257 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcr_1556 on replicon NC_007520
Organism: Thiomicrospira crunogena XCL-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007520  Tcr_1556  Ion transport protein  100 
 
 		 328 aa  651    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000506014  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1082  putative potassium channel protein  29.73 
 
 		 280 aa  100  3e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0620  ion transport 2 domain-containing protein  25.31 
 
 		 264 aa  92  1e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0909  Ion transport 2 domain protein  23.69 
 
 		 274 aa  90.5  4e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0497907  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0885  Ion transport 2 domain-containing protein  23.69 
 
 		 274 aa  90.5  4e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.543733  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3453  Ion transport 2 domain-containing protein  23.69 
 
 		 274 aa  90.5  4e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.837221  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0824  Ion transport 2 domain-containing protein  23.32 
 
 		 274 aa  89.7  6e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.978487 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3117  Ion transport 2 domain-containing protein  22.92 
 
 		 274 aa  89.4  7e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0962789  normal  0.861695 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0855  Ion transport 2 domain-containing protein  22.92 
 
 		 274 aa  89.4  7e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.289459  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0919  Ion transport 2 domain-containing protein  24.5 
 
 		 274 aa  89.4  8e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3768  ion transporter  23.6 
 
 		 274 aa  85.5  0.000000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0129  Ion transport 2 domain protein  28.73 
 
 		 241 aa  85.5  0.000000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000177719  hitchhiker  0.0000693343 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0882  Ion transport 2 domain-containing protein  27.85 
 
 		 241 aa  85.1  0.000000000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000375333  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3841  ion transport 2 domain-containing protein  25.33 
 
 		 268 aa  83.2  0.000000000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.735786  unclonable  0.000000000129627 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3485  Ion transport 2 domain-containing protein  22.83 
 
 		 265 aa  82  0.00000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.319934  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0253  Ion transport 2 domain protein  29.7 
 
 		 260 aa  82  0.00000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3094  Ion transport 2 domain-containing protein  22.86 
 
 		 273 aa  81.3  0.00000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.533818  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0719  Ion transport 2 domain-containing protein  24.29 
 
 		 270 aa  79.3  0.00000000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000693847  hitchhiker  0.000000252906 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00865  hypothetical protein  28.23 
 
 		 272 aa  76.3  0.0000000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3269  Ion transport 2 domain-containing protein  21.17 
 
 		 269 aa  74.7  0.000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3070  Ion transport 2 domain-containing protein  26.46 
 
 		 244 aa  72.4  0.00000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.550123  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0694  Ion transport 2  23.85 
 
 		 276 aa  71.2  0.00000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000792601  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2564  Ion transport 2 domain-containing protein  26.24 
 
 		 268 aa  70.9  0.00000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.108416  decreased coverage  0.00000252987 
 
 
-
 
NC_002950  PG1606  ion transporter  25.29 
 
 		 240 aa  69.7  0.00000000006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.954695 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2679  putative ion transport protein  26.83 
 
 		 253 aa  68.9  0.0000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0253286  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2671  ion transporter  20.6 
 
 		 280 aa  68.6  0.0000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03944  putative potassium channel protein  26.69 
 
 		 311 aa  67.8  0.0000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1875  Ion transport protein  28.02 
 
 		 278 aa  67.4  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.354062  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1119  Ion transport 2 domain-containing protein  26.52 
 
 		 279 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1404  Ion transport protein  27.54 
 
 		 278 aa  65.9  0.0000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1932  Ion transport protein  27.54 
 
 		 278 aa  65.9  0.0000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.595369  normal  0.0211569 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1586  Ion transport protein  27.54 
 
 		 278 aa  65.9  0.0000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.580145  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0363  Kef-type K+ transporter NAD-binding component  24.37 
 
 		 292 aa  65.9  0.0000000009  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000112983 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004526  cAMP-dependent Kef-type K+ transport system  25.91 
 
 		 257 aa  65.5  0.000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2923  Ion transport protein  30.17 
 
 		 271 aa  65.5  0.000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.136204  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2774  Ion transport 2 domain protein  28.5 
 
 		 244 aa  64.7  0.000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000298794 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2446  Ion transport 2 domain protein  30 
 
 		 269 aa  64.7  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1869  Ion transport protein  27.54 
 
 		 278 aa  64.7  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.275809  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2438  hypothetical protein  38.32 
 
 		 430 aa  63.9  0.000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.1503  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1457  Kef-type K+ transport system NAD-binding protein  26.7 
 
 		 255 aa  64.3  0.000000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1725  Ion transport protein  26.17 
 
 		 292 aa  64.3  0.000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0536813  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2003  Ion transport 2 domain protein  23.64 
 
 		 269 aa  63.9  0.000000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.191416 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1866  putative K+ ion channel  36.36 
 
 		 281 aa  63.9  0.000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0288  Ion transport protein  27.83 
 
 		 272 aa  63.9  0.000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.503473 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3664  Ion transport 2 domain protein  29.38 
 
 		 271 aa  63.9  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.819416 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0253  Ion transport protein  29.33 
 
 		 273 aa  63.2  0.000000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.614768  normal  0.426198 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1424  Ion transport 2 domain protein  27.65 
 
 		 253 aa  62  0.00000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.287794  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3915  TrkA domain-containing protein  28.89 
 
 		 330 aa  60.5  0.00000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.557122  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2112  ion transport protein  26.17 
 
 		 295 aa  60.8  0.00000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5187  TrkA domain-containing protein  30.77 
 
 		 330 aa  60.5  0.00000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3053  Ion transport protein  26.77 
 
 		 288 aa  60.1  0.00000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2388  Ion transport protein  32.35 
 
 		 302 aa  60.1  0.00000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.971604 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2413  Ion transport 2 domain-containing protein  29.06 
 
 		 268 aa  59.7  0.00000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.592727  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5246  potassium channel protein, N-terminus  29.55 
 
 		 146 aa  59.7  0.00000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0630714  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2640  potassium channel protein  21.9 
 
 		 277 aa  59.7  0.00000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0236  Ion transport 2 domain protein  25.93 
 
 		 256 aa  59.7  0.00000007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.317103 
 
 
-
 
NC_002936  DET0408  cation channel family protein  26.55 
 
 		 269 aa  59.3  0.00000008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5573  potassium uptake protein, TrkA family  29.91 
 
 		 330 aa  58.9  0.0000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0700  Ion transport 2 domain protein  36.36 
 
 		 274 aa  58.5  0.0000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00257952  normal  0.062566 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5075  potassium channel protein  29.06 
 
 		 334 aa  58.2  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000793674  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5092  potassium channel protein  29.06 
 
 		 334 aa  58.2  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00108262  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0044  Ion transport 2 domain protein  34.41 
 
 		 316 aa  57.8  0.0000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5489  potassium uptake protein, TrkA family  29.06 
 
 		 330 aa  58.2  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1142  TrkA domain-containing protein  29.47 
 
 		 341 aa  58.2  0.0000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3507  Ion transport 2 domain-containing protein  30.99 
 
 		 331 aa  57.4  0.0000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00681097  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17521  GIC family ligand gated channel  40 
 
 		 333 aa  57.4  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.689704 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0167  Ion transport protein  35.44 
 
 		 273 aa  57.4  0.0000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.177755  normal  0.634812 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0387  Ion transport protein  30.09 
 
 		 269 aa  57.4  0.0000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5434  potassium uptake protein, TrkA family  29.06 
 
 		 337 aa  57.4  0.0000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0287  hypothetical protein  40.32 
 
 		 231 aa  56.6  0.0000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1581  Ion transport 2 domain-containing protein  31.58 
 
 		 262 aa  56.6  0.0000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.69738  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5517  potassium uptake protein, TrkA family  27.27 
 
 		 330 aa  56.2  0.0000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1715  voltage-gated potassium channel  28.28 
 
 		 391 aa  55.8  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2168  TrkA-N domain protein  27.54 
 
 		 531 aa  55.5  0.000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1615  Ion transport protein  23.5 
 
 		 271 aa  55.5  0.000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4020  cyclic nucleotide-binding  36.17 
 
 		 367 aa  55.8  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.109231  normal  0.727114 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4470  extracellular solute-binding protein  41.67 
 
 		 360 aa  55.1  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.643517  normal  0.165286 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2209  Ion transport protein  26.36 
 
 		 289 aa  55.8  0.000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.427173 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4712  cyclic nucleotide-binding protein  48.84 
 
 		 412 aa  55.1  0.000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.566577  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0453  Ion transport 2 domain protein  37.04 
 
 		 347 aa  54.7  0.000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4718  Ion transport 2 domain-containing protein  32.23 
 
 		 331 aa  55.1  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0856432  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1402  Ion transport protein  25.5 
 
 		 331 aa  55.1  0.000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0277452  hitchhiker  0.00237581 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4447  Ion transport 2  25.36 
 
 		 260 aa  55.1  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0874617  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2286  Ion transport protein  26.36 
 
 		 289 aa  54.7  0.000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.630315  normal  0.644367 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0861  Ion transport protein  37.14 
 
 		 231 aa  54.7  0.000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0024  Ion transport protein  24 
 
 		 265 aa  55.1  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0306194  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4534  Ion transport 2 domain-containing protein  25.36 
 
 		 260 aa  55.1  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.480815 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1097  Ion transport 2 domain-containing protein  29.57 
 
 		 140 aa  55.1  0.000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.168795  normal  0.504261 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1821  ion transport protein  24.62 
 
 		 279 aa  54.3  0.000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3219  voltage-gated potassium channel  28.28 
 
 		 391 aa  54.3  0.000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.630222 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4068  voltage-gated potassium channel  28.28 
 
 		 391 aa  54.3  0.000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0673  potassium channel protein  27.71 
 
 		 428 aa  54.3  0.000003  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.0468102  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3716  voltage-gated potassium channel  28.28 
 
 		 391 aa  53.9  0.000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.947773 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4298  voltage-gated potassium channel  28.28 
 
 		 391 aa  54.3  0.000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2419  Ion transport protein  26.36 
 
 		 289 aa  54.3  0.000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1991  potassium channel protein  24.89 
 
 		 279 aa  53.9  0.000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2579  hypothetical protein  24.62 
 
 		 298 aa  53.9  0.000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.932967  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2520  Ion transport protein  25.94 
 
 		 284 aa  53.9  0.000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0989  Ion transport 2 domain-containing protein  42.59 
 
 		 344 aa  53.9  0.000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.369667 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2527  Ion transport protein  25.94 
 
 		 284 aa  53.9  0.000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>