236 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_4283 on replicon NC_010515
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010515  Bcenmc03_4283  Ion transport protein  100 
 
 		 285 aa  572  1.0000000000000001e-162  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0210487  normal  0.0226615 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4211  Ion transport protein  83.57 
 
 		 283 aa  438  9.999999999999999e-123  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2791  Ion transport protein  51.5 
 
 		 306 aa  246  3e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3292  Ion transport protein  51.87 
 
 		 290 aa  246  3e-64  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2927  Ion transport protein  51.59 
 
 		 307 aa  241  7.999999999999999e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1267  Ion transport protein  47.41 
 
 		 305 aa  232  6e-60  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.905498  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1557  Ion transport protein  44.28 
 
 		 277 aa  229  5e-59  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1821  ion transport protein  44.53 
 
 		 279 aa  223  2e-57  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3005  potassium channel protein  48.85 
 
 		 272 aa  221  9.999999999999999e-57  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.318755  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1590  Ion transport protein  43.32 
 
 		 276 aa  221  9.999999999999999e-57  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2209  Ion transport protein  43.63 
 
 		 289 aa  220  1.9999999999999999e-56  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.427173 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2419  Ion transport protein  44.05 
 
 		 289 aa  218  8.999999999999998e-56  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03020  hypothetical protein  46.15 
 
 		 282 aa  216  2.9999999999999998e-55  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1854  putative ion transport protein  44.76 
 
 		 282 aa  216  2.9999999999999998e-55  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.807615  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2286  Ion transport protein  43.24 
 
 		 289 aa  216  5e-55  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.630315  normal  0.644367 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1014  Ion transport protein  48 
 
 		 276 aa  215  5.9999999999999996e-55  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000934363  hitchhiker  0.000116097 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5285  Ion transport protein  51.67 
 
 		 310 aa  214  9.999999999999999e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1725  Ion transport protein  48 
 
 		 292 aa  213  1.9999999999999998e-54  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0536813  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1491  Ion transport protein  44.07 
 
 		 275 aa  213  2.9999999999999995e-54  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1166  Ion transport protein  47.06 
 
 		 294 aa  213  3.9999999999999995e-54  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2281  Ion transport protein  43.15 
 
 		 289 aa  211  7e-54  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.87963  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3382  Ion transport protein  42.48 
 
 		 277 aa  211  1e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.0078085  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002929  possible potassium channel VIC family  46.25 
 
 		 287 aa  211  1e-53  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000118679  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2527  Ion transport protein  43.25 
 
 		 284 aa  211  1e-53  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1478  Ion transport protein  47.03 
 
 		 276 aa  211  2e-53  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.870774  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2640  Ion transport protein  42.86 
 
 		 284 aa  209  3e-53  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.512871  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1824  Ion transport protein  42.86 
 
 		 284 aa  209  3e-53  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0249663  normal  0.467552 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2520  Ion transport protein  42.86 
 
 		 284 aa  209  3e-53  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2579  hypothetical protein  45.38 
 
 		 298 aa  209  4e-53  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.932967  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0939  VIC family potassium channel protein  46.19 
 
 		 276 aa  208  6e-53  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.650828  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2112  ion transport protein  41.11 
 
 		 295 aa  208  8e-53  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0288  Ion transport protein  43.72 
 
 		 272 aa  208  9e-53  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.503473 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2780  Ion transport protein  45.38 
 
 		 284 aa  207  2e-52  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.715663  normal  0.450959 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3624  ion transport protein, putative  41.35 
 
 		 277 aa  207  2e-52  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3630  Ion transport protein  41.83 
 
 		 274 aa  207  2e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.334747  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0515  ion transport protein  43.28 
 
 		 280 aa  206  3e-52  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45070  putative potassium channel  49.19 
 
 		 283 aa  206  4e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0709  Ion transport protein  43.48 
 
 		 295 aa  205  6e-52  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2766  Ion transport protein  42 
 
 		 279 aa  205  7e-52  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0676384  normal  0.308489 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0040  Ion transport protein  45.77 
 
 		 272 aa  205  7e-52  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2375  Ion transport protein  39.68 
 
 		 276 aa  204  1e-51  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0685  Ion transport protein  45.8 
 
 		 297 aa  203  3e-51  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.301571  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3869  Ion transport protein  42.29 
 
 		 273 aa  202  4e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.519934  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0773  ion transporter  44.96 
 
 		 297 aa  202  5e-51  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.888374  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0253  Ion transport protein  41.39 
 
 		 273 aa  202  7e-51  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.614768  normal  0.426198 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3836  putative potassium channel  48.73 
 
 		 283 aa  202  7e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.122783  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1566  Ion transport protein  42.29 
 
 		 273 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0452104  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02294  ion transporter  45.14 
 
 		 290 aa  200  1.9999999999999998e-50  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3225  Ion transport protein  47.21 
 
 		 258 aa  199  3e-50  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1991  potassium channel protein  40.81 
 
 		 279 aa  199  5e-50  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4304  cation transporter, voltage-gated ion channel cation transporter  41.9 
 
 		 273 aa  198  6e-50  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09508  potassium channel protein  40.29 
 
 		 288 aa  197  1.0000000000000001e-49  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.993518  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2339  Ion transport protein  44.62 
 
 		 276 aa  197  2.0000000000000003e-49  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0091  Ion transport protein  40.23 
 
 		 299 aa  196  5.000000000000001e-49  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2444  Ion transport protein  43.22 
 
 		 271 aa  191  1e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1592  Ion transport protein  43.46 
 
 		 274 aa  191  1e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0101925  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1660  potassium channel protein  41.11 
 
 		 277 aa  191  2e-47  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.819465 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3452  Ion transport protein  40.77 
 
 		 279 aa  188  1e-46  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.81213  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6685  Ion transport protein  44.49 
 
 		 273 aa  183  3e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4286  Ion transport protein  44.09 
 
 		 272 aa  182  7e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.361083  normal  0.259623 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0076  Ion transport protein  45.64 
 
 		 303 aa  179  4e-44  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1690  Ion transport protein  45.64 
 
 		 302 aa  179  4e-44  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2036  ion transporter  38.91 
 
 		 303 aa  170  3e-41  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    unclonable  0.000000000745091 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3053  Ion transport protein  41.48 
 
 		 288 aa  164  2.0000000000000002e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1586  Ion transport protein  34.39 
 
 		 278 aa  156  4e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.580145  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1404  Ion transport protein  34.39 
 
 		 278 aa  156  4e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1932  Ion transport protein  34.39 
 
 		 278 aa  156  4e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.595369  normal  0.0211569 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1869  Ion transport protein  34.39 
 
 		 278 aa  155  8e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.275809  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1875  Ion transport protein  33.99 
 
 		 278 aa  154  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.354062  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30340  potassium channel  46.99 
 
 		 186 aa  143  3e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.051354  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2297  Ion transport protein  36.03 
 
 		 289 aa  140  1.9999999999999998e-32  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.653039  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0178  VIC family potassium channel protein  38.38 
 
 		 282 aa  122  7e-27  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0132  VIC family potassium channel protein  36.84 
 
 		 275 aa  119  7.999999999999999e-26  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0238536  normal  0.0130464 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0929  Ion transport protein  33.33 
 
 		 274 aa  113  4.0000000000000004e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.765221  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1325  VIC family potassium channel protein  32.19 
 
 		 325 aa  112  1.0000000000000001e-23  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.266187  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1053  Ion transport protein  31.76 
 
 		 325 aa  110  2.0000000000000002e-23  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1342  Ion transport protein  35.37 
 
 		 269 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0543607  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03944  putative potassium channel protein  31.36 
 
 		 311 aa  110  3e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0600  Ion transport protein  33.65 
 
 		 228 aa  109  6e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.90662  normal  0.0268571 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0024  Ion transport protein  26.23 
 
 		 265 aa  108  9.000000000000001e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0306194  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0861  Ion transport protein  31.28 
 
 		 231 aa  108  1e-22  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1898  Ion transport protein  32.06 
 
 		 308 aa  106  6e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000138161 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2030  Ion transport protein  32.04 
 
 		 263 aa  103  4e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1941  Ion transport protein  35.05 
 
 		 265 aa  102  9e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0124996 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2388  Ion transport protein  29.66 
 
 		 302 aa  100  2e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.971604 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4038  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  32.73 
 
 		 409 aa  99.4  6e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2640  potassium channel protein  23.58 
 
 		 277 aa  99  8e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0408  cation channel family protein  30.2 
 
 		 269 aa  97.8  2e-19  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_351  cation channel protein  26.94 
 
 		 269 aa  97.4  2e-19  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0387  Ion transport protein  28.29 
 
 		 269 aa  96.3  6e-19  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1378  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  31.42 
 
 		 408 aa  95.9  6e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21361  potassium channel, VIC family protein  31.82 
 
 		 212 aa  94.7  2e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.5958 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2779  Ion transport protein  28.57 
 
 		 357 aa  92.8  5e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00211831 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1358  Ion transport protein  31.78 
 
 		 419 aa  89.7  4e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5447  voltage-dependent potassium channel  31.56 
 
 		 409 aa  89.7  5e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.532768  normal  0.0697598 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0236  Ion transport 2 domain protein  27.11 
 
 		 256 aa  89.7  5e-17  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.317103 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1005  Ion transport protein  28.33 
 
 		 267 aa  87.4  2e-16  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4712  cyclic nucleotide-binding protein  29.55 
 
 		 412 aa  85.9  7e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.566577  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0167  Ion transport protein  32.08 
 
 		 273 aa  84  0.000000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.177755  normal  0.634812 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0564  Ion transport 2 domain protein  29.3 
 
 		 276 aa  83.6  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>