153 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_2230 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_2230  hypothetical protein  100 
 
 		 356 aa  733    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00323716 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1731  hypothetical protein  31.23 
 
 		 376 aa  167  2e-40  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2946  cyclic nucleotide-binding protein  30.06 
 
 		 369 aa  166  5e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.360561  normal  0.390891 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_82287  cAMP-dependent protein kinase regulatory subunit (PKA regulatory subunit)  40 
 
 		 441 aa  60.1  0.00000006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.770378 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3842  cyclic nucleotide-binding protein  41.98 
 
 		 582 aa  58.9  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.306863  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3549  cyclic nucleotide-binding protein  41.98 
 
 		 582 aa  58.2  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.864417 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2890  SirA family protein  38.71 
 
 		 189 aa  57.4  0.0000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0866  cyclic nucleotide-regulated FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  36.26 
 
 		 546 aa  57.4  0.0000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.100369 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4020  cyclic nucleotide-binding  36.63 
 
 		 367 aa  56.6  0.0000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.109231  normal  0.727114 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0565  SirA family protein  39.34 
 
 		 189 aa  55.5  0.000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000944688  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1308  Rhodanese domain protein  35 
 
 		 271 aa  54.3  0.000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.197822  normal  0.0310663 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1432  cyclic nucleotide-binding protein  25.88 
 
 		 431 aa  54.3  0.000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_10848  predicted protein  37.96 
 
 		 261 aa  54.3  0.000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5447  voltage-dependent potassium channel  33.33 
 
 		 409 aa  53.9  0.000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.532768  normal  0.0697598 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2725  cyclic nucleotide binding/GGDEF domain-containing protein  31.3 
 
 		 322 aa  53.5  0.000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.792666  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5417  cyclic nucleotide-binding protein  29.58 
 
 		 419 aa  53.1  0.000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0881735  normal  0.0681678 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10105  hypothetical protein  33.04 
 
 		 504 aa  53.1  0.000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_5235  predicted protein  34.04 
 
 		 263 aa  52.8  0.000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.540131  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04987  cAMP-dependent protein kinase regulatory subunit (PKA regulatory subunit) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:O59922]  35.45 
 
 		 412 aa  52  0.00001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.599779  normal  0.51731 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2561  rhodanese-like protein  38.46 
 
 		 288 aa  52.8  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.900675  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4167  cyclic nucleotide-binding protein  30 
 
 		 570 aa  52.4  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2629  Rhodanese domain protein  36.07 
 
 		 216 aa  52  0.00001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.770931  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0841  cyclic nucleotide-binding protein  35.16 
 
 		 160 aa  52.4  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.108052 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18160  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  31.13 
 
 		 219 aa  52.4  0.00001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000607267  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1513  cyclic nucleotide-binding protein  33.04 
 
 		 308 aa  52  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00604424  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3345  cyclic nucleotide-binding protein  31.82 
 
 		 417 aa  51.2  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.254717  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0773  Rhodanese domain protein  34.69 
 
 		 117 aa  52  0.00002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0533  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  36.51 
 
 		 568 aa  51.2  0.00002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.913571  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0424  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30 
 
 		 242 aa  51.2  0.00003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.24952 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3095  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.36 
 
 		 220 aa  50.4  0.00004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000148221 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0320  Rhodanese domain protein  39.06 
 
 		 103 aa  50.8  0.00004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000962456  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0079  hypothetical protein  29.91 
 
 		 169 aa  50.1  0.00005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.26747 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2129  Crp/Fnr family transcriptional regulator  30 
 
 		 225 aa  50.1  0.00005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.185639  normal  0.344505 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4039  cyclic nucleotide-binding protein  33 
 
 		 161 aa  50.4  0.00005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.17311  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7131  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.7 
 
 		 155 aa  50.4  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.331754 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0119  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  35.48 
 
 		 813 aa  50.1  0.00006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1199  rhodanese domain-containing protein  40.98 
 
 		 282 aa  49.7  0.00008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0177216  hitchhiker  0.00286909 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_3120  predicted protein  36.25 
 
 		 241 aa  49.7  0.00008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1505  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  31.17 
 
 		 581 aa  49.3  0.00009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.184185  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0869  rhodanese-like domain-containing protein  37.14 
 
 		 119 aa  48.9  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4027  cyclic nucleotide-binding protein  32.56 
 
 		 413 aa  48.9  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0162  Rhodanese domain protein  38.81 
 
 		 108 aa  49.3  0.0001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.963879  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3910  cyclic nucleotide-binding protein  33.04 
 
 		 167 aa  49.3  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.34683  normal  0.175845 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0067  cyclic nucleotide-binding protein  37.23 
 
 		 153 aa  48.9  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.821564  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0517  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  33 
 
 		 224 aa  48.9  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1523  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  28.41 
 
 		 550 aa  48.1  0.0002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.861068  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0406  rhodanese domain-containing protein  31.87 
 
 		 278 aa  48.5  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.932253 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3370  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  31.13 
 
 		 425 aa  48.5  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0061  Rhodanese domain protein  34.18 
 
 		 277 aa  48.9  0.0002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2732  cyclic nucleotide-binding protein  31.13 
 
 		 425 aa  48.5  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1144  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  36.51 
 
 		 817 aa  48.5  0.0002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000586256  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2074  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  31.82 
 
 		 225 aa  47.8  0.0003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.971908 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2642  SirA family protein  39.06 
 
 		 201 aa  47.8  0.0003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.140879  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5981  cyclic nucleotide-binding protein  27.7 
 
 		 155 aa  47.8  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0117  cyclic nucleotide-binding: regulatory protein, Crp  29.52 
 
 		 228 aa  47.4  0.0004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3395  Crp/FNR family transcriptional regulator  30.09 
 
 		 225 aa  47.4  0.0004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2261  rhodanese domain-containing protein  34.43 
 
 		 279 aa  47.4  0.0004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2356  Rhodanese domain protein  30.23 
 
 		 124 aa  47.4  0.0004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3368  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  35.96 
 
 		 503 aa  47  0.0005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00879958  normal  0.135189 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04890  cAMP-binding protein  26.36 
 
 		 226 aa  47  0.0005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.84759 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0339  cyclic nucleotide-binding  29.57 
 
 		 225 aa  47  0.0005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3780  cyclic nucleotide-binding protein  34.04 
 
 		 715 aa  47  0.0005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.12201  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2851  Rhodanese domain-containing protein  32.79 
 
 		 220 aa  47  0.0005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5025  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  31.67 
 
 		 1056 aa  47  0.0005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00524189  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5044  rhodanese-like protein  30.19 
 
 		 535 aa  46.6  0.0006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1433  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  30.48 
 
 		 408 aa  46.6  0.0007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.532362  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0378  Rhodanese domain protein  31.33 
 
 		 284 aa  46.6  0.0007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.656719  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0772  cyclic nucleotide-binding protein  29.63 
 
 		 164 aa  46.6  0.0007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3863  cyclic nucleotide-binding protein  33.02 
 
 		 715 aa  46.6  0.0007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0623706  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0506  cyclic nucleotide-binding protein, putative  35.59 
 
 		 137 aa  46.2  0.0008  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.191962  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1951  Crp/FNR family transcriptional regulator  35.35 
 
 		 222 aa  46.2  0.0008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.861655  normal  0.0267012 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3804  MscS Mechanosensitive ion channel  35.06 
 
 		 495 aa  46.2  0.0008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0337  rhodanese domain-containing protein  35.85 
 
 		 290 aa  46.2  0.0009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.680282 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1425  CRP/FNR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 212 aa  46.2  0.0009  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0689  rhodanese-like domain-containing protein  36.92 
 
 		 119 aa  45.4  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.152263  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0675  rhodanese-like domain-containing protein  36.92 
 
 		 119 aa  45.4  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.852423  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3083  rhodanese-like protein  38.46 
 
 		 198 aa  45.4  0.001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2892  Rhodanese domain protein  36.07 
 
 		 121 aa  46.2  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2274  rhodanese-related sulfurtransferase  34.85 
 
 		 280 aa  45.8  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000200812  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3025  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  31 
 
 		 179 aa  45.8  0.001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0339332  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2490  cyclic nucleotide-binding protein  35.63 
 
 		 143 aa  45.4  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.529165  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2535  cyclic nucleotide-binding protein  35.63 
 
 		 143 aa  45.4  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.187626  normal  0.577012 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2527  cyclic nucleotide-binding protein  35.63 
 
 		 143 aa  45.4  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.122265 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0588  putative NADH oxidase  34.38 
 
 		 567 aa  45.8  0.001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3727  cyclic nucleotide-binding protein  30.36 
 
 		 167 aa  45.8  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00887093 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0689  rhodanese domain-containing protein  36.36 
 
 		 120 aa  45.8  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0833  rhodanese-like domain protein  36.92 
 
 		 119 aa  45.8  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00574407  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4503  rhodanese-like domain protein  36.23 
 
 		 119 aa  45.4  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000135209 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0873  rhodanese-like domain protein  36.92 
 
 		 119 aa  45.4  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000378208 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0840  cyclic nucleotide-binding protein  32.26 
 
 		 350 aa  45.8  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.126759 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7320  cyclic nucleotide-binding protein  29.31 
 
 		 169 aa  45.4  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.376819  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3723  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  34.04 
 
 		 714 aa  45.4  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1169  Crp/FNR family transcriptional regulator  33.63 
 
 		 227 aa  45.1  0.002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0303416  normal  0.0506186 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1619  beta-lactamase-like protein  37.7 
 
 		 479 aa  45.1  0.002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.00000199695  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2586  putative thiosulfate sulfurtransferase  39.44 
 
 		 361 aa  45.4  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.721613  normal  0.12101 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0563  Rhodanese domain protein  34.33 
 
 		 121 aa  45.1  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000600861  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4598  Rhodanese domain protein  29.89 
 
 		 549 aa  45.1  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.664806  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3038  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.59 
 
 		 225 aa  45.4  0.002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2691  rhodanese domain-containing protein  29.21 
 
 		 411 aa  44.7  0.002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.608697  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1108  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25.47 
 
 		 1075 aa  45.4  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000733786  normal  0.267995 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>