72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_50123 on replicon NC_011695
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011695  PHATRDRAFT_50123  predicted protein  100 
 
 
507 aa  1051    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.386802  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2640  potassium channel protein  31.13 
 
 
277 aa  104  4e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0024  Ion transport protein  31 
 
 
265 aa  82  0.00000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0306194  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03944  putative potassium channel protein  25.25 
 
 
311 aa  76.6  0.000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44535  predicted protein  26.64 
 
 
1283 aa  76.6  0.000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.231791  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0167  Ion transport protein  32.24 
 
 
273 aa  72.4  0.00000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.177755  normal  0.634812 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1590  Ion transport protein  24.73 
 
 
276 aa  72  0.00000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2771  Ion transport protein  27.7 
 
 
292 aa  70.9  0.00000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.415569  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1053  Ion transport protein  28.28 
 
 
325 aa  68.9  0.0000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1325  VIC family potassium channel protein  28.28 
 
 
325 aa  68.6  0.0000000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.266187  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0861  Ion transport protein  29.77 
 
 
231 aa  68.6  0.0000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2388  Ion transport protein  23.7 
 
 
302 aa  65.1  0.000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.971604 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1941  Ion transport protein  27.93 
 
 
265 aa  64.3  0.000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0124996 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2281  Ion transport protein  27.92 
 
 
289 aa  62  0.00000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.87963  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21361  potassium channel, VIC family protein  28.17 
 
 
212 aa  62  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.5958 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2419  Ion transport protein  27.64 
 
 
289 aa  61.6  0.00000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2286  Ion transport protein  27.64 
 
 
289 aa  61.6  0.00000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.630315  normal  0.644367 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2209  Ion transport protein  27.64 
 
 
289 aa  62  0.00000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.427173 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2779  Ion transport protein  26.69 
 
 
357 aa  61.6  0.00000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00211831 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0600  Ion transport protein  30.77 
 
 
228 aa  60.5  0.00000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.90662  normal  0.0268571 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1898  Ion transport protein  31.22 
 
 
308 aa  60.5  0.00000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000138161 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1342  Ion transport protein  28.88 
 
 
269 aa  60.1  0.00000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0543607  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03020  hypothetical protein  24.08 
 
 
282 aa  59.7  0.0000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45070  putative potassium channel  28.7 
 
 
283 aa  58.9  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1358  Ion transport protein  22.62 
 
 
419 aa  59.3  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2112  ion transport protein  25 
 
 
295 aa  58.9  0.0000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1005  Ion transport protein  26.27 
 
 
267 aa  58.9  0.0000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1557  Ion transport protein  25.22 
 
 
277 aa  57.4  0.0000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1821  ion transport protein  24.16 
 
 
279 aa  57.4  0.0000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5447  voltage-dependent potassium channel  27.83 
 
 
409 aa  56.6  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.532768  normal  0.0697598 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1491  Ion transport protein  24.89 
 
 
275 aa  56.6  0.000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_86010  VIC family transporter: potassium ion channel subfamily B VIC  25.44 
 
 
513 aa  56.2  0.000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3836  putative potassium channel  27.69 
 
 
283 aa  55.5  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.122783  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2766  Ion transport protein  24.9 
 
 
279 aa  55.8  0.000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0676384  normal  0.308489 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2520  Ion transport protein  25.83 
 
 
284 aa  55.1  0.000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2640  Ion transport protein  25.83 
 
 
284 aa  55.1  0.000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.512871  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0408  cation channel family protein  27.51 
 
 
269 aa  55.1  0.000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2527  Ion transport protein  25.83 
 
 
284 aa  55.1  0.000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1824  Ion transport protein  25.83 
 
 
284 aa  55.1  0.000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0249663  normal  0.467552 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0044  Ion transport 2 domain protein  27.21 
 
 
316 aa  55.1  0.000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3292  Ion transport protein  21.46 
 
 
290 aa  54.7  0.000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4567  cyclic nucleotide-binding protein  28.51 
 
 
385 aa  54.7  0.000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0724971  normal  0.278006 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1378  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  25.84 
 
 
408 aa  54.3  0.000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002929  possible potassium channel VIC family  25.2 
 
 
287 aa  53.5  0.000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000118679  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4038  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  23.08 
 
 
409 aa  52  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_351  cation channel protein  27.43 
 
 
269 aa  52.4  0.00002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1402  Ion transport protein  27.69 
 
 
331 aa  51.2  0.00004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0277452  hitchhiker  0.00237581 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1725  Ion transport protein  23.5 
 
 
292 aa  51.2  0.00004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0536813  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09508  potassium channel protein  22.27 
 
 
288 aa  50.8  0.00006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.993518  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1854  putative ion transport protein  22.37 
 
 
282 aa  50.1  0.00009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.807615  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5285  Ion transport protein  25.68 
 
 
310 aa  50.1  0.00009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2780  Ion transport protein  23.89 
 
 
284 aa  49.7  0.0001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.715663  normal  0.450959 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2375  Ion transport protein  23.38 
 
 
276 aa  49.7  0.0001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1267  Ion transport protein  23.94 
 
 
305 aa  48.9  0.0002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.905498  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0387  Ion transport protein  27.23 
 
 
269 aa  48.9  0.0002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0091  Ion transport protein  23.83 
 
 
299 aa  48.5  0.0003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2030  Ion transport protein  26.92 
 
 
263 aa  48.1  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG2036  ion transporter  26.09 
 
 
303 aa  47.8  0.0004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    unclonable  0.000000000745091 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00471  hypothetical protein  22.47 
 
 
265 aa  48.1  0.0004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1014  Ion transport protein  24.76 
 
 
276 aa  48.1  0.0004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000934363  hitchhiker  0.000116097 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3630  Ion transport protein  25 
 
 
274 aa  47.4  0.0006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.334747  normal 
 
 
-
 
NC_006684  CNB01080  conserved hypothetical protein  23.43 
 
 
554 aa  47.4  0.0007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.160096  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0040  Ion transport protein  24.16 
 
 
272 aa  47  0.0009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3452  Ion transport protein  22.18 
 
 
279 aa  46.2  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.81213  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0231  cation channel family protein  30.43 
 
 
143 aa  46.6  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1368  Kef-type K+ transporter NAD-binding component  22.53 
 
 
264 aa  47  0.001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3053  Ion transport protein  24.28 
 
 
288 aa  46.6  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3382  Ion transport protein  25.33 
 
 
277 aa  45.8  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.0078085  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0253  Ion transport protein  23.89 
 
 
273 aa  44.3  0.005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.614768  normal  0.426198 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1332  TrkA-N:Ion transport protein  20.9 
 
 
517 aa  44.3  0.005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.478947  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3624  ion transport protein, putative  24.12 
 
 
277 aa  44.3  0.005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_10571  potassium channel, VIC family protein  24.03 
 
 
259 aa  43.5  0.009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>