227 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_1342 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_1342  Ion transport protein  100 
 
 		 269 aa  528  1e-149  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0543607  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2640  potassium channel protein  43.7 
 
 		 277 aa  251  1e-65  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0024  Ion transport protein  45.25 
 
 		 265 aa  245  4e-64  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0306194  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0408  cation channel family protein  50.19 
 
 		 269 aa  244  9.999999999999999e-64  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0167  Ion transport protein  52.99 
 
 		 273 aa  236  2e-61  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.177755  normal  0.634812 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0861  Ion transport protein  54.42 
 
 		 231 aa  233  3e-60  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_351  cation channel protein  46.72 
 
 		 269 aa  230  2e-59  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0387  Ion transport protein  47.73 
 
 		 269 aa  229  5e-59  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1005  Ion transport protein  44.4 
 
 		 267 aa  222  6e-57  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2779  Ion transport protein  42.64 
 
 		 357 aa  210  2e-53  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00211831 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03944  putative potassium channel protein  40.89 
 
 		 311 aa  195  6e-49  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2388  Ion transport protein  41.44 
 
 		 302 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.971604 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1325  VIC family potassium channel protein  41.43 
 
 		 325 aa  179  4.999999999999999e-44  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.266187  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1053  Ion transport protein  41.04 
 
 		 325 aa  177  1e-43  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2771  Ion transport protein  38.96 
 
 		 292 aa  177  2e-43  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.415569  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1402  Ion transport protein  41.7 
 
 		 331 aa  153  2.9999999999999998e-36  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0277452  hitchhiker  0.00237581 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4567  cyclic nucleotide-binding protein  40.4 
 
 		 385 aa  149  6e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0724971  normal  0.278006 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1941  Ion transport protein  33.46 
 
 		 265 aa  148  8e-35  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0124996 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2444  Ion transport protein  36.47 
 
 		 271 aa  147  1.0000000000000001e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21361  potassium channel, VIC family protein  37.89 
 
 		 212 aa  146  4.0000000000000006e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.5958 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5447  voltage-dependent potassium channel  38.96 
 
 		 409 aa  145  5e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.532768  normal  0.0697598 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0044  Ion transport 2 domain protein  38.25 
 
 		 316 aa  145  6e-34  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4038  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  36.03 
 
 		 409 aa  142  5e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1557  Ion transport protein  33.33 
 
 		 277 aa  142  6e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1898  Ion transport protein  35.06 
 
 		 308 aa  141  9.999999999999999e-33  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000138161 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1378  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  35.63 
 
 		 408 aa  140  3e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0600  Ion transport protein  43.82 
 
 		 228 aa  139  6e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.90662  normal  0.0268571 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1821  ion transport protein  31.65 
 
 		 279 aa  137  2e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3292  Ion transport protein  34.08 
 
 		 290 aa  137  2e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1590  Ion transport protein  32.58 
 
 		 276 aa  136  4e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1854  putative ion transport protein  33.73 
 
 		 282 aa  135  6.0000000000000005e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.807615  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1491  Ion transport protein  34.5 
 
 		 275 aa  135  8e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2209  Ion transport protein  34.36 
 
 		 289 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.427173 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2112  ion transport protein  32.3 
 
 		 295 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2419  Ion transport protein  36 
 
 		 289 aa  133  3e-30  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0040  Ion transport protein  38.43 
 
 		 272 aa  132  7.999999999999999e-30  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3005  potassium channel protein  39.08 
 
 		 272 aa  131  9e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.318755  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2281  Ion transport protein  35.91 
 
 		 289 aa  131  1.0000000000000001e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.87963  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2286  Ion transport protein  34.75 
 
 		 289 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.630315  normal  0.644367 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2780  Ion transport protein  32.31 
 
 		 284 aa  130  3e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.715663  normal  0.450959 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09508  potassium channel protein  33.7 
 
 		 288 aa  129  5.0000000000000004e-29  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.993518  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2520  Ion transport protein  33.59 
 
 		 284 aa  129  6e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2640  Ion transport protein  33.59 
 
 		 284 aa  129  6e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.512871  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1824  Ion transport protein  33.59 
 
 		 284 aa  129  6e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0249663  normal  0.467552 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2527  Ion transport protein  33.59 
 
 		 284 aa  129  7.000000000000001e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2766  Ion transport protein  33.1 
 
 		 279 aa  128  8.000000000000001e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0676384  normal  0.308489 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1358  Ion transport protein  33.47 
 
 		 419 aa  128  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1725  Ion transport protein  31.73 
 
 		 292 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0536813  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4712  cyclic nucleotide-binding protein  34.01 
 
 		 412 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.566577  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002929  possible potassium channel VIC family  30.74 
 
 		 287 aa  126  3e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000118679  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03020  hypothetical protein  31.73 
 
 		 282 aa  127  3e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4283  Ion transport protein  35.37 
 
 		 285 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0210487  normal  0.0226615 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44535  predicted protein  30.5 
 
 		 1283 aa  126  4.0000000000000003e-28  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.231791  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0939  VIC family potassium channel protein  33.08 
 
 		 276 aa  126  5e-28  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.650828  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1368  Kef-type K+ transporter NAD-binding component  29.59 
 
 		 264 aa  125  9e-28  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1478  Ion transport protein  32.69 
 
 		 276 aa  125  9e-28  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.870774  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0515  ion transport protein  36.48 
 
 		 280 aa  124  1e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0091  Ion transport protein  32.17 
 
 		 299 aa  125  1e-27  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0288  Ion transport protein  29.6 
 
 		 272 aa  124  1e-27  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.503473 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1014  Ion transport protein  32.31 
 
 		 276 aa  124  1e-27  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000934363  hitchhiker  0.000116097 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1267  Ion transport protein  32.93 
 
 		 305 aa  124  1e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.905498  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3053  Ion transport protein  36.57 
 
 		 288 aa  123  3e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00471  hypothetical protein  29.32 
 
 		 265 aa  123  4e-27  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2579  hypothetical protein  31.45 
 
 		 298 aa  121  9.999999999999999e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.932967  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2375  Ion transport protein  31.33 
 
 		 276 aa  121  1.9999999999999998e-26  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1869  Ion transport protein  29.75 
 
 		 278 aa  120  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.275809  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1875  Ion transport protein  29.39 
 
 		 278 aa  119  7e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.354062  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3630  Ion transport protein  29.92 
 
 		 274 aa  118  7.999999999999999e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.334747  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1932  Ion transport protein  29.39 
 
 		 278 aa  119  7.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.595369  normal  0.0211569 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1586  Ion transport protein  29.39 
 
 		 278 aa  119  7.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.580145  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1404  Ion transport protein  29.39 
 
 		 278 aa  119  7.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3382  Ion transport protein  30.53 
 
 		 277 aa  118  9e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.0078085  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3624  ion transport protein, putative  29.39 
 
 		 277 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3225  Ion transport protein  33.2 
 
 		 258 aa  117  9.999999999999999e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3836  putative potassium channel  33.59 
 
 		 283 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.122783  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3452  Ion transport protein  30.69 
 
 		 279 aa  117  1.9999999999999998e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.81213  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0929  Ion transport protein  33.08 
 
 		 274 aa  117  3e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.765221  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4020  cyclic nucleotide-binding  36.94 
 
 		 367 aa  116  3e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.109231  normal  0.727114 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0253  Ion transport protein  28.79 
 
 		 273 aa  116  3.9999999999999997e-25  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.614768  normal  0.426198 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0076  Ion transport protein  34.29 
 
 		 303 aa  114  1.0000000000000001e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1690  Ion transport protein  34.29 
 
 		 302 aa  114  1.0000000000000001e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0773  ion transporter  33.46 
 
 		 297 aa  114  1.0000000000000001e-24  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.888374  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1566  Ion transport protein  31.15 
 
 		 273 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0452104  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4304  cation transporter, voltage-gated ion channel cation transporter  31.15 
 
 		 273 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45070  putative potassium channel  33.21 
 
 		 283 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3869  Ion transport protein  30.38 
 
 		 273 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.519934  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_10571  potassium channel, VIC family protein  30.08 
 
 		 259 aa  113  3e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4286  Ion transport protein  33.04 
 
 		 272 aa  113  4.0000000000000004e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.361083  normal  0.259623 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4211  Ion transport protein  35.71 
 
 		 283 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0685  Ion transport protein  33.08 
 
 		 297 aa  112  5e-24  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.301571  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6685  Ion transport protein  35.36 
 
 		 273 aa  112  9e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1660  potassium channel protein  31.85 
 
 		 277 aa  111  1.0000000000000001e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.819465 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2927  Ion transport protein  33.07 
 
 		 307 aa  111  1.0000000000000001e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_7186  VIC family transporter: potassium ion channel  38.86 
 
 		 189 aa  111  1.0000000000000001e-23  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0156441  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG2036  ion transporter  32.42 
 
 		 303 aa  111  2.0000000000000002e-23  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    unclonable  0.000000000745091 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2791  Ion transport protein  33.61 
 
 		 306 aa  109  5e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5285  Ion transport protein  34.11 
 
 		 310 aa  109  6e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1166  Ion transport protein  32.4 
 
 		 294 aa  107  3e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5210  cyclic nucleotide-binding protein  42.48 
 
 		 355 aa  106  4e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.465426  normal  0.688608 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1991  potassium channel protein  32.95 
 
 		 279 aa  105  6e-22  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>