299 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_1494 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_1494  cyclic nucleotide-binding protein  100 
 
 
119 aa  246  9e-65  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00548568  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0972  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  54.24 
 
 
122 aa  144  6e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0589137  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1436  putative Crp/Fnr family transcriptional regulator  50 
 
 
122 aa  136  1e-31  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1194  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  48.74 
 
 
127 aa  124  6e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2645  cyclic nucleotide-binding protein  49.58 
 
 
123 aa  124  6e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.597241 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2573  cyclic nucleotide-binding protein  49.58 
 
 
132 aa  122  2e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1167  cyclic nucleotide-binding protein  47.06 
 
 
127 aa  119  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1254  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  47.9 
 
 
131 aa  113  1.0000000000000001e-24  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.000276684  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1957  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  47.46 
 
 
145 aa  99.8  1e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3546  cyclic nucleotide-binding  32.74 
 
 
124 aa  79  0.00000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.194157 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0706  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  35.48 
 
 
127 aa  79  0.00000000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18160  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  32.77 
 
 
219 aa  71.6  0.000000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000607267  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4850  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  35.29 
 
 
228 aa  65.9  0.0000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5745  transcriptional regulator  30.28 
 
 
243 aa  65.1  0.0000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.810963  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1995  transcriptional regulator  35.24 
 
 
224 aa  64.7  0.0000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3370  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  33.65 
 
 
425 aa  63.5  0.0000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4167  cyclic nucleotide-binding protein  32.48 
 
 
570 aa  63.5  0.0000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2732  cyclic nucleotide-binding protein  33.65 
 
 
425 aa  63.5  0.0000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0049  Crp/FNR family transcriptional regulator  33.65 
 
 
252 aa  62.8  0.000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.422683  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1066  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  31.71 
 
 
225 aa  62.4  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6450  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  33.98 
 
 
253 aa  62  0.000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3831  cyclic nucleotide-binding protein  32.41 
 
 
435 aa  61.6  0.000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0387698 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4027  cyclic nucleotide-binding protein  33.05 
 
 
413 aa  61.6  0.000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0468  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  31.43 
 
 
226 aa  58.9  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.974187 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0204  Crp/Fnr family transcriptional regulator  29.27 
 
 
226 aa  58.5  0.00000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0718939  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3249  cyclic nucleotide-binding protein  29.41 
 
 
171 aa  58.5  0.00000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2419  cyclic nucleotide-binding protein  31.3 
 
 
563 aa  58.2  0.00000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.871595  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0517  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.93 
 
 
224 aa  57.8  0.00000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3425  cyclic nucleotide-binding protein  32.48 
 
 
151 aa  57.8  0.00000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2905  cyclic nucleotide-binding protein  28.71 
 
 
157 aa  57.4  0.00000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0600936 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5417  cyclic nucleotide-binding protein  29.82 
 
 
419 aa  57.4  0.00000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0881735  normal  0.0681678 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1284  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  31.73 
 
 
224 aa  57.4  0.00000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.304913  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7131  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30.39 
 
 
155 aa  57  0.00000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.331754 
 
 
-
 
NC_002620  TC0506  cyclic nucleotide-binding protein, putative  36.67 
 
 
137 aa  57  0.00000009  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.191962  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0998  cyclic nucleotide-binding protein  28.32 
 
 
265 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00000000222196  unclonable  1.0277600000000001e-18 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5315  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  33.33 
 
 
228 aa  55.8  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.527594 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2616  cyclic nucleotide-binding protein  30.39 
 
 
219 aa  55.8  0.0000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04890  cAMP-binding protein  31.37 
 
 
226 aa  55.5  0.0000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.84759 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3395  Crp/FNR family transcriptional regulator  29.41 
 
 
225 aa  55.5  0.0000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1108  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  32.65 
 
 
1075 aa  55.1  0.0000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000733786  normal  0.267995 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3713  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  36.08 
 
 
613 aa  55.5  0.0000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000235103  unclonable  0.0000000288509 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2102  CRP/FNR family transcriptional regulator  32.69 
 
 
227 aa  55.5  0.0000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3345  cyclic nucleotide-binding protein  29.91 
 
 
417 aa  55.5  0.0000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.254717  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0435  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  32.35 
 
 
226 aa  55.1  0.0000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.376669 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18280  cAMP-binding protein  32.35 
 
 
225 aa  55.1  0.0000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.186071  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0150  ribonuclease BN-like family protein  38.95 
 
 
435 aa  54.7  0.0000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1398  cyclic nucleotide-binding protein  31 
 
 
157 aa  55.1  0.0000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.908167  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0424  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.41 
 
 
242 aa  54.7  0.0000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.24952 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4102  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25.21 
 
 
251 aa  54.7  0.0000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.363021  normal  0.0126572 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62260  hypothetical protein  27.43 
 
 
265 aa  54.7  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000560596  normal  0.205453 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5025  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  35.05 
 
 
1056 aa  54.7  0.0000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00524189  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3176  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.57 
 
 
225 aa  54.3  0.0000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.231761 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2034  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.57 
 
 
243 aa  53.9  0.0000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.663242  normal  0.0439569 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4818  Crp/FNR family transcriptional regulator  29.81 
 
 
224 aa  54.3  0.0000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5420  hypothetical protein  27.43 
 
 
265 aa  54.3  0.0000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00117771  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3499  Crp/FNR family transcriptional regulator  25 
 
 
230 aa  54.3  0.0000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00506626 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5205  Crp/FNR family transcriptional regulator  29.81 
 
 
224 aa  54.3  0.0000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.703662  hitchhiker  0.000819508 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4904  Crp/FNR family transcriptional regulator  29.81 
 
 
224 aa  54.3  0.0000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.385516 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5435  CRP/FNR family transcriptional regulator  29.81 
 
 
224 aa  53.9  0.0000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.397858 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5981  cyclic nucleotide-binding protein  29.82 
 
 
155 aa  53.9  0.0000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1371  CRP/FNR family transcriptional regulator  29.81 
 
 
224 aa  53.9  0.0000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0955358 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3460  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  34.55 
 
 
644 aa  53.9  0.0000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_12211  predicted protein  35.48 
 
 
528 aa  53.5  0.000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3912  cyclic nucleotide-binding protein  33 
 
 
144 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.262178  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0117  cyclic nucleotide-binding: regulatory protein, Crp  32.35 
 
 
228 aa  53.1  0.000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3038  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.64 
 
 
225 aa  53.1  0.000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2750  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.63 
 
 
222 aa  53.1  0.000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000000354449  normal  0.602467 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4909  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.27 
 
 
221 aa  53.5  0.000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.385812  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13707  Cpr/FNR family transcriptional regulator  29.81 
 
 
224 aa  53.1  0.000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0333343 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0505  cyclic nucleotide-binding protein  33.33 
 
 
224 aa  53.1  0.000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.287437  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0324  Crp/FNR family transcriptional regulator  30.84 
 
 
226 aa  52  0.000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.105795  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1573  cyclic nucleotide-binding  33 
 
 
158 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.490025  hitchhiker  0.00990577 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12584  glutamine-transport ATP-binding protein ABC transporter glnQ  37.66 
 
 
330 aa  52.8  0.000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.516819 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0339  cyclic nucleotide-binding  31.43 
 
 
225 aa  52.8  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0691  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  32.69 
 
 
214 aa  52  0.000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.275069  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4460  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  32.28 
 
 
171 aa  52  0.000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1954  putative Crp/Fnr family transcriptional regulator  26.73 
 
 
141 aa  52  0.000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0235  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  31.48 
 
 
171 aa  52  0.000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.742856 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0841  cyclic nucleotide-binding protein  28.57 
 
 
160 aa  52  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.108052 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4231  Crp/FNR family transcriptional regulator  31.73 
 
 
220 aa  52  0.000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.572136 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3269  CRP/FNR family transcriptional regulator  24.07 
 
 
230 aa  52  0.000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.883713  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6804  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  32.35 
 
 
238 aa  51.6  0.000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.743669  normal  0.223692 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0617  cyclic nucleotide-binding protein  31.78 
 
 
577 aa  51.6  0.000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.340501  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1598  hypothetical protein  28.97 
 
 
407 aa  51.6  0.000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.303519  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4598  cyclic nucleotide-binding protein  31.53 
 
 
414 aa  51.2  0.000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1119  catabolite gene activator (cAMP receptor protein) (cAMP-regulatory protein)  27.88 
 
 
222 aa  50.8  0.000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.106899 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1878  cyclic nucleotide-binding protein  31.43 
 
 
275 aa  50.4  0.000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.116046  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3019  cyclic nucleotide-binding protein  28.45 
 
 
149 aa  50.8  0.000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.852704  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5944  cyclic nucleotide-binding  29.41 
 
 
228 aa  50.4  0.000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0718  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  31.82 
 
 
224 aa  50.4  0.000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3275  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25.23 
 
 
195 aa  50.4  0.000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0513046  hitchhiker  0.00943034 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2118  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  23.97 
 
 
227 aa  50.1  0.000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.545546  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0893  Crp/FNR family transcriptional regulator  29.63 
 
 
226 aa  50.1  0.000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0386  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  34.25 
 
 
340 aa  49.7  0.00001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1772  cyclic nucleotide-binding protein  26.72 
 
 
161 aa  49.7  0.00001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0691544 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_3120  predicted protein  37.5 
 
 
241 aa  50.1  0.00001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1742  cyclic nucleotide-binding  29.37 
 
 
251 aa  50.1  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0700  CRP/FNR family transcriptional regulator  24.3 
 
 
228 aa  49.7  0.00001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.259996 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4601  cyclic nucleotide-binding protein  29.81 
 
 
154 aa  49.7  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.930738 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2316  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  28 
 
 
428 aa  48.9  0.00002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000260717  hitchhiker  0.000176219 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>