More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_1731 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_1731  hypothetical protein  100 
 
 		 376 aa  776    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2946  cyclic nucleotide-binding protein  41.01 
 
 		 369 aa  250  3e-65  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.360561  normal  0.390891 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2230  hypothetical protein  31.23 
 
 		 356 aa  167  2e-40  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00323716 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0320  thiamine biosynthesis protein ThiI  45.95 
 
 		 484 aa  63.9  0.000000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0913  rhodanese-like domain protein  32.99 
 
 		 127 aa  63.2  0.000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.130078  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4320  rhodanese-like domain protein  32.99 
 
 		 127 aa  62.8  0.00000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0436  rhodanese-like protein  38.3 
 
 		 116 aa  61.6  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0485207  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0737  rhodanese domain-containing protein  37.76 
 
 		 144 aa  62  0.00000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.109302  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0470  Rhodanese domain protein  40 
 
 		 116 aa  60.5  0.00000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.571299  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0119  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  40.58 
 
 		 813 aa  60.5  0.00000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0465  Rhodanese domain protein  40 
 
 		 116 aa  60.5  0.00000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.210477  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2900  rhodanese domain-containing protein  30.93 
 
 		 127 aa  60.1  0.00000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.423457  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4064  rhodanese domain-containing protein  30.93 
 
 		 127 aa  59.7  0.00000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.585247  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3838  rhodanese domain-containing protein  37.08 
 
 		 127 aa  59.7  0.00000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0564  Rhodanese domain protein  34.78 
 
 		 98 aa  58.9  0.0000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000375905  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2356  Rhodanese domain protein  35.05 
 
 		 124 aa  58.9  0.0000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0061  Rhodanese domain protein  38.04 
 
 		 277 aa  59.3  0.0000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5447  voltage-dependent potassium channel  31.25 
 
 		 409 aa  58.9  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.532768  normal  0.0697598 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4229  rhodanese-like domain protein  30.93 
 
 		 127 aa  58.2  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4285  rhodanese-like domain-containing protein  30.93 
 
 		 127 aa  58.2  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4112  rhodanese-like domain-containing protein  30.93 
 
 		 127 aa  58.2  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4340  rhodanese-like domain protein  30.93 
 
 		 127 aa  58.2  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3953  rhodanese-related sulfurtransferase  30.93 
 
 		 127 aa  58.2  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3963  rhodanese-related sulfurtransferase  30.93 
 
 		 127 aa  58.2  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4432  rhodanese-like domain-containing protein  30.93 
 
 		 127 aa  58.2  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0378  Rhodanese domain protein  36.36 
 
 		 284 aa  58.5  0.0000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.656719  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0075  rhodanese domain-containing protein  36.26 
 
 		 354 aa  57.8  0.0000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0262  Rhodanese domain protein  41.33 
 
 		 145 aa  57.8  0.0000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0073  rhodanese domain-containing protein  36.26 
 
 		 354 aa  57.8  0.0000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01120  Rhodanese-related sulfurtransferase  42.11 
 
 		 108 aa  58.2  0.0000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0218  Rhodanese domain protein  34.83 
 
 		 124 aa  57.4  0.0000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1505  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  39.44 
 
 		 581 aa  57.4  0.0000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.184185  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5210  cyclic nucleotide-binding protein  32.59 
 
 		 355 aa  57.4  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.465426  normal  0.688608 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0728  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  39.39 
 
 		 388 aa  57.4  0.0000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.652305  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0320  Rhodanese domain protein  36.26 
 
 		 103 aa  57.4  0.0000004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000962456  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2720  Rhodanese domain protein  39.13 
 
 		 113 aa  57  0.0000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000000079592  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2261  rhodanese domain-containing protein  40 
 
 		 279 aa  57  0.0000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_12655  predicted protein  32.54 
 
 		 260 aa  57  0.0000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4944  cyclic nucleotide-binding protein  39.56 
 
 		 454 aa  57  0.0000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0658137  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3395  Crp/FNR family transcriptional regulator  28.33 
 
 		 225 aa  56.6  0.0000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2515  rhodanese-like domain-containing protein  34.07 
 
 		 354 aa  55.8  0.000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.411992  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2007  metallo-beta-lactamase family protein  40.54 
 
 		 361 aa  55.8  0.000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.256762  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0035  rhodanese domain-containing protein  34.07 
 
 		 354 aa  55.8  0.000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3176  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.33 
 
 		 225 aa  55.8  0.000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.231761 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0035  rhodanese domain-containing protein  34.07 
 
 		 354 aa  55.8  0.000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3835  rhodanese domain-containing protein  39.29 
 
 		 113 aa  56.2  0.000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0039  phage shock protein E  39.44 
 
 		 123 aa  55.1  0.000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2116  sulphate transporter  40.74 
 
 		 703 aa  55.1  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.242384 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1056  putative rhodanese-related sulfurtransferase  35.8 
 
 		 116 aa  55.1  0.000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.218606  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0137  rhodanese domain-containing protein  42.53 
 
 		 108 aa  55.1  0.000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4020  cyclic nucleotide-binding  43.04 
 
 		 367 aa  54.3  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.109231  normal  0.727114 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3095  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.93 
 
 		 220 aa  54.3  0.000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000148221 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2074  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.32 
 
 		 225 aa  54.3  0.000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.971908 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2117  sulphate transporter  40.74 
 
 		 703 aa  54.3  0.000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.271394  normal  0.0391706 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4601  cyclic nucleotide-binding protein  30.63 
 
 		 154 aa  54.7  0.000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.930738 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1523  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  31.25 
 
 		 550 aa  54.3  0.000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.861068  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2274  rhodanese-related sulfurtransferase  42.03 
 
 		 280 aa  53.9  0.000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000200812  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2042  rhodanese-like domain-containing protein  41.18 
 
 		 100 aa  53.9  0.000005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000168009  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3038  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.9 
 
 		 225 aa  53.5  0.000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1816  rhodanese-like domain-containing protein  33.61 
 
 		 120 aa  53.5  0.000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.717844  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0870  rhodanese domain-containing protein  36.96 
 
 		 98 aa  53.5  0.000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2184  phage shock protein E  38.16 
 
 		 129 aa  53.5  0.000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0017776  hitchhiker  0.00888717 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4614  Rhodanese domain protein  35.87 
 
 		 129 aa  53.5  0.000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0480272  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2891  Rhodanese domain protein  35.71 
 
 		 98 aa  53.1  0.000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0573  rhodanese-like protein  36.9 
 
 		 109 aa  53.1  0.000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.000000000146252  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0773  Rhodanese domain protein  35.87 
 
 		 117 aa  53.1  0.000007  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0258  Rhodanese domain protein  39.19 
 
 		 124 aa  53.1  0.000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0156  rhodanese domain-containing protein  39.73 
 
 		 111 aa  53.5  0.000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.634327  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1513  cyclic nucleotide-binding protein  32.14 
 
 		 308 aa  53.1  0.000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00604424  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3148  putative phage shock protein E  39.76 
 
 		 133 aa  52.8  0.000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02700  Molybdopterin biosynthesis protein, MoeB  32.63 
 
 		 377 aa  53.1  0.000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1713  putative lipoprotein  33.68 
 
 		 134 aa  52.4  0.00001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2434  rhodanese-like domain-containing protein  30.77 
 
 		 356 aa  52.4  0.00001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0020  Rhodanese domain-containing protein  30.77 
 
 		 119 aa  52.8  0.00001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.529293  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0689  rhodanese-like domain-containing protein  34 
 
 		 119 aa  52.8  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.152263  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0675  rhodanese-like domain-containing protein  34 
 
 		 119 aa  52.8  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.852423  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0617  cyclic nucleotide-binding protein  32.93 
 
 		 577 aa  52.4  0.00001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.340501  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3370  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.04 
 
 		 425 aa  52.8  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0541  hypothetical protein  36.36 
 
 		 598 aa  52.8  0.00001  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.360191  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3931  Rhodanese domain protein  39.24 
 
 		 129 aa  52.8  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0175301 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4038  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  26.88 
 
 		 409 aa  52.4  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4704  Rhodanese domain protein  33.33 
 
 		 114 aa  52.4  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.930099  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0873  rhodanese-like domain protein  34 
 
 		 119 aa  52.8  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000378208 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4591  rhodanese domain-containing protein  36.94 
 
 		 130 aa  52.8  0.00001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2691  rhodanese domain-containing protein  43.66 
 
 		 125 aa  52.4  0.00001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2732  cyclic nucleotide-binding protein  27.04 
 
 		 425 aa  52.8  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0263  Rhodanese domain protein  40.85 
 
 		 116 aa  52.4  0.00001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2725  cyclic nucleotide binding/GGDEF domain-containing protein  28.44 
 
 		 322 aa  52  0.00002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.792666  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1581  Rhodanese domain protein  39.44 
 
 		 138 aa  51.6  0.00002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0432262  hitchhiker  0.00000000099869 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1605  Rhodanese domain protein  33.33 
 
 		 147 aa  52  0.00002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.501134  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0985  beta-lactamase domain-containing protein  42.86 
 
 		 459 aa  51.6  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3152  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  33.78 
 
 		 487 aa  52  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.833452  normal  0.47191 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2872  rhodanese domain-containing protein  39.44 
 
 		 143 aa  52  0.00002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0499006  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3066  Crp/FNR family transcriptional regulator  28.95 
 
 		 232 aa  51.6  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0206  Rhodanese domain protein  36.9 
 
 		 98 aa  52  0.00002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2561  rhodanese-like protein  34.26 
 
 		 288 aa  52  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.900675  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5691  beta-lactamase domain-containing protein  42.86 
 
 		 459 aa  52  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0689  rhodanese domain-containing protein  34 
 
 		 120 aa  51.6  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000724  phage shock protein E  39.44 
 
 		 116 aa  52  0.00002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1456  rhodanese domain-containing protein  39.44 
 
 		 132 aa  51.6  0.00002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00260172  hitchhiker  0.000336538 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>