292 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_0287 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_0287  hypothetical protein  100 
 
 		 231 aa  459  9.999999999999999e-129  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1606  ion transporter  36.98 
 
 		 240 aa  123  3e-27  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.954695 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0620  ion transport 2 domain-containing protein  32.74 
 
 		 264 aa  108  7.000000000000001e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2003  Ion transport 2 domain protein  34.76 
 
 		 269 aa  106  3e-22  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.191416 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3117  Ion transport 2 domain-containing protein  32.42 
 
 		 274 aa  105  6e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0962789  normal  0.861695 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0855  Ion transport 2 domain-containing protein  32.42 
 
 		 274 aa  105  6e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.289459  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0600  Ion transport protein  31.33 
 
 		 228 aa  105  8e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.90662  normal  0.0268571 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0824  Ion transport 2 domain-containing protein  32.42 
 
 		 274 aa  105  8e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.978487 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3768  ion transporter  29.63 
 
 		 274 aa  102  4e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0919  Ion transport 2 domain-containing protein  31.46 
 
 		 274 aa  102  4e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3841  ion transport 2 domain-containing protein  33.52 
 
 		 268 aa  102  4e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.735786  unclonable  0.000000000129627 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0909  Ion transport 2 domain protein  31.46 
 
 		 274 aa  102  7e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0497907  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0885  Ion transport 2 domain-containing protein  31.46 
 
 		 274 aa  102  7e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.543733  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3453  Ion transport 2 domain-containing protein  31.46 
 
 		 274 aa  102  7e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.837221  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3269  Ion transport 2 domain-containing protein  31.46 
 
 		 269 aa  100  2e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2679  putative ion transport protein  31.67 
 
 		 253 aa  100  3e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0253286  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0262  Ion transport 2 domain-containing protein  30.09 
 
 		 263 aa  98.6  8e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00865  hypothetical protein  31.78 
 
 		 272 aa  98.2  1e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3094  Ion transport 2 domain-containing protein  30.77 
 
 		 273 aa  97.8  1e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.533818  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2671  ion transporter  32.97 
 
 		 280 aa  97.8  1e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0719  Ion transport 2 domain-containing protein  31.77 
 
 		 270 aa  96.3  4e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000693847  hitchhiker  0.000000252906 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2923  Ion transport protein  33.53 
 
 		 271 aa  95.5  6e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.136204  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004526  cAMP-dependent Kef-type K+ transport system  30.54 
 
 		 257 aa  94.7  9e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0694  Ion transport 2  31.87 
 
 		 276 aa  92.8  4e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000792601  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3485  Ion transport 2 domain-containing protein  31.67 
 
 		 265 aa  92  7e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.319934  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0882  Ion transport 2 domain-containing protein  29.86 
 
 		 241 aa  88.6  7e-17  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000375333  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1192  Ion transport protein  30.4 
 
 		 277 aa  88.6  7e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.645124  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2527  Ion transport protein  31.6 
 
 		 284 aa  88.6  8e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2640  Ion transport protein  31.6 
 
 		 284 aa  88.6  8e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.512871  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1824  Ion transport protein  31.6 
 
 		 284 aa  88.6  8e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0249663  normal  0.467552 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2520  Ion transport protein  31.6 
 
 		 284 aa  88.6  8e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2286  Ion transport protein  30.62 
 
 		 289 aa  87.8  1e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.630315  normal  0.644367 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2419  Ion transport protein  30.62 
 
 		 289 aa  87.8  1e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2564  Ion transport 2 domain-containing protein  31.46 
 
 		 268 aa  85.1  8e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.108416  decreased coverage  0.00000252987 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2209  Ion transport protein  30.14 
 
 		 289 aa  85.1  9e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.427173 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1581  Ion transport 2 domain-containing protein  27.62 
 
 		 262 aa  83.6  0.000000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.69738  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1941  Ion transport protein  27.6 
 
 		 265 aa  84.3  0.000000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0124996 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1424  Ion transport 2 domain protein  32.63 
 
 		 253 aa  83.2  0.000000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.287794  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2375  Ion transport protein  26.53 
 
 		 276 aa  83.2  0.000000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1332  TrkA-N:Ion transport protein  31.49 
 
 		 517 aa  82  0.000000000000007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.478947  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1491  Ion transport protein  28.79 
 
 		 275 aa  81.3  0.00000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1053  Ion transport protein  33.51 
 
 		 325 aa  80.9  0.00000000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1325  VIC family potassium channel protein  33.51 
 
 		 325 aa  80.1  0.00000000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.266187  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1082  putative potassium channel protein  28.14 
 
 		 280 aa  80.5  0.00000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1821  ion transport protein  26.82 
 
 		 279 aa  79.7  0.00000000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2168  TrkA-N domain protein  28.57 
 
 		 531 aa  79.7  0.00000000000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2413  Ion transport 2 domain-containing protein  30.64 
 
 		 268 aa  79.3  0.00000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.592727  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1590  Ion transport protein  27.14 
 
 		 276 aa  79.7  0.00000000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0129  Ion transport 2 domain protein  29.83 
 
 		 241 aa  79.3  0.00000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000177719  hitchhiker  0.0000693343 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2281  Ion transport protein  32.69 
 
 		 289 aa  79  0.00000000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.87963  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3664  Ion transport 2 domain protein  29.55 
 
 		 271 aa  79  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.819416 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1557  Ion transport protein  32.69 
 
 		 277 aa  78.6  0.00000000000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2766  Ion transport protein  27.62 
 
 		 279 aa  78.2  0.0000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0676384  normal  0.308489 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2446  Ion transport 2 domain protein  28.98 
 
 		 269 aa  78.2  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2112  ion transport protein  26.36 
 
 		 295 aa  77.8  0.0000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1378  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  29.05 
 
 		 408 aa  77.4  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1582  Ion transport 2 domain-containing protein  30.48 
 
 		 288 aa  76.6  0.0000000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2030  Ion transport protein  30.09 
 
 		 263 aa  75.9  0.0000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03944  putative potassium channel protein  27.97 
 
 		 311 aa  75.9  0.0000000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0253  Ion transport protein  27.56 
 
 		 273 aa  75.5  0.0000000000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.614768  normal  0.426198 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1358  Ion transport protein  29.88 
 
 		 419 aa  75.5  0.0000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0363  Kef-type K+ transporter NAD-binding component  29.94 
 
 		 292 aa  75.5  0.0000000000007  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000112983 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1745  Ion transport 2 domain-containing protein  29.89 
 
 		 252 aa  75.1  0.0000000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.454353 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3680  TrkA domain-containing protein  41.01 
 
 		 509 aa  75.1  0.0000000000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2774  Ion transport 2 domain protein  38.3 
 
 		 244 aa  74.3  0.000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000298794 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0564  Ion transport 2 domain protein  28.45 
 
 		 276 aa  74.7  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0288  Ion transport protein  28.64 
 
 		 272 aa  74.3  0.000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.503473 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1725  Ion transport protein  26.84 
 
 		 292 aa  73.9  0.000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0536813  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2640  potassium channel protein  25.88 
 
 		 277 aa  73.6  0.000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4829  Ion transport 2 domain-containing protein  28.32 
 
 		 260 aa  72.4  0.000000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.700731  normal  0.213601 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4447  Ion transport 2  28.32 
 
 		 260 aa  72.4  0.000000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0874617  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4534  Ion transport 2 domain-containing protein  28.32 
 
 		 260 aa  72.4  0.000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.480815 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2779  Ion transport protein  30.36 
 
 		 357 aa  72  0.000000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00211831 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03020  hypothetical protein  27.27 
 
 		 282 aa  72  0.000000000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0861  Ion transport protein  30.71 
 
 		 231 aa  72  0.000000000008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0989  Ion transport 2 domain-containing protein  39.5 
 
 		 344 aa  70.1  0.00000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.369667 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5210  cyclic nucleotide-binding protein  37.3 
 
 		 355 aa  70.1  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.465426  normal  0.688608 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3070  Ion transport 2 domain-containing protein  40.23 
 
 		 244 aa  69.7  0.00000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.550123  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0024  Ion transport protein  33.88 
 
 		 265 aa  69.3  0.00000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0306194  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0186  Ion transport protein  32.41 
 
 		 513 aa  69.3  0.00000000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5008  Ion transport 2 domain-containing protein  47.54 
 
 		 251 aa  69.3  0.00000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.649259 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1854  putative ion transport protein  25.84 
 
 		 282 aa  67.8  0.0000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.807615  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2438  hypothetical protein  45.16 
 
 		 430 aa  67  0.0000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.1503  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1615  Ion transport protein  26.55 
 
 		 271 aa  67.4  0.0000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2339  Ion transport protein  27.53 
 
 		 276 aa  66.6  0.0000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2007  Ion transport 2 domain protein  29.95 
 
 		 270 aa  66.6  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.867159 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002929  possible potassium channel VIC family  30 
 
 		 287 aa  66.6  0.0000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000118679  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2579  hypothetical protein  28.57 
 
 		 298 aa  66.2  0.0000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.932967  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4283  Ion transport protein  25.34 
 
 		 285 aa  65.9  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0210487  normal  0.0226615 
 
 
-
 
NC_002950  PG2036  ion transporter  27.37 
 
 		 303 aa  65.5  0.0000000007  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    unclonable  0.000000000745091 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2916  TrkA-N domain protein  30.62 
 
 		 477 aa  65.1  0.0000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.380494  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5447  voltage-dependent potassium channel  33.05 
 
 		 409 aa  65.1  0.0000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.532768  normal  0.0697598 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0387  Ion transport protein  34.94 
 
 		 269 aa  65.1  0.0000000009  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0253  Ion transport 2 domain protein  46.55 
 
 		 260 aa  65.1  0.000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0091  Ion transport protein  26.24 
 
 		 299 aa  64.3  0.000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1991  potassium channel protein  29.1 
 
 		 279 aa  64.7  0.000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0929  Ion transport protein  32.5 
 
 		 274 aa  63.9  0.000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.765221  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0040  Ion transport protein  27.48 
 
 		 272 aa  63.5  0.000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_351  cation channel protein  37.08 
 
 		 269 aa  63.5  0.000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3869  Ion transport protein  26.92 
 
 		 273 aa  63.2  0.000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.519934  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>