More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_5447 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_5447  voltage-dependent potassium channel  100 
 
 		 409 aa  808    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.532768  normal  0.0697598 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1378  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  48.87 
 
 		 408 aa  352  1e-95  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1358  Ion transport protein  47.44 
 
 		 419 aa  347  2e-94  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4712  cyclic nucleotide-binding protein  47.31 
 
 		 412 aa  338  7e-92  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.566577  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4038  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  46.95 
 
 		 409 aa  330  2e-89  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4567  cyclic nucleotide-binding protein  41.1 
 
 		 385 aa  240  4e-62  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0724971  normal  0.278006 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4020  cyclic nucleotide-binding  39.07 
 
 		 367 aa  214  1.9999999999999998e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.109231  normal  0.727114 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5210  cyclic nucleotide-binding protein  41.67 
 
 		 355 aa  201  1.9999999999999998e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.465426  normal  0.688608 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2640  potassium channel protein  32.81 
 
 		 277 aa  145  9e-34  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1325  VIC family potassium channel protein  36.76 
 
 		 325 aa  144  3e-33  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.266187  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1053  Ion transport protein  36.36 
 
 		 325 aa  143  4e-33  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2779  Ion transport protein  31.58 
 
 		 357 aa  142  9.999999999999999e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00211831 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03944  putative potassium channel protein  33.59 
 
 		 311 aa  140  3e-32  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1342  Ion transport protein  38.15 
 
 		 269 aa  140  4.999999999999999e-32  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0543607  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0024  Ion transport protein  31.5 
 
 		 265 aa  138  2e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0306194  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0167  Ion transport protein  32.8 
 
 		 273 aa  136  7.000000000000001e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.177755  normal  0.634812 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0861  Ion transport protein  35.71 
 
 		 231 aa  134  3e-30  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0044  Ion transport 2 domain protein  36.84 
 
 		 316 aa  130  6e-29  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0408  cation channel family protein  34.82 
 
 		 269 aa  128  2.0000000000000002e-28  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0387  Ion transport protein  33.33 
 
 		 269 aa  127  2.0000000000000002e-28  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2388  Ion transport protein  33.04 
 
 		 302 aa  127  4.0000000000000003e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.971604 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1402  Ion transport protein  33.33 
 
 		 331 aa  127  5e-28  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0277452  hitchhiker  0.00237581 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1898  Ion transport protein  34.18 
 
 		 308 aa  126  7e-28  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000138161 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1005  Ion transport protein  31.33 
 
 		 267 aa  124  4e-27  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_351  cation channel protein  32.74 
 
 		 269 aa  123  5e-27  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1014  Ion transport protein  32 
 
 		 276 aa  120  6e-26  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000934363  hitchhiker  0.000116097 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3382  Ion transport protein  30.24 
 
 		 277 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.0078085  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2780  Ion transport protein  29.55 
 
 		 284 aa  117  5e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.715663  normal  0.450959 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3630  Ion transport protein  29.48 
 
 		 274 aa  116  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.334747  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3624  ion transport protein, putative  29.84 
 
 		 277 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0939  VIC family potassium channel protein  30.18 
 
 		 276 aa  114  4.0000000000000004e-24  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.650828  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0040  Ion transport protein  36.47 
 
 		 272 aa  113  7.000000000000001e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2112  ion transport protein  29.55 
 
 		 295 aa  112  9e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2771  Ion transport protein  32.24 
 
 		 292 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.415569  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0600  Ion transport protein  34.1 
 
 		 228 aa  111  2.0000000000000002e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.90662  normal  0.0268571 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1478  Ion transport protein  29.45 
 
 		 276 aa  110  5e-23  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.870774  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1590  Ion transport protein  29.18 
 
 		 276 aa  110  5e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3869  Ion transport protein  29.88 
 
 		 273 aa  110  6e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.519934  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1566  Ion transport protein  29.69 
 
 		 273 aa  108  1e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0452104  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5285  Ion transport protein  36.2 
 
 		 310 aa  109  1e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4304  cation transporter, voltage-gated ion channel cation transporter  29.48 
 
 		 273 aa  107  3e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3005  potassium channel protein  35.94 
 
 		 272 aa  106  6e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.318755  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1592  Ion transport protein  29.46 
 
 		 274 aa  106  8e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0101925  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03020  hypothetical protein  32.14 
 
 		 282 aa  105  2e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1557  Ion transport protein  31.74 
 
 		 277 aa  104  2e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1854  putative ion transport protein  32.9 
 
 		 282 aa  104  2e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.807615  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21361  potassium channel, VIC family protein  33.51 
 
 		 212 aa  104  3e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.5958 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2444  Ion transport protein  29.69 
 
 		 271 aa  103  4e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2168  TrkA-N domain protein  34.78 
 
 		 531 aa  103  5e-21  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2766  Ion transport protein  31.63 
 
 		 279 aa  102  2e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0676384  normal  0.308489 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1725  Ion transport protein  28.69 
 
 		 292 aa  101  2e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0536813  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1267  Ion transport protein  31.56 
 
 		 305 aa  101  2e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.905498  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0253  Ion transport protein  32.09 
 
 		 273 aa  99.8  7e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.614768  normal  0.426198 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002929  possible potassium channel VIC family  32.17 
 
 		 287 aa  99  1e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000118679  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2927  Ion transport protein  30.38 
 
 		 307 aa  99  1e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1368  Kef-type K+ transporter NAD-binding component  27.82 
 
 		 264 aa  98.2  2e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3836  putative potassium channel  30.99 
 
 		 283 aa  98.2  2e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.122783  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3292  Ion transport protein  29.78 
 
 		 290 aa  98.6  2e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2375  Ion transport protein  33.19 
 
 		 276 aa  97.8  3e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45070  putative potassium channel  30.99 
 
 		 283 aa  97.8  3e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0515  ion transport protein  30.92 
 
 		 280 aa  97.4  4e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0709  Ion transport protein  31.01 
 
 		 295 aa  97.4  4e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1875  Ion transport protein  31.3 
 
 		 278 aa  97.4  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.354062  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2640  Ion transport protein  31.88 
 
 		 284 aa  97.1  5e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.512871  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3452  Ion transport protein  28.84 
 
 		 279 aa  97.1  5e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.81213  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2520  Ion transport protein  31.88 
 
 		 284 aa  97.1  5e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1824  Ion transport protein  31.88 
 
 		 284 aa  97.1  5e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0249663  normal  0.467552 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2527  Ion transport protein  31.88 
 
 		 284 aa  97.1  6e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00471  hypothetical protein  27.42 
 
 		 265 aa  96.7  6e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2419  Ion transport protein  29.96 
 
 		 289 aa  97.1  6e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2286  Ion transport protein  31.88 
 
 		 289 aa  96.7  7e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.630315  normal  0.644367 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0076  Ion transport protein  31.97 
 
 		 303 aa  96.3  9e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2209  Ion transport protein  29.59 
 
 		 289 aa  96.3  9e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.427173 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1690  Ion transport protein  31.97 
 
 		 302 aa  96.3  1e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1821  ion transport protein  28.35 
 
 		 279 aa  95.9  1e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1404  Ion transport protein  30.87 
 
 		 278 aa  95.5  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1869  Ion transport protein  30.87 
 
 		 278 aa  94.7  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.275809  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1586  Ion transport protein  30.87 
 
 		 278 aa  95.5  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.580145  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1932  Ion transport protein  30.87 
 
 		 278 aa  95.5  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.595369  normal  0.0211569 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1491  Ion transport protein  30.84 
 
 		 275 aa  94.7  3e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2281  Ion transport protein  33.19 
 
 		 289 aa  94.4  3e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.87963  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4286  Ion transport protein  28.5 
 
 		 272 aa  93.6  5e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.361083  normal  0.259623 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3225  Ion transport protein  30.45 
 
 		 258 aa  93.6  5e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3053  Ion transport protein  29.77 
 
 		 288 aa  93.6  6e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1941  Ion transport protein  28.02 
 
 		 265 aa  91.7  2e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0124996 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0288  Ion transport protein  29.63 
 
 		 272 aa  92  2e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.503473 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1166  Ion transport protein  30.68 
 
 		 294 aa  91.3  3e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG2036  ion transporter  31.53 
 
 		 303 aa  90.5  4e-17  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    unclonable  0.000000000745091 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0929  Ion transport protein  29.6 
 
 		 274 aa  90.5  5e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.765221  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2339  Ion transport protein  30.49 
 
 		 276 aa  90.5  5e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1332  TrkA-N:Ion transport protein  24.3 
 
 		 517 aa  90.1  7e-17  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.478947  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0236  Ion transport 2 domain protein  27.39 
 
 		 256 aa  90.1  7e-17  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.317103 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4283  Ion transport protein  31.56 
 
 		 285 aa  89.7  8e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0210487  normal  0.0226615 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02294  ion transporter  31.98 
 
 		 290 aa  89  1e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2579  hypothetical protein  30.2 
 
 		 298 aa  89  1e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.932967  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3549  cyclic nucleotide-binding protein  34.31 
 
 		 582 aa  89.4  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.864417 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6685  Ion transport protein  29.24 
 
 		 273 aa  88.6  2e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1991  potassium channel protein  28.63 
 
 		 279 aa  88.2  2e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3842  cyclic nucleotide-binding protein  34.31 
 
 		 582 aa  88.6  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.306863  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2791  Ion transport protein  29.41 
 
 		 306 aa  87.8  3e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>