291 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_I2679 on replicon NC_011312
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011312  VSAL_I2679  putative ion transport protein  100 
 
 		 253 aa  512  1e-144  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0253286  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00865  hypothetical protein  59.84 
 
 		 272 aa  309  2.9999999999999997e-83  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004526  cAMP-dependent Kef-type K+ transport system  58.33 
 
 		 257 aa  303  2.0000000000000002e-81  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3453  Ion transport 2 domain-containing protein  44.73 
 
 		 274 aa  221  9.999999999999999e-57  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.837221  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0885  Ion transport 2 domain-containing protein  44.73 
 
 		 274 aa  221  9.999999999999999e-57  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.543733  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0909  Ion transport 2 domain protein  44.73 
 
 		 274 aa  221  9.999999999999999e-57  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0497907  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0919  Ion transport 2 domain-containing protein  43.88 
 
 		 274 aa  218  1e-55  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0620  ion transport 2 domain-containing protein  44.03 
 
 		 264 aa  215  5.9999999999999996e-55  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3117  Ion transport 2 domain-containing protein  41.34 
 
 		 274 aa  210  1e-53  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0962789  normal  0.861695 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0855  Ion transport 2 domain-containing protein  41.34 
 
 		 274 aa  210  1e-53  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.289459  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0824  Ion transport 2 domain-containing protein  42.21 
 
 		 274 aa  210  2e-53  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.978487 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3768  ion transporter  43.91 
 
 		 274 aa  208  7e-53  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0719  Ion transport 2 domain-containing protein  42.21 
 
 		 270 aa  205  6e-52  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000693847  hitchhiker  0.000000252906 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3841  ion transport 2 domain-containing protein  43.3 
 
 		 268 aa  204  1e-51  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.735786  unclonable  0.000000000129627 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3094  Ion transport 2 domain-containing protein  41.56 
 
 		 273 aa  201  9.999999999999999e-51  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.533818  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2671  ion transporter  44.3 
 
 		 280 aa  199  5e-50  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3269  Ion transport 2 domain-containing protein  42.19 
 
 		 269 aa  198  7.999999999999999e-50  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0694  Ion transport 2  40.65 
 
 		 276 aa  196  4.0000000000000005e-49  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000792601  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3485  Ion transport 2 domain-containing protein  41.33 
 
 		 265 aa  191  9e-48  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.319934  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2923  Ion transport protein  33.19 
 
 		 271 aa  144  1e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.136204  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1606  ion transporter  33.8 
 
 		 240 aa  141  8e-33  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.954695 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0262  Ion transport 2 domain-containing protein  31.15 
 
 		 263 aa  134  1.9999999999999998e-30  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1082  putative potassium channel protein  29.25 
 
 		 280 aa  111  1.0000000000000001e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2564  Ion transport 2 domain-containing protein  29.48 
 
 		 268 aa  108  7.000000000000001e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.108416  decreased coverage  0.00000252987 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2003  Ion transport 2 domain protein  29.11 
 
 		 269 aa  100  3e-20  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.191416 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0129  Ion transport 2 domain protein  35.6 
 
 		 241 aa  98.6  8e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000177719  hitchhiker  0.0000693343 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1581  Ion transport 2 domain-containing protein  27.8 
 
 		 262 aa  93.6  3e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.69738  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3864  ion transporter  26.48 
 
 		 228 aa  91.7  9e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.611066 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2413  Ion transport 2 domain-containing protein  25.73 
 
 		 268 aa  90.5  3e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.592727  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0287  hypothetical protein  30 
 
 		 231 aa  90.1  3e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1332  TrkA-N:Ion transport protein  36.23 
 
 		 517 aa  88.6  8e-17  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.478947  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1424  Ion transport 2 domain protein  29.01 
 
 		 253 aa  84.3  0.000000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.287794  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1325  VIC family potassium channel protein  38.22 
 
 		 325 aa  82.4  0.000000000000007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.266187  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0929  Ion transport protein  28.51 
 
 		 274 aa  81.6  0.00000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.765221  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1053  Ion transport protein  36.75 
 
 		 325 aa  81.6  0.00000000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1941  Ion transport protein  27.19 
 
 		 265 aa  79.3  0.00000000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0124996 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2774  Ion transport 2 domain protein  37.14 
 
 		 244 aa  79.3  0.00000000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000298794 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2168  TrkA-N domain protein  36.23 
 
 		 531 aa  77.8  0.0000000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0600  Ion transport protein  26.96 
 
 		 228 aa  77  0.0000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.90662  normal  0.0268571 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3070  Ion transport 2 domain-containing protein  35.83 
 
 		 244 aa  76.6  0.0000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.550123  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2388  Ion transport protein  29.67 
 
 		 302 aa  76.6  0.0000000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.971604 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1457  Kef-type K+ transport system NAD-binding protein  30.82 
 
 		 255 aa  76.3  0.0000000000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1854  putative ion transport protein  27.38 
 
 		 282 aa  75.5  0.0000000000009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.807615  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03020  hypothetical protein  28.64 
 
 		 282 aa  74.7  0.000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0253  Ion transport 2 domain protein  33.91 
 
 		 260 aa  74.7  0.000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0861  Ion transport protein  31.47 
 
 		 231 aa  75.1  0.000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03944  putative potassium channel protein  30.97 
 
 		 311 aa  74.3  0.000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2771  Ion transport protein  27.37 
 
 		 292 aa  73.9  0.000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.415569  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1745  Ion transport 2 domain-containing protein  28.87 
 
 		 252 aa  73.2  0.000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.454353 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0186  Ion transport protein  31.22 
 
 		 513 aa  73.2  0.000000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4286  Ion transport protein  43.75 
 
 		 272 aa  72.8  0.000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.361083  normal  0.259623 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09508  potassium channel protein  26.51 
 
 		 288 aa  72  0.000000000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.993518  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4038  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  33.05 
 
 		 409 aa  72.4  0.000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4304  cation transporter, voltage-gated ion channel cation transporter  26.06 
 
 		 273 aa  71.6  0.00000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21361  potassium channel, VIC family protein  29.47 
 
 		 212 aa  71.6  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.5958 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0024  Ion transport protein  30 
 
 		 265 aa  72  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0306194  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3005  potassium channel protein  29.41 
 
 		 272 aa  71.2  0.00000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.318755  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0091  Ion transport protein  26.61 
 
 		 299 aa  71.6  0.00000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1192  Ion transport protein  21.58 
 
 		 277 aa  71.2  0.00000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.645124  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1566  Ion transport protein  26.7 
 
 		 273 aa  71.6  0.00000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0452104  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_351  cation channel protein  31.25 
 
 		 269 aa  71.6  0.00000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0253  Ion transport protein  26.73 
 
 		 273 aa  71.6  0.00000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.614768  normal  0.426198 
 
 
-
 
NC_002936  DET0408  cation channel family protein  29.69 
 
 		 269 aa  70.9  0.00000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0387  Ion transport protein  31.93 
 
 		 269 aa  70.9  0.00000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3630  Ion transport protein  26.57 
 
 		 274 aa  70.1  0.00000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.334747  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2779  Ion transport protein  31.68 
 
 		 357 aa  69.3  0.00000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00211831 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3869  Ion transport protein  25.53 
 
 		 273 aa  68.9  0.00000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.519934  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002929  possible potassium channel VIC family  29.78 
 
 		 287 aa  68.6  0.00000000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000118679  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1378  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  29.68 
 
 		 408 aa  68.6  0.00000000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1456  Ion transport 2 domain protein  31.85 
 
 		 405 aa  67.8  0.0000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0288  Ion transport protein  27.06 
 
 		 272 aa  68.6  0.0000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.503473 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2375  Ion transport protein  28.73 
 
 		 276 aa  68.6  0.0000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0939  VIC family potassium channel protein  25.71 
 
 		 276 aa  67.4  0.0000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.650828  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4829  Ion transport 2 domain-containing protein  29.03 
 
 		 260 aa  67  0.0000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.700731  normal  0.213601 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3382  Ion transport protein  29.33 
 
 		 277 aa  67  0.0000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.0078085  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4534  Ion transport 2 domain-containing protein  29.03 
 
 		 260 aa  67  0.0000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.480815 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1725  Ion transport protein  28.95 
 
 		 292 aa  67  0.0000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0536813  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4447  Ion transport 2  29.03 
 
 		 260 aa  67  0.0000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0874617  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0044  Ion transport 2 domain protein  31.34 
 
 		 316 aa  67  0.0000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2579  hypothetical protein  24.75 
 
 		 298 aa  66.2  0.0000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.932967  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2339  Ion transport protein  26.98 
 
 		 276 aa  65.9  0.0000000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5447  voltage-dependent potassium channel  29.27 
 
 		 409 aa  65.9  0.0000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.532768  normal  0.0697598 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1478  Ion transport protein  25.36 
 
 		 276 aa  65.9  0.0000000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.870774  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3452  Ion transport protein  26.98 
 
 		 279 aa  65.5  0.0000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.81213  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1358  Ion transport protein  29.41 
 
 		 419 aa  65.5  0.0000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3624  ion transport protein, putative  32 
 
 		 277 aa  65.1  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0236  Ion transport 2 domain protein  26.42 
 
 		 256 aa  64.7  0.000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.317103 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1402  Ion transport protein  34 
 
 		 331 aa  64.7  0.000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0277452  hitchhiker  0.00237581 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2780  Ion transport protein  27.74 
 
 		 284 aa  65.1  0.000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.715663  normal  0.450959 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0178  VIC family potassium channel protein  21.92 
 
 		 282 aa  64.7  0.000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4020  cyclic nucleotide-binding  28.26 
 
 		 367 aa  65.1  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.109231  normal  0.727114 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2640  potassium channel protein  29.66 
 
 		 277 aa  64.7  0.000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3680  TrkA domain-containing protein  31.15 
 
 		 509 aa  65.1  0.000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5210  cyclic nucleotide-binding protein  39.73 
 
 		 355 aa  64.3  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.465426  normal  0.688608 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1491  Ion transport protein  25 
 
 		 275 aa  63.9  0.000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0882  Ion transport 2 domain-containing protein  25 
 
 		 241 aa  63.9  0.000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000375333  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2007  Ion transport 2 domain protein  25.51 
 
 		 270 aa  64.3  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.867159 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5008  Ion transport 2 domain-containing protein  31.78 
 
 		 251 aa  63.5  0.000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.649259 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0040  Ion transport protein  28.57 
 
 		 272 aa  63.5  0.000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1991  potassium channel protein  24.87 
 
 		 279 aa  63.5  0.000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>