267 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_3452 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009441  Fjoh_3452  Ion transport protein  100 
 
 
279 aa  561  1.0000000000000001e-159  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.81213  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0091  Ion transport protein  55.52 
 
 
299 aa  338  7e-92  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09508  potassium channel protein  53.99 
 
 
288 aa  281  8.000000000000001e-75  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.993518  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1557  Ion transport protein  46.45 
 
 
277 aa  261  8.999999999999999e-69  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1267  Ion transport protein  44.81 
 
 
305 aa  259  4e-68  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.905498  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0253  Ion transport protein  46.1 
 
 
273 aa  258  6e-68  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.614768  normal  0.426198 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0040  Ion transport protein  45.82 
 
 
272 aa  256  3e-67  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0288  Ion transport protein  48.15 
 
 
272 aa  255  5e-67  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.503473 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1821  ion transport protein  46.27 
 
 
279 aa  254  1.0000000000000001e-66  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1725  Ion transport protein  44.84 
 
 
292 aa  251  1e-65  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0536813  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1991  potassium channel protein  44.94 
 
 
279 aa  249  3e-65  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1014  Ion transport protein  47.29 
 
 
276 aa  249  3e-65  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000934363  hitchhiker  0.000116097 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3382  Ion transport protein  47.55 
 
 
277 aa  249  4e-65  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.0078085  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3624  ion transport protein, putative  47.17 
 
 
277 aa  249  5e-65  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3005  potassium channel protein  45.11 
 
 
272 aa  248  8e-65  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.318755  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0515  ion transport protein  47.19 
 
 
280 aa  247  2e-64  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1590  Ion transport protein  43.77 
 
 
276 aa  246  2e-64  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2281  Ion transport protein  45.09 
 
 
289 aa  246  3e-64  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.87963  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2112  ion transport protein  44.61 
 
 
295 aa  246  3e-64  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0939  VIC family potassium channel protein  47.92 
 
 
276 aa  246  4e-64  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.650828  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1478  Ion transport protein  47.55 
 
 
276 aa  245  4.9999999999999997e-64  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.870774  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2209  Ion transport protein  44.94 
 
 
289 aa  245  6e-64  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.427173 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2286  Ion transport protein  44.94 
 
 
289 aa  245  6e-64  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.630315  normal  0.644367 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2766  Ion transport protein  46.49 
 
 
279 aa  245  6.999999999999999e-64  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0676384  normal  0.308489 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3292  Ion transport protein  42.07 
 
 
290 aa  245  8e-64  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1824  Ion transport protein  44.04 
 
 
284 aa  243  1.9999999999999999e-63  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0249663  normal  0.467552 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2527  Ion transport protein  44.04 
 
 
284 aa  243  1.9999999999999999e-63  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2640  Ion transport protein  44.04 
 
 
284 aa  243  1.9999999999999999e-63  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.512871  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2520  Ion transport protein  44.04 
 
 
284 aa  243  1.9999999999999999e-63  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2419  Ion transport protein  44.91 
 
 
289 aa  244  1.9999999999999999e-63  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3630  Ion transport protein  44.28 
 
 
274 aa  242  5e-63  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.334747  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2780  Ion transport protein  45.72 
 
 
284 aa  241  9e-63  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.715663  normal  0.450959 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1491  Ion transport protein  42.18 
 
 
275 aa  241  1e-62  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2339  Ion transport protein  46.99 
 
 
276 aa  240  2e-62  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45070  putative potassium channel  46.86 
 
 
283 aa  239  4e-62  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2444  Ion transport protein  42.49 
 
 
271 aa  238  5e-62  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3836  putative potassium channel  46.49 
 
 
283 aa  238  5.999999999999999e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.122783  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2036  ion transporter  48.13 
 
 
303 aa  237  1e-61  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    unclonable  0.000000000745091 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2375  Ion transport protein  43.02 
 
 
276 aa  236  4e-61  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2791  Ion transport protein  45.9 
 
 
306 aa  235  6e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3869  Ion transport protein  44.65 
 
 
273 aa  234  8e-61  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.519934  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1166  Ion transport protein  40.67 
 
 
294 aa  234  8e-61  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1566  Ion transport protein  44.2 
 
 
273 aa  232  5e-60  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0452104  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4304  cation transporter, voltage-gated ion channel cation transporter  44.91 
 
 
273 aa  232  6e-60  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03020  hypothetical protein  42.65 
 
 
282 aa  231  7.000000000000001e-60  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2579  hypothetical protein  49.25 
 
 
298 aa  231  9e-60  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.932967  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6685  Ion transport protein  46.13 
 
 
273 aa  230  2e-59  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1854  putative ion transport protein  43.89 
 
 
282 aa  228  9e-59  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.807615  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2927  Ion transport protein  45.52 
 
 
307 aa  226  4e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002929  possible potassium channel VIC family  41.85 
 
 
287 aa  224  1e-57  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000118679  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3225  Ion transport protein  45.08 
 
 
258 aa  223  2e-57  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5285  Ion transport protein  46.09 
 
 
310 aa  223  4e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1592  Ion transport protein  45.49 
 
 
274 aa  222  7e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0101925  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4286  Ion transport protein  49.26 
 
 
272 aa  219  3.9999999999999997e-56  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.361083  normal  0.259623 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02294  ion transporter  44.44 
 
 
290 aa  218  7e-56  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0685  Ion transport protein  43.91 
 
 
297 aa  212  4.9999999999999996e-54  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.301571  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0709  Ion transport protein  39.07 
 
 
295 aa  211  9e-54  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0773  ion transporter  43.17 
 
 
297 aa  210  2e-53  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.888374  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4283  Ion transport protein  41.11 
 
 
285 aa  203  3e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0210487  normal  0.0226615 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1690  Ion transport protein  41.79 
 
 
302 aa  201  8e-51  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0076  Ion transport protein  41.79 
 
 
303 aa  201  9.999999999999999e-51  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4211  Ion transport protein  41.07 
 
 
283 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1586  Ion transport protein  36.82 
 
 
278 aa  196  3e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.580145  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1932  Ion transport protein  36.82 
 
 
278 aa  196  3e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.595369  normal  0.0211569 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1404  Ion transport protein  36.82 
 
 
278 aa  196  3e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1869  Ion transport protein  36.82 
 
 
278 aa  196  4.0000000000000005e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.275809  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1875  Ion transport protein  36.82 
 
 
278 aa  196  4.0000000000000005e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.354062  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1660  potassium channel protein  36.57 
 
 
277 aa  193  2e-48  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.819465 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2297  Ion transport protein  36.76 
 
 
289 aa  185  8e-46  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.653039  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3053  Ion transport protein  36.5 
 
 
288 aa  169  4e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0178  VIC family potassium channel protein  33.94 
 
 
282 aa  154  2e-36  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30340  potassium channel  42.93 
 
 
186 aa  153  4e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.051354  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0132  VIC family potassium channel protein  32.97 
 
 
275 aa  148  1.0000000000000001e-34  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0238536  normal  0.0130464 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0024  Ion transport protein  34.02 
 
 
265 aa  140  1.9999999999999998e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0306194  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0600  Ion transport protein  36.97 
 
 
228 aa  135  6.0000000000000005e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.90662  normal  0.0268571 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1941  Ion transport protein  30.86 
 
 
265 aa  134  9.999999999999999e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0124996 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0929  Ion transport protein  31.62 
 
 
274 aa  129  7.000000000000001e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.765221  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03944  putative potassium channel protein  34.91 
 
 
311 aa  128  1.0000000000000001e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2640  potassium channel protein  29.89 
 
 
277 aa  125  6e-28  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2388  Ion transport protein  33.19 
 
 
302 aa  125  9e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.971604 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2779  Ion transport protein  33.46 
 
 
357 aa  120  3e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00211831 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2030  Ion transport protein  28.78 
 
 
263 aa  116  3e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1342  Ion transport protein  30.69 
 
 
269 aa  115  6e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0543607  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1378  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  28.41 
 
 
408 aa  112  9e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0861  Ion transport protein  32.74 
 
 
231 aa  112  9e-24  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0408  cation channel family protein  26.92 
 
 
269 aa  111  2.0000000000000002e-23  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0564  Ion transport 2 domain protein  29.85 
 
 
276 aa  110  3e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0387  Ion transport protein  27.72 
 
 
269 aa  109  4.0000000000000004e-23  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1325  VIC family potassium channel protein  32.93 
 
 
325 aa  107  1e-22  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.266187  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4038  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  28.39 
 
 
409 aa  108  1e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_351  cation channel protein  28.36 
 
 
269 aa  107  2e-22  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1358  Ion transport protein  28.03 
 
 
419 aa  107  2e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1053  Ion transport protein  32.52 
 
 
325 aa  107  3e-22  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21361  potassium channel, VIC family protein  33.86 
 
 
212 aa  105  8e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.5958 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2020  Ion transport protein  29.79 
 
 
282 aa  103  4e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3664  Ion transport 2 domain protein  32.57 
 
 
271 aa  101  2e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.819416 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5447  voltage-dependent potassium channel  29.07 
 
 
409 aa  100  3e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.532768  normal  0.0697598 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4712  cyclic nucleotide-binding protein  28.44 
 
 
412 aa  99  7e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.566577  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2446  Ion transport 2 domain protein  31.02 
 
 
269 aa  97.1  3e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1898  Ion transport protein  27.63 
 
 
308 aa  94  2e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000138161 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>