More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_5210 on replicon NC_011368
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011368  Rleg2_5210  cyclic nucleotide-binding protein  100 
 
 		 355 aa  704    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.465426  normal  0.688608 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4020  cyclic nucleotide-binding  44.2 
 
 		 367 aa  222  8e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.109231  normal  0.727114 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5447  voltage-dependent potassium channel  41.67 
 
 		 409 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.532768  normal  0.0697598 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1358  Ion transport protein  39.08 
 
 		 419 aa  184  3e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1378  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  39.58 
 
 		 408 aa  182  6e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4038  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  39.13 
 
 		 409 aa  173  3.9999999999999995e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4712  cyclic nucleotide-binding protein  38.62 
 
 		 412 aa  171  2e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.566577  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4567  cyclic nucleotide-binding protein  31.84 
 
 		 385 aa  130  4.0000000000000003e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0724971  normal  0.278006 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0044  Ion transport 2 domain protein  37.27 
 
 		 316 aa  104  2e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1325  VIC family potassium channel protein  36.61 
 
 		 325 aa  101  2e-20  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.266187  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1053  Ion transport protein  36.26 
 
 		 325 aa  100  3e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0861  Ion transport protein  34.63 
 
 		 231 aa  99  1e-19  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03944  putative potassium channel protein  38.51 
 
 		 311 aa  98.6  2e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1342  Ion transport protein  45.54 
 
 		 269 aa  97.4  3e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0543607  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2388  Ion transport protein  36.2 
 
 		 302 aa  96.3  7e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.971604 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0167  Ion transport protein  36.27 
 
 		 273 aa  94.7  2e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.177755  normal  0.634812 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4944  cyclic nucleotide-binding protein  28.35 
 
 		 454 aa  94.4  3e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0658137  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2779  Ion transport protein  44.64 
 
 		 357 aa  93.6  4e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00211831 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2640  potassium channel protein  35.71 
 
 		 277 aa  92  2e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0024  Ion transport protein  36.42 
 
 		 265 aa  90.9  3e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0306194  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1402  Ion transport protein  43.52 
 
 		 331 aa  89.7  8e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0277452  hitchhiker  0.00237581 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1005  Ion transport protein  40.22 
 
 		 267 aa  88.6  2e-16  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1898  Ion transport protein  34.31 
 
 		 308 aa  85.1  0.000000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000138161 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3166  cyclic nucleotide-binding protein  36.97 
 
 		 482 aa  82.8  0.000000000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00363184  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2894  cyclic nucleotide-binding protein  36.97 
 
 		 482 aa  82.8  0.000000000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00660929  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21361  potassium channel, VIC family protein  45.78 
 
 		 212 aa  82  0.00000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.5958 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3842  cyclic nucleotide-binding protein  33.58 
 
 		 582 aa  80.9  0.00000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.306863  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3549  cyclic nucleotide-binding protein  32.84 
 
 		 582 aa  79  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.864417 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0929  Ion transport protein  44.3 
 
 		 274 aa  79  0.0000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.765221  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0408  cation channel family protein  37.5 
 
 		 269 aa  77.4  0.0000000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3370  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  35.04 
 
 		 425 aa  77  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2732  cyclic nucleotide-binding protein  35.04 
 
 		 425 aa  77  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0387  Ion transport protein  40 
 
 		 269 aa  76.6  0.0000000000006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_351  cation channel protein  33.02 
 
 		 269 aa  75.5  0.000000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1814  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  36.29 
 
 		 225 aa  75.1  0.000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_10571  potassium channel, VIC family protein  41.33 
 
 		 259 aa  73.6  0.000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2771  Ion transport protein  37.39 
 
 		 292 aa  73.6  0.000000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.415569  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0236  Ion transport 2 domain protein  41.98 
 
 		 256 aa  72.8  0.000000000008  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.317103 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1368  Kef-type K+ transporter NAD-binding component  40.51 
 
 		 264 aa  72  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0600  Ion transport protein  37.65 
 
 		 228 aa  72.4  0.00000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.90662  normal  0.0268571 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0178  VIC family potassium channel protein  34.02 
 
 		 282 aa  72  0.00000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00471  hypothetical protein  40.51 
 
 		 265 aa  71.6  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03020  hypothetical protein  32.28 
 
 		 282 aa  70.9  0.00000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1941  Ion transport protein  34.74 
 
 		 265 aa  69.7  0.00000000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0124996 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1491  Ion transport protein  34.59 
 
 		 275 aa  68.6  0.0000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1590  Ion transport protein  32.9 
 
 		 276 aa  68.6  0.0000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2527  Ion transport protein  35.1 
 
 		 284 aa  67.4  0.0000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2640  Ion transport protein  35.1 
 
 		 284 aa  67.8  0.0000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.512871  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1824  Ion transport protein  35.1 
 
 		 284 aa  67.8  0.0000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0249663  normal  0.467552 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1854  putative ion transport protein  31.48 
 
 		 282 aa  67.8  0.0000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.807615  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2520  Ion transport protein  35.1 
 
 		 284 aa  67.8  0.0000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04510  cyclic nucleotide-binding domain protein (AFU_orthologue; AFUA_2G03170)  33.06 
 
 		 923 aa  67.4  0.0000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_12211  predicted protein  34.58 
 
 		 528 aa  67  0.0000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0515  ion transport protein  42.86 
 
 		 280 aa  67  0.0000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2112  ion transport protein  33.54 
 
 		 295 aa  66.6  0.0000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1332  TrkA-N:Ion transport protein  34.69 
 
 		 517 aa  67  0.0000000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.478947  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0287  hypothetical protein  40.22 
 
 		 231 aa  66.6  0.0000000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0939  VIC family potassium channel protein  30 
 
 		 276 aa  66.6  0.0000000006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.650828  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002929  possible potassium channel VIC family  31.85 
 
 		 287 aa  66.6  0.0000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000118679  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2209  Ion transport protein  31.33 
 
 		 289 aa  66.6  0.0000000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.427173 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2286  Ion transport protein  31.33 
 
 		 289 aa  66.6  0.0000000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.630315  normal  0.644367 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0841  cyclic nucleotide-binding protein  34.96 
 
 		 160 aa  66.2  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.108052 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2419  Ion transport protein  31.33 
 
 		 289 aa  66.2  0.0000000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0132  VIC family potassium channel protein  36.03 
 
 		 275 aa  65.9  0.000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0238536  normal  0.0130464 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1513  cyclic nucleotide-binding protein  33.06 
 
 		 308 aa  65.9  0.000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00604424  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4027  cyclic nucleotide-binding protein  33.06 
 
 		 413 aa  65.5  0.000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2725  cyclic nucleotide binding/GGDEF domain-containing protein  31.34 
 
 		 322 aa  65.5  0.000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.792666  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3692  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  32.17 
 
 		 146 aa  64.7  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0288  Ion transport protein  32.41 
 
 		 272 aa  65.1  0.000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.503473 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3176  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  34.35 
 
 		 225 aa  64.7  0.000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.231761 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3395  Crp/FNR family transcriptional regulator  34.35 
 
 		 225 aa  65.1  0.000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2074  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  33.6 
 
 		 225 aa  64.3  0.000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.971908 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3674  cyclic nucleotide-binding protein  32.06 
 
 		 788 aa  64.3  0.000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.301148 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00865  hypothetical protein  28.4 
 
 		 272 aa  64.3  0.000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3094  Ion transport 2 domain-containing protein  35.96 
 
 		 273 aa  64.3  0.000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.533818  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3768  ion transporter  37.21 
 
 		 274 aa  63.9  0.000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2679  putative ion transport protein  40 
 
 		 253 aa  63.9  0.000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0253286  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2579  hypothetical protein  35.79 
 
 		 298 aa  63.9  0.000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.932967  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0919  Ion transport 2 domain-containing protein  36.84 
 
 		 274 aa  63.9  0.000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0909  Ion transport 2 domain protein  36.84 
 
 		 274 aa  63.9  0.000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0497907  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0885  Ion transport 2 domain-containing protein  36.84 
 
 		 274 aa  63.9  0.000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.543733  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0091  Ion transport protein  29.19 
 
 		 299 aa  63.5  0.000000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2780  Ion transport protein  33.99 
 
 		 284 aa  63.5  0.000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.715663  normal  0.450959 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3117  Ion transport 2 domain-containing protein  36.05 
 
 		 274 aa  63.5  0.000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0962789  normal  0.861695 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0855  Ion transport 2 domain-containing protein  36.05 
 
 		 274 aa  63.5  0.000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.289459  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3453  Ion transport 2 domain-containing protein  36.84 
 
 		 274 aa  63.9  0.000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.837221  n/a   
 
 
-
 
NC_009047  PICST_63653  Leucine rich repeat protein, contains F-box  29.93 
 
 		 868 aa  63.5  0.000000005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.422768  normal  0.952681 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2700  cyclic nucleotide-binding protein  35.64 
 
 		 215 aa  63.2  0.000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00108848  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1725  Ion transport protein  32.17 
 
 		 292 aa  63.5  0.000000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0536813  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0772  cyclic nucleotide-binding protein  31.54 
 
 		 164 aa  63.5  0.000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0824  Ion transport 2 domain-containing protein  36.05 
 
 		 274 aa  63.2  0.000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.978487 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1478  Ion transport protein  28.75 
 
 		 276 aa  63.2  0.000000007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.870774  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1592  Ion transport protein  31.21 
 
 		 274 aa  62.8  0.000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0101925  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5025  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  33.9 
 
 		 1056 aa  62.8  0.000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00524189  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0253  Ion transport protein  29.66 
 
 		 273 aa  62.8  0.000000009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.614768  normal  0.426198 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1557  Ion transport protein  32.5 
 
 		 277 aa  62.4  0.00000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2375  Ion transport protein  35.29 
 
 		 276 aa  62.4  0.00000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3804  MscS Mechanosensitive ion channel  29.41 
 
 		 495 aa  62.4  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2281  Ion transport protein  31.29 
 
 		 289 aa  61.6  0.00000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.87963  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3910  cyclic nucleotide-binding protein  32.48 
 
 		 167 aa  62  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.34683  normal  0.175845 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>