223 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Elen_1898 on replicon NC_013204
Organism: Eggerthella lenta DSM 2243



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013204  Elen_1898  Ion transport protein  100 
 
 
308 aa  609  1e-173  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000138161 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2640  potassium channel protein  34.73 
 
 
277 aa  160  3e-38  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1325  VIC family potassium channel protein  35.32 
 
 
325 aa  158  1e-37  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.266187  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03944  putative potassium channel protein  33.33 
 
 
311 aa  155  1e-36  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1053  Ion transport protein  34.52 
 
 
325 aa  153  4e-36  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0167  Ion transport protein  38.6 
 
 
273 aa  146  4.0000000000000006e-34  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.177755  normal  0.634812 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0861  Ion transport protein  37.31 
 
 
231 aa  141  9.999999999999999e-33  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0024  Ion transport protein  31.91 
 
 
265 aa  139  4.999999999999999e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0306194  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0408  cation channel family protein  33.91 
 
 
269 aa  134  9.999999999999999e-31  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0387  Ion transport protein  35.37 
 
 
269 aa  135  9.999999999999999e-31  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2771  Ion transport protein  30.24 
 
 
292 aa  132  9e-30  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.415569  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1342  Ion transport protein  35.06 
 
 
269 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0543607  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1402  Ion transport protein  34.5 
 
 
331 aa  130  3e-29  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0277452  hitchhiker  0.00237581 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2779  Ion transport protein  30.16 
 
 
357 aa  130  3e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00211831 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1005  Ion transport protein  31.76 
 
 
267 aa  127  2.0000000000000002e-28  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1378  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  32.02 
 
 
408 aa  127  3e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5447  voltage-dependent potassium channel  34.18 
 
 
409 aa  126  5e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.532768  normal  0.0697598 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4038  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  31.18 
 
 
409 aa  124  2e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21361  potassium channel, VIC family protein  34.87 
 
 
212 aa  124  2e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.5958 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1358  Ion transport protein  31.54 
 
 
419 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4712  cyclic nucleotide-binding protein  32.03 
 
 
412 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.566577  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_351  cation channel protein  31.88 
 
 
269 aa  122  9.999999999999999e-27  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3292  Ion transport protein  32.59 
 
 
290 aa  118  9.999999999999999e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2388  Ion transport protein  31.45 
 
 
302 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.971604 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1821  ion transport protein  30.41 
 
 
279 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0091  Ion transport protein  26.95 
 
 
299 aa  112  6e-24  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1854  putative ion transport protein  34.77 
 
 
282 aa  112  7.000000000000001e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.807615  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0600  Ion transport protein  32.98 
 
 
228 aa  111  2.0000000000000002e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.90662  normal  0.0268571 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2112  ion transport protein  29.92 
 
 
295 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3630  Ion transport protein  29.05 
 
 
274 aa  110  3e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.334747  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4567  cyclic nucleotide-binding protein  39.56 
 
 
385 aa  109  6e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0724971  normal  0.278006 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02294  ion transporter  30.14 
 
 
290 aa  108  9.000000000000001e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3624  ion transport protein, putative  30.14 
 
 
277 aa  108  2e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1941  Ion transport protein  30.6 
 
 
265 aa  108  2e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0124996 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5285  Ion transport protein  34.56 
 
 
310 aa  107  3e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03020  hypothetical protein  31.09 
 
 
282 aa  107  4e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1267  Ion transport protein  31.8 
 
 
305 aa  107  4e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.905498  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0236  Ion transport 2 domain protein  30.12 
 
 
256 aa  106  5e-22  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.317103 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0929  Ion transport protein  33.94 
 
 
274 aa  106  6e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.765221  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4283  Ion transport protein  32.06 
 
 
285 aa  106  6e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0210487  normal  0.0226615 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3869  Ion transport protein  28.99 
 
 
273 aa  105  7e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.519934  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2286  Ion transport protein  30.67 
 
 
289 aa  105  8e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.630315  normal  0.644367 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4304  cation transporter, voltage-gated ion channel cation transporter  28.4 
 
 
273 aa  105  1e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1566  Ion transport protein  29.05 
 
 
273 aa  105  1e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0452104  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2209  Ion transport protein  30.77 
 
 
289 aa  105  1e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.427173 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45070  putative potassium channel  33.16 
 
 
283 aa  104  2e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2419  Ion transport protein  31.2 
 
 
289 aa  104  2e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3382  Ion transport protein  29.67 
 
 
277 aa  103  3e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.0078085  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1991  potassium channel protein  31.72 
 
 
279 aa  103  3e-21  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1557  Ion transport protein  30.4 
 
 
277 aa  103  4e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002929  possible potassium channel VIC family  34.98 
 
 
287 aa  103  5e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000118679  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3836  putative potassium channel  32.65 
 
 
283 aa  102  1e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.122783  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2375  Ion transport protein  29.03 
 
 
276 aa  102  1e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1725  Ion transport protein  31.14 
 
 
292 aa  102  1e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0536813  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1590  Ion transport protein  29.73 
 
 
276 aa  102  1e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1368  Kef-type K+ transporter NAD-binding component  28.74 
 
 
264 aa  101  2e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00471  hypothetical protein  28.34 
 
 
265 aa  100  2e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0288  Ion transport protein  30.33 
 
 
272 aa  100  3e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.503473 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2640  Ion transport protein  30.64 
 
 
284 aa  100  4e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.512871  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1824  Ion transport protein  30.64 
 
 
284 aa  100  4e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0249663  normal  0.467552 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2520  Ion transport protein  30.64 
 
 
284 aa  100  4e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2527  Ion transport protein  30.64 
 
 
284 aa  100  4e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2281  Ion transport protein  30.77 
 
 
289 aa  100  4e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.87963  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0044  Ion transport 2 domain protein  30.87 
 
 
316 aa  99.8  5e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2444  Ion transport protein  29.37 
 
 
271 aa  99.4  6e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2780  Ion transport protein  27.95 
 
 
284 aa  99  9e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.715663  normal  0.450959 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1478  Ion transport protein  32.8 
 
 
276 aa  98.6  1e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.870774  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0253  Ion transport protein  28.63 
 
 
273 aa  98.6  1e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.614768  normal  0.426198 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0939  VIC family potassium channel protein  32.28 
 
 
276 aa  97.8  2e-19  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.650828  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1014  Ion transport protein  31.22 
 
 
276 aa  95.9  7e-19  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000934363  hitchhiker  0.000116097 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1491  Ion transport protein  28.41 
 
 
275 aa  95.9  7e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1592  Ion transport protein  30.84 
 
 
274 aa  95.9  8e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0101925  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0564  Ion transport 2 domain protein  27.2 
 
 
276 aa  94.4  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1166  Ion transport protein  34.92 
 
 
294 aa  94.4  2e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1875  Ion transport protein  28.62 
 
 
278 aa  94.7  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.354062  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2927  Ion transport protein  28.67 
 
 
307 aa  94  3e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3225  Ion transport protein  29.8 
 
 
258 aa  94  3e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0186  Ion transport protein  24.75 
 
 
513 aa  93.6  4e-18  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1404  Ion transport protein  28.98 
 
 
278 aa  93.6  4e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4211  Ion transport protein  34.31 
 
 
283 aa  93.6  4e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1869  Ion transport protein  28.98 
 
 
278 aa  93.6  4e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.275809  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1932  Ion transport protein  28.98 
 
 
278 aa  93.6  4e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.595369  normal  0.0211569 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1586  Ion transport protein  28.98 
 
 
278 aa  93.6  4e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.580145  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2766  Ion transport protein  28.51 
 
 
279 aa  93.2  5e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0676384  normal  0.308489 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09508  potassium channel protein  27.52 
 
 
288 aa  92.8  6e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.993518  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2339  Ion transport protein  28.39 
 
 
276 aa  92.8  7e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_10571  potassium channel, VIC family protein  29.29 
 
 
259 aa  91.7  2e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0178  VIC family potassium channel protein  35.19 
 
 
282 aa  90.5  3e-17  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0040  Ion transport protein  33.64 
 
 
272 aa  90.1  4e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0773  ion transporter  28.89 
 
 
297 aa  89.7  6e-17  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.888374  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3005  potassium channel protein  28.97 
 
 
272 aa  89.7  6e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.318755  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2020  Ion transport protein  27.73 
 
 
282 aa  89.4  8e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0709  Ion transport protein  28.02 
 
 
295 aa  89  9e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2791  Ion transport protein  27.01 
 
 
306 aa  88.6  1e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2030  Ion transport protein  28.33 
 
 
263 aa  87.8  2e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0685  Ion transport protein  28.68 
 
 
297 aa  87.8  2e-16  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.301571  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2579  hypothetical protein  28.29 
 
 
298 aa  87  4e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.932967  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3452  Ion transport protein  28.57 
 
 
279 aa  86.3  6e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.81213  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0132  VIC family potassium channel protein  32.84 
 
 
275 aa  86.3  6e-16  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0238536  normal  0.0130464 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2168  TrkA-N domain protein  26.27 
 
 
531 aa  86.3  6e-16  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>