223 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_0044 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_0044  Ion transport 2 domain protein  100 
 
 		 316 aa  632  1e-180  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2388  Ion transport protein  51.16 
 
 		 302 aa  285  5.999999999999999e-76  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.971604 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0024  Ion transport protein  40 
 
 		 265 aa  182  7e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0306194  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1342  Ion transport protein  38.25 
 
 		 269 aa  153  4e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0543607  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0861  Ion transport protein  43.3 
 
 		 231 aa  152  7e-36  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2640  potassium channel protein  36.21 
 
 		 277 aa  150  2e-35  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1053  Ion transport protein  35.44 
 
 		 325 aa  147  2.0000000000000003e-34  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1325  VIC family potassium channel protein  35.44 
 
 		 325 aa  147  3e-34  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.266187  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0387  Ion transport protein  34.72 
 
 		 269 aa  147  3e-34  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2771  Ion transport protein  34.78 
 
 		 292 aa  145  6e-34  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.415569  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_351  cation channel protein  33.74 
 
 		 269 aa  145  9e-34  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0408  cation channel family protein  35.12 
 
 		 269 aa  145  1e-33  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5447  voltage-dependent potassium channel  36.84 
 
 		 409 aa  143  4e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.532768  normal  0.0697598 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03944  putative potassium channel protein  32.42 
 
 		 311 aa  142  8e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2779  Ion transport protein  35.16 
 
 		 357 aa  141  9.999999999999999e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00211831 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0167  Ion transport protein  38.22 
 
 		 273 aa  139  6e-32  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.177755  normal  0.634812 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1402  Ion transport protein  35.11 
 
 		 331 aa  132  5e-30  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0277452  hitchhiker  0.00237581 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1358  Ion transport protein  30.53 
 
 		 419 aa  132  9e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1005  Ion transport protein  32.82 
 
 		 267 aa  129  7.000000000000001e-29  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21361  potassium channel, VIC family protein  36.98 
 
 		 212 aa  127  3e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.5958 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4567  cyclic nucleotide-binding protein  31.64 
 
 		 385 aa  127  4.0000000000000003e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0724971  normal  0.278006 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4038  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  30.08 
 
 		 409 aa  126  5e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1378  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  29.15 
 
 		 408 aa  123  4e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4712  cyclic nucleotide-binding protein  31.17 
 
 		 412 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.566577  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1898  Ion transport protein  30.87 
 
 		 308 aa  113  3e-24  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000138161 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5210  cyclic nucleotide-binding protein  33.8 
 
 		 355 aa  107  3e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.465426  normal  0.688608 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1368  Kef-type K+ transporter NAD-binding component  30.66 
 
 		 264 aa  107  3e-22  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1941  Ion transport protein  26.97 
 
 		 265 aa  107  3e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0124996 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00471  hypothetical protein  30.29 
 
 		 265 aa  106  5e-22  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4020  cyclic nucleotide-binding  32.13 
 
 		 367 aa  106  7e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.109231  normal  0.727114 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1590  Ion transport protein  34.52 
 
 		 276 aa  104  2e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1725  Ion transport protein  36.87 
 
 		 292 aa  101  2e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0536813  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_10571  potassium channel, VIC family protein  32.14 
 
 		 259 aa  100  3e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1854  putative ion transport protein  32.35 
 
 		 282 aa  100  3e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.807615  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1991  potassium channel protein  30.6 
 
 		 279 aa  100  4e-20  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5285  Ion transport protein  30.36 
 
 		 310 aa  99  9e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0929  Ion transport protein  26.43 
 
 		 274 aa  99  9e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.765221  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1557  Ion transport protein  33.85 
 
 		 277 aa  98.2  1e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0288  Ion transport protein  33.65 
 
 		 272 aa  98.6  1e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.503473 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03020  hypothetical protein  31.34 
 
 		 282 aa  98.6  1e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1014  Ion transport protein  28.7 
 
 		 276 aa  97.1  3e-19  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000934363  hitchhiker  0.000116097 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0600  Ion transport protein  32 
 
 		 228 aa  97.4  3e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.90662  normal  0.0268571 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2339  Ion transport protein  35.03 
 
 		 276 aa  97.1  3e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2520  Ion transport protein  34.01 
 
 		 284 aa  96.7  4e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2640  Ion transport protein  34.01 
 
 		 284 aa  96.7  4e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.512871  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1824  Ion transport protein  34.01 
 
 		 284 aa  96.7  4e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0249663  normal  0.467552 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0253  Ion transport protein  33.7 
 
 		 273 aa  97.1  4e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.614768  normal  0.426198 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2527  Ion transport protein  34.01 
 
 		 284 aa  96.7  4e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1491  Ion transport protein  32.65 
 
 		 275 aa  96.7  5e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3869  Ion transport protein  30.41 
 
 		 273 aa  96.3  6e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.519934  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002929  possible potassium channel VIC family  29.03 
 
 		 287 aa  96.3  6e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000118679  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1821  ion transport protein  33.33 
 
 		 279 aa  96.3  6e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0939  VIC family potassium channel protein  33.15 
 
 		 276 aa  95.9  7e-19  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.650828  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3630  Ion transport protein  28.74 
 
 		 274 aa  95.9  7e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.334747  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG2036  ion transporter  32.63 
 
 		 303 aa  95.9  8e-19  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    unclonable  0.000000000745091 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3452  Ion transport protein  31.22 
 
 		 279 aa  95.9  9e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.81213  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4304  cation transporter, voltage-gated ion channel cation transporter  28.04 
 
 		 273 aa  95.5  1e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1592  Ion transport protein  29.11 
 
 		 274 aa  95.1  1e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0101925  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1478  Ion transport protein  30.56 
 
 		 276 aa  95.5  1e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.870774  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1566  Ion transport protein  28.04 
 
 		 273 aa  95.1  1e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0452104  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1267  Ion transport protein  34.21 
 
 		 305 aa  95.1  1e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.905498  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3382  Ion transport protein  32.42 
 
 		 277 aa  94.4  2e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.0078085  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2112  ion transport protein  32.82 
 
 		 295 aa  94.7  2e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2766  Ion transport protein  32.31 
 
 		 279 aa  95.1  2e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0676384  normal  0.308489 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2209  Ion transport protein  33.33 
 
 		 289 aa  94  3e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.427173 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2281  Ion transport protein  34.34 
 
 		 289 aa  94  3e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.87963  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0091  Ion transport protein  28.08 
 
 		 299 aa  93.6  4e-18  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2375  Ion transport protein  33.16 
 
 		 276 aa  93.2  5e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2286  Ion transport protein  33.33 
 
 		 289 aa  93.2  5e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.630315  normal  0.644367 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0236  Ion transport 2 domain protein  31.44 
 
 		 256 aa  93.2  5e-18  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.317103 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3624  ion transport protein, putative  31.96 
 
 		 277 aa  92.8  7e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2419  Ion transport protein  33.33 
 
 		 289 aa  92.8  7e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3053  Ion transport protein  30.39 
 
 		 288 aa  92  1e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_86010  VIC family transporter: potassium ion channel subfamily B VIC  26.4 
 
 		 513 aa  92  1e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2444  Ion transport protein  26.17 
 
 		 271 aa  90.9  3e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0132  VIC family potassium channel protein  29.29 
 
 		 275 aa  90.1  4e-17  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0238536  normal  0.0130464 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3005  potassium channel protein  32.07 
 
 		 272 aa  90.5  4e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.318755  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1332  TrkA-N:Ion transport protein  33.33 
 
 		 517 aa  90.1  4e-17  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.478947  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1875  Ion transport protein  29.81 
 
 		 278 aa  89.7  6e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.354062  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2579  hypothetical protein  34.02 
 
 		 298 aa  89.7  6e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.932967  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1166  Ion transport protein  33.51 
 
 		 294 aa  89.4  8e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0515  ion transport protein  32.22 
 
 		 280 aa  88.6  1e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1404  Ion transport protein  29.33 
 
 		 278 aa  87.8  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3836  putative potassium channel  31.68 
 
 		 283 aa  87.8  2e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.122783  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3292  Ion transport protein  31.07 
 
 		 290 aa  88.2  2e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1586  Ion transport protein  29.33 
 
 		 278 aa  87.8  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.580145  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1660  potassium channel protein  32.63 
 
 		 277 aa  87.8  2e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.819465 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4283  Ion transport protein  31.41 
 
 		 285 aa  87.8  2e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0210487  normal  0.0226615 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09508  potassium channel protein  31.91 
 
 		 288 aa  88.2  2e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.993518  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1932  Ion transport protein  29.33 
 
 		 278 aa  87.8  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.595369  normal  0.0211569 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0186  Ion transport protein  28.15 
 
 		 513 aa  87.4  3e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1869  Ion transport protein  29.33 
 
 		 278 aa  87.4  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.275809  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45070  putative potassium channel  31.19 
 
 		 283 aa  87.4  3e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2780  Ion transport protein  27.52 
 
 		 284 aa  86.7  4e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.715663  normal  0.450959 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4286  Ion transport protein  32.16 
 
 		 272 aa  85.9  7e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.361083  normal  0.259623 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0040  Ion transport protein  33.33 
 
 		 272 aa  85.5  0.000000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2297  Ion transport protein  27.5 
 
 		 289 aa  84.3  0.000000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.653039  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0076  Ion transport protein  30.37 
 
 		 303 aa  82.8  0.000000000000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2168  TrkA-N domain protein  30.73 
 
 		 531 aa  82.8  0.000000000000008  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1690  Ion transport protein  30.37 
 
 		 302 aa  82.8  0.000000000000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>