174 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNB01080 on replicon NC_006684
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006684  CNB01080  conserved hypothetical protein  100 
 
 
554 aa  1129    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.160096  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_86010  VIC family transporter: potassium ion channel subfamily B VIC  32.95 
 
 
513 aa  124  5e-27  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0091  Ion transport protein  27.6 
 
 
299 aa  101  4e-20  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2640  potassium channel protein  32.2 
 
 
277 aa  100  8e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03944  putative potassium channel protein  27.46 
 
 
311 aa  98.2  3e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1725  Ion transport protein  29.32 
 
 
292 aa  98.2  3e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0536813  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1053  Ion transport protein  31.19 
 
 
325 aa  95.9  2e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1325  VIC family potassium channel protein  31.68 
 
 
325 aa  94  7e-18  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.266187  normal 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_7186  VIC family transporter: potassium ion channel  34.54 
 
 
189 aa  93.2  1e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0156441  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5285  Ion transport protein  27.78 
 
 
310 aa  92  2e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0515  ion transport protein  27.92 
 
 
280 aa  92.4  2e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45070  putative potassium channel  30.08 
 
 
283 aa  91.7  3e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2209  Ion transport protein  28.76 
 
 
289 aa  91.3  4e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.427173 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3292  Ion transport protein  28.02 
 
 
290 aa  91.3  4e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0253  Ion transport protein  25.18 
 
 
273 aa  91.3  5e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.614768  normal  0.426198 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2112  ion transport protein  29.08 
 
 
295 aa  90.1  9e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3005  potassium channel protein  29.24 
 
 
272 aa  89.4  1e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.318755  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0024  Ion transport protein  28.03 
 
 
265 aa  88.6  2e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0306194  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2286  Ion transport protein  27.98 
 
 
289 aa  89  2e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.630315  normal  0.644367 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1941  Ion transport protein  32 
 
 
265 aa  89  2e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0124996 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1267  Ion transport protein  26.56 
 
 
305 aa  89.4  2e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.905498  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0600  Ion transport protein  30.89 
 
 
228 aa  88.6  3e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.90662  normal  0.0268571 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1824  Ion transport protein  29.2 
 
 
284 aa  88.2  4e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0249663  normal  0.467552 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2419  Ion transport protein  28.32 
 
 
289 aa  88.2  4e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2527  Ion transport protein  29.2 
 
 
284 aa  88.2  4e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2640  Ion transport protein  29.2 
 
 
284 aa  88.2  4e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.512871  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2520  Ion transport protein  29.2 
 
 
284 aa  88.2  4e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3225  Ion transport protein  30.92 
 
 
258 aa  87.8  5e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3836  putative potassium channel  29.66 
 
 
283 aa  87.4  6e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.122783  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1821  ion transport protein  27.27 
 
 
279 aa  87.4  7e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0178  VIC family potassium channel protein  32.52 
 
 
282 aa  87  8e-16  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0288  Ion transport protein  26.1 
 
 
272 aa  86.3  0.000000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.503473 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1660  potassium channel protein  28.9 
 
 
277 aa  86.7  0.000000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.819465 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03020  hypothetical protein  29.01 
 
 
282 aa  86.7  0.000000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2444  Ion transport protein  31.05 
 
 
271 aa  85.9  0.000000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3452  Ion transport protein  29.5 
 
 
279 aa  85.5  0.000000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.81213  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2780  Ion transport protein  31.87 
 
 
284 aa  85.1  0.000000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.715663  normal  0.450959 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3624  ion transport protein, putative  29.2 
 
 
277 aa  84.3  0.000000000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1590  Ion transport protein  29.22 
 
 
276 aa  83.6  0.000000000000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2036  ion transporter  27.08 
 
 
303 aa  83.2  0.00000000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    unclonable  0.000000000745091 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3382  Ion transport protein  28.57 
 
 
277 aa  82.8  0.00000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.0078085  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2766  Ion transport protein  29.47 
 
 
279 aa  83.2  0.00000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0676384  normal  0.308489 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1557  Ion transport protein  28.07 
 
 
277 aa  83.2  0.00000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1166  Ion transport protein  26.19 
 
 
294 aa  82.8  0.00000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2388  Ion transport protein  25.95 
 
 
302 aa  82.8  0.00000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.971604 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2375  Ion transport protein  27.44 
 
 
276 aa  82.8  0.00000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2281  Ion transport protein  28.42 
 
 
289 aa  82.8  0.00000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.87963  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6685  Ion transport protein  27.01 
 
 
273 aa  82  0.00000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1358  Ion transport protein  24.83 
 
 
419 aa  82  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1491  Ion transport protein  29.1 
 
 
275 aa  82  0.00000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0387  Ion transport protein  33.33 
 
 
269 aa  81.6  0.00000000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1014  Ion transport protein  30.11 
 
 
276 aa  81.6  0.00000000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000934363  hitchhiker  0.000116097 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3630  Ion transport protein  31.29 
 
 
274 aa  81.6  0.00000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.334747  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2791  Ion transport protein  24.39 
 
 
306 aa  80.9  0.00000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1478  Ion transport protein  29.59 
 
 
276 aa  80.9  0.00000000000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.870774  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5447  voltage-dependent potassium channel  27.97 
 
 
409 aa  80.9  0.00000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.532768  normal  0.0697598 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09508  potassium channel protein  28.06 
 
 
288 aa  80.9  0.00000000000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.993518  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3869  Ion transport protein  28.24 
 
 
273 aa  80.5  0.00000000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.519934  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0040  Ion transport protein  31.58 
 
 
272 aa  80.5  0.00000000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4567  cyclic nucleotide-binding protein  27.39 
 
 
385 aa  80.1  0.00000000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0724971  normal  0.278006 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4304  cation transporter, voltage-gated ion channel cation transporter  26.61 
 
 
273 aa  79.3  0.0000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_48794  predicted protein  25.33 
 
 
524 aa  79.3  0.0000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1404  Ion transport protein  27.46 
 
 
278 aa  79.7  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1566  Ion transport protein  28.12 
 
 
273 aa  79.7  0.0000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0452104  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1586  Ion transport protein  27.46 
 
 
278 aa  79.7  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.580145  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1932  Ion transport protein  27.46 
 
 
278 aa  79.7  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.595369  normal  0.0211569 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0939  VIC family potassium channel protein  28.06 
 
 
276 aa  79  0.0000000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.650828  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1875  Ion transport protein  27.46 
 
 
278 aa  79  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.354062  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1869  Ion transport protein  27.46 
 
 
278 aa  79  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.275809  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3053  Ion transport protein  28.92 
 
 
288 aa  79.3  0.0000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2579  hypothetical protein  30.41 
 
 
298 aa  77.8  0.0000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.932967  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4038  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  26.12 
 
 
409 aa  77.8  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002929  possible potassium channel VIC family  30.69 
 
 
287 aa  78.2  0.0000000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000118679  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1342  Ion transport protein  31.32 
 
 
269 aa  77.4  0.0000000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0543607  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4283  Ion transport protein  30.91 
 
 
285 aa  77.4  0.0000000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0210487  normal  0.0226615 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1991  potassium channel protein  28.11 
 
 
279 aa  77  0.0000000000008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21361  potassium channel, VIC family protein  28.37 
 
 
212 aa  75.5  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.5958 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2339  Ion transport protein  30.26 
 
 
276 aa  75.9  0.000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1402  Ion transport protein  25 
 
 
331 aa  75.5  0.000000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0277452  hitchhiker  0.00237581 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0132  VIC family potassium channel protein  30.06 
 
 
275 aa  75.5  0.000000000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0238536  normal  0.0130464 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1378  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  26.29 
 
 
408 aa  75.1  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1854  putative ion transport protein  28.57 
 
 
282 aa  74.7  0.000000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.807615  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4712  cyclic nucleotide-binding protein  24.44 
 
 
412 aa  73.6  0.000000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.566577  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0408  cation channel family protein  32.49 
 
 
269 aa  72.4  0.00000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02294  ion transporter  27.41 
 
 
290 aa  72.8  0.00000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0861  Ion transport protein  29.35 
 
 
231 aa  72.4  0.00000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0564  Ion transport 2 domain protein  28.19 
 
 
276 aa  72  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0044  Ion transport 2 domain protein  24.21 
 
 
316 aa  70.9  0.00000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1368  Kef-type K+ transporter NAD-binding component  26.07 
 
 
264 aa  70.9  0.00000000006  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0929  Ion transport protein  26.6 
 
 
274 aa  70.5  0.00000000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.765221  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_351  cation channel protein  30.46 
 
 
269 aa  68.2  0.0000000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0709  Ion transport protein  24.62 
 
 
295 aa  67.8  0.0000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00471  hypothetical protein  25.54 
 
 
265 aa  67.4  0.0000000007  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4211  Ion transport protein  26.81 
 
 
283 aa  67  0.0000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2771  Ion transport protein  25.37 
 
 
292 aa  65.9  0.000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.415569  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4286  Ion transport protein  27.04 
 
 
272 aa  65.9  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.361083  normal  0.259623 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2297  Ion transport protein  27.27 
 
 
289 aa  65.1  0.000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.653039  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2779  Ion transport protein  27.34 
 
 
357 aa  64.3  0.000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00211831 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1592  Ion transport protein  28.57 
 
 
274 aa  63.9  0.000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0101925  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2927  Ion transport protein  24.33 
 
 
307 aa  63.9  0.000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>