235 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal195_2640 on replicon NC_009997
Organism: Shewanella baltica OS195



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009665  Shew185_2520  Ion transport protein  100 
 
 
284 aa  579  1e-164  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2640  Ion transport protein  100 
 
 
284 aa  579  1e-164  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.512871  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2527  Ion transport protein  99.65 
 
 
284 aa  577  1e-164  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1824  Ion transport protein  100 
 
 
284 aa  579  1e-164  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0249663  normal  0.467552 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2209  Ion transport protein  88.97 
 
 
289 aa  517  1e-146  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.427173 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2419  Ion transport protein  88.97 
 
 
289 aa  517  1e-146  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2281  Ion transport protein  87.32 
 
 
289 aa  520  1e-146  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.87963  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2286  Ion transport protein  88.61 
 
 
289 aa  514  1.0000000000000001e-145  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.630315  normal  0.644367 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2112  ion transport protein  77.78 
 
 
295 aa  444  1.0000000000000001e-124  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1821  ion transport protein  79.03 
 
 
279 aa  443  1e-123  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1557  Ion transport protein  77.82 
 
 
277 aa  438  9.999999999999999e-123  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1491  Ion transport protein  77.65 
 
 
275 aa  431  1e-120  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2766  Ion transport protein  77.21 
 
 
279 aa  419  1e-116  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0676384  normal  0.308489 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1590  Ion transport protein  71.64 
 
 
276 aa  413  1e-114  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2375  Ion transport protein  69.57 
 
 
276 aa  408  1e-113  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03020  hypothetical protein  54.07 
 
 
282 aa  321  7e-87  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1854  putative ion transport protein  52.43 
 
 
282 aa  316  2e-85  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.807615  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002929  possible potassium channel VIC family  53 
 
 
287 aa  311  6.999999999999999e-84  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000118679  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2579  hypothetical protein  55.64 
 
 
298 aa  309  4e-83  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.932967  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0515  ion transport protein  50 
 
 
280 aa  297  1e-79  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0040  Ion transport protein  54.95 
 
 
272 aa  295  5e-79  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2780  Ion transport protein  51.7 
 
 
284 aa  285  7e-76  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.715663  normal  0.450959 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3005  potassium channel protein  49.27 
 
 
272 aa  280  1e-74  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.318755  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0939  VIC family potassium channel protein  49.82 
 
 
276 aa  280  2e-74  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.650828  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1478  Ion transport protein  50 
 
 
276 aa  277  1e-73  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.870774  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1014  Ion transport protein  50.57 
 
 
276 aa  275  5e-73  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000934363  hitchhiker  0.000116097 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45070  putative potassium channel  50.72 
 
 
283 aa  275  7e-73  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3382  Ion transport protein  47.58 
 
 
277 aa  274  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.0078085  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3630  Ion transport protein  48.33 
 
 
274 aa  274  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.334747  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3836  putative potassium channel  51.87 
 
 
283 aa  274  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.122783  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3624  ion transport protein, putative  47.71 
 
 
277 aa  271  1e-71  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3292  Ion transport protein  46.55 
 
 
290 aa  269  5e-71  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1725  Ion transport protein  45.42 
 
 
292 aa  267  2e-70  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0536813  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0288  Ion transport protein  46.3 
 
 
272 aa  263  3e-69  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.503473 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1566  Ion transport protein  47.21 
 
 
273 aa  260  1e-68  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0452104  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4304  cation transporter, voltage-gated ion channel cation transporter  46.84 
 
 
273 aa  260  2e-68  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1267  Ion transport protein  47.25 
 
 
305 aa  259  2e-68  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.905498  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1991  potassium channel protein  46.32 
 
 
279 aa  259  4e-68  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3869  Ion transport protein  46.1 
 
 
273 aa  258  1e-67  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.519934  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2339  Ion transport protein  46.67 
 
 
276 aa  256  2e-67  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1166  Ion transport protein  47.37 
 
 
294 aa  255  6e-67  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1592  Ion transport protein  49.07 
 
 
274 aa  255  7e-67  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0101925  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0253  Ion transport protein  45.69 
 
 
273 aa  254  1.0000000000000001e-66  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.614768  normal  0.426198 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2444  Ion transport protein  46.77 
 
 
271 aa  249  2e-65  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0709  Ion transport protein  46.99 
 
 
295 aa  246  3e-64  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2927  Ion transport protein  45.26 
 
 
307 aa  238  8e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0091  Ion transport protein  43.32 
 
 
299 aa  235  5.0000000000000005e-61  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2791  Ion transport protein  46.44 
 
 
306 aa  235  7e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5285  Ion transport protein  48.73 
 
 
310 aa  234  1.0000000000000001e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1690  Ion transport protein  47.79 
 
 
302 aa  232  6e-60  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0076  Ion transport protein  47.79 
 
 
303 aa  231  7.000000000000001e-60  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02294  ion transporter  45.85 
 
 
290 aa  231  1e-59  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0773  ion transporter  46.84 
 
 
297 aa  229  3e-59  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.888374  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0685  Ion transport protein  46.84 
 
 
297 aa  229  3e-59  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.301571  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3452  Ion transport protein  44.04 
 
 
279 aa  228  6e-59  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.81213  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2036  ion transporter  46.79 
 
 
303 aa  226  3e-58  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    unclonable  0.000000000745091 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1660  potassium channel protein  42.86 
 
 
277 aa  226  3e-58  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.819465 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3225  Ion transport protein  50.87 
 
 
258 aa  226  3e-58  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6685  Ion transport protein  46.56 
 
 
273 aa  225  6e-58  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09508  potassium channel protein  39.86 
 
 
288 aa  222  7e-57  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.993518  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4286  Ion transport protein  45.72 
 
 
272 aa  217  1e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.361083  normal  0.259623 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4283  Ion transport protein  42.86 
 
 
285 aa  209  3e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0210487  normal  0.0226615 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1404  Ion transport protein  38.83 
 
 
278 aa  204  1e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1586  Ion transport protein  38.83 
 
 
278 aa  204  1e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.580145  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1932  Ion transport protein  38.83 
 
 
278 aa  204  1e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.595369  normal  0.0211569 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1875  Ion transport protein  38.83 
 
 
278 aa  203  2e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.354062  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3053  Ion transport protein  42.91 
 
 
288 aa  203  2e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1869  Ion transport protein  38.83 
 
 
278 aa  204  2e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.275809  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4211  Ion transport protein  45.96 
 
 
283 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2297  Ion transport protein  37.4 
 
 
289 aa  179  4.999999999999999e-44  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.653039  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30340  potassium channel  47.59 
 
 
186 aa  174  9.999999999999999e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.051354  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0178  VIC family potassium channel protein  34.55 
 
 
282 aa  161  1e-38  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0132  VIC family potassium channel protein  35.48 
 
 
275 aa  157  2e-37  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0238536  normal  0.0130464 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4038  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  35.29 
 
 
409 aa  129  7.000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1941  Ion transport protein  34.29 
 
 
265 aa  129  8.000000000000001e-29  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0124996 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2388  Ion transport protein  33.47 
 
 
302 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.971604 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0024  Ion transport protein  29.93 
 
 
265 aa  125  6e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0306194  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0861  Ion transport protein  34.67 
 
 
231 aa  125  7e-28  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2640  potassium channel protein  30.65 
 
 
277 aa  123  4e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2030  Ion transport protein  30.37 
 
 
263 aa  122  9.999999999999999e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1358  Ion transport protein  35.11 
 
 
419 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0564  Ion transport 2 domain protein  31.07 
 
 
276 aa  120  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1325  VIC family potassium channel protein  29.92 
 
 
325 aa  119  3.9999999999999996e-26  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.266187  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03944  putative potassium channel protein  30.4 
 
 
311 aa  120  3.9999999999999996e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1053  Ion transport protein  29.53 
 
 
325 aa  118  7.999999999999999e-26  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_351  cation channel protein  29.5 
 
 
269 aa  117  3e-25  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1378  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  33.61 
 
 
408 aa  115  7.999999999999999e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1342  Ion transport protein  33.59 
 
 
269 aa  114  3e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0543607  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0408  cation channel family protein  28.63 
 
 
269 aa  112  5e-24  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4712  cyclic nucleotide-binding protein  32.89 
 
 
412 aa  112  5e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.566577  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2771  Ion transport protein  31.69 
 
 
292 aa  110  3e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.415569  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0929  Ion transport protein  33.2 
 
 
274 aa  110  3e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.765221  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2779  Ion transport protein  29.96 
 
 
357 aa  109  6e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00211831 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0387  Ion transport protein  28.57 
 
 
269 aa  108  9.000000000000001e-23  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1582  Ion transport 2 domain-containing protein  29.48 
 
 
288 aa  108  1e-22  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0600  Ion transport protein  32.46 
 
 
228 aa  107  2e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.90662  normal  0.0268571 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21361  potassium channel, VIC family protein  34.18 
 
 
212 aa  107  2e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.5958 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_86010  VIC family transporter: potassium ion channel subfamily B VIC  31.2 
 
 
513 aa  107  2e-22  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3664  Ion transport 2 domain protein  29.03 
 
 
271 aa  107  2e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.819416 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2020  Ion transport protein  25.09 
 
 
282 aa  106  4e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>