase  36.04 
 
 		 309 aa  189  1e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0044437  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0480  glutaminase  36.04 
 
 		 309 aa  189  1e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>