231 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_1821 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_1821  ion transport protein  100 
 
 		 279 aa  571  1.0000000000000001e-162  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1557  Ion transport protein  80.36 
 
 		 277 aa  467  1.0000000000000001e-131  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2766  Ion transport protein  81.36 
 
 		 279 aa  459  9.999999999999999e-129  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0676384  normal  0.308489 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2209  Ion transport protein  77.06 
 
 		 289 aa  451  1.0000000000000001e-126  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.427173 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2286  Ion transport protein  76.7 
 
 		 289 aa  449  1e-125  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.630315  normal  0.644367 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2419  Ion transport protein  76.7 
 
 		 289 aa  450  1e-125  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1491  Ion transport protein  78.39 
 
 		 275 aa  448  1e-125  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2640  Ion transport protein  79.03 
 
 		 284 aa  443  1e-123  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.512871  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1824  Ion transport protein  79.03 
 
 		 284 aa  443  1e-123  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0249663  normal  0.467552 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2520  Ion transport protein  79.03 
 
 		 284 aa  443  1e-123  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2112  ion transport protein  76.95 
 
 		 295 aa  442  1e-123  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2527  Ion transport protein  79.03 
 
 		 284 aa  444  1e-123  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2281  Ion transport protein  77.9 
 
 		 289 aa  436  1e-121  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.87963  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1590  Ion transport protein  71.27 
 
 		 276 aa  414  1e-114  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2375  Ion transport protein  69.2 
 
 		 276 aa  407  1e-113  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1854  putative ion transport protein  57.52 
 
 		 282 aa  345  4e-94  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.807615  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03020  hypothetical protein  58.21 
 
 		 282 aa  343  2e-93  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002929  possible potassium channel VIC family  58.09 
 
 		 287 aa  327  1.0000000000000001e-88  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000118679  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2579  hypothetical protein  59.32 
 
 		 298 aa  318  7e-86  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.932967  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0515  ion transport protein  50.36 
 
 		 280 aa  306  3e-82  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0040  Ion transport protein  54.37 
 
 		 272 aa  292  5e-78  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0939  VIC family potassium channel protein  52.17 
 
 		 276 aa  291  7e-78  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.650828  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1478  Ion transport protein  51.81 
 
 		 276 aa  288  5.0000000000000004e-77  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.870774  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3005  potassium channel protein  49.63 
 
 		 272 aa  285  5.999999999999999e-76  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.318755  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2780  Ion transport protein  51.32 
 
 		 284 aa  284  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.715663  normal  0.450959 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3836  putative potassium channel  53.33 
 
 		 283 aa  283  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.122783  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45070  putative potassium channel  53.33 
 
 		 283 aa  283  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3630  Ion transport protein  50.74 
 
 		 274 aa  281  6.000000000000001e-75  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.334747  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1014  Ion transport protein  51.52 
 
 		 276 aa  281  8.000000000000001e-75  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000934363  hitchhiker  0.000116097 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0253  Ion transport protein  45.39 
 
 		 273 aa  275  6e-73  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.614768  normal  0.426198 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3382  Ion transport protein  48.11 
 
 		 277 aa  274  9e-73  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.0078085  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3624  ion transport protein, putative  47.01 
 
 		 277 aa  272  5.000000000000001e-72  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3292  Ion transport protein  45.76 
 
 		 290 aa  271  1e-71  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1725  Ion transport protein  47.45 
 
 		 292 aa  270  2e-71  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0536813  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1166  Ion transport protein  46.07 
 
 		 294 aa  269  5e-71  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4304  cation transporter, voltage-gated ion channel cation transporter  49.07 
 
 		 273 aa  268  8e-71  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1566  Ion transport protein  49.06 
 
 		 273 aa  268  8e-71  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0452104  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3869  Ion transport protein  48.48 
 
 		 273 aa  268  8.999999999999999e-71  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.519934  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1267  Ion transport protein  45.39 
 
 		 305 aa  266  2e-70  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.905498  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0288  Ion transport protein  45.99 
 
 		 272 aa  262  4e-69  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.503473 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2339  Ion transport protein  47.92 
 
 		 276 aa  261  8e-69  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2444  Ion transport protein  48.29 
 
 		 271 aa  261  8.999999999999999e-69  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1991  potassium channel protein  46.39 
 
 		 279 aa  258  8e-68  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1592  Ion transport protein  49.26 
 
 		 274 aa  257  1e-67  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0101925  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2791  Ion transport protein  47.39 
 
 		 306 aa  254  1.0000000000000001e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6685  Ion transport protein  49.24 
 
 		 273 aa  249  3e-65  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2927  Ion transport protein  47.39 
 
 		 307 aa  249  3e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0709  Ion transport protein  44.19 
 
 		 295 aa  244  9.999999999999999e-64  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0076  Ion transport protein  47.6 
 
 		 303 aa  243  3e-63  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1690  Ion transport protein  47.6 
 
 		 302 aa  243  3e-63  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0091  Ion transport protein  44.44 
 
 		 299 aa  243  3e-63  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3452  Ion transport protein  46.27 
 
 		 279 aa  239  2.9999999999999997e-62  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.81213  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5285  Ion transport protein  47.3 
 
 		 310 aa  238  5.999999999999999e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02294  ion transporter  45.36 
 
 		 290 aa  236  3e-61  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2036  ion transporter  46.18 
 
 		 303 aa  233  2.0000000000000002e-60  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    unclonable  0.000000000745091 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3225  Ion transport protein  47.04 
 
 		 258 aa  232  6e-60  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0685  Ion transport protein  44.4 
 
 		 297 aa  230  2e-59  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.301571  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0773  ion transporter  45.19 
 
 		 297 aa  229  4e-59  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.888374  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09508  potassium channel protein  42.2 
 
 		 288 aa  228  1e-58  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.993518  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4286  Ion transport protein  47.83 
 
 		 272 aa  226  4e-58  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.361083  normal  0.259623 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4283  Ion transport protein  44.53 
 
 		 285 aa  223  2e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0210487  normal  0.0226615 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3053  Ion transport protein  44.07 
 
 		 288 aa  216  2e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1404  Ion transport protein  38.24 
 
 		 278 aa  215  5.9999999999999996e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1932  Ion transport protein  38.24 
 
 		 278 aa  215  5.9999999999999996e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.595369  normal  0.0211569 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1586  Ion transport protein  38.24 
 
 		 278 aa  215  5.9999999999999996e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.580145  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1869  Ion transport protein  38.24 
 
 		 278 aa  215  8e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.275809  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1660  potassium channel protein  41.29 
 
 		 277 aa  214  9e-55  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.819465 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1875  Ion transport protein  38.24 
 
 		 278 aa  214  9e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.354062  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4211  Ion transport protein  44.72 
 
 		 283 aa  209  4e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2297  Ion transport protein  36.98 
 
 		 289 aa  194  1e-48  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.653039  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30340  potassium channel  47.06 
 
 		 186 aa  180  2e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.051354  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0178  VIC family potassium channel protein  36.26 
 
 		 282 aa  167  1e-40  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0132  VIC family potassium channel protein  35.16 
 
 		 275 aa  159  4e-38  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0238536  normal  0.0130464 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2388  Ion transport protein  34.75 
 
 		 302 aa  135  6.0000000000000005e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.971604 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03944  putative potassium channel protein  34.31 
 
 		 311 aa  134  1.9999999999999998e-30  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0861  Ion transport protein  31.28 
 
 		 231 aa  129  7.000000000000001e-29  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2640  potassium channel protein  31.46 
 
 		 277 aa  126  3e-28  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0024  Ion transport protein  28.57 
 
 		 265 aa  126  5e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0306194  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1941  Ion transport protein  31.27 
 
 		 265 aa  125  7e-28  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0124996 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1325  VIC family potassium channel protein  32.35 
 
 		 325 aa  122  8e-27  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.266187  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1342  Ion transport protein  31.65 
 
 		 269 aa  121  9.999999999999999e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0543607  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4038  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  32.49 
 
 		 409 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1053  Ion transport protein  31.93 
 
 		 325 aa  120  1.9999999999999998e-26  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2030  Ion transport protein  29.18 
 
 		 263 aa  119  4.9999999999999996e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1378  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  29.37 
 
 		 408 aa  118  9e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0929  Ion transport protein  33.33 
 
 		 274 aa  115  7.999999999999999e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.765221  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1898  Ion transport protein  30.41 
 
 		 308 aa  114  1.0000000000000001e-24  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000138161 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0564  Ion transport 2 domain protein  29.24 
 
 		 276 aa  114  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0600  Ion transport protein  33.33 
 
 		 228 aa  113  4.0000000000000004e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.90662  normal  0.0268571 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3664  Ion transport 2 domain protein  30.19 
 
 		 271 aa  111  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.819416 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2446  Ion transport 2 domain protein  29.86 
 
 		 269 aa  110  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2779  Ion transport protein  29 
 
 		 357 aa  110  2.0000000000000002e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00211831 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2771  Ion transport protein  31.25 
 
 		 292 aa  109  5e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.415569  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0387  Ion transport protein  29.37 
 
 		 269 aa  109  5e-23  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0408  cation channel family protein  27.14 
 
 		 269 aa  108  8.000000000000001e-23  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1358  Ion transport protein  28.29 
 
 		 419 aa  108  8.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_351  cation channel protein  28.15 
 
 		 269 aa  107  2e-22  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4712  cyclic nucleotide-binding protein  30.94 
 
 		 412 aa  107  2e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.566577  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1582  Ion transport 2 domain-containing protein  29.75 
 
 		 288 aa  105  8e-22  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_86010  VIC family transporter: potassium ion channel subfamily B VIC  31.36 
 
 		 513 aa  104  2e-21  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>