226 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_3768 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_3768  ion transporter  100 
 
 		 274 aa  556  1e-157  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0824  Ion transport 2 domain-containing protein  95.26 
 
 		 274 aa  534  1e-151  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.978487 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3117  Ion transport 2 domain-containing protein  94.89 
 
 		 274 aa  529  1e-149  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0962789  normal  0.861695 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0855  Ion transport 2 domain-containing protein  94.89 
 
 		 274 aa  529  1e-149  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.289459  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0919  Ion transport 2 domain-containing protein  86.5 
 
 		 274 aa  502  1e-141  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0909  Ion transport 2 domain protein  86.86 
 
 		 274 aa  500  1e-140  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0497907  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0885  Ion transport 2 domain-containing protein  86.86 
 
 		 274 aa  500  1e-140  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.543733  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3453  Ion transport 2 domain-containing protein  86.86 
 
 		 274 aa  500  1e-140  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.837221  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3094  Ion transport 2 domain-containing protein  87.55 
 
 		 273 aa  477  1e-134  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.533818  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3269  Ion transport 2 domain-containing protein  70.29 
 
 		 269 aa  379  1e-104  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0620  ion transport 2 domain-containing protein  65.2 
 
 		 264 aa  365  1e-100  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0694  Ion transport 2  66.3 
 
 		 276 aa  362  4e-99  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000792601  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3485  Ion transport 2 domain-containing protein  68.86 
 
 		 265 aa  361  6e-99  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.319934  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2671  ion transporter  66.06 
 
 		 280 aa  349  3e-95  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3841  ion transport 2 domain-containing protein  63.74 
 
 		 268 aa  341  8e-93  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.735786  unclonable  0.000000000129627 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0719  Ion transport 2 domain-containing protein  61.68 
 
 		 270 aa  327  1.0000000000000001e-88  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000693847  hitchhiker  0.000000252906 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2679  putative ion transport protein  42.62 
 
 		 253 aa  205  6e-52  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0253286  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00865  hypothetical protein  40.86 
 
 		 272 aa  200  1.9999999999999998e-50  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004526  cAMP-dependent Kef-type K+ transport system  38.13 
 
 		 257 aa  184  1.0000000000000001e-45  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1606  ion transporter  37.73 
 
 		 240 aa  160  2e-38  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.954695 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2923  Ion transport protein  34.87 
 
 		 271 aa  143  2e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.136204  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0262  Ion transport 2 domain-containing protein  31.71 
 
 		 263 aa  129  6e-29  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3864  ion transporter  32.24 
 
 		 228 aa  96.3  4e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.611066 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1082  putative potassium channel protein  26.29 
 
 		 280 aa  96.3  5e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1053  Ion transport protein  31.55 
 
 		 325 aa  90.5  3e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1424  Ion transport 2 domain protein  27.31 
 
 		 253 aa  89.7  4e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.287794  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0129  Ion transport 2 domain protein  33.66 
 
 		 241 aa  90.1  4e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000177719  hitchhiker  0.0000693343 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1325  VIC family potassium channel protein  31.55 
 
 		 325 aa  88.6  1e-16  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.266187  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0287  hypothetical protein  29.63 
 
 		 231 aa  86.7  4e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03944  putative potassium channel protein  30.82 
 
 		 311 aa  86.3  4e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1581  Ion transport 2 domain-containing protein  26.73 
 
 		 262 aa  85.1  0.000000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.69738  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2564  Ion transport 2 domain-containing protein  29.52 
 
 		 268 aa  80.9  0.00000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.108416  decreased coverage  0.00000252987 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0861  Ion transport protein  30.94 
 
 		 231 aa  81.3  0.00000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2388  Ion transport protein  28.7 
 
 		 302 aa  80.5  0.00000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.971604 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2003  Ion transport 2 domain protein  25.64 
 
 		 269 aa  78.2  0.0000000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.191416 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1358  Ion transport protein  26.19 
 
 		 419 aa  77.8  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1875  Ion transport protein  28.03 
 
 		 278 aa  77  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.354062  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1586  Ion transport protein  27.62 
 
 		 278 aa  74.7  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.580145  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1404  Ion transport protein  27.62 
 
 		 278 aa  74.7  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1932  Ion transport protein  27.62 
 
 		 278 aa  74.7  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.595369  normal  0.0211569 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1869  Ion transport protein  27.62 
 
 		 278 aa  73.6  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.275809  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0044  Ion transport 2 domain protein  30.07 
 
 		 316 aa  73.6  0.000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2413  Ion transport 2 domain-containing protein  30.34 
 
 		 268 aa  73.6  0.000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.592727  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1332  TrkA-N:Ion transport protein  32.03 
 
 		 517 aa  73.2  0.000000000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.478947  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1457  Kef-type K+ transport system NAD-binding protein  34.04 
 
 		 255 aa  73.6  0.000000000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3292  Ion transport protein  27.52 
 
 		 290 aa  73.2  0.000000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0186  Ion transport protein  28.57 
 
 		 513 aa  72.4  0.000000000007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1745  Ion transport 2 domain-containing protein  34.51 
 
 		 252 aa  72.4  0.000000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.454353 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0024  Ion transport protein  27.04 
 
 		 265 aa  72.4  0.000000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0306194  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09508  potassium channel protein  24.2 
 
 		 288 aa  72.4  0.000000000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.993518  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1378  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  31.47 
 
 		 408 aa  72  0.000000000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0882  Ion transport 2 domain-containing protein  23.46 
 
 		 241 aa  71.2  0.00000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000375333  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3630  Ion transport protein  24.67 
 
 		 274 aa  70.9  0.00000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.334747  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2771  Ion transport protein  27.88 
 
 		 292 aa  71.2  0.00000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.415569  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3382  Ion transport protein  22.08 
 
 		 277 aa  70.5  0.00000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.0078085  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0253  Ion transport protein  26.54 
 
 		 273 aa  70.1  0.00000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.614768  normal  0.426198 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1556  Ion transport protein  22.57 
 
 		 328 aa  70.5  0.00000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000506014  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002929  possible potassium channel VIC family  28.22 
 
 		 287 aa  70.5  0.00000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000118679  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03020  hypothetical protein  24.03 
 
 		 282 aa  70.5  0.00000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2030  Ion transport protein  32.91 
 
 		 263 aa  69.7  0.00000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2168  TrkA-N domain protein  31.43 
 
 		 531 aa  69.7  0.00000000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0253  Ion transport 2 domain protein  38.78 
 
 		 260 aa  69.7  0.00000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1941  Ion transport protein  24.78 
 
 		 265 aa  69.7  0.00000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0124996 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1590  Ion transport protein  23.56 
 
 		 276 aa  68.9  0.00000000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1854  putative ion transport protein  26.47 
 
 		 282 aa  68.9  0.00000000008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.807615  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0288  Ion transport protein  23.66 
 
 		 272 aa  68.9  0.00000000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.503473 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3624  ion transport protein, putative  22.22 
 
 		 277 aa  68.2  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2774  Ion transport 2 domain protein  31.36 
 
 		 244 aa  68.6  0.0000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000298794 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1005  Ion transport protein  27.62 
 
 		 267 aa  67.4  0.0000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1898  Ion transport protein  28.28 
 
 		 308 aa  67.4  0.0000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000138161 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4038  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  29.41 
 
 		 409 aa  67.8  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1402  Ion transport protein  25.29 
 
 		 331 aa  67.4  0.0000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0277452  hitchhiker  0.00237581 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3836  putative potassium channel  26.67 
 
 		 283 aa  67  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.122783  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0939  VIC family potassium channel protein  22.97 
 
 		 276 aa  67  0.0000000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.650828  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3869  Ion transport protein  26.34 
 
 		 273 aa  67  0.0000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.519934  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4304  cation transporter, voltage-gated ion channel cation transporter  28.06 
 
 		 273 aa  66.6  0.0000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3664  Ion transport 2 domain protein  29.94 
 
 		 271 aa  66.6  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.819416 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1566  Ion transport protein  28.06 
 
 		 273 aa  66.6  0.0000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0452104  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45070  putative potassium channel  26.67 
 
 		 283 aa  66.6  0.0000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2780  Ion transport protein  29.17 
 
 		 284 aa  66.6  0.0000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.715663  normal  0.450959 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2281  Ion transport protein  21.86 
 
 		 289 aa  66.6  0.0000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.87963  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0600  Ion transport protein  22.89 
 
 		 228 aa  65.9  0.0000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.90662  normal  0.0268571 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2286  Ion transport protein  22.57 
 
 		 289 aa  65.9  0.0000000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.630315  normal  0.644367 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1824  Ion transport protein  23.45 
 
 		 284 aa  65.9  0.0000000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0249663  normal  0.467552 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2520  Ion transport protein  23.45 
 
 		 284 aa  65.9  0.0000000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2446  Ion transport 2 domain protein  29.3 
 
 		 269 aa  65.9  0.0000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2640  Ion transport protein  23.45 
 
 		 284 aa  65.9  0.0000000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.512871  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2527  Ion transport protein  23.45 
 
 		 284 aa  65.9  0.0000000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1557  Ion transport protein  22.69 
 
 		 277 aa  65.5  0.0000000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1192  Ion transport protein  25.24 
 
 		 277 aa  65.5  0.0000000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.645124  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0091  Ion transport protein  20.73 
 
 		 299 aa  65.1  0.000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2036  ion transporter  26.05 
 
 		 303 aa  65.1  0.000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    unclonable  0.000000000745091 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3005  potassium channel protein  22.22 
 
 		 272 aa  64.7  0.000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.318755  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2419  Ion transport protein  22.51 
 
 		 289 aa  65.5  0.000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4447  Ion transport 2  32.56 
 
 		 260 aa  64.3  0.000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0874617  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2209  Ion transport protein  22.35 
 
 		 289 aa  64.3  0.000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.427173 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5210  cyclic nucleotide-binding protein  37.21 
 
 		 355 aa  63.9  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.465426  normal  0.688608 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4534  Ion transport 2 domain-containing protein  32.56 
 
 		 260 aa  64.3  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.480815 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4829  Ion transport 2 domain-containing protein  34.38 
 
 		 260 aa  64.7  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.700731  normal  0.213601 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2375  Ion transport protein  21.3 
 
 		 276 aa  63.9  0.000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>