207 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_0024 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_0024  Ion transport protein  100 
 
 		 265 aa  540  9.999999999999999e-153  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0306194  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2640  potassium channel protein  41.26 
 
 		 277 aa  235  5.0000000000000005e-61  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1342  Ion transport protein  45.25 
 
 		 269 aa  229  4e-59  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0543607  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0861  Ion transport protein  47.32 
 
 		 231 aa  220  1.9999999999999999e-56  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1005  Ion transport protein  42.8 
 
 		 267 aa  213  2.9999999999999995e-54  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0408  cation channel family protein  46.84 
 
 		 269 aa  212  4.9999999999999996e-54  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2779  Ion transport protein  44.44 
 
 		 357 aa  210  2e-53  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00211831 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0387  Ion transport protein  47.26 
 
 		 269 aa  209  4e-53  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_351  cation channel protein  46.41 
 
 		 269 aa  208  8e-53  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0167  Ion transport protein  45.11 
 
 		 273 aa  207  1e-52  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.177755  normal  0.634812 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03944  putative potassium channel protein  38.76 
 
 		 311 aa  180  2e-44  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1325  VIC family potassium channel protein  38.4 
 
 		 325 aa  173  1.9999999999999998e-42  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.266187  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1053  Ion transport protein  38.8 
 
 		 325 aa  174  1.9999999999999998e-42  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2388  Ion transport protein  36.11 
 
 		 302 aa  169  5e-41  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.971604 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0044  Ion transport 2 domain protein  38.85 
 
 		 316 aa  167  2e-40  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1402  Ion transport protein  39.76 
 
 		 331 aa  163  3e-39  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0277452  hitchhiker  0.00237581 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1358  Ion transport protein  32.13 
 
 		 419 aa  155  6e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21361  potassium channel, VIC family protein  34.36 
 
 		 212 aa  150  3e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.5958 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1378  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  30.92 
 
 		 408 aa  146  4.0000000000000006e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4038  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  32.02 
 
 		 409 aa  146  4.0000000000000006e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2771  Ion transport protein  35.9 
 
 		 292 aa  144  1e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.415569  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1590  Ion transport protein  34.81 
 
 		 276 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2444  Ion transport protein  32.51 
 
 		 271 aa  140  3e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1898  Ion transport protein  31.91 
 
 		 308 aa  139  3.9999999999999997e-32  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000138161 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1991  potassium channel protein  32.92 
 
 		 279 aa  139  7e-32  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5447  voltage-dependent potassium channel  31.5 
 
 		 409 aa  138  7.999999999999999e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.532768  normal  0.0697598 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3005  potassium channel protein  30.83 
 
 		 272 aa  138  1e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.318755  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0091  Ion transport protein  31.88 
 
 		 299 aa  137  1e-31  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1941  Ion transport protein  32.73 
 
 		 265 aa  137  1e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0124996 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4712  cyclic nucleotide-binding protein  30.92 
 
 		 412 aa  137  2e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.566577  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0939  VIC family potassium channel protein  29.7 
 
 		 276 aa  137  2e-31  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.650828  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1478  Ion transport protein  30.08 
 
 		 276 aa  137  2e-31  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.870774  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1557  Ion transport protein  31.8 
 
 		 277 aa  137  2e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0600  Ion transport protein  41.08 
 
 		 228 aa  136  3.0000000000000003e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.90662  normal  0.0268571 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5285  Ion transport protein  32.17 
 
 		 310 aa  135  6.0000000000000005e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3225  Ion transport protein  31.11 
 
 		 258 aa  135  8e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2112  ion transport protein  32.46 
 
 		 295 aa  134  9.999999999999999e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1368  Kef-type K+ transporter NAD-binding component  34.12 
 
 		 264 aa  134  1.9999999999999998e-30  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1014  Ion transport protein  28.95 
 
 		 276 aa  134  1.9999999999999998e-30  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000934363  hitchhiker  0.000116097 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2375  Ion transport protein  33.47 
 
 		 276 aa  133  3e-30  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1854  putative ion transport protein  32.1 
 
 		 282 aa  132  6e-30  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.807615  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3452  Ion transport protein  35.78 
 
 		 279 aa  132  7.999999999999999e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.81213  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00471  hypothetical protein  33.73 
 
 		 265 aa  131  9e-30  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_10571  potassium channel, VIC family protein  34.51 
 
 		 259 aa  131  1.0000000000000001e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1166  Ion transport protein  30.94 
 
 		 294 aa  130  2.0000000000000002e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2780  Ion transport protein  30.8 
 
 		 284 aa  129  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.715663  normal  0.450959 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2766  Ion transport protein  30.71 
 
 		 279 aa  128  9.000000000000001e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0676384  normal  0.308489 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0515  ion transport protein  31.37 
 
 		 280 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3292  Ion transport protein  30.24 
 
 		 290 aa  127  1.0000000000000001e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3630  Ion transport protein  29.59 
 
 		 274 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.334747  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1267  Ion transport protein  29.3 
 
 		 305 aa  127  2.0000000000000002e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.905498  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1821  ion transport protein  28.57 
 
 		 279 aa  126  4.0000000000000003e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1824  Ion transport protein  29.93 
 
 		 284 aa  125  5e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0249663  normal  0.467552 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2640  Ion transport protein  29.93 
 
 		 284 aa  125  5e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.512871  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2520  Ion transport protein  29.93 
 
 		 284 aa  125  5e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2527  Ion transport protein  29.93 
 
 		 284 aa  125  5e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2209  Ion transport protein  29.85 
 
 		 289 aa  124  1e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.427173 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3624  ion transport protein, putative  30.04 
 
 		 277 aa  124  2e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1725  Ion transport protein  32.57 
 
 		 292 aa  123  2e-27  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0536813  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2286  Ion transport protein  29.33 
 
 		 289 aa  124  2e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.630315  normal  0.644367 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2281  Ion transport protein  30.11 
 
 		 289 aa  124  2e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.87963  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09508  potassium channel protein  34.55 
 
 		 288 aa  124  2e-27  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.993518  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0288  Ion transport protein  28.29 
 
 		 272 aa  123  3e-27  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.503473 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2419  Ion transport protein  30.31 
 
 		 289 aa  122  4e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4567  cyclic nucleotide-binding protein  32.11 
 
 		 385 aa  122  6e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0724971  normal  0.278006 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3382  Ion transport protein  29.1 
 
 		 277 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.0078085  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03020  hypothetical protein  27.56 
 
 		 282 aa  121  9.999999999999999e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3869  Ion transport protein  29.48 
 
 		 273 aa  119  7e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.519934  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0236  Ion transport 2 domain protein  32.2 
 
 		 256 aa  118  7.999999999999999e-26  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.317103 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1491  Ion transport protein  29.13 
 
 		 275 aa  118  7.999999999999999e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1566  Ion transport protein  28.62 
 
 		 273 aa  118  9e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0452104  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002929  possible potassium channel VIC family  29.91 
 
 		 287 aa  118  9.999999999999999e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000118679  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4304  cation transporter, voltage-gated ion channel cation transporter  29.02 
 
 		 273 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0040  Ion transport protein  30.6 
 
 		 272 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0929  Ion transport protein  30.74 
 
 		 274 aa  116  3e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.765221  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2339  Ion transport protein  30.54 
 
 		 276 aa  117  3e-25  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4286  Ion transport protein  33.92 
 
 		 272 aa  117  3e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.361083  normal  0.259623 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0253  Ion transport protein  27.98 
 
 		 273 aa  116  3.9999999999999997e-25  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.614768  normal  0.426198 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0709  Ion transport protein  30.3 
 
 		 295 aa  115  6e-25  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2036  ion transporter  35.1 
 
 		 303 aa  114  2.0000000000000002e-24  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    unclonable  0.000000000745091 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3836  putative potassium channel  27.82 
 
 		 283 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.122783  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0076  Ion transport protein  30.34 
 
 		 303 aa  112  6e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1690  Ion transport protein  30.34 
 
 		 302 aa  112  6e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44535  predicted protein  26.03 
 
 		 1283 aa  111  9e-24  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.231791  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2579  hypothetical protein  32.84 
 
 		 298 aa  110  3e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.932967  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45070  putative potassium channel  28.09 
 
 		 283 aa  110  3e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1404  Ion transport protein  27.64 
 
 		 278 aa  109  4.0000000000000004e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1586  Ion transport protein  27.64 
 
 		 278 aa  109  4.0000000000000004e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.580145  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1932  Ion transport protein  27.64 
 
 		 278 aa  109  4.0000000000000004e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.595369  normal  0.0211569 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1332  TrkA-N:Ion transport protein  31.38 
 
 		 517 aa  108  8.000000000000001e-23  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.478947  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4283  Ion transport protein  26.23 
 
 		 285 aa  108  8.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0210487  normal  0.0226615 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1875  Ion transport protein  27.27 
 
 		 278 aa  108  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.354062  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1869  Ion transport protein  27.27 
 
 		 278 aa  107  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.275809  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1660  potassium channel protein  28.31 
 
 		 277 aa  107  2e-22  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.819465 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3053  Ion transport protein  28.25 
 
 		 288 aa  107  2e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2927  Ion transport protein  31.4 
 
 		 307 aa  104  1e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2791  Ion transport protein  31.4 
 
 		 306 aa  103  4e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6685  Ion transport protein  29.41 
 
 		 273 aa  101  1e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1592  Ion transport protein  28.36 
 
 		 274 aa  100  3e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0101925  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2168  TrkA-N domain protein  32.38 
 
 		 531 aa  99.4  6e-20  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>