More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_3320 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009665  Shew185_1104  putative sulfate transporter YchM  75.35 
 
 		 587 aa  860    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1138  putative sulfate transporter YchM  75.17 
 
 		 587 aa  856    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3553  putative sulfate transporter YchM  74.74 
 
 		 588 aa  851    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3320  putative sulfate transporter YchM  100 
 
 		 573 aa  1144    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0232868  hitchhiker  0.00197509 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1042  putative sulfate transporter YchM  74.83 
 
 		 585 aa  853    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1334  putative sulfate transporter YchM  79.93 
 
 		 574 aa  907    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.817877  normal  0.258167 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1037  putative sulfate transporter YchM  75.35 
 
 		 587 aa  860    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3154  putative sulfate transporter YchM  74.56 
 
 		 590 aa  843    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.32723  normal  0.884447 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3470  putative sulfate transporter YchM  66.84 
 
 		 578 aa  751    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3253  putative sulfate transporter YchM  75.17 
 
 		 587 aa  859    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00237703 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2974  putative sulfate transporter YchM  74.91 
 
 		 590 aa  846    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.117668  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3056  putative sulfate transporter YchM  74.74 
 
 		 590 aa  844    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.524026  normal  0.540816 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3674  putative sulfate transporter YchM  60.25 
 
 		 575 aa  673    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2174  putative sulfate transporter YchM  59.5 
 
 		 565 aa  627  1e-178  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.813593  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2061  putative sulfate transporter YchM  59.5 
 
 		 565 aa  627  1e-178  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.160318  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2454  putative sulfate transporter YchM  59.32 
 
 		 565 aa  624  1e-177  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2575  putative sulfate transporter YchM  58.74 
 
 		 567 aa  619  1e-176  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.228059  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2268  putative sulfate transporter YchM  58.56 
 
 		 572 aa  615  1e-175  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1995  putative sulfate transporter YchM  58.29 
 
 		 562 aa  614  9.999999999999999e-175  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00599656 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1356  putative sulfate transporter YchM  56.94 
 
 		 561 aa  592  1e-168  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0275368  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2342  putative sulfate transporter YchM  57.12 
 
 		 560 aa  593  1e-168  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1914  putative sulfate transporter YchM  56.76 
 
 		 561 aa  593  1e-168  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.200297  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1978  putative sulfate transporter YchM  56.76 
 
 		 561 aa  592  1e-168  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0846232  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1540  putative sulfate transporter YchM  56.94 
 
 		 561 aa  592  1e-168  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0985805  normal  0.161381 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1920  putative sulfate transporter YchM  56.58 
 
 		 561 aa  589  1e-167  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0235525  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1792  sulfate transporter  57.19 
 
 		 571 aa  586  1e-166  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.793346  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01181  predicted transporter  56.76 
 
 		 559 aa  580  1e-164  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.968457  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2441  sulfate transporter  56.76 
 
 		 550 aa  580  1e-164  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.445001  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01191  hypothetical protein  56.76 
 
 		 559 aa  580  1e-164  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.818983  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1311  putative sulfate transporter YchM  56.76 
 
 		 550 aa  580  1e-164  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000228855  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1936  putative sulfate transporter YchM  56.65 
 
 		 559 aa  578  1e-164  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000016191  normal  0.11461 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2420  putative sulfate transporter YchM  56.76 
 
 		 550 aa  580  1e-164  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.643639  hitchhiker  0.00551985 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1687  putative sulfate transporter YchM  56.76 
 
 		 559 aa  580  1e-164  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000554758  normal  0.520634 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1353  putative sulfate transporter YchM  56.76 
 
 		 550 aa  580  1e-164  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000101083  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1756  sulfate transporter  57.62 
 
 		 572 aa  568  1e-161  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1370  putative sulfate transporter YchM  56.4 
 
 		 559 aa  560  1e-158  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000347462  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1426  putative sulfate transporter YchM  53.14 
 
 		 579 aa  559  1e-158  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.144333  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1067  putative sulfate transporter YchM  56.49 
 
 		 572 aa  550  1e-155  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.773654 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0965  putative sulfate transporter YchM  51.54 
 
 		 573 aa  537  1e-151  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.175193  normal  0.1395 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0497  putative sulfate transporter YchM  50.27 
 
 		 565 aa  492  9.999999999999999e-139  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0608  putative sulfate transporter YchM  48.73 
 
 		 594 aa  447  1.0000000000000001e-124  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.288861  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0948  putative sulfate transporter YchM  50 
 
 		 579 aa  424  1e-117  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.327323 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2103  sulfate transporter  42.47 
 
 		 568 aa  422  1e-117  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0913  sulfate transporter  42.75 
 
 		 568 aa  417  9.999999999999999e-116  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0667  sulphate anion transporter  40.33 
 
 		 570 aa  408  1.0000000000000001e-112  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0679788 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1553  sulphate anion transporter  41.41 
 
 		 553 aa  399  9.999999999999999e-111  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000000364529  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2454  sulfate transporter  39.53 
 
 		 606 aa  399  9.999999999999999e-111  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.792452  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1648  sulfate transporter  40.51 
 
 		 568 aa  398  1e-109  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.423895  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1575  sulfate transporter  39.57 
 
 		 570 aa  397  1e-109  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0900  sulfate transporter  40.79 
 
 		 556 aa  391  1e-107  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.312059 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0363  sulfate transporter  42.61 
 
 		 552 aa  383  1e-105  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2701  sulfate transporter  39.25 
 
 		 568 aa  381  1e-104  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.293526 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0405  sulphate transporter  42.3 
 
 		 560 aa  378  1e-103  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2616  SulP family sulfate permease  42.14 
 
 		 551 aa  376  1e-103  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.352608 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2506  sulfate permease  40.61 
 
 		 581 aa  379  1e-103  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.037188  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1731  SulP family sulfate permease  40.25 
 
 		 551 aa  376  1e-103  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.281721  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1078  sulfate transporter  42.05 
 
 		 552 aa  373  1e-102  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.408762  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0062  sulfate permease family protein  40.71 
 
 		 553 aa  371  1e-101  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000218031  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1459  SulP family sulfate permease  39.57 
 
 		 551 aa  369  1e-101  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.032999  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0223  sulphate transporter  36.56 
 
 		 553 aa  364  2e-99  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0022  sulfate permease family protein  38.96 
 
 		 558 aa  363  4e-99  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1549  sulfate transporter  40.83 
 
 		 552 aa  363  4e-99  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0674996 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0441  sulfate transporter  38.46 
 
 		 587 aa  362  1e-98  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0288663  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0864  hypothetical protein  37.21 
 
 		 567 aa  361  2e-98  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0835  hypothetical protein  37.21 
 
 		 567 aa  360  4e-98  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2612  sulphate transporter  39.5 
 
 		 555 aa  358  1.9999999999999998e-97  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2065  sulfate transporter/antisigma-factor antagonist STAS  38.73 
 
 		 579 aa  357  2.9999999999999997e-97  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0195664  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1474  sulphate transporter  39.86 
 
 		 560 aa  357  3.9999999999999996e-97  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.525598  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0736  sulphate anion transporter  37.21 
 
 		 545 aa  354  2.9999999999999997e-96  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1136  sulfate transporter  39.55 
 
 		 572 aa  352  7e-96  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1808  sulfate transporter  39.79 
 
 		 587 aa  351  2e-95  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1992  sulphate transporter  41.43 
 
 		 559 aa  351  2e-95  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.998362 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1668  sulphate transporter  40.41 
 
 		 550 aa  349  7e-95  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.299108 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0164  Sulfate transporter/antisigma-factor antagonist  38.21 
 
 		 575 aa  349  7e-95  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4804  sulphate transporter  38.1 
 
 		 583 aa  348  1e-94  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0245  sulfate transporter family protein  36.92 
 
 		 605 aa  346  7e-94  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.651817  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1686  sulfate transporter  39.19 
 
 		 552 aa  343  2.9999999999999997e-93  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1643  sulphate transporter  35.82 
 
 		 583 aa  340  4e-92  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4982  Sulfate transporter/antisigma-factor antagonist STAS:xanthine/uracil/vitamin C permease:sulphate transporter  37.89 
 
 		 552 aa  339  8e-92  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2257  sulphate transporter  36.68 
 
 		 572 aa  336  7e-91  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.00522526  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3404  sulfate permease family protein  38.46 
 
 		 587 aa  335  1e-90  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2581  sulphate transporter  34.34 
 
 		 563 aa  333  5e-90  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000213177  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0571  sulphate anion transporter  38.97 
 
 		 563 aa  333  7.000000000000001e-90  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0840  sulfate transporter  39.93 
 
 		 559 aa  332  1e-89  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0640  sulphate transporter  38.34 
 
 		 581 aa  327  4.0000000000000003e-88  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.029925  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5404  sulphate transporter  38.87 
 
 		 577 aa  326  7e-88  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.428288  normal  0.878672 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1354  sulphate transporter  36.76 
 
 		 541 aa  326  8.000000000000001e-88  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.0620345 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3387  sulphate transporter  42.63 
 
 		 564 aa  325  1e-87  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.084852  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1585  sulfate transporter  37.37 
 
 		 563 aa  325  1e-87  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1734  sulphate transporter  36.47 
 
 		 581 aa  324  2e-87  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.181286  normal  0.0512367 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1160  sulfate transporter  35.82 
 
 		 554 aa  321  1.9999999999999998e-86  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.175133  normal  0.549813 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24970  Sulphate transporter-SulP-type  39.22 
 
 		 553 aa  322  1.9999999999999998e-86  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3882  sulphate transporter  42.19 
 
 		 573 aa  318  2e-85  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0900185 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4088  sulphate transporter  35.07 
 
 		 558 aa  318  2e-85  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.242606  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1108  sulphate transporter  37.89 
 
 		 583 aa  317  4e-85  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5173  sulphate transporter  41.78 
 
 		 426 aa  314  2.9999999999999996e-84  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00867302  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0960  sulphate transporter  35.41 
 
 		 556 aa  309  6.999999999999999e-83  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2233  sulphate transporter  37.66 
 
 		 545 aa  308  1.0000000000000001e-82  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.566684  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0616  sulphate transporter  38.93 
 
 		 580 aa  306  8.000000000000001e-82  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.012784 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1556  sulphate transporter  36.62 
 
 		 568 aa  304  3.0000000000000004e-81  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.902777  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>