269 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_2413 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_2413  Ion transport 2 domain-containing protein  100 
 
 		 268 aa  523  1e-147  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.592727  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2564  Ion transport 2 domain-containing protein  84.09 
 
 		 268 aa  442  1e-123  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.108416  decreased coverage  0.00000252987 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1581  Ion transport 2 domain-containing protein  42.42 
 
 		 262 aa  196  3e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.69738  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4447  Ion transport 2  47.66 
 
 		 260 aa  171  9e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0874617  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4534  Ion transport 2 domain-containing protein  47.66 
 
 		 260 aa  171  9e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.480815 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4829  Ion transport 2 domain-containing protein  48.09 
 
 		 260 aa  171  2e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.700731  normal  0.213601 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0253  Ion transport 2 domain protein  47.01 
 
 		 260 aa  167  1e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1745  Ion transport 2 domain-containing protein  47.14 
 
 		 252 aa  155  5.0000000000000005e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.454353 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5008  Ion transport 2 domain-containing protein  47.83 
 
 		 251 aa  155  7e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.649259 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3070  Ion transport 2 domain-containing protein  44.21 
 
 		 244 aa  147  2.0000000000000003e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.550123  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1424  Ion transport 2 domain protein  36.61 
 
 		 253 aa  137  2e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.287794  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2774  Ion transport 2 domain protein  42.13 
 
 		 244 aa  136  3.0000000000000003e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000298794 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1457  Kef-type K+ transport system NAD-binding protein  42.62 
 
 		 255 aa  129  4.0000000000000003e-29  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1082  putative potassium channel protein  32.7 
 
 		 280 aa  112  9e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1192  Ion transport protein  34.58 
 
 		 277 aa  104  1e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.645124  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00865  hypothetical protein  34.34 
 
 		 272 aa  98.6  1e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2679  putative ion transport protein  28.1 
 
 		 253 aa  97.4  2e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0253286  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2923  Ion transport protein  31.66 
 
 		 271 aa  97.8  2e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.136204  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0129  Ion transport 2 domain protein  33.33 
 
 		 241 aa  94.4  2e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000177719  hitchhiker  0.0000693343 
 
 
-
 
NC_002950  PG1606  ion transporter  35.23 
 
 		 240 aa  93.6  3e-18  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.954695 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004526  cAMP-dependent Kef-type K+ transport system  30.59 
 
 		 257 aa  92.4  6e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0262  Ion transport 2 domain-containing protein  33.67 
 
 		 263 aa  92.4  6e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3453  Ion transport 2 domain-containing protein  27.6 
 
 		 274 aa  84.7  0.000000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.837221  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0885  Ion transport 2 domain-containing protein  27.6 
 
 		 274 aa  84.7  0.000000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.543733  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0909  Ion transport 2 domain protein  27.6 
 
 		 274 aa  84.7  0.000000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0497907  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3094  Ion transport 2 domain-containing protein  29.36 
 
 		 273 aa  84.3  0.000000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.533818  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0882  Ion transport 2 domain-containing protein  28.29 
 
 		 241 aa  83.6  0.000000000000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000375333  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2671  ion transporter  30.73 
 
 		 280 aa  83.2  0.000000000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3269  Ion transport 2 domain-containing protein  29.31 
 
 		 269 aa  82.8  0.000000000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0824  Ion transport 2 domain-containing protein  28.51 
 
 		 274 aa  82.4  0.000000000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.978487 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0600  Ion transport protein  29.22 
 
 		 228 aa  82.4  0.000000000000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.90662  normal  0.0268571 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0620  ion transport 2 domain-containing protein  29 
 
 		 264 aa  82.4  0.000000000000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2003  Ion transport 2 domain protein  28.02 
 
 		 269 aa  82  0.000000000000008  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.191416 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3841  ion transport 2 domain-containing protein  27.23 
 
 		 268 aa  82  0.000000000000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.735786  unclonable  0.000000000129627 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3117  Ion transport 2 domain-containing protein  28.51 
 
 		 274 aa  82  0.000000000000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0962789  normal  0.861695 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0855  Ion transport 2 domain-containing protein  28.51 
 
 		 274 aa  82  0.000000000000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.289459  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0719  Ion transport 2 domain-containing protein  26.64 
 
 		 270 aa  81.6  0.00000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000693847  hitchhiker  0.000000252906 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0919  Ion transport 2 domain-containing protein  27.64 
 
 		 274 aa  81.6  0.00000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3768  ion transporter  26.78 
 
 		 274 aa  80.1  0.00000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0287  hypothetical protein  29.94 
 
 		 231 aa  80.1  0.00000000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3485  Ion transport 2 domain-containing protein  29.89 
 
 		 265 aa  79.3  0.00000000000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.319934  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0694  Ion transport 2  27.07 
 
 		 276 aa  79  0.00000000000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000792601  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1615  Ion transport protein  27.82 
 
 		 271 aa  76.6  0.0000000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2007  Ion transport 2 domain protein  28.08 
 
 		 270 aa  76.6  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.867159 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1941  Ion transport protein  26.07 
 
 		 265 aa  70.9  0.00000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0124996 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1332  TrkA-N:Ion transport protein  29.08 
 
 		 517 aa  69.7  0.00000000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.478947  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1358  Ion transport protein  33.52 
 
 		 419 aa  68.9  0.00000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1053  Ion transport protein  31.45 
 
 		 325 aa  67.4  0.0000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1325  VIC family potassium channel protein  30.82 
 
 		 325 aa  66.6  0.0000000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.266187  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0989  Ion transport 2 domain-containing protein  38.1 
 
 		 344 aa  65.9  0.0000000007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.369667 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0462  Kef-type K+ transporter NAD-binding component  28.24 
 
 		 216 aa  65.1  0.000000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.402567  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1866  putative K+ ion channel  35.9 
 
 		 281 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3680  TrkA domain-containing protein  41.98 
 
 		 509 aa  63.5  0.000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2438  hypothetical protein  39.08 
 
 		 430 aa  63.2  0.000000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.1503  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4283  Ion transport protein  30.06 
 
 		 285 aa  63.2  0.000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0210487  normal  0.0226615 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1456  Ion transport 2 domain protein  31.85 
 
 		 405 aa  63.2  0.000000005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2168  TrkA-N domain protein  33.33 
 
 		 531 aa  62.4  0.000000008  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0363  Kef-type K+ transporter NAD-binding component  26.34 
 
 		 292 aa  61.6  0.00000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000112983 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5447  voltage-dependent potassium channel  34.33 
 
 		 409 aa  60.8  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.532768  normal  0.0697598 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4718  Ion transport 2 domain-containing protein  37.5 
 
 		 331 aa  59.3  0.00000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0856432  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0132  VIC family potassium channel protein  34.01 
 
 		 275 aa  59.3  0.00000006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0238536  normal  0.0130464 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0700  Ion transport 2 domain protein  39.06 
 
 		 274 aa  59.3  0.00000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00257952  normal  0.062566 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1556  Ion transport protein  29.31 
 
 		 328 aa  58.9  0.00000008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000506014  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0167  Ion transport protein  33.98 
 
 		 273 aa  58.9  0.00000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.177755  normal  0.634812 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1378  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  33.58 
 
 		 408 aa  58.5  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0929  Ion transport protein  29.73 
 
 		 274 aa  58.5  0.0000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.765221  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0861  Ion transport protein  29.92 
 
 		 231 aa  58.5  0.0000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2446  Ion transport 2 domain protein  30.77 
 
 		 269 aa  58.2  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5210  cyclic nucleotide-binding protein  32.93 
 
 		 355 aa  57.8  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.465426  normal  0.688608 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0471  TrkA domain-containing protein  36.05 
 
 		 325 aa  57.8  0.0000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3664  Ion transport 2 domain protein  30.13 
 
 		 271 aa  57  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.819416 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4765  hypothetical protein  39.39 
 
 		 331 aa  57  0.0000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.641012  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4605  potassium channel protein  39.39 
 
 		 331 aa  57  0.0000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5008  hypothetical protein  39.39 
 
 		 331 aa  57  0.0000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5128  hypothetical protein  39.39 
 
 		 331 aa  57  0.0000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1402  Ion transport protein  29.66 
 
 		 331 aa  56.6  0.0000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0277452  hitchhiker  0.00237581 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1660  potassium channel protein  30.46 
 
 		 277 aa  56.6  0.0000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.819465 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0253  Ion transport protein  30.46 
 
 		 273 aa  56.6  0.0000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.614768  normal  0.426198 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2020  Ion transport protein  26.56 
 
 		 282 aa  57  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1097  Ion transport 2 domain-containing protein  27.27 
 
 		 140 aa  56.6  0.0000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.168795  normal  0.504261 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4627  potassium channel protein  39.39 
 
 		 331 aa  56.2  0.0000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0205  hypothetical protein  39.39 
 
 		 331 aa  56.2  0.0000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000989873  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1898  Ion transport protein  33.13 
 
 		 308 aa  56.2  0.0000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000138161 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0387  Ion transport protein  32.76 
 
 		 269 aa  56.6  0.0000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4038  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  31.82 
 
 		 409 aa  56.2  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5028  hypothetical protein  37.88 
 
 		 331 aa  55.8  0.0000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0307727  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4020  cyclic nucleotide-binding  42.25 
 
 		 367 aa  55.5  0.0000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.109231  normal  0.727114 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0040  Ion transport protein  34.09 
 
 		 272 aa  55.5  0.0000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2779  Ion transport protein  41.38 
 
 		 357 aa  55.5  0.0000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00211831 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1005  Ion transport protein  29.81 
 
 		 267 aa  55.1  0.000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1119  Ion transport 2 domain-containing protein  34 
 
 		 279 aa  55.1  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0178  VIC family potassium channel protein  38.04 
 
 		 282 aa  55.5  0.000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0236  Ion transport 2 domain protein  28.1 
 
 		 256 aa  55.1  0.000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.317103 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1499  Ion transport 2 domain-containing protein  45.24 
 
 		 230 aa  55.1  0.000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.288718  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_351  cation channel protein  31.25 
 
 		 269 aa  54.3  0.000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1106  Ion transport 2 domain-containing protein  41.38 
 
 		 256 aa  54.3  0.000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.226548  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6042  Ion transport 2 domain-containing protein  32.71 
 
 		 256 aa  54.3  0.000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.985257  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5040  hypothetical protein  37.88 
 
 		 331 aa  54.3  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00727764  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1249  Ion transport 2 domain protein  41.38 
 
 		 249 aa  54.3  0.000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.940335  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4211  Ion transport protein  34.07 
 
 		 283 aa  53.9  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>