More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_2030 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_2030  Ion transport protein  100 
 
 
263 aa  529  1e-149  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0564  Ion transport 2 domain protein  63.32 
 
 
276 aa  341  7e-93  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2020  Ion transport protein  52.55 
 
 
282 aa  263  2e-69  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3664  Ion transport 2 domain protein  47.47 
 
 
271 aa  259  4e-68  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.819416 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2446  Ion transport 2 domain protein  47.08 
 
 
269 aa  259  4e-68  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1582  Ion transport 2 domain-containing protein  40.52 
 
 
288 aa  192  4e-48  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1590  Ion transport protein  33.71 
 
 
276 aa  142  4e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1014  Ion transport protein  30.63 
 
 
276 aa  130  2.0000000000000002e-29  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000934363  hitchhiker  0.000116097 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2375  Ion transport protein  30.26 
 
 
276 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3382  Ion transport protein  29.85 
 
 
277 aa  129  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.0078085  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2112  ion transport protein  29.96 
 
 
295 aa  129  5.0000000000000004e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1725  Ion transport protein  29.52 
 
 
292 aa  129  6e-29  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0536813  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0939  VIC family potassium channel protein  31.5 
 
 
276 aa  128  1.0000000000000001e-28  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.650828  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2780  Ion transport protein  32.7 
 
 
284 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.715663  normal  0.450959 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1478  Ion transport protein  31.87 
 
 
276 aa  127  2.0000000000000002e-28  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.870774  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3624  ion transport protein, putative  29.48 
 
 
277 aa  126  3e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3292  Ion transport protein  37.09 
 
 
290 aa  126  4.0000000000000003e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4304  cation transporter, voltage-gated ion channel cation transporter  34.47 
 
 
273 aa  125  9e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2209  Ion transport protein  30.47 
 
 
289 aa  124  1e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.427173 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3630  Ion transport protein  32.38 
 
 
274 aa  124  2e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.334747  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1566  Ion transport protein  33.98 
 
 
273 aa  123  3e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0452104  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2419  Ion transport protein  29.81 
 
 
289 aa  122  4e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3836  putative potassium channel  34.93 
 
 
283 aa  122  4e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.122783  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3869  Ion transport protein  33.5 
 
 
273 aa  122  6e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.519934  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0040  Ion transport protein  31.01 
 
 
272 aa  122  6e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0288  Ion transport protein  30.77 
 
 
272 aa  122  7e-27  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.503473 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2527  Ion transport protein  30.37 
 
 
284 aa  122  8e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0515  ion transport protein  31.01 
 
 
280 aa  121  9e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2640  Ion transport protein  30.37 
 
 
284 aa  122  9e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.512871  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1824  Ion transport protein  30.37 
 
 
284 aa  122  9e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0249663  normal  0.467552 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2520  Ion transport protein  30.37 
 
 
284 aa  122  9e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1875  Ion transport protein  31.64 
 
 
278 aa  121  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.354062  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45070  putative potassium channel  35.41 
 
 
283 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1586  Ion transport protein  31.64 
 
 
278 aa  120  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.580145  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1854  putative ion transport protein  29.89 
 
 
282 aa  120  1.9999999999999998e-26  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.807615  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2444  Ion transport protein  28.95 
 
 
271 aa  120  1.9999999999999998e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0709  Ion transport protein  32.71 
 
 
295 aa  120  1.9999999999999998e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1404  Ion transport protein  31.64 
 
 
278 aa  120  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1932  Ion transport protein  31.64 
 
 
278 aa  120  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.595369  normal  0.0211569 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2766  Ion transport protein  31.14 
 
 
279 aa  119  3e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0676384  normal  0.308489 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1991  potassium channel protein  30.86 
 
 
279 aa  120  3e-26  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1869  Ion transport protein  31.64 
 
 
278 aa  120  3e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.275809  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2286  Ion transport protein  30.22 
 
 
289 aa  119  3.9999999999999996e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.630315  normal  0.644367 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03020  hypothetical protein  33.79 
 
 
282 aa  119  4.9999999999999996e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1821  ion transport protein  29.18 
 
 
279 aa  119  4.9999999999999996e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002929  possible potassium channel VIC family  32.72 
 
 
287 aa  118  9.999999999999999e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000118679  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0132  VIC family potassium channel protein  31.6 
 
 
275 aa  117  9.999999999999999e-26  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0238536  normal  0.0130464 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2281  Ion transport protein  30.4 
 
 
289 aa  116  3.9999999999999997e-25  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.87963  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1557  Ion transport protein  27.63 
 
 
277 aa  115  5e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1592  Ion transport protein  34.3 
 
 
274 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0101925  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09508  potassium channel protein  29.64 
 
 
288 aa  112  6e-24  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.993518  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2579  hypothetical protein  30.86 
 
 
298 aa  112  6e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.932967  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6685  Ion transport protein  30.3 
 
 
273 aa  112  7.000000000000001e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1491  Ion transport protein  28.02 
 
 
275 aa  112  8.000000000000001e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0178  VIC family potassium channel protein  30.63 
 
 
282 aa  112  8.000000000000001e-24  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2339  Ion transport protein  30.92 
 
 
276 aa  111  2.0000000000000002e-23  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0600  Ion transport protein  35.56 
 
 
228 aa  110  3e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.90662  normal  0.0268571 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2791  Ion transport protein  29.55 
 
 
306 aa  109  4.0000000000000004e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0253  Ion transport protein  33.49 
 
 
273 aa  109  4.0000000000000004e-23  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.614768  normal  0.426198 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1166  Ion transport protein  31.13 
 
 
294 aa  108  1e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3452  Ion transport protein  29 
 
 
279 aa  107  2e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.81213  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0091  Ion transport protein  30.66 
 
 
299 aa  107  2e-22  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2036  ion transporter  29.35 
 
 
303 aa  107  3e-22  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    unclonable  0.000000000745091 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1267  Ion transport protein  27.86 
 
 
305 aa  106  3e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.905498  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1660  potassium channel protein  30.4 
 
 
277 aa  104  2e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.819465 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3005  potassium channel protein  30.73 
 
 
272 aa  103  3e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.318755  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4283  Ion transport protein  32.04 
 
 
285 aa  103  3e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0210487  normal  0.0226615 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3053  Ion transport protein  32.86 
 
 
288 aa  102  4e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2927  Ion transport protein  31.51 
 
 
307 aa  102  6e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1325  VIC family potassium channel protein  38.95 
 
 
325 aa  102  9e-21  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.266187  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3161  Ion transport 2 domain protein  28.74 
 
 
258 aa  101  1e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.672229  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0685  Ion transport protein  34.26 
 
 
297 aa  101  1e-20  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.301571  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4286  Ion transport protein  34.58 
 
 
272 aa  101  1e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.361083  normal  0.259623 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0773  ion transporter  33.49 
 
 
297 aa  100  2e-20  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.888374  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2297  Ion transport protein  33.02 
 
 
289 aa  100  2e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.653039  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1053  Ion transport protein  37.79 
 
 
325 aa  99.4  5e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1941  Ion transport protein  29.34 
 
 
265 aa  96.3  4e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0124996 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02294  ion transporter  31.31 
 
 
290 aa  95.9  5e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0024  Ion transport protein  29.13 
 
 
265 aa  95.9  6e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0306194  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3225  Ion transport protein  28.92 
 
 
258 aa  94.7  1e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6042  Ion transport 2 domain-containing protein  31.4 
 
 
256 aa  92.8  4e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.985257  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0861  Ion transport protein  25.74 
 
 
231 aa  93.2  4e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5285  Ion transport protein  32.43 
 
 
310 aa  92.8  5e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0076  Ion transport protein  29.85 
 
 
303 aa  91.3  1e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1690  Ion transport protein  29.85 
 
 
302 aa  91.3  1e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2640  potassium channel protein  28.4 
 
 
277 aa  90.9  2e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1332  TrkA-N:Ion transport protein  32.11 
 
 
517 aa  89  7e-17  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.478947  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1898  Ion transport protein  28.33 
 
 
308 aa  87.8  1e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000138161 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4211  Ion transport protein  32.23 
 
 
283 aa  87.4  2e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0236  Ion transport 2 domain protein  33.64 
 
 
256 aa  87.8  2e-16  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.317103 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03944  putative potassium channel protein  28.43 
 
 
311 aa  87  3e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2765  Ion transport 2  27.73 
 
 
258 aa  85.9  6e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.909105  normal  0.293362 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1499  Ion transport 2 domain-containing protein  36.16 
 
 
230 aa  85.9  6e-16  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.288718  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2388  Ion transport protein  30.46 
 
 
302 aa  85.5  8e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.971604 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2762  Ion transport 2  29.09 
 
 
258 aa  85.1  9e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2720  Ion transport protein  30.52 
 
 
258 aa  85.1  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.56603  normal  0.249922 
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_48178  predicted protein  25.4 
 
 
457 aa  85.1  0.000000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.880924  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1814  Ion transport 2 domain-containing protein  36.54 
 
 
266 aa  84  0.000000000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.176499 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1249  Ion transport 2 domain protein  33.83 
 
 
249 aa  82.8  0.000000000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.940335  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1106  Ion transport 2 domain-containing protein  33.83 
 
 
256 aa  82.4  0.000000000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.226548  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>