111 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_44535 on replicon NC_011672
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011672  PHATRDRAFT_44535  predicted protein  100 
 
 
1283 aa  2630    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.231791  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1342  Ion transport protein  29.3 
 
 
269 aa  117  1.0000000000000001e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0543607  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0861  Ion transport protein  30.97 
 
 
231 aa  113  3e-23  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0024  Ion transport protein  25.82 
 
 
265 aa  112  7.000000000000001e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0306194  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0408  cation channel family protein  28.75 
 
 
269 aa  103  3e-20  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2640  potassium channel protein  25 
 
 
277 aa  100  2e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2779  Ion transport protein  27.43 
 
 
357 aa  95.9  4e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00211831 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_351  cation channel protein  26.61 
 
 
269 aa  95.1  8e-18  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0387  Ion transport protein  26.34 
 
 
269 aa  90.9  1e-16  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1005  Ion transport protein  25.83 
 
 
267 aa  84.3  0.00000000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03944  putative potassium channel protein  23.02 
 
 
311 aa  82.8  0.00000000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1941  Ion transport protein  24.79 
 
 
265 aa  81.3  0.0000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0124996 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0167  Ion transport protein  23.91 
 
 
273 aa  80.9  0.0000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.177755  normal  0.634812 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1378  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  22.68 
 
 
408 aa  80.1  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0091  Ion transport protein  21.76 
 
 
299 aa  77.8  0.000000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_50123  predicted protein  27.06 
 
 
507 aa  77  0.000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.386802  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3292  Ion transport protein  25 
 
 
290 aa  76.3  0.000000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2444  Ion transport protein  23.57 
 
 
271 aa  75.9  0.000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1491  Ion transport protein  22.5 
 
 
275 aa  75.1  0.000000000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0515  ion transport protein  24.81 
 
 
280 aa  73.2  0.00000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1725  Ion transport protein  27.72 
 
 
292 aa  72.8  0.00000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0536813  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1325  VIC family potassium channel protein  24.49 
 
 
325 aa  72.4  0.00000000005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.266187  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4038  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  22.3 
 
 
409 aa  71.6  0.00000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1557  Ion transport protein  20.92 
 
 
277 aa  71.6  0.00000000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1358  Ion transport protein  21.82 
 
 
419 aa  71.2  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3225  Ion transport protein  25.17 
 
 
258 aa  70.9  0.0000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0600  Ion transport protein  23.53 
 
 
228 aa  71.2  0.0000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.90662  normal  0.0268571 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2771  Ion transport protein  26.86 
 
 
292 aa  70.9  0.0000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.415569  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1053  Ion transport protein  24.49 
 
 
325 aa  70.5  0.0000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2209  Ion transport protein  25.4 
 
 
289 aa  70.1  0.0000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.427173 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4712  cyclic nucleotide-binding protein  24.81 
 
 
412 aa  70.1  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.566577  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21361  potassium channel, VIC family protein  25 
 
 
212 aa  69.7  0.0000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.5958 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2286  Ion transport protein  25.4 
 
 
289 aa  68.9  0.0000000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.630315  normal  0.644367 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1898  Ion transport protein  27.23 
 
 
308 aa  68.6  0.0000000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000138161 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45070  putative potassium channel  31.21 
 
 
283 aa  68.6  0.0000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3664  Ion transport 2 domain protein  27.18 
 
 
271 aa  68.6  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.819416 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2419  Ion transport protein  25.4 
 
 
289 aa  68.6  0.0000000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3836  putative potassium channel  31.21 
 
 
283 aa  68.6  0.0000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.122783  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2446  Ion transport 2 domain protein  24.41 
 
 
269 aa  68.6  0.0000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2281  Ion transport protein  21.45 
 
 
289 aa  68.2  0.0000000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.87963  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1478  Ion transport protein  29.73 
 
 
276 aa  68.2  0.000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.870774  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1267  Ion transport protein  22.34 
 
 
305 aa  67.8  0.000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.905498  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2527  Ion transport protein  24.87 
 
 
284 aa  67.8  0.000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2520  Ion transport protein  24.87 
 
 
284 aa  67.8  0.000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1821  ion transport protein  23.68 
 
 
279 aa  68.2  0.000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2640  Ion transport protein  24.87 
 
 
284 aa  67.8  0.000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.512871  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1824  Ion transport protein  24.87 
 
 
284 aa  67.8  0.000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0249663  normal  0.467552 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5285  Ion transport protein  24.56 
 
 
310 aa  67.8  0.000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3005  potassium channel protein  23.05 
 
 
272 aa  67.4  0.000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.318755  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2388  Ion transport protein  21.03 
 
 
302 aa  67.4  0.000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.971604 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3452  Ion transport protein  22.22 
 
 
279 aa  67  0.000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.81213  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03020  hypothetical protein  25.79 
 
 
282 aa  67  0.000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0253  Ion transport protein  24.9 
 
 
273 aa  67.4  0.000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.614768  normal  0.426198 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2579  hypothetical protein  21.31 
 
 
298 aa  66.6  0.000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.932967  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09508  potassium channel protein  24.02 
 
 
288 aa  66.2  0.000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.993518  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2112  ion transport protein  20.77 
 
 
295 aa  66.2  0.000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1854  putative ion transport protein  20.96 
 
 
282 aa  65.9  0.000000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.807615  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1014  Ion transport protein  24.86 
 
 
276 aa  65.5  0.000000007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000934363  hitchhiker  0.000116097 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2020  Ion transport protein  26.29 
 
 
282 aa  65.5  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0709  Ion transport protein  22.48 
 
 
295 aa  64.3  0.00000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3630  Ion transport protein  25.26 
 
 
274 aa  64.7  0.00000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.334747  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0939  VIC family potassium channel protein  28.99 
 
 
276 aa  63.9  0.00000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.650828  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1402  Ion transport protein  20.67 
 
 
331 aa  63.9  0.00000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0277452  hitchhiker  0.00237581 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1875  Ion transport protein  25.27 
 
 
278 aa  63.9  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.354062  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30340  potassium channel  27.27 
 
 
186 aa  63.9  0.00000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.051354  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3624  ion transport protein, putative  26.6 
 
 
277 aa  63.2  0.00000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3869  Ion transport protein  26.04 
 
 
273 aa  63.2  0.00000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.519934  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0288  Ion transport protein  21.34 
 
 
272 aa  63.5  0.00000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.503473 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1932  Ion transport protein  25.63 
 
 
278 aa  63.2  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.595369  normal  0.0211569 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1404  Ion transport protein  25.63 
 
 
278 aa  63.2  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1586  Ion transport protein  25.63 
 
 
278 aa  63.2  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.580145  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3382  Ion transport protein  26.11 
 
 
277 aa  62.8  0.00000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.0078085  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1660  potassium channel protein  23.48 
 
 
277 aa  62.4  0.00000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.819465 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2375  Ion transport protein  29.89 
 
 
276 aa  62.4  0.00000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1869  Ion transport protein  24.91 
 
 
278 aa  62.4  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.275809  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0040  Ion transport protein  18.65 
 
 
272 aa  62.4  0.00000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1590  Ion transport protein  23.28 
 
 
276 aa  62  0.00000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4304  cation transporter, voltage-gated ion channel cation transporter  29.25 
 
 
273 aa  61.6  0.0000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG2036  ion transporter  31.17 
 
 
303 aa  61.6  0.0000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    unclonable  0.000000000745091 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1991  potassium channel protein  29.17 
 
 
279 aa  61.2  0.0000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_86010  VIC family transporter: potassium ion channel subfamily B VIC  23.9 
 
 
513 aa  61.2  0.0000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1566  Ion transport protein  29.25 
 
 
273 aa  61.2  0.0000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0452104  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0685  Ion transport protein  21.31 
 
 
297 aa  61.2  0.0000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.301571  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB01080  conserved hypothetical protein  25 
 
 
554 aa  60.5  0.0000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.160096  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2780  Ion transport protein  23.96 
 
 
284 aa  60.8  0.0000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.715663  normal  0.450959 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0773  ion transporter  20.95 
 
 
297 aa  59.7  0.0000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.888374  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2339  Ion transport protein  24.88 
 
 
276 aa  58.9  0.0000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2766  Ion transport protein  28.26 
 
 
279 aa  58.5  0.0000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0676384  normal  0.308489 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4283  Ion transport protein  21.88 
 
 
285 aa  57.8  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0210487  normal  0.0226615 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02294  ion transporter  21.94 
 
 
290 aa  57.8  0.000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3053  Ion transport protein  22.77 
 
 
288 aa  57.4  0.000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002929  possible potassium channel VIC family  23.68 
 
 
287 aa  57  0.000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000118679  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4286  Ion transport protein  21.95 
 
 
272 aa  57.4  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.361083  normal  0.259623 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1166  Ion transport protein  21.17 
 
 
294 aa  56.6  0.000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5447  voltage-dependent potassium channel  22.47 
 
 
409 aa  55.8  0.000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.532768  normal  0.0697598 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4567  cyclic nucleotide-binding protein  22.27 
 
 
385 aa  56.2  0.000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0724971  normal  0.278006 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0231  cation channel family protein  31.52 
 
 
143 aa  55.1  0.000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1368  Kef-type K+ transporter NAD-binding component  21.39 
 
 
264 aa  53.9  0.00002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00471  hypothetical protein  21.5 
 
 
265 aa  53.9  0.00002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_10571  potassium channel, VIC family protein  23.29 
 
 
259 aa  53.5  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>